Cours 1 (microbio) : adénovirus et picornaviridae, biologie et classification des virus, virus causant la diarrhée Flashcards
Schématiser structure d’un virus (nu et enveloppé) en incorporant : virion, capside, génome, enveloppe.
VOIR DOCUMENT WORD!
Caractéristiques des virus.
- pas vivants
- parasites INTRAcellu obligatoires
- incapables de synthèse prot ou prd d’É par eux-mêmes (à l’ext d’une cell)
- peuvent infecter insectes, poissons, plantes, reptiles, mammifères, bactéries (bactériophages)… normalement, pas 2 classes pour 1 virus (exception : rage)
- taille BCP + petite que bactéries (non visible microscope optique)
Décris le cycle de réplication d’un virus nu
1) attachement (prots d’attache sur virus ; récepteurs sur cell)
2) pénétration du virus dans cell par ENDOCYTOSE
3) décapsidation
4) transcription et réplication (copie génome et création prots)
5) assemblage (copies du génome avec ports)
6) libération : lyse
Décris le cycle de réplication d’un virus enveloppé
1) attachement (prots d’attache sur virus ; récepteurs sur cell)
2) pénétration du virus dans cell par FUSION des membranes
3) décapsidation
4) transcription et réplication (copie génome et création prots)
5) assemblage (copies du génome avec ports)
6) libération : en douceur ou lyse
Les virus ne sont pas des êtres vivants : quelle est l’implication de cette caractéristique sur leur survie?
Incapables de synthèse prot ou prd d’É par eux-mêmes (à l’ext d’une cell) doivent contaminer cell.
Caractéristiques des virus nus.
1) résistants (survie environnement, détergents, pH acide de l’estomac)
- échantillons ne requièrent PAS de milieu de transport spécial
- libérés par lyse cellu
- transmission directe, indirecte (fomites), gouttelettes, fécale-orale
Caractéristiques des virus enveloppés.
- fragiles aux conditions adverses de l’environnement
- facilement détruits par acidité gastrique
- transmission + par direct et gouttelettes
- libérés de cell hôte par bourgeonnement ou lyse cellu
- milieu de transport requis pour échantillons (pour préserver enveloppe et permettre culture virale dans petit liquide rose)
Quels sont les virus ARN nus?
- Rotