Cours 5 Flashcards

1
Q

Pourquoi utiliser des primates non-humains pour la recherche en neuroscience?

A

• Similaire aux humains génétiquement, anatomiquement et sur le plan comportemental
–>permet aux scientifiques d’étendre les résultats expérimentaux
aux théories de fonctionnement du cerveau humain
• Capables d’être entrainés à effectuer des comportements et tâches plus complexes que d’autres modèles animaux
–> permet aux scientifiques d’examiner l’activité neurale alors que les animaux effectuent des tâches identiques ou similaires à celles effectuées par les humains dans des études psychophysiques ou cognitives

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Q

Quels sont 4 exemples de sujets de recherche étudiés chez les primates non-humains?

A
  • Quelle est la base neurale des fonctions cognitives supérieures? primates sont + semblables à nous sur le pt de la cognition, quand on étudie les aspects cog, ils sont très reliés aux aspects sensoriels et moteurs car une partie se passe dans les syst plus bas
  • Comment les signaux sensoriels sont-ils traités et combinés pour la perception et l’action?
  • Comment planifier et contrôler nos actions motrices?
  • Désordres neurologiques
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3
Q

Quels sont les aspects généraux des expériences chez les primates non-humains? (5)

A

• Les singes utilisés le plus fréquemment incluent le macaque rhésus (Macaca mulatta) et le singe cynomolgus (Macaca fascicularis)
• Travailler avec des singes implique un grand inverstissement de ressources et de temps
• L’utilisation des singes est minimisée autant que possible
– typiquement, 1-3 singes sont utilisés dans une période de 3-5 ans
• Les expériences sur les primates mettent l’accent sur l’enregistrement des propriétés de réponse neurale alors que des animaux entraînés effectuent des tâches
comportementales
– la puissance statistique est atteinte non pas par le nombre d’animaux étudiés mais plutôt par le nombre de neurones enregistrés
• Chaque expérience est typiquement effectuée avec un minimum de 2 animaux pour assurer la reproductibilité des résultats

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4
Q

Quelle est la structure de base des expériences chez les primates non-humains? (7)

A
  1. Conception d’une tâche expérimentale pour répondre à une question spécifique
    – Quelle est la structure de la tâche?
    – Comment les stimuli seront-ils présentés?
    – Comment le comportement sera-il mesuré?
    contrairement à quand on travaille avec rongeurs ou humains (bcp de sujets), avec primates, on doit préciser les tâches expérimentales bcp +, on peut pas changer les paramètres d’un exp au cours de l’exp (on peut pas les entrainer à faire une tâche +ieurs fois), on fait les exp pilotes chez l’humain pour bien connaitre tâche avant de pouvoir construire exp chez singes
  2. Assembler ou construire l’équipement expérimental nécessaire pour effectuer cette tâche et l’acquisition des données
  3. Préparer un animal pour l’entrainement (familiarisation avec le laboratoire, l’équipement et le personnel; parfois chirurgies pour implanter des appareils de mesure du comportement)
  4. Entrainer l’animal à effectuer la tâche
  5. Procédure chirurgicale pour permettre l’accès au cerveau
  6. Enregistrements neuraux alors que l’animal effectue la tâche
  7. Analyse des données où l’activité neurale est corrélée avec le comportement
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5
Q

Quels sont 4 méthodes de présentation du stim?

A
  • Stimulus visuel sur un écran
  • Stimulateur tactile; test traitements somatosensoriels
  • F ou perturbations appliquées sur bras robotique; pour voir bases neuronales de l’apprentissage moteur
  • Système de mouvement pour bouger le singe dans l’espace; Pour comprendre comment créé estimations de mvmts dans l’espace et comment on utilise l’info pour prod nos mvmts, comment on coordonne nos actions complexes et comment on crée nos estimations pour pouvoir les faire
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6
Q

Comment on mesure la performance comportementale?

A

Mouvements des yeux:
- Scleral search coil technique
• Le singe est assis avec la tête centrée dans le champ magnétique
• Lorsqu’il bouge les yeux, le champ magnétique induit de petits courants dans le “eye coil” qui sont mesurés comme des changements de potentiel proportionels à la position de l’oeil
- Oculomètre
• Système utilisant une caméra pour suivre le mouvement des yeux
• Souvent ce type système suit la position de la pupille
• Résolution temporelle et spatiale limitée comparativement à une approche utilisant un système de champ magnétique
Mouvement du bras:
- Bras robotisé ou interface manipulable et Système de caméra pour mesurer trajet
- Écran tactile Mesure la position de la main au début et à la fin du mouvement mais pas le trajet (mesure prise de décision)
Activité muscu:
Enregistrements électromyographiques (EMG)
• Enregistrement des potentiels électriques générés par les cellules musculaires en réponse à une stimulation neurale ou électrique
Électrodes de surface, Électrodes percutanées, Électrodes implantées chroniquement

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7
Q

Comment on fait l’entrainement comportemental? Quelles sont les étapes de base?

A

• Consiste à former graduellement le comportement du singe par renforcement positif, on ne punit jamais un singe
• Selon la difficulté de la tâche, le temps d’entrainement varie de 2-3 mois (ex., tâche simple
de mouvement des yeux) à 1-2 années (tâches cognitives plus complexes)
Étapes de base:
1. Apprendre à sortir de la cage et à entrer dans une chaise de primate et devenir familier avec le lab et le personnel du lab
• 1-2 semaines pendant lesquelles le singe vient au lab quotidiennement et reçoit des récompenses pour qu’il devienne confortable avec l’environnement et le perçoive positivement
2. Apprendre la tâche expérimentale
• Introduction à l’appareillage expérimental et concepts simples sur quoi faire
• Introduction progressive de nouveaux concepts étape par étape
• Perfectionnement de la tâche (+ de précision et + rapide)

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8
Q

Quels sont les appareils implantés chirurgicalement? (3)

A
  1. Appareils pour mesurer les réponses comportementales
    • “Eye coil”
    – bobine de fil suturé sur la sclérotique de l’oeil pour mesurer les déviations de la position de l’oeil à l’aide du “scleral search coil technique”
    • Électrodes EMG
    – électrodes en fil implantées dans le muscle pour mesurer l’activité musculaire lors de tâches motrices
  2. Système de fixation de la tête
    • Implant ou poteau attaché à la tête afin de permettre la stabilisation de la tête pour l’enregistrement neuronal et certaines tâches comportementales
  3. Implants pour l’accès à long terme au cerveau
    • Chambre pour enregistrement:
    – cylindre avec un bouchon vissable
    – implanté autour d’un trou ouvert chirugicalement dans le crâne par craniotomie de sorte que la surface du cerveau puisse être exposée lors d’expériences d’enregistrement neuronal
    – le cerveau est protégé en refermant le bouchon
    • Réseau d’électrodes implanté de façon chronique:
    − Réseau d’électrodes implanté à long terme pour
    enregistrer l’activité d’une population neuronale
    • Canule:
    − tube cylindrique étroit utilisé pour accéder aux
    structures profondes du cerveau
    − utilisé pour introduire des électrodes étroites ou pour délivrer des agents pharmacologiques, vecteurs viraux ou des sondes optiques pour la stimulation avec lumière
    • Fenêtre crânienne:
    − Fenêtre d’observation créée lors d’une craniotomie ou en polissant une partie du crâne pour le rendre translucide et permettant un accès visuel aux structures superficielles du cerveau
    − Utilisée pour l’imagerie des neurones (ex., neurones marqués avec des traceurs fluorescents)
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9
Q

Comment se font les procédures chirurgicales? (6)

A

• Les procédures chirugicales sont effectuées dans des conditions de travail stériles
– Les instruments chirugicaux, les implants, et les draps couvrant la plupart de la surface de travail sont typiquement stérilisés à l`aide d’un autoclave
– L’autoclave est un appareil qui augmente sa pression interne afin de créer de la vapeur d’eau à une température supérieure au point d’ébullition naturel de l’eau la vapeur à haute température est utilisée pour tuer les microorganismes
– Parfois un gaz ou un désinfectant chimique est utilisé pour stériliser les outils ou implants qui sont sensibles à la chaleur
– Le chirugien porte une blouse stérile et des gants stériles ainsi qu’un masque chirugical, un filet à cheveux et des lunettes pour protéger les yeux
• L’animal est anesthésié avec des agents pharmacologiques ou un anesthétique au gaz
– Ketamine souvent combiné avec Xylazine (propriétés sédatives and analgésiques)
– Isoflurane (anesthétique au gaz, éther inhalable)
• L’animal est souvent positionné dans un instrument stéréotaxique afin de placer précisément les implants relativement aux structures d’intérêt dans le cerveau
• Pour accéder au cerveau afin de faire les enregistrements neuraux un petit trou est fait dans le crâne procédure appelée craniotomie
• Les implants permanents sont typiquement maintenus en place à l’aide de vis à os ou alternativement avec un ciment cranioplastique ou acrylique dentaire
• Après la chirugie les animaux sont traités avec des analgésiques et des agents antibiotiques pendant une période de récupération

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10
Q

Comment on fait un placement stéréotaxique des implants?

A
  • Un instrument stéréotaxique est conçu pour positionner la tête de l’animal dans une orientation précise afin de définir un cadre de référence en 3D qui soit constant d’un animal à un autre
  • Un atlas stéréotaxique fourni des informations sur la position des structures du cerveau dans ce cadre de référence stéréotaxique
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11
Q

Comment on fait un placement des implants à l’aide de l’imagerie par résonance magnetique?

A

• Reconstruction des régions d’intérêt pour l’enregistrement en 3D à partir d’une série d’images d’IRM
• Estimation d’où la chambre devrait être placé afin que les électrodes atteignent les régions d’intérêt
• Calibration de cette emplacement désiré de la chambre par rapport à des points de repère fixés sur le crâne
Met pins en or dans crâne de l’animal avec IRM pour faire correspondances entre pts sur vrai crâne et pts sur image pour positionner électrodes spécifiquement

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12
Q

Quelles sont les 3 techniques d’enregistrements in vivo? Elles servent à mesurer quoi?

A

Intracell: • Interactions synaptiques entre les neurones
• Comment les agents pharmacologiques, NT et neuromodulatateurs affectent les potentiels locaux et les potentiels d’action d’un neurone
Patch: • Fonction de canaux individuels et leur contribution à l’activité du neurone entier
Extracell: • Comment un neurone contribue à différents comportements?
• Quelle information est encodée?
• Comment l’activité d’un groupe de neurones est-elle coordonnée?

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13
Q

Qu’est-ce qu’un pot extracell? Quelles sont les 2 hypothèses simplificatrices pour estimer le pot et les 2 conclusions?

A
  • Produit par le courant qui traverse l’espace extracellulaire
  • Il n’y a pas d’accumulation de charges dans ce milieu conducteur
  • Par conséquent, lorsqu’un courant entre dans un neurone, il doit y avoir un courant équivalent qui sort à travers la membrane vers le milieu extracellulaire
  • L’écoulement du courant est produit par des sources et puits séparées dans l’espace

Hypothèses simplificatrices pour estimer le potentiel:
• Considérer chaque source/puit de courant comme un source point
• Considérer le milieu extracellulaire comme un conducteur homogène

  • Les potentiels extracellulaires réflètent la somme des contributions de nombreuses sources/puits de courant dans un volume conducteur
  • La contribution de chaque source/puit au potentiel extracellulaire est inversement reliée à sa distance par rapport à l’électrode d’enregistrement
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14
Q

Quels sont les 2 types de pot extracell?

A
  1. Potentiels d’action
    • Composante à haute fréquence du signal extracellulaire (100 Hz-10kHz)
    • Enregistrement près de la cellule (pointe de l’électrode < 140 μm du neurone)
    • Reflète le signal de sortie du neurone avec une résolution temporelle de l’ordre de la milliseconde
    • Généralement accepté comme la mesure donnant le plus d’information par rapport à ce que les neurones encodent/signalent
    • L’amplitude du potentiel extracellulaire proche du soma est beaucoup moins grande que le potentiel intracellulaire et son potentiel est inversé
  2. Potentiels de champ
    • Composante à basse fréquence du signal extracellulaire (< 100Hz)
    • Peuvent être enregistrés loin du corps cellulaire
    – les potentiels extracellulaires dus aux décharges neurales (càd., composante à haute fréquence du signal extracellulaire) sont fortement atténués en s’éloignant du corps cellulaire une explication possible est que le tissu neural à des propriétés de filtre passe-bas
    • Puisque les potentiels de champ représentent l’activité dans un volume de tissu ils sont plus difficile à interpréter
    • Des données suggèrent qu’ils reflètent en grande partie les courants synaptiques
    • Les potentiels de champ sont souvent classés en bandes de fréquences basées sur leur corrélation avec différents états comportementaux
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15
Q

Qu’est-ce que la dépendance spatiale de la forme du potentiel extracellulaire?

A

• La forme et l’amplitude du potentiel extracellulaire dépend de la position de l’électrode et de la géometrie de la cellule
Ce qu’on mesure avec l’électrode varie selon ou on place l’électrode
- près du soma, neg en 1er et après +
- près de l’axone: monophasique et positif
Ce qu’on mesure extracell est bcp moins fixe que ce qu’on mesure en intracell
• L’amplitude des potentiels d’action diminue très rapidement avec distance du soma

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16
Q

Quelles sont les 2 façons de mesurer les pot de champ?

A

Électroencéphalogramme (EEG)
• Enregistrés à la surface du cuir chevelu
• Facile à enregistrer avec des électrodes de surface
• Enregistrements non-invasif utilisé typiquement avec des sujets humains
• Reflète la somme des courants d’un grand volume de tissu très faible résolution spatiale (ordre du cm)
• Module plus lentement que les potentiels d’action
• Beaucoup moins de détails en temps réel concernant le comportement comparativement aux potentiels d’action
• Pas une mesure des potentiels d’action mais plutôt reflète les entrées synaptiques sychronisées aux populations de neurones dans les couches corticales superficielles

Électrocorticogram (ECoG)
• Électrodes placées sous le crâne en contact avec les méninges (sous la dure-mère)
• Moins invasif que les enregistrements dans le cerveau
• Meilleure détection des processus locaux que les EEG
• Résolution spatiale est quand même faible

17
Q

Qu’Est-ce qu’un pot de champ local?

A
  • Composante à basse fréquence du signal enregistré dans le cerveau avec des électrodes extracellulaires
  • Somme de l’activité de nombreuses sources/puits de courant
  • Beaucoup meilleure résolution spatiale et temporelle que l’EEG ou l’ECoG
  • Considéré comme reflétant l’entrée synaptique synchronisée d’une population neurale
  • Puisque les LFPs représentent une somme d’activité à travers une population de neurones, l’information contenue dans ce signal est difficile à interpréter.
  • Néanmoins, il est suggéré que ces signaux fournissent des informations uniques quant aux sommes d’entrées synaptiques, aux interactions neurales locales et l’état des réseaux corticaux qui sont difficiles à obtenir en examinant les potentiels d’action de quelques neurones individuels combiner l’enregistrement et l’analyse des potentiels d’action avec celle des LFPs peut donner des informations additionnelles concernant la fonction des réseaux neuraux
18
Q

Quelles sont les diff approches d’enregistrement?

A
  1. Technique du microdescendeur
  2. Réseaux d’électrodes implantés de façon chronique
  3. Réseaux d’électrodes mobiles
19
Q

Qu’est-ce que la tehnique du miccrodescendeur, ses 2 avantages et 2 désavantages?

