Cours 10 Flashcards

1
Q

le nombre de différences entre les séquences d’ADN de 2 organismes donne une indication sur quoi?

A
  • une indication directe, objective et quantitative de la distance évolutive qui existe entre eux
  • par exemple gène codant pour arn ribosomique petite 16s(pro) vs 18S (euc), large 23s(pro) vs 28s (euc)
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2
Q

Les archéobactéries apparaissent plus proches des _____ en ce qui concerne la transmission de l’info génétique, mais plus proches des ____ en ce qui concerne le métabolisme et la conversion de l’énergie

A
  • eucaryotes
  • bactéries
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3
Q

Que représente chaque birufication?

A

un ancêtre commun

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4
Q

Que représente la longueur des lignes dans l’arbre?

A
  • le nb de changements de nucléotides qui se sont produis dans chaque lignée au cours de l’évolution
  • légende: 1 changement = 10 nucléotides
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5
Q

Certains gènes évoluent rapidement, alors que d’autres sont conservés. Quel genre de gène est conservé?

A
  • gène qui code pour protéine essentielle, hautement spécialisée et non redondante n’est pas modifiée facilement
  • erreur survient = cellules défectueuses éliminées
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6
Q

Régions intergéniques (ITS1 et ITS2)

A

permettent de différencier les genres et espèces de levures quand sont en population mixte et isolée

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7
Q

Évolution des procaryotes/eucaryotes unicellulaires conduit à l’émergence des organismes pluricellulaire

A

1- nouveaux gènes proviennent de gènes existants
2- si mutation = amélioration alors conservée
3- si mutation = aucune différence alors conservée ou non
4- si mutation = dommage alors pas conservée
5- régions non codantes changent, codantes sont constantes
6- séquences codantes qui produisent ARNs ribosomiques hautement conservées

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8
Q

quel genre de gène code pour une molécule commune à tous les organismes?

A

gène produisant ARNr

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9
Q

duplication de gène

A
  • donnent naissance à des familles de gènes apparentés dans une même cellule
  • résultat de réplication incomplète ou partielle (glissement lors de la réplication)
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10
Q

Orthologues

A
  • gènes qui dans deux espèces différentes dérivent d’un gène d’un ancêtre commun à ces deux espèces
  • 2 orthologues codent pour 2 protéines qui ont même fonction
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11
Q

Paralogues

A
  • gènes proches provenant d’une duplication dans un même génome mais qui n’ont pas même fonction
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12
Q

Glissement lors de la réplication (expansion génique)

A
  • Réplication
  • DNA polymérase se décroche
  • recule en amont et se réapparie
  • duplication région déjà répliquée
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13
Q

Cladogramme de gène

A
  • code pour protéines paralogues
  • dérivés d’un gène ancestral
  • longueur = importance de divergence entre les différences séquences codantes
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14
Q

Arbre phylogénétique

A
  • met en évidence les différences entre les séquences polypeptidiques pour une même séquence d’une protéine donnée entre deux espèces différentes
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15
Q

L’évolution des gènes est le fruit de quelles innovations génétiques?

A
  • mutation intragénique
  • duplication d’un gène
  • recombinaison homologue
  • transfert horizontal (entre deux organismes)
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16
Q

Recombinaison ectopique inégale (diversification)

A

Crossover inégal lors de la méiose entre deux paires de chromosomes qui sont alignés incorrectement

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17
Q

Quel est le mécanisme le plus fréquent pour l’expansion génique?

A

Glissement réplicatif

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18
Q

Rétrotransposition (duplication)

A
  • ARN cellulaire de l’hôte est converti en cDNA par RT du rétrovirus et produit rétrogène
  • se réintègre au génome de l’hôte produisant seconde copie
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19
Q

Duplication génome entier

A

Duplication

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20
Q

Aneuploidie (diversification)

A
  • nb anormal chromosome
  • mauvaise ségrégation des chromosomes homologues ou chromatides soeurs lors de la méiose
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21
Q

Mutation intragénique

A

mutation à l’intérieur d’une séquence codante

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22
Q

Duplication de gène

A
  • produire deux gènes identiques qui pourront diverger au cours de l’évolution
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23
Q

Mélange ADN

A

résultat d’une recombinaison homologue égale ou inégale, produisant une séquence codante hyrbide

24
Q

Transfert horizontal plus actif chez…

A

organismes procaryotiques que eucaryotes d’organismes multicellulaies

25
Q

organisation des gènes sur chromosome humain

A

a) bras gauche chrom22 constitué de courtes séquences répétées adn, empaquetées sous forme hétérochromatine (transcri inactive)
b) expansion par facteur 10 portion chrom22
c) portion étendue montre longueur tot de plusieurs gènes
d) L’organisation intron-exon d’un gène typique est montrée après une nouvelle expansion par un facteur dix. Chaque exon (rouge) code pour une partie de la
protéine, tandis que la séquence d’ADN des introns (gris) sera enlevée des ARN messagers matures.

