cours 3 mcb2992

Question 1

quelles sont les caractéristiques des promoteurs qui sont dépendant d’activateurs

Answer 1

• faible affinité pour ARN pol
• séq éloignée de -35 -10

Question 2

caractéristiques des activateurs qui lient les promoteurs

Answer 2

• compensent pour faible affinité entre promoteur et ARN pol
• lie souvent domaine carboxyl-terminal sous-unités alpha ARN pol

Question 3

que se passe-t-il si activateur se lie à promoteur qui à une forte affinité avec ARN pol

Answer 3

peut bloquer ARN pol de passer à phase élongation

Question 4

comment les protéines activatrices jouent un role dans le mécanisme de régulation de l’activation transcriptionnelle

Answer 4

• recrutent ARN pol au promoteur (souvent -35 -10)
• attachement alpha-CTD à élément UP pour stabiliser ARN pol
• protéine activatrice CAP lie promoteur et lie alpha-CTD
• lie deux opérateurs et permet contact entre sigma70 et alpha-CTD
• lie ARN pol avant d’attacher promoteur
• change espace -35 -10 pour aider ARN pol

Question 5

qu’est-ce que atténuation de la transcription

Answer 5

ARN pol commence transcription, mais termine avant d’atteindre l’opéron

Question 6

comment se fait atténuation de la transcription (de façon globale)

Answer 6

change conformation structure secondaire de ARN

Question 7

quelles sont les deux structures secondaires alternatives

Answer 7

• terminateur (avec suite de UUU)
• antiterminateur

Question 8

quel ARN régule l’atténuation de la transcription chez E.coli

Answer 8

ARNt trp

Question 9

quelles sont les 3 structures secondaires dans la région trpL de l’opéron trp E.coli ( dans atténuation de transcription)

Answer 9

1-2: fait pause transcription (permet bon rythme entre transcription/traduction)
2-3: antiterminaison
3-4: terminateur

Question 10

quelle est la différence entre régulation atténuation de opéron trp chez E.coli vs B. subtilis

Answer 10

chez B. subtilis: protéine TRAP interagissant avec ARN qui détecte niveau ARNt trp

Question 11

qu’est-ce que la protéine TRAP et dans quoi est-elle impliquée

Answer 11

11 sous-unités qui interagissent avec trp ce qui forme une roue: permet formation structure terminaison
TRAP est un répresseur

Question 12

quelle est l’action de TRAP sur la traduction

Answer 12

peut inhiber initiation traduction en interagissant avec triplets près de RBS

Question 13

comment ecq la protéine TRAP est régulé dans atténuation traduction de opéron trp de B.subtilis

Answer 13

• augmentation ARNt trp non chargé induit synthèse anti-TRAP
• anti-TRAP interagit avec TRAP empêche d’interagir avec ARN

Question 14

que fait un riboswitch

Answer 14

ARN qui controle sa propre expression en détecter signal directement (pas besoin intermédiaire ribosome)

Question 15

comment ecq ARNt trp régule atténuation transcription chez E.coli

(modulation ARN)

Answer 15

dans gène trpL: 2 codons trp: après transcription ribosome reste prise aux 2 codons trp si peu ARNt trp: pause permet former structure anti-terminaison

si excès ARNt trp: va tout de suite les ajouter: emprisonne structure 2: donc peut faire 3-4 (terminaison)

Question 16

deux rôles des riboswitch dans atténuation de transcription

Answer 16

1. senseur ARNt chargé
2. réguler métabolites

Question 17

comment fonctionne atténuation transcription par riboswitch senseur ARNt chargé

Answer 17

ARNt non-chargé peut se lier à 2 endroits du riboswitch
(anticodon: specifier loop, partie où aurait a.a.: structure anti-terminaison)

si ARNt chargé: peut pas se lier à structure anti-terminaison: donc formation terminaison

Question 18

comment fonctionne l’atténuation transcription par riboswitch pour réguler les métabolites

Answer 18

exemple: vitamines, bases, cofacteurs

si bcp de métabolite: se lie au riboswitch pour former structure anti-anti-terminaison: fait terminaison

si peu: anti-terminaison

Question 19

par quoi peut se faire la régulation de la dégradation des ARNm

Answer 19

• protéines qui changent stabilité (+ ou-)
• petit ARN qui change stabilité (+ ou -)

Question 20

par quoi se fait la régulation de l’initiation de traduction

Answer 20

• protéines interagissant avec TIR
• petits ARN
• ARN thermosenseur
• riboswitch

Question 21

qu’est-ce qu’un TIR

Answer 21

traduction initiation region
contient RBS et codon initiateur AUG

Question 22

quand est-ce que les riboswitch sont le plus utilisé chez les Gram - vs B.subtilis

Answer 22

Gram-: traduction
B.subtilis: transcription

Question 23

quelles sont les étapes supplémentaire pour assurer que les protéines soit active après leur traduction

Answer 23

• repliement adéquat
• modifications chimiques
• qté protéine peut affecter stabilité
• possible retro-inhibition par petites molécules

Question 24

qu’est-ce que la protéolyse régulée

Answer 24

changement de susceptibilité aux protéases pour changer la stabilité d’une protéine

utilisation adaptateur (aider protéolyse) et anti-adaptateur (stabilise protéine)

Question 25

comment se fait la régulation du facteur sigmaS par adaptateur/anti-adaptateur

Answer 25

sigmaS: relier à expression gènes pour réponse au stress, toujours synthétisé

• sans stress: adaptateur RssB lie sigmaS pour se faire dégrader par ClpXP
• avec stress: anti-adaptateur Ira lie RssB pour stabiliser sigmaS

Question 26

comment se fait la régulation post-traductionnelle par retro-inhibition

Answer 26

produit final interagit avec première enzyme de la voie métabolique pour l’inhiber