Cours 4 Flashcards
transposons
- 44% génome humain
- passe d’un endroit à l’autre dans le génôme
importance transposons pour évolution
- accélère modifications
- peut générer certaines maladies
Bénéfices transposons chez l’humain
- suppression formation tumeurs
- régule l’accès à la chromatine
- aide au développement du cortex cérébral
- activation de l’ostéogénèse
Désavantages transposons chez l’humain
- stimule inflammation chroniques dans les maladies auto immunes
- promeut la tumorigénèse
- stimule inflammation dans les maladies neurologiques
3 types transposons
- cut and paste
- replicative
- retro
Cut and paste
- séquence adn est transférée d’un site à l’autre, entre site donneur et accepteur
- mécanisme le plus simple
Élément IS : Insertion sequence
- Ce que transposase reconnaît
- extrémités répétées inversées
Étapes IS
1- les deux brins de adn cible sont clivés à deux sites différents
2- Élément IS est inséré dans le trou créer par clivage de adn cible
3- synthèse adn comble vide de chaque bord de IS, ce qui produit une duplication direct du site cible
Les éléments transposables peuvent s’insérer dans des sites d’ADN ou il n’y a pas d’homologie de séquence. V ou F
V
Les transposons ont besoin de recombinaison homologue. V ou F?
F
Les transposons peuvent s’insérer dans n’importe quelle séquence d’ADN, de manière aléatoire, par recombinaison non homologue. V ou F
V
Que se passe-t’il quand deux IS sont suffisamment proches?
agissent comme un transposon unique
Transposons composites
deux is suffisamment proche
Modification génétique par utilisation de transposons (drosophiles, gène ry+ yeux rouges)
1- dna étranger est inséré dans un élément P incomplet dans le plasmide
2- Un élément P complet est inséré dans un autre plasmide
3- les deux plasmides sont mélangés dans la même solution
4- mix de plasmide mis dans oeuf ry- (yeux bruns)
5- Transposase de l’élément P complet catalyse l’excision de l’élément P incomplet de son plasmide
6- élément p excisé est inséré dans un chromosome de l’embryon
7- embryon devient adulte
8- progéniture de cette mouche peut avoir ry+
CAR T cell
- enlève du sang pour avoir T cells
- modifie lymphocyte t et insère anticorps (CAR) contre cellules cancéreuses (transposition)
- en fait croître des millions sur géloses
- réinjecte aux patients malades et anticorps reconnait cellules cancéreuses
- CAR T cells se lie aux cancer cells et les tuent
Transposons réplicatifs
- élément transposable est transféré d’un site à un autre, tout en restant au site original
- augmentation nb de copies de l’éléments transposable
Transposition réplicative (étapes)
1- transposase encodée par Tn3 catalyse la formation d’une cointégration entre les plasmides donneurs et receveurs. Tn3 est répliqué pour qu’il y ait une copie de chaque élément à chaque jonction
2- Resolvase produite par tnpR gene assure la médiation de la recombinaison entre les deux éléments Tn3
3- Plasmides donneurs et receveurs se séparent avec chacun une copie de Tn3
Rétrotransposons
- élément transposable transcrit en arn
- arn converti en adn complémentaire
- adn s’intègre dans chromosome
Cycle de vie rétrotransposons Ty1 de la levure
1- Ty1 est transcrit en arn
2- arn est reverse transcriptase en adn par un enzyme encodé par le gène TyB
3- ADN inséré dans chromosome ce qui crée une nouvelle copie de Ty1
Ou est excisé Ty1 (levure)
hors du chromosome
Est-ce que le rétrovirus du VIH est un rétrotransposon?
Non, il a un gène de plus (env)
Cycle de vie VIH
1- fusion des membranes (virus et cellule)
2- capside viral libéré dans cytoplasme
3- arn viral libéré, reverse transcriptase
4- intégration adn viral dans chromosome du lymphocyte
5- excision, capside fusionne et créer membrane viral
Protéines VIH
- gag (cofacteur)
- pol (reverse transcriptase)
- env (enveloppe)
que permet gène env
permet au rétrotransposon de devenir infectieux
