Cours 2 : Structure du génome Flashcards
Qu’est ce que la structure primaire des acides aminées
Chaîne d’acides aminés unis par des liens peptidiques
Quelles sont les 2 formes de structures secondaires des protéines
Hélice alpha (chaine R vers l’extérieur)
Feuillets Bêta (chaine R vers le haut et le bas)
Vrai ou faux : Les structures secondaires se forment spontanément
Vrai, grâce aux liens H au niveau des coeurs des acides aminés
Qu’est ce que la structure tertiaire des protéines
Un agencement d’hélices alpha et de feuillets bêta possédant des domaines fonctionnels
Qu’est ce qui détermine la fonction d’un domaine protéique
La forme de ce domaine (un même domaine se replie toujours de la même façon)
Vrai ou faux : un domaine donné ne fait parti que d’une seule protéine
Faux, un même domaine peut faire partie de plusieurs protéines
Qu’est ce que la structure quaternaire des protéines
Interaction entre plusieurs chaines peptidiques pour former une protéine fonctionnelle (assemblage de sous-unités)
Comment est l’ensemble de l’ADN génomique chez les procaryotes vs eucaryotes
Procaryotes : un seul chromosome circulaire
Eucaryotes : Plusieurs chromosomes
Où est situé l’ADN chez les procaryotes
Dans le cytoplasme et forme une structure appelée nucléoïde
Petites protéines qui aident à l’organisation spatiale de l’ADN
Quelles sont les 3 protéines qui compactent l’ADN chez les procaryotes
- H-NS : formation d’un pont
- Protéine d’enroulement
- Protéine pliant l’ADN
Vrai ou faux : le nucléoïde est dynamique
Vrai, il change selon les besoins de la cellule
Comment se trouve l’ADN eucaryote lors de la vie normale d’une cellule (interphase)
L’ADN est sous forme de chromatine
Comment se trouve l’ADN eucaryote lors de la mitose
L’ADN est condensé en chromosomes mitotiques
Qu’est ce que la chromatine
Un ensemble d’ADN et de protéines
Quels sont les 2 niveaux de compaction de la chromatine
Hétérochromatine : région non-transcrite (condensé de 30nm)
Euchromatine : région active pour la transcription (étendue de 11 nm)
Qu’est ce qu’un nucléosome
La structure de base de la chromatine et le premier niveau de compaction
De quoi est composé un nucléosome
ADN et 8 histones (2 H2A, 2 H2B, 2 H3, 2 H4)
Combien de fois l’ADN s’enroule autour d’un noyau d’histone et comment s’appelle l’ADN entre 2 nucléosomes
1,65 fois
ADN intercalaire
Qu’est ce qui explique la grande affinité non spécifique des Histones avec l’ADN
- Histones riches en lysines et arginines chargés positivement (ADN est -)
- Les séquences riches en AT se courbent plus facilement (moins d’encombrement)
Comment se retrouvent les dimères et les tétramères d’histones lorsqu’il n’y a pas d’ADN disponible
Ils sont en solution (pas assembler en noyaux)
Étapes de la formation du noyau des nucléosomes
- Tétramère H3-H4 se lie à l’ADN et l’enroule
- Les 2 dimères H2A-H2B se joignent au complexe et le stabilise
Où se retrouvent les queues N-terminales des histones dans le nucléosome et quel est leur rôle
à l’extérieur, elles stabilisent l’ADN autour du noyau et permettent des interactions entre nucléosomes
Combien y a-t-il de points de contact ADN-Histone et combien de liens hydrogènes sont formés pour 1 nucléosome
14 points de contact (1 à chaque fois que le sillon mineur fait face au noyau)
40 liens hydrogènes
Par où émergent les queue N-terminales des histones du nucléosomes
H2B et H3 : entre 2 brins d’ADN où 2 sillons mineurs se font face
H4 et H2A : en haut et en bas de 2 hélices
Vrai ou faux : les queues N-terminales des histones peuvent être modifiées par des enzymes
Vrai