cours 11 mcb2992

Question 1

quels sont les mécanismes de réparation de ADN (3)

Answer 1

• système de réparation spécifique
• système de réparation non-spécifique (généraux)
• réponse SOS

Question 2

quels sont les types de systèmes de réparation ADN spécifique

Answer 2

• désamination bases
• dommages causés par oxygène réactif
• dommages causé par UV

Question 3

quels sont les types de système de réparation ADN non-spécifiques/généraux

Answer 3

• système réparation mauvais appariement de base dirigé par méthylation
• réparation par excision de nucléotides

Question 4

qu’ont montré les expériences mesurant le temps de survie des cellules exposées aux rayons UV

Answer 4

que les cellules ont un système de réparation de ADN:
formation coude (survie jusqu’à un certain point)
s’il n’y avait pas ce mécanisme: formation droite

Question 5

en quoi consiste la désamination de bases

Answer 5

• perte groupe amine des bases ce qui change appariement des nt et cause des mutations ponctuelles (transitions)
• induit par T° élevé, agent désaminant (hydroxylamine, bisulfate, acide nitreux)
• exemple: C en U ou 5-méthylcytosine en T

Question 6

pourquoi ecq la désamination de base C en U explique pourquoi il n’y a pas de U dans ADN

Answer 6

pcq si avait U: comment différencier une mutation de C vs un vrai U

Question 7

comment se fait la réparation des désaminations des bases

Answer 7

1. glycosylase ADN (une pour chaque type de base donc très spécifique) brise lien glycosyl entre sucre et base
2. AP endonucléase apurinique/apyrimidique coupe lien phosphodiester 5’
3. ADN pol I ajoute bon nt
4. ligase lie

Question 8

quels sonts les dommages causés par l’oxygène réactif

Answer 8

• formes réactives: peroxyde, hydroxyl, superoxyde
• contrer par: superoxide dismutase, catalase, peroxydase

-induit par chaine respiratoire ou exposition UV

• exemple: base oxydée 8-oxoG: dérivé de G qui lie A (donc cause transversion)

Question 9

comment les dommages causé par oxygène réactif sont réparés

Answer 9

-prévention par MutT (phosphatase): 8-oxoGTP en 8-oxoGMP: empêche incorporation

si se lie dans ADN:
- MutY (glycosylase): enlève A en face du 8-oxoG
- MutM (glycosylase): enlève 8-oxoG

Question 10

que causent les dommages causés par UV

Answer 10

dimères de pyrimidine

Question 11

comment réparer les dimères de pyrimidine

Answer 11

photoréactivation:
- photolyase: contient FADH2, absorbe lumière, énergie utilisée pour séparer bases
- glycosylase spécifique peut enlever les dimères

Question 11

que reconnaissent les systèmes de réparation non-spécifiques

Answer 11

les distorsions dans double hélice causées par mauvais appariement de bases, glissement cadre lecture, incorporations analogues, alkylation

bref: quand changement ne sont pas extrêmes et qu’ils ne bloquent pas la réplication

Question 12

lors d’une réparation mauvais appariement de bases: comment savoir quelle base est erronée?

Answer 12

selon brin: matrice est méthylé alors que le nouveau brin ne l’est pas: coupe le brin non méthylé

Question 13

comment se fait la réparation des mauvais appariements de bases dirigé par la méthylation

Answer 13

1. dimère de MutS reconnait mismatch
2. hydrolyse 2 ATP
3. formation complexe avec dimère MutS, dimère MutL
4. MutH coupe séquence GATC non méthylé
5. exonucléase ExoI, ExoVII, ExoX, RecJ forme un gap: direction donné par UvrD
6. resynthèse par pol III (PAS POL I)
7. ligase

Question 13

quand est-ce la réparation par excision de nucléotides est utilisée

Answer 13

quand distorions sont majeures: bloque réplication (exemple dimère de pyrimidines)

Question 14

comment fonctionne la réparation par excision de nt

système réparation non-spécifique

Answer 14

1. dimère UvrA et un UvrB se déplace sur double hélice jusqu’à rencontrer grosse distortion
2. UvrA quitte et remplacée par UvrC
3. attachement a UvrB stimule activité endonucléase de UvrC: coupe 4 nt en 3’ et 7 nt en 5’
4. hélicase UvrD élimine oligonucléotide
5. ADN pol I synthétise
6. ligase

Question 15

par quoi est induite la réponse SOS

Answer 15

région simple brin ADN causé par réplication lorsque présence d’obstacle comme dimères de pyrimidine ou ARN pol

Question 16

comment ecq la réponse SOS est activé

Answer 16

de base: réprimer par LexA

1. RecBCD forment séquence simple brin pour RecA (activé quand lié à simple brin)
2. RecA interagit avec LexA et stimule son autoclivage: inactivation LexA
3. expression régulon SOS

Question 17

quels gènes sont retrouvé dans régulon SOS

Answer 17

uvrA,uvrB, recF, sfiA (inhibe FTsZ: donc pas division cellulaire)

Question 18

qu’arrive-t-il quand il y a bcp trop de dommages à ADN

dans la réponse SOS

Answer 18

1. quand beaucoup de RecA: peut autocliver umuD
2. UmuC+ 2 UmuD clivé = pol V
3. pol V + filament RecA activé = mutasome PolV
4. mutasome passe par dessus les obstacles et ajoute au hasard des nt (donc fait des erreurs) ce qui permet de terminer la réplication

Question 19

caractéristiques des polymérases translésions

Answer 19

• Pol II, Pol IV, PolV
• induite par SOS
• besoin de beta-clamp pcq pas processives

Question 20

que veut dire la mutagénèse adaptative

Answer 20

accélération de évolution (acquérir plus de mutations) pour pouvoir survivre en mauvaises conditions

Question 21

qu’arrive-t-il lors de la mutagenèse dirigée

Answer 21

utilisation de pol II, IV, V pour pouvoir induire le plus de mutations
- Rpos pour inhiber mutS (veut pas de réparation par pol III)
- veut réplication à partir R-loops (besoin de réplication pour induire mutations et pas de réplication à oriC en stress)
- cassure double brin