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Génétique (GNT305) > Cours 3 > Flashcards

Cours 3 Flashcards

1
Q

Antibiogramme

A

déterminer la sensibilité d’une souche bactérienne à différents antibiotiques

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2
Q

Plus de prescriptions =

A

plus de résistance des bactéries, moins sensibles

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3
Q

Microbiome (ou microbiote)

A

Collection de microo qui vivent dans un environnement spécifique

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4
Q

Profil microbien ont un impact sur la santé (souris)

A
  • souris germ free a été colonisé par un gros microbiome ce qui a donné une augmentation du body fat
  • celle avec petit microbiome a bcp moins grossi
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5
Q

Cancer du colon

A
  • 3e cancer au monde
  • 2e + dangereux
  • dur à détecter car asymptomatique
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6
Q

Évolution du microbiote avec le cancer du colon

A

driver bacteria outcompeted by passenger bacteria

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7
Q

H pylori induit cascade oncogénique

A
  • CagA injectée dans cellule gastrique et active EGFR
  • Accumulation B catenine qui stimule transcription de gène qui favorise carcinogénèse
  • arrêt apoptose
  • diminution fct protectrice épithélium
  • augmente prolifération cellulaire
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8
Q

Infos générales sur les bactéries

A
  • pas de noyau, procaryote
  • un seul chromosome (haploïde)
  • Prototrophe
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9
Q

Prototrophe

A
  • peut croître sur milieu qui ne contient que le minimum nécessaire de nutriments
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10
Q

Combien de crossover nécessaire pour la recombinaison entre une molécule linéaire et une circulaire?

A

2
(Donneur: ADN linéaire)

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11
Q

Qu’arrive-t’il si un seul crossover pour la recombinaison entre un adn linéaire et circulaire?

A

Produit un chromosome linéaire instable

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12
Q

Combien de crossover nécessaire pour la recombinaison entre deux molécules circulaires?

A

Un seul

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13
Q

Transformation

A

prend adn libre

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14
Q

conjugaison

A

transfert d’adn d’une bactérie à une autre

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15
Q

Transduction

A

Transfert d’adn bactérien par un bactériophage

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16
Q

Transformation chimique (en labo)

A
  • Choc chimique ou électrique
  • induction du plasmide dans la cellule
  • réplication du plasmide (indépendante du chromosome)
  • souche résistante à ampicilline et tétracycline
17
Q

Transformation naturelle

A

1- récepteur de liaison à l’ADN sur bactérie compétente lie adn double brin. Lorsque adn entre la cellule, un brin est dégradé et l’autre est recouvert d’une protéine de liaison
2- brin seul est intégré dans le chromosome de la cellule receveuse, produisant un hétéroduplex d’ADN avec des allèles différents dans les deux brins

18
Q

Découverte de la transformation avec Streptococcus pneumoniae

A
  • Une souche virulente lisse et une souche non virulente rugueuse
  • Souche lisse seule souris survie
  • Mélange des deux souches = souris meurt
19
Q

Conjugaison du T-DNA bactérien vers une cellule de plante

A

T-DNA (tumeur dna) transférer dans le génome de la plante

20
Q

Transfert de gène par conjugaison dans une plante

A

1- plasmide est enlevé de la bactérie et le T-DNA est coupé par une enzyme de restriction
2- DNA étranger est coupé par la même enzyme
3- DNA étranger inséré dans le T-DNA du plasmide
4- plasmide remis dans bactérie
5- la bactérie utilisée pour insérer le T-DNA avec le gène dans le chromosome d’une cellule de plante
6- la cellule de plante grandi en culture
7- toutes cellules de la plante ont le gène étranger et peut avoir nouveaux traits

21
Q

Conjugaison entre deux bactéries

A

1- Pili F du donneur F+ fait contact avec receveur F- et met les cellules côte à côte. Gènes sur facteur F créer pont conjugaison. Receveuse reçoit infos
2- Rolling circle replication transfère un brin du facteur F dans la cellule réceptrice
3- Transfert du facteur F est complété. Deux cellules F+

22
Q

Importance médicale des transposons (naissance facteur R)

A

1- La recombinaison entre les éléments IS1 dans le plasmide non conjugatif R et un plasmide conjugatif RTF produit un plasmide conjugatif R avec le gène de résistance pour la streptomycine
2- La recombinaison médiée IS1 entre le plasmide conjugatif résistant à la streptomycine et un autre plasmide non conjugatif R produit un plasmide avec gène pour streptomycine et tétracycline

23
Q

Phage

A

virus bactérien
spécifique aux bactéries

24
Q

Transfert d’ADN phagique

A
  • capside du phage contient le virus adn ou arn
  • genome viral est injecté dans la cellule bactérienne
25
Q

Vibrio cholerae

A
  • cause choléra
  • contient pas info pour virulence
  • doit être infectée par phage pour que bactérie infecte
26
Q

Cycles transfert ADN phagique

A
  • Cycle lytique: S’intègre, fabrique phage qui vont lyser cellules et attaquer autres cellules
  • Cycle lysogène: Reste dans ADN et ne fait rien
27
Q

Infection et résistance de la cellule procaryote (par phage)

A
  • majorité lysent
  • minorité reste intacte et devient immune à seconde infection par le même phage
28
Q

Immunité bactérienne

A

1- phage infecte bactérie
2- bactérie acquiert section adn phagique dans son chromosome
3- bactérie devient “vaccinée” contre ce type de phage
4- immunité se transfère aux cellules filles

29
Q

Pourquoi met fragment proche du promoteur?

A

pour s’assurer de la transcription de l’ADN étranger

30
Q

Action nucléolytique du crRNA

A
  • protéine CAS reconnaît séquence structure du “Repeat” (permet de reconnaître cible qu’on veut détruire)
  • la séquence “Repeat” est reconnue comme l’ADN de l’hôte et n’est pas utilisée pour déterminer cible à couper
31
Q

Cas3

A

coupe adn simple brin présent dans le R loop

32
Q

Sommaire des CRISPR

A
  • protège bactéries contre les infections phagiques
  • immunité acquise durant infection antérieure
  • une fois immunité pour type de phage, spécifique aux phages de la même famille
33
Q

Potentiel thérapeutique CRISPR

A

peut enlever et faire fonctionner dans cellule humaine

34
Q

Remodelage de génome

A
  • reprogrammer un gène
  • bloquer gène (codon stop)
  • corriger expression d’un gène avec l’ajout d’une séquence donatrice
35
Q

Thérapie génique par CRISPR

A
  • cells sont enlevés du patient
  • CRISPR/Cas9 sont mis dans la culture cellulaire
  • cells modifées remis au patient
36
Q

Étapes CRISPR

A

1- PAM reconnaît ADN phage
2- qqch le coupe et intégré dans CRISPR sous forme de spacers
3- séquences transcrites en ARN. ARN coupé
4- Si 2e attaque, ARN dirige CAS 3 vers séquence virale et coupe ADN du bactériophage

37
Q

Knock out CRISPR

A
  • désactive/inactive gène
  • CAS9
38
Q

Knock in CRISPR

A
  • insérer un gène
  • CAS9

Génétique (GNT305) (11 decks)

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