cours 7 mcb2992 Flashcards
quelles sont les propriétés de la double hélice
- 10 pb par tour
- liens H
- tourne côté droit
- sillons majeur/mineur
- quantité G=C et A=T
de quoi est composé ADN
bases
sucre
nucléotide
le ruban au premier ou deuxième plan détermine le côté que tourne la double-hélice
premier plan
comment se fait la synthèse des dNTPs
- ribonucléotide réductase enlève O en position 2’
- kinase ajoute P
pour dTTP:
1. phosphatase transforme dUTP en dUMP
2. ajout 5-méthyl par thymidylate synthétase via tétrahydrofolate
tétrahydrofolate vient de dihydrofolate via dihydrofolate réductase
quel phosphate des dNTP permet attachement entre dNTP
alpha
beta et gamma sont relâchés
qu’est-ce que la polarité obligatoire dans la polymérisation de l’ADN
pol peut juste se déplacer 3’ vers 5’ sur brin matrice donc synthèse nouveau brin 5’-3’
quelles sont les polymérases qui participent à synthèse normale ADN
pol I: exo 5’-3’, rôle dans réplication et réparation
(activité exo 5’-3’ permet enlever nt de amorce et activité polymérase 5’-3’ remplace dNTP)
pol III: gros complex protéines, responsable de réplicationn, processive, fait partie du réplisome
pourquoi ecq ADN pol processive
DnaE (pour polymérisation)
fortement ancrée à ADN via DnaN/beta-clamp/sliding clamp
quelles sont les primases et que font elles
DnaG est la primase qui fait une amorce ARN
amorce remplacé par ADN par pol I
qu’est-ce que le clamp loader
complexe de plusieurs protéines qui relient deux ADN pol
quelles sont les autres protéines nécessaire à la réplication
DnaB: ADN hélicase: sépare brin
SSB: lie ADN sb pour empêcher fermeture
ADN gyrase: (ADN topoisomérase) enlève surenroulement positif
comme les pol III sont reliées ecq synthèse brin continu et discontinu se font en même temps
brin discontinu synthétisé 1-2 sec plus tard
quelles polymérases ont une activité 3’-5’ exonucléase
I et III
pour corriger erreurs de réplication
pourquoi amorce fait ARN et pas ADN
si ADN: erreur dans amorce ne causerait pas distorsion pour être reconnu par pol, donc pas correction
quels sont les obstacles de la réplication et comment les contourner
-protéines attachées ADN, surenroulement, cassures
- pol III peut sauter par dessus sur brin discontinu
- utiliser une nouvelle pol pour brin continu
- translesion pol
qu’est-ce que la translesion polymérase
c’est une polymérase qui peut passer par dessus dommag du brin continu et qui s’enlève après avoir passé le dommage (pol III continue)
que se passe-t-il quand ARN pol croise fourche réplication
collision face à face plus dommageables que co-directionnelles
1. réplication plus rapide que transcription
2. enlève ARN pol
3. forme gap dans brin continu, réplication continue, mais brin ARN formé par ARN pol reste là et est utilisé comme amorce
qu’est-ce que la topologie de ADN
pas sûr de comprendre
surenroulement négatif: tend à déroulé mais aussi enroulé par gyrase: utilise surenroulement positif pour donner du surenroulement négatif: permet ouvrir brins
que permettent les topoisomérases
activité cassure brin, passage de brin, ligation
participent dans toutes étapes de réplication
gyrase vs topoisomérase
gyrase: introduit surenroulement
topoisomérase: enlève
quelle est la topologie de ADN pendant élongation de réplication
surenroulement positif en avant fourche peut passer en arrière pour former des précaténanes
précaténanes enlevés par topo IV
quelle est la topologie de ADN pendant terminaison de réplication
deux fourches convergent à ter se qui cause superenroulement positif qui ne peut être enlevé
supertours diffusent en arrière: enlever par topo IV
séparation topologique termine réplication
surenroulement négatif favorise éloignement et décaténation
qu’est-ce que la décaténation
séparation finale des chromosomes
(fait par topo IV pour enlever surenroulement négtif)
pourquoi ecq terminaison se fait seulement dans région ter
système Tus/ter bloque les fourches unidirectionnelles
(terA et terB)