A

• Lors de chaque session expérimentale, une ou plusieurs électrodes sont descendues lentement dans le cerveau en utilisant un microdescendeur
• L’activité neurale est enregistrée alors que l’animal reçoit un certain stimulus ou effectue une certaine tâche
• Les neurones des régions d’intérêt qui sont reliés au stimulus ou à la tâche sont enregistrés dans un ensemble de paradigmes expérimentaux
• On déplace l’électrode à une nouvelle position pour enregistrer une nouvelle cellule
Avantages:
• Flexible; peut échantillonner plusieurs neurones de plusieurs régions différentes
• Possibilité de bouger l’électrode pour optimiser l’enregistrement du neurone
Désavantages:
• Difficile d’enregistrer plus de quelques neurones à la fois
• Peut prendre longtemps pour enregistrer des données d’une grande population de neurones

20
Q

Qu’Est-ce que la technique de réseaux d’électrodes implantés chroniquement, ses 2 avantages et 2 désavantages?

A

• Lors de chaque session expérimentale, l’activité neurale est enregistrée par chaque électrode alors que l’animal reçoit un certain stimulus ou effectue une certaine tâche
Avantages:
• Permet d’enregistrer de nombreux neurones simultanément
• Permet souvent d’enregistrer les même neurones sur de longues périodes de temps (heures, jours, semaines)
Désavantages:
• Échantillon limité de neurones d’une région particulière
• Aucune garantie après l’implantation que toutes ou même la plupart des électrodes seront dans une position appropriée pour enregistrer une activité neuronale reliée à la tâche; fait tests avec électrodes simples pour trouver région d’intérêt avant de faire implantations chroniques

21
Q

Qu’est-ce que la technique de réseaux d’électrodes mobiles, ses 3 avantages et son désavantage?

A

Système microdescendeur « Gray Matter » et Plexon U-probe (électrode avec pleins de pts de mesure)
Avantages:
• Flexible peut échantillonner plusieurs neurones de plusieurs régions différentes
• Possibilité de bouger l’électrode pour optimiser l’enregistrement de neurones
• Permet d’enregistrer un assez grand nombre de neurones à la fois
Désavantages:
• Typiquement couteux

22
Q

Les électrodes extracell sont faits avec quels 3 matériaux et quelles sont leurs 5 caractéristiques importantes?

A

Matériaux: Verre, Métal, À base de silicium
Caractéristiques importantes:
• Mécaniquement and chimiquement stable
• Matériaux biocompatibles
• Métaux polarisable (e.g., iridium, platine, tungstène)
− ne s’oxyde pas facilement (transfert de charge minime entre l’électrode et le tissu)
• Forme de l’électrode (affecte la qualité d’enregistrement et la quantité de dommage fait au tissu)
• Résistance électrique de l’électrode
− typiquement une pointe plus fine (électrode plus sélective) implique une résistance plus élevée
− une résistance plus élevée implique un bruit plus grand

23
Q

Quelles sont les 5 diff technologies d’électrodes?

A
  1. Microélectrode en verre
    • Tube capillaire en verre rempli d’un électrolyte (1M NaCl)
    • Enregistrement intracellulaire et extracellulaire
    • Pointe de diamètre 1-5 μm (~0.1MOhm à 200MOhm)
    • Pas utilisé pour des enregistrements chroniques ou des enregistrements simultanés
    • Mécaniquement fragile
  2. Électrode pointue en métal
    • Fil de métal gravé pour obtenir une pointe fine de diamètre 1-10 μm (~1MOhm to 10MOhm) et isolé avec un polymère ou du verre
    • Utilisé pour les enregistrements extracellulaires
    • Mécaniquement fragile
  3. Électrodes de microfils
    • Fils fins de tungstène ou d’acier inoxydable isolés avec un polymère (téflon, polyimide)
    • Pointe de 10-50 μm de diamètre
    • Mécaniquement robuste, avec une bonne stabilité mécanique utilisé pour les implantations chroniques
    • Souvent arrangés en réseaux espacés de ~100-300 μm
    • Possibilité d’avoir plusieurs sites d’enregistrement simultanés dans un animal librement mobile
    • Mauvaise isolation des potentiels d’action de neurones individuels
    • Les problèmes à identifier les potentiels d’action de neurones individuels peuvent parfois être surmontés en combinant les enregistrements de plusieurs fils
    – Stéreotrode (2 fils)
    – Tétrode (4 fils)
  4. Réseaux d’électrodes fabriqués en silicium
    • Implantés et utilisés pour des enregistrements chroniques
    • Permettent un grand nombre de sites d’enregistrement
    • Bonne stabilité mécanique
    - Réseaux à haute densité (e.g., « Utah array »)
    • Bloc de silicium gravé pour former un réseau d’aiguilles (~1-1.5mm de long)
    • Pointes enduites de platine (résistance 100-500 kΩ)
    • Permet une haute densité de sites d’enregistrement
    - Sonde multisite (e.g., « Michigan probe »)
    • Sonde en silicium avec du métal déposé pour former des sites d’enregistrement
    • Électrodes avec un surface de 1-50 μm2 (0.1MOhm to 1 MOhm)
    • Permet des enregistrements chroniques à différentes profondeurs
  5. Réseaux d’électrodes mobiles
    Système microdescendeur « Gray Matter » et Plexon U-probe et Neuropixels probe qu’a 960 électrodes
24
Q

Les tétrodes servent à quoi?

A
  • Comparer l’activité enregistrée par plusieurs électrodes très rapprochées aide à déterminer quels potentiels proviennent de cellules distinctes
  • Technologie souvent utilisée pour enregistrer chez les animaux mobiles
25
Q

Quels sont les éléments de base d’un système d’enregistrement neurophysiologique

A

ya pas de microscope, ya un eamplificateur, un filtreur et un syst d’enregistrement, ya un haut parleur pcq la facon qu’on sait qu’on est proche d’un neurone lié à la tâche est qu’on l’écoute

26
Q

Quel est l’important prob à résoudre avec les enregistrements extracell?

A

• Il y a de nombreux neurones qui « parlent » en même temps, chacun avec un amplitude différente à différente distances de « l’enregistreur » et dans un langage que nous ne comprenons pas
• Comment isoler la « voix » d’un neurone individuel?
• Comment interpréter ce que ce neurone est en train de « dire » ?
Il est difficile d’entendre un seul neurone pcq y’ont tous des amplitudes diff pcq sont tous à des distances diff de l’électrode

27
Q

Comment on peut ésoudre le prob important avec les enregistrements extracell?

A

Isolation et classement des potentiels
• Quand les décharges d’une cellule sont présentes, elle doivent être distingués du bruit de fond et de l’activité des autres cellules
Étapes pour détecter et classifier les potentiels d’action:
1. Filtrage
• Extraire la portion du signal extracellulaire liée aux potentiels d’action (e.g., 100Hz-10kHz)
2. Détection des potentiels
• Seuil pour identifier les décharges
3. Extraction des caractéristiques
• Discrimination des potentiels d’action selon un sous-groupe de caractéristiques (ex., différences dans la forme du potentiel)
− Placer des fenêtres
− Définir un patron (« template »)
• Une technique quantitative « Analyse en composantes principales » est souvent utilisée pour définir un sous groupe réduit de caractéristiques qui sont les « plus différentes » (variance maximale)
4. « Clustering »
• Définir différents groupes ou « clusters » qui correspondent aux décharges de différent neurones

28
Q

Pourquoi enregistrer directement dans le cerveau des animaux?

A

• Les potentiels d’actions sont généralement accepté comme la mesure donnant le plus d’information par rapport à ce que les neurones encodent
• Les techniques non-invasives pour mesurer l’activité (ex., imagerie par résonance magnétique fonctionnelle- IRMf; électro- et magnéto-encéphalographie – EEG et
MEG) ont une faible resolution temporelle et/ou spatiale et ne peuvent pas fournir des informations par rapport aux décharges des neurones individuels en temps réel
pendant le comportement
– les potentiels d’action fournissent de l’information avec une résolution temporelle de l’ordre de la milliseconde tandis que l’IRMf fournis de l’information avec une résolution temporelle de l’ordre de secondes
– le signal « BOLD » utilisé dans l`IRMf est seulement une mesure indirecte de l’activité neuronale