cours 7 mcb2992

Question 1

quelles sont les propriétés de la double hélice

Answer 1

• 10 pb par tour
• liens H
• tourne côté droit
• sillons majeur/mineur
• quantité G=C et A=T

Question 2

de quoi est composé ADN

Answer 2

bases
sucre
nucléotide

Question 3

le ruban au premier ou deuxième plan détermine le côté que tourne la double-hélice

Answer 3

premier plan

Question 4

comment se fait la synthèse des dNTPs

Answer 4

1. ribonucléotide réductase enlève O en position 2’
2. kinase ajoute P

pour dTTP:
1. phosphatase transforme dUTP en dUMP
2. ajout 5-méthyl par thymidylate synthétase via tétrahydrofolate

tétrahydrofolate vient de dihydrofolate via dihydrofolate réductase

Question 5

quel phosphate des dNTP permet attachement entre dNTP

Answer 5

alpha

beta et gamma sont relâchés

Question 6

qu’est-ce que la polarité obligatoire dans la polymérisation de l’ADN

Answer 6

pol peut juste se déplacer 3’ vers 5’ sur brin matrice donc synthèse nouveau brin 5’-3’

Question 7

quelles sont les polymérases qui participent à synthèse normale ADN

Answer 7

pol I: exo 5’-3’, rôle dans réplication et réparation
(activité exo 5’-3’ permet enlever nt de amorce et activité polymérase 5’-3’ remplace dNTP)

pol III: gros complex protéines, responsable de réplicationn, processive, fait partie du réplisome

Question 8

pourquoi ecq ADN pol processive

Answer 8

DnaE (pour polymérisation)
fortement ancrée à ADN via DnaN/beta-clamp/sliding clamp

Question 9

quelles sont les primases et que font elles

Answer 9

DnaG est la primase qui fait une amorce ARN
amorce remplacé par ADN par pol I

Question 10

qu’est-ce que le clamp loader

Answer 10

complexe de plusieurs protéines qui relient deux ADN pol

Question 11

quelles sont les autres protéines nécessaire à la réplication

Answer 11

DnaB: ADN hélicase: sépare brin
SSB: lie ADN sb pour empêcher fermeture
ADN gyrase: (ADN topoisomérase) enlève surenroulement positif

Question 12

comme les pol III sont reliées ecq synthèse brin continu et discontinu se font en même temps

Answer 12

brin discontinu synthétisé 1-2 sec plus tard

Question 13

quelles polymérases ont une activité 3’-5’ exonucléase

Answer 13

I et III
pour corriger erreurs de réplication

Question 14

pourquoi amorce fait ARN et pas ADN

Answer 14

si ADN: erreur dans amorce ne causerait pas distorsion pour être reconnu par pol, donc pas correction

Question 15

quels sont les obstacles de la réplication et comment les contourner

Answer 15

-protéines attachées ADN, surenroulement, cassures

• pol III peut sauter par dessus sur brin discontinu
• utiliser une nouvelle pol pour brin continu
• translesion pol

Question 16

qu’est-ce que la translesion polymérase

Answer 16

c’est une polymérase qui peut passer par dessus dommag du brin continu et qui s’enlève après avoir passé le dommage (pol III continue)

Question 17

que se passe-t-il quand ARN pol croise fourche réplication

Answer 17

collision face à face plus dommageables que co-directionnelles
1. réplication plus rapide que transcription
2. enlève ARN pol
3. forme gap dans brin continu, réplication continue, mais brin ARN formé par ARN pol reste là et est utilisé comme amorce

Question 18

qu’est-ce que la topologie de ADN

pas sûr de comprendre

Answer 18

surenroulement négatif: tend à déroulé mais aussi enroulé par gyrase: utilise surenroulement positif pour donner du surenroulement négatif: permet ouvrir brins

Question 19

que permettent les topoisomérases

Answer 19

activité cassure brin, passage de brin, ligation
participent dans toutes étapes de réplication

Question 20

gyrase vs topoisomérase

Answer 20

gyrase: introduit surenroulement

topoisomérase: enlève

Question 21

quelle est la topologie de ADN pendant élongation de réplication

Answer 21

surenroulement positif en avant fourche peut passer en arrière pour former des précaténanes

précaténanes enlevés par topo IV

Question 22

quelle est la topologie de ADN pendant terminaison de réplication

Answer 22

deux fourches convergent à ter se qui cause superenroulement positif qui ne peut être enlevé

supertours diffusent en arrière: enlever par topo IV

séparation topologique termine réplication

surenroulement négatif favorise éloignement et décaténation

Question 23

qu’est-ce que la décaténation

Answer 23

séparation finale des chromosomes
(fait par topo IV pour enlever surenroulement négtif)

Question 24

pourquoi ecq terminaison se fait seulement dans région ter

Answer 24

système Tus/ter bloque les fourches unidirectionnelles
(terA et terB)