26
Q

Les humains diffèrent les uns des autres par une moyenne de

A

un nucléotide sur mille

27
Q

paradoxe de la valeur c

A

la taille du génome d’un organisme n’est pas proportionnelle à la complexité de cet organisme

28
Q

alpha globine humaine

A
  • chrom16
29
Q

B globine humaine

A
  • chrom11
  • exprimé au stade adulte
30
Q

gène avec longue séquence codante pour protéine de masse moléculaire élevée =

A

combinaison d’exons provenant de gènes différents (dupli exons formant répétition)

31
Q

Conséquence mécanisme de duplication

A

une inactivation (mut) unique ne révèle pas tous les rôles d’un gène lors des analyses génétiques

32
Q

Qu’a permis la duplication des gènes?

A
  • développement d’une forme de vie plus complexe
  • copies de secours
  • augmenter complexité et sophistication
33
Q

Phylogénie moléculaire (avec/sans racine)

A
  • branches terminales visent organismes à étudier
  • bifurcation = ancêtre commun
  • associations entre organismes = sans racine
  • origine de laquelle un organisme dérive = arbre avec racine
34
Q

arbre à caractère évolutif

A

montre existence potentiel d’organismes communs qui ont divergés et évolués

35
Q

DIAPO 34 importante

A

*

36
Q

Principe de parcimonie

A
  • établit que l’arbre le plus probable est celui généré par le plus petit nombre de mutations
  • 2 gènes avec le nb de changements le plus faible sont les plus rapprochés
37
Q

Méthode construire arbres phylogénétiques

A
  • alignements des séquences afin de permettre comparaison entre elles
  • déterminer pourcentages de similarités
  • regroupement à partir de pourcentage
  • placer séquences aux extrémités de chacune des branches de l’arbre
38
Q

filiation

A

lien de parenté unissant A à son descendant

39
Q

Taux évolution

A

nb diff/a.a

40
Q

Pourquoi codons varient surtout à la 3e position?

A
  • pas de conséquence
  • pas de changement de AA
41
Q

substitution synonyme

A

change pas a.a

42
Q

substitution non silencieuse

A

change a.a

43
Q

Taux d’évolution varie selon

A

la séquence génétique

44
Q

Spéciation

A
  • caractéristiques phénotypiques: apparence
  • génétique (reproduction): espèces apparaissent lorsqu’une population d’organismes se divisent en 2 groupes génétiquement distincts qui ne peuvent plus se reproduire entre des individus à partir de chacun des groupes respectifs.
45
Q

Isolement ou barrière prézygotique

A

1- barrières physiques (rivières, océans, etc)
2- habitats différents
3- isolement temporel (saison reproduction différente)
4- comportements différents
5- isolement mécanique
6- incompatibilités

46
Q

Isolement post zygotique

A
  • arrêt embryonnaire
  • infertilité
  • sélection naturelle
47
Q

Allopatrique

A

en présence d’une barrière géographique, 2 sous populations sont séparées et deviennent reproductivement isolées.

48
Q

Sympatrique

A

sans barrière géographique, 2 sous-populations deviennent reproductivement isolées.

49
Q

spéciation implique que…

A

2 espèces deviennent différentes ne pouvant se reproduire entre elles.

50
Q

modèle isolement reproductif

A
  • après réunification, majorité de croisements improductifs (hybride peut naître mais stérile)
  • deux populations séparées divergent en deux espèces
51
Q

Blynx

A
  • lynx canada + lynx roux
  • fertile
52
Q

chien loup

A
  • chienne + loup
  • fertile
53
Q

grolar

A
  • ours polaire + grizzli
  • fertile
54
Q

mule/mulet

A
  • âne + jument
  • stérile
55
Q

Mécanisme de spéciation

A
  • population similaires
  • efficacité repose sur fonction des cellules germinales
  • bindines: récepteurs de spermato (ADAM) permettent fixation à ovocyte