Cours 6 Flashcards
4 types de polymérases
- ADN dépendante de l’ADN (DNA pol1 et 3)
- ARN dépendante de l’ADN (primase)
- ADN dépendante de l’ARN (télomérase)
- ARN dépendante de l’ARN (arn génomique viral)
Werners syndrome et progeria
- syndrome de vieillissement accéléré
- télomères plus courts que la normale
Vaccin viral vector
utilise virus inoffensif qui est altéré et qui contient le code génétique
Vaccin RNA
Contient arn messager du virus
Vaccin Whole virus
Contient une version plus faible ou inactivée du virus
Vaccin Protéine
Utilise des fragments de protéines du virus
Fourche de réplication de l’ADN
- A,T,G,C
- Colonne sucre-phosphate
Pourquoi plus facile de démarrer réplication avec A et T
- 2 ponts H au lieu de 3 (CG)
Origine de la réplication de l’ADN procaryote
1- protéine DnaA s’attache à l’ADN proche du site d’initiation
2- ADN se courbe
3- Ouverture de la double hélice ADN afin de démarrer la réplication
_____ catalyse le déroulement de la double hélice
ADN hélicase
Complexe de réplication complet
holoenzyme
La polymérase ADN ne peut démarrer la réplication, elle dépend de ____
la primase
Réplication du brin lagging
1- Initiation de la synthèse des amorces d’ARN par l’ADN primase
2- extension 5’ -> 3’ de l’amorce ARN et dissociation de l’ADN primase
3- ARN pol3 synthétise 5’ -> 3’ ADN au niveau des 3’OH libre de l’amorce ARN
4- élimination simultanée de l’amorce ARN par l’activité exonucléase 5’->3’ de adn pol1 et synthèse 5’->3’ par l’activité polymérase de adn pol1
5- adn ligase lie brins
2 rôle adn polymérase
1- reconnaissance du bon nucléotide à ajouter (pont H)
2- polymérisation en 3’ du brin nouvellement synthétisé (lien covalent)
Activité 5’ -> 3’ principale de
polymérisation de l’ADN
Activité 3’->5’ exonucléase permet …
d’éliminer les mauvais nucléotides durant l’élongation: contrôle de qualité qui augmente la fidélité de la réplication
Activité 5’->3’ exonuclease (DNA pol1) permet…
éliminer fragments okazaki
Réplication d’un chromatide
1- initiation de réplication à une origine
2- réplication bidirectionnel à une origine. Initiation à la deuxième origine
3- réplication bidirectionnel continue jusqu’à ce que les terminaisons soient atteintes
Comment l’ADN polymérase augmente sa processivité?
- grâce à l’anneau formé par les sous unités Beta, qui attachent solidement l’enzyme à l’ADN
Synthèse processive
enzyme se dissocie après chaque ajout de monomère
Synthèse distributive
- mécanisme ou enzyme effectue des cycles successifs de catalyse en restant associé à son substrat
- polymérase reste associé au brin matrice et ajoute plusieurs nucléotides sans se dissocier à chaque cycle
Brin continu
- synthétisé de 5’ à 3’
- même direction que fourche de réplication
- adn pol3 ajoute nucléotide avec à partir de amorce (primase)
Brin discontinu
- synthétiser de façon discontinu sous forme de courts fragments d’Okazaki
- reliés par adn ligase pour former brin continu
Progeria
- vieillissement prématuré
- 15-25 ans espérance
- mutation ponctuelle (un nucléotide) de novo
- division cellulaire limitée
- pas de traitement
- télomère plus courts
Qu’est-ce qui est muté pour les gens ayant la progeria
- Progerine: version tronquée de la prélamine A due à une délétion
Quel gène est muté dans la progeria?
- LMNA qui code pour la protéine lamin A
- enveloppe devient anormal (rugueuse)
- farnesyl n’est pas enlevé de la lamin A et s’empile sur enveloppe
Réplication brin discontinu
1- initiation synthèse amorce arn par adn primase
2- extension amorce arn 5’->3’ et dissociation de adn primase
3- adn pol3 synthétise 5’->3’ (3’-OH amorce arn)
le problème de l’amorce du brin discontinu (télomères)
Pas d’extension 3’OH (amorce)
Réplication adn et raccourcissement des télomères
- élimination fragment okazaki
- réplication brin continu
- réplication brin discontinu
- élimination fragment okazaki
Limite de Hayflick
- limite de division cellulaire chez les cellules différenciées (environ 52 chez humain)
corrélation entre âge et la longueur des télomères chez l’humain
- longueur des télomères mesurés chez les macrophages humains
- plus l’âge avance plus on observe une diminution dans la longueur des télomères
Enzyme télomérase
- adn polymérase dépendante de l’ARN
- constitué de plusieurs protéines et d’un brin arn matrice
- permet de maintenir l’intégrité des extrémités des chromosomes
Expression normale de la télomérase
- cellules souches embryonnaires expriment la télomérase
- cellules somatiques (différenciées) expriment peu ou pas de télomérase
Comment télomérase résout le problème terminal de l’Amorce
- Télomérase se lie à l’extrémité 3’ du brin parental
- allonge extrémité 3’
- Translocation
- répète extension et translocation plusieurs fois
- Complète le brin complémentaire par la adn polymérase qui utilise une nouvelle amorce
Cancer et immortalité
- expriment la télomérase, ce qui les rend mortelle
Structure télomère humain
- POT-1 : protection du télomère
- TRF: facteur de liaison de répétition des télomères
Virus à arn
- génome arn immédiatement infectieux quand introduit dans cellule
- génome ARN (+) d’un virus à ARN sert aussi de ARNm
- réplication génome cytoplasmique
1ere étape virus à arn
synthèse protéique (synthèse RdRp)
Synthèse protéique d’un virus à arn
1- traduction de la RdRp
2- synthèse du brin ARNc par RdRp
3- synthèse de l’ARN viral à partir du ARNc par RdRp
RdRP
ARN polymérase dépendante de l’ARN
Vaccins à arn conventionnels
- arn exposé à la dégradation par ribonucléases
- entrera pas dans les cellules et ne sera pas lu par ribosomes
- sera attaqué et éliminé par SI
Particule lipidique
- protège ARN de la dégradation par RNases
- permet entrée dans la cellule
- protège arn du système immunitaire
Fonctionnement vaccin à arn conventionnel dans la cellule
- vaccin est un ARNm encapsulé
- encode protéine immunogène qui activera le système immunitaire de l’hôte
Vaccins auto-amplifiés
- arn auto amplifiants ont montré expression antigène améliorée à des doses plus faibles par rapport à l’ARNm conventionnel, suggérant que cette technologie peut améliorer l’immunisation
nsP1/2/3/4
protéine non structural qui facilite coiffage arn et sa réplication
