cours 5 mcb2992

Question 1

quel est l’avantage de régulation la synthèse des ribosomes et ARNt

Answer 1

une des façon majeure de conserver énergie

Question 2

pourquoi ecq c’est si demandant de synthétiser ribosomes et ARNr

Answer 2

chaque ribosome est fait de plus de 50 protéines et ARNt

Question 3

quelles sont les protéines ribosomales

Answer 3

rps : pour petite sou-unité 30S
rpl: grande s-u 50S
L11: 11e protéine ribosomale qui se lie à 50s codée par gène rplK (K= 11e lettre alphabet)

54 gènes pour 54 protéines ribosomales

Question 4

comment ecq régulation protéines ribosomales est relié aux ARNr

Answer 4

les deux sont synthétisés indépendamment MAIS jamais excès ARNr ou protéines ribosomales

Question 5

taux de synthèse ARNr est régulé selon taux synthèse protéines ribosomales ou inverse

Answer 5

taux synthèse protéines se fait selon taux synthèse ARNr

Question 6

comment se déroule la régulation des protéines ribosomales

Answer 6

autorégulation pendant traduction: 1 protéine de l’opéron va inhiber tout opéron par couple de la traduction

Question 7

comment fonctionne le couplage de la traduction sur la régulation des protéines ribosomales

Answer 7

1. TIR du 2e gène de opéron est bloqué dans structure secondaire
2. traduction 1er gène défait la structure secondaire grâce au ribosome et permet traduction 2e gène

Question 8

comment se fait la régulation opéron rlpK-rplA chez E.coli

Answer 8

L1 (rlpA) se lie au TIR de de rplK (début opéron) quand il y a peu ARNr

si présenceARNr: L1 se lie avec ces ARNr, permet traduction L11

Question 9

qu’est-ce que le dosage génique

Answer 9

expression des opérons des protéines ribosomales est régulée

si normalement 1 copie de gène fait 2 protéines et que je double le nombre de copies du gène, il y a quand même production de 2 protéines (pas 4)

Question 10

comment ecq les ARNr 16,23,5S et les ARNt sont synthétisés en même quantité

Answer 10

1 long ARN précuseur contenant les trois ARNr avec ARNt entre pour donner même quantité

Question 11

que sont les opéron rrn et combien y en a-t-il

Answer 11

pour ARNr

e.coli: 7
B.subtilis: 10

Question 12

comment ecq la synthèse des ribosomes et ARNt se fait rapidement

Answer 12

1. plusieurs ARNpol sur même opéron rrn
2. promoteurs forts
3. séquence UP qui active promoteur (interaction CTD-alpha)
4. activation protéine FIS (interagit avec ADN pour meilleure action promoteur)

Question 13

régulation ARNr et ARNt se fait en fonction de quoi

Answer 13

taux de croissance

Question 14

la transcription des opérons rrn commence par quel nt

Answer 14

6/7 de e.coli: ATP (7e GTP)

Question 15

comment se déroule la régulation des ARNr/ARNt selon le taux de croissance

Answer 15

promoteurs forte affinité avec ARNpol: bon complex fermé mais complex ouvert instable

si riche (bcp ATP/GTP): plus de codons initiateurs peuvent entrer dans ARN pol pour former complex ouvert

si pauvre: moins codons dans ARNpol, moins de complex ouvert, moins d’ARNr/ARNt

Question 16

quelle est l’autre régulation pour les opérons rrn

autre que régulation selon taux de croissance

Answer 16

réponse stringente

Question 17

quand a lieu la réponse stringente

Answer 17

quand pénurie nutriment essentiel: exemple un a.a. plus dans milieu (cellule affamée)

Question 18

à quoi sert ppGpp

Answer 18

médiateur réponse stringente

Question 19

comment former ppGpp

Answer 19

GTP + 2 P de ATP (par RelA ou SpoT) = pppGpp
pppGpp avec phosphatase= ppGpp

Question 20

différence RelA et SpoT

réponse stringente

Answer 20

RelA: produit ppGpp
SpoT: produit ET dégrade ppGpp

utilisation SpoT dans conditions autres que pénurie (exemple stress) sinon utilisation RelA

Question 21

comment ecq production ppGpp stimulé

Answer 21

si manque un a.a: ARNt non chargé va se lier au site A du ribosome

va stimuler RelA

Question 22

que fait ppGpp

Answer 22

inhibe activité promoteurs rrn: diminue stabilité complexe ouvert: empêche transcription ribosomes/ARNt

activité positive sur facteurs de stres sigmaH et sigmaE

Question 23

ecq effet positif ppGpp est direct ou indirect

Answer 23

les deux
- direct: ppGpp interagit avec ARNpol pour activer certians promoteurs
- indirect: décroche ARNpol des opérons rrn pour permettre d’aller exprimer d’autres gènes

Question 24

qu’est-ce que DksA et que fait cette protéine

Answer 24

partenaire ppGpp dans réponse stringente
augmente effet positif et effet négatif de ppGpp