COURS 16 - VIRUS Flashcards
qu’est-ce qui défini les virus (4)
- agent qui peut etre filtré
- parasite intracell obligatoire
- agent ne pouvant produire nin énergie ni protéines indépendamment de la cellule hote
- ses composantes individuelles sont assemblées : il ne se reprod pas par division cellulaire
donner les caractéristiques structurelles des virus (2)
- fait d’un génome viral d’ADN ou d’ARN
- enveloppé ou non
*
est-ce que les virus sont vivants
NON
comment est-ce que les virus assurent leur survie
en infectant les cellules
comment est-ce que les virus produisent leurs composantes
en utilisant la machinerie cellulaire de l’hote → ils doivent donc encoder tous les processus requis qui ne sont pas “fournis” par la cellule hote
comment s’assemblent les composantes virales
elles doivent s’assembler par elles-mêmes
ce ne sont pas TOUS les virus qui peuvent infecter TOUTES les cellules ou TOUS les hotes : que doivent pouvoir faire les virus pour parvenir à infecter? (3)
- le virus doit pouvoir entrer dans la cellule hote
- une fois le virus entré, la cellule doit posséder la machinerie nécessaire pour lui permettre de se répliquer
- une fois répliqué, le virus doit pouvoir être libéré de la cellule our trasmettre l’infection (et pouvoir ainsi assurer sa survie)
en quoi se mesure la taille des virus
en nanomètres
quels sont les virus les + petits et combien mesurent-ils
- 18 nm
- parvovirus
quels sont les virus les + gros et combien mesurent-ils
- 300 nm
- poxvirus
les virus sont-ils visible en microscopie optique
non, mais les plus gros virus le sont presque
vrai ou faux : en général, les plus gros virions ont un plus gros génome qui encode pour plus de protéines et sont généralement plus complexes que les petits virions
vrai
décrire la structure de la particule virale
- génome d’acide nucléique compris dans une couche protectrice de protéines, la capside
définir nucléocapside
génome d’acide nucléique + capside = nucléocapside
nommer les formes possibles de nucléocapsides (3)
- icosahédrique
- hélicoidale
- complexe
est-ce que tous les virions ont une nucléocapside
oui
nommer les différentes composantes d’un virion
voir image
décrire les structures possibles de l’ADN virale (2)
- simple ou double brin
- linéaire ou circulaire
décrire les structures possibles de l’ARN (3)
- simple brin positive (comme l’ARNm) ou négative
- double brin (réovirus) : polarité + ou - ou double sens
- segmenté ou non
quelle est la couche la plus externe d’un virus
la capsule ou l’enveloppe
a quoi servent la capsule et l’enveloppe (3)
- structure
- protection
- véhicule de transmission du virus
comment est-ce que la capsule/l’enveloppe permettent la transmission du virus
- les structures présentes a la surface de la capside ou de l’enveloppe permettent l’interaction entre le virus et la cellule hote via une protéine d’attachement virale (PAV) ou autre structure
que se passe-t-il si on détruit la couche la plus externe d’un virus
- on inactive le virus
- ainsi, des Ac développés contre les composantes de ces structures de surface peuvent prévenir l’infection*
la capside - de quoi est-elle faite
de prots
la capside - définir
structure rigide capable de résister a des conditions environnementales difficiles
la capside - a quoi sont résistants les virus nus (3)
- sécheresse
- acidité (incluant l’acide du tractus digestif)
- détergent (incluant la bile du tractus digestif)
la capside - qu’est-ce qui déterminer le mode de transmission des virus
les substances auxquelles ils sont résistants
la capside - nommer ses structures possibles (3)
- symétrique : icosaédrique ou hélicoidale
- asymétrique : complexe
la capside icosahédrique - comment est-elle formée (4)
- les sous-unités virales s’unissent en protomères
- 5 protomères s’unissent pour former des capsomères (pentamères) qui s’assemblent en capside
- la capside icosahédrique simple est formée de 12 capsomères
- chacun des 12 capsom;èes (aux 12 sommets) interagit avec 5 autres capsomères → on les appelle des pentamères ou pentons
la capside icosahédrique - décrire sa structure (3)
- ressemble a une sphère
- est constituée par l’assemblage de sous-unités protéiques
- toutes les faces de l’icosahèdre simple sont identiques
la capside icosahédrique - ou est situé l’acide nucléique? qu’est-ce que cela permet?
- au centre de la capside
- le protège de l’environnement
la capside icosahédrique - comment est-ce que des virions a plus grosse capside sont fabriqués (2)
- en insérant des capsomères (hexons) entre les pentons
- c’est tjrs la meme structure de base, mais avec + ou - d’hexons selon la grosseur
la capside hélicoïdale - comment est-elle formée
les sous-unités protéiques interagissent entre elles et avec l’acide nucléique pour former une structure qui ressemble a un batonnet
l’enveloppe - de quoi est elle composée (3)
membrane composée de lipides, de prots et de glycoprots
l’enveloppe - décrire sa structure
sa structure est similaire a celles des membranes cellulaire
l’enveloppe - décrire les glycoprots qu’elle contient
des glycoprots virales sont ancrées sur l’enveloppe et se projettent hors de la surface du virion, comme des spicules (spikes)
l’enveloppe - quel est le role des spicules (3)
- certaines agissent comme prot d’attachement virale, capable de se lier a des cellules cibles
- sont des Ag majeurs pouvant éliciter une immunité protectrice
- autres fonctions possibles
l’enveloppe - décrire la résistance des virus enveloppés
- les virus enveloppés sont facilement inactivés par la sécheresse, l’acidité, les détergents et les solvants
- la plupart de ces virus ne peuvent pas survivre dans le tractus digestif
l’enveloppe - décrire le milieu nécessaire au maintien de la structure de l’enveloppe
la structure ne peut etre maintenue uniquement dans une solution aqueuse (les virus enveloppés doivent rester mouillés)
l’enveloppe - comment sont généralement transmis les virus enveloppés
par les fluides tels que le sang, les goutelettes resp et les tissus
classification internationale des virus - comment est-ce que les virus sont classifiés (2)
- nature du génome
- morphologie/structure
classification internationale des virus - comment classifie-t-on les virus à partir de la nature de leur génome (5)
- ADN ou ARN
- simple brin ou double birin
- si ARN : polarité +/-
- segmenté o unon
- linéaire ou circulaire
- simple brin ou double birin
classification internationale des virus - comment classifie-t-on les virus selon la structure du virion (4)
- symétrie de la nucléocapside (icosahédrique, hélicoidale, complexe)
- enveloppe ou non
- nombre de capsomères
- autres caract
classification internationale des virus - terminaison utilisé selon la hiérarchie taxonomique : ordre
-virales
classification internationale des virus - terminaison utilisé selon la hiérarchie taxonomique : famille
-viridae
classification internationale des virus - terminaison utilisé selon la hiérarchie taxonomique : sous-famille
-virinae
classification internationale des virus - terminaison utilisé selon la hiérarchie taxonomique : genre
-virus
classification internationale des virus - terminaison utilisé selon la hiérarchie taxonomique : espèce
aucune terminaison particulière (ex : virus de l’hépatite C)
classification internationale des virus - résumer la classification des virus a ADN
classification internationale des virus - résumer la classification des virus à ARN
réplication virale - vrai ou faux : les principales étapes de la réplication virale sont les mêmes d’un virus à l’autre
VRAI
réplication virale - décrire le role de la cellule hote
agit comme une usine en fournissant les substrats, l’É et la machinerie nécessaires à la synthèse des prots virales et à la réplication du génome
réplication virale - quels éléments doivent etre encodés par le virus
ce qui n’est pas fourni par la cellule hote
réplication virale - nommer les grandes étapes (8)
- reconnaissance de la cellule cible
- attachement
- entrée dans la cellule a travers la membrane plasmatique
- décapsidation
- synthèse des constituants viraux (multiplication virale)
- assemblage du virus
- bourgeonnement des virus enveloppés
- relâchement du virus hors de la cellule hote
réplication virale - nommer les sous-étapes de la synthèse des constituants viraux/multiplication virale (4)
- synthèse de l’ARNm précoce est des prots non structurale
- réplication du génome
- synthèse de l’ARNm tardif et des prots structurales
- modification post-traduction de la prot
réplication virale - reconnaissance et attachement a la cellule cible : comment est-ce que cela se fait
- via les PAV ou autres structures a la surface du virus qui se lient a des récepteurs sur la cellule hote
réplication virale - reconnaissance et attachement a la cellule cible : qu’est-ce que le tropisme tissulaire (2)
- les virus peuvent se lier a des R présent sur certaines cellules seulement (spécifiques au type de cellule), parfois présents chez certains hote seulement (spécifiques à l’hote)
- les cellules susceptibles ciblées définissent le tropisme tissulaire
réplication virale - reconnaissance et attachement a la cellule cible : donner 2 exemples de PAVs
- gp120 du VIH
- HA gp du virus influenza A
réplication virale - reconnaissance et attachement a la cellule cible : donner 2 exemples de R sur la cellule hote
- CD4 et co-récepteur chemokines sur les LT helper pour le VIHç
- acide sialique des cellules épithéliales pour influenza A
réplication virale - entrée dans la cellule : décrire le processus pour les virus nus
endocytose médiée par un récepteur
réplication virale - entrée dans la cellule : décrire le processus pour les virus enveloppés (2)
- fusion des membranes du virus et de la cellule cible (précédée ou non d’endocytose)
- la nucléocapside ou le génome viral est ensuite relaché dans le cytoplasme
réplication virale - décapsidation : décrire cette étape (3)
- après internalisation, la nucléocapside doit arriver au site de réplication et se rompre
- le génome d’ADN est alors habituellement transporté au noyau
- le génome d’ARN reste normalement dans le cytoplasme
réplication virale - décapsidation : nommer un virus ADN dont le génome n’est pas transporté au noyau
poxvirus
réplication virale - décapsidation : nommer 2 virus ARN dont le genome ne reste pas dans le cytoplasme
- orthomyxovirus
- retrovirus
réplication virale - synthèse des constituants viraux (multiplication virale) : ou se trouve la machinerie cellulaire nécessaire pour la transcription de l’ARNm
dans le noyau de la cellule
réplication virale - synthèse des constituants viraux (multiplication virale) : quelle enzyme est utilisée par les virus ADN pour synthétiser l’ARNm dans le noyau
- les polymérases de la cellule hote
réplication virale - synthèse des constituants viraux (multiplication virale) : quelles enzymes sont utilisés par les virus a ARNm pour la transcription et la réplication? pourquoi?
- ils doivent eux-même encoder les enzymes nécessaire
- car la cellule hote n’a pas ce qu’il faut pour répliquer de l’ARN
réplication virale - synthèse des constituants viraux (multiplication virale) : décrire la fiabilité des ARN polymérases virales
peu fiables, elle font bcp d’erreurs
réplication virale - assemblage et bourgeonnement : de quoi dépend le site et le mécanisme d’assemblage du virus
- d’ou la réplication a eu lieu
- si la structure finale est celle d’un virus nu ou enveloppé
réplication virale - assemblage et bourgeonnement : ou sont assemblés les virus ADN? ARN?
- ADN : noyau (sauf poxvirus)
- ARN (+ poxvirus) : cytoplasme
réplication virale - assemblage et bourgeonnement : décrire les 2 méthodes d’assemblage de la nucléocapside
- les capsides virales peuvent etre assemblées et ensuite remplies de génome
- peuvent etre assemblées autour du génome
réplication virale - assemblage et bourgeonnement : comment est acquise l’enveloppe (2)
- lors du bourgeonnement du virus : la plupart des virus ARN bourgeonnement de la memb plasmique sans tuer la cellule
- d’autres virus acquièrent leur env du réticulum endo et de l’appareil de Golgi
réplication virale - assemblage et bourgeonnement : en quoi résultent les erreurs d’assemblage (2)
- virions vides
- virions avec génome défectueux
réplication virale - relachement hors de la cellule hote : nommer les méthodes de relachement possible (3)
- par lyse cellulaire
- par exocytose
- par bourgeonnement a travers la membrane plasmatique
réplication virale - relachement hors de la cellule hote : comment sont genéralement relachés les virus nus
après lyse cellulaire
réplication virale - relachement hors de la cellule hote : comment sont genéralement relachés les virus enveloppés
par bourgeonnement par la membrane plasmatique sans tuer la cellule
réplication virale - relachement hors de la cellule hote : comment sont genéralement relachés les virus qui bourgeonnent dans le cytoplasme (2)
- exocytose
- lyse cellulaire
mode de transmission des virus - nommer les mécanismes de transmission virale (8)
- aérosols
- ingestion de nourriture et eau contaminée (fécale-orale)
- fomites
- contact direct avec les sécrétions (salive, plaie, gouttelettes)
- contact sexuel
- sang contaminé ou transplantation d’organe
- zoonoses (animaux, insectes)
- de la mère a l’enfant : transmission verticale
écologie et transmission - de quoi dep le mode de transmission (2)
- de quelle est la source du virus
- de la capacité du virus a endurer les conditions de l’environnement et du corps jusqu’à sa cellule cible
écologie et transmission - nommer le principal déterminant structural du mode de transmission virale? expliquer (2)
- la présence ou non d’un enveloppe
- les virus nus sont résistants à la sécheresse, les détergents, les extremes de T et de pH, alors que les virus enveloppés non
- les virus nus peuvent donc survivre à l’acidité et à l’effet détergent des acides biliaires de l’intestin
écologie et transmission - comment sont generalement transmis les virus nus
- voie fécale-orale
écologie et transmission - nommer la source la plus fréquente de virus nus
objets contaminés (fomites)
écologie et transmission - comment sont généralement transmis les virus enveloppés (6)? pourquoi?
- gouttelettes resp, mucus, salive, sperme, sang, organe transplanté
- ils sont + fragiles, ils ont besoin d,une enveloppe intact pour rester infectieux et dovient donc rester mouillés
zoonoses et arboviroses - nommer le role des animaux dans le processus infectieux (2)
- les animaux peuvent etre des vecteurs (ils transmettent l’infection a d’autres animaux ou a des H)
- ils peuvent agir comme réservoir maintiennent et amplifient le virus dans l’environnement)
zoonoses et arboviroses - définir zoonoses
maladies virales qui peuvent atteindre les animaux (ou les insectes) et les H
zoonoses et arboviroses - définir arboviroses
- lorsque les arthropodes (moustiques, tiques, mouches) sont le vecteur d’une infection virale
nommer quelques autres sources associées a la transmission des infections (5)
- ITSS asymptomatiques
- conditions de vie / promiscuité
- travails/loisirs
- styles de vie (voyages)
- fréquentations des garderies
détection des virus/Dx des infections virales - nommer les méthodes possibles (4)
- culture virale sur des cellules dérivées de tissus humaines en couches monocellulaire
- détection d’Ac spécifiques chez l’hote infecté
- détection du matériel génétique viral (PCR)
- observation en microscopie életcronique
détection des virus/Dx des infections virales - décrire la culture virale sur cellules (2)
- permet d’observer l’apparition d’effets cytopathogènes caract
- était encore utilisée pour certains spécimens avant la pandémie
détection des virus/Dx des infections virales - décrire la détection d’Ac spécifiques chez l’hote (2)
- via sérologie : sérum précoce, sérum tardif (phase aigue ou latente/chronique)
- très souvent utilisé
détection des virus/Dx des infections virales - quelle est la méthode de choix
détection du matériel génétique viral (PCR)
controle des infections virales - nommer les principaux moyens (3)
- hygiène (lavage des mains, équipement de protetcion individuelle, distanciation…)
- vaccination (prévention)
- Tx antiviral pour certaines infections virales seulement
Tx antiviral - quelles sont les cibles thérapeutiques
- des étapes du cycle de réplication virale
Tx antiviral - mécanismes d’action possibles (6)
- inhibition de l’attachement du virus à la cellule
- inhibition de l’entrée dans la cellule
- inhibition de la décapsidation
- inhibition de la synthèse d’ARNm
- inhibition de la réplication du génome
- inhibition de l’assemblage et du relachement
Tx antiviral - inhibition de l’attachement du virus à la cellule : quelles méthodes permettent de faire cela (2)
- Ac neutralisants
- antagonistes de récepteurs spécifiques : analogues des R cellulaire ou de la PAV qui bloquent l’interaction entre le virus et la cellule
Tx antiviral - inhibition de l’entrée dans la cellule et de la décapsidation : expliquer le concept
si le processus est bloqué, le génome du virus ne peut pas etre relâché dans la cellule pour se répliquer
Tx antiviral - inhibition de l’entrée dans la cellule et de la décapsidation : comment y parvient-on
pour les virus qui entrent par des vésicule endocytiques, certains antiviraux vont neutraliser le pH de ces compartiments pour empecher la fusion ou le bris de la membrane empechant la décapsidation
Tx antiviral - inhibition de l’entrée dans la cellule et de la décapsidation : donner 3 exemples
- amantadine
- rimantadine
- enfuvirtide (inhibition gp41 du VIH)
Tx antiviral - inhibition de la synthèse de l’ARNm : est-ce une bonne cible? pourquoi?
- NON
- l’ARNm n’est pas une bonne cible, puisqu’il est difficile d’inhiber l’ARNm du virus sans inhiber l’ARNm de la cellule hote
Tx antiviral - inhibition de la réplication du génome : la plupart des antiviraux sont des analogues des nucléosides (nucléosides modifiés) → expliquer comment cela fonctionne
les analogues nucléosidiques se lient facilement a la polymérase virale (qui est moins précise que les enzymes de l’hote) et inhibent la réplication virale le plus souvent par arret de l’élongation de la chaine d’ADN/ARN
Tx antiviral - inhibition de la réplication du génome : nommer deux exemples de cibles + pourquoi elles sont des bonnes cibles
- ADN pol virale du HSV et TIV du VIH
- elles sont essentielles a la réplication virale mais elle sont différentes des enzymes de l’hote
Tx antiviral - inhibition de la réplication du génome : il existe aussi des analogue non nucléosidiques de la polymérase → comment fonctionnent-ils
ils se lient de façon non compétitive a l’enzyme à des sites autres que celui du substrat, inhibant ainsi la polymérase
Tx antiviral - inhibition de l’assemblage et du relachement : décrire le principe
on veut inhiber les enzymes responsables de ces étapes
Tx antiviral - inhibition de l’assemblage et du relachement : donner 2 exemples
- inhibiteurs de la protéase du VIH, une enzyme essentielle a l’assemblage du virus et à la prod de virion défectueux
- inhibiteurs de la neuraminidase de l’influenza A et B, une enzyme qui permet au virus d’etre libéré hors de la cellule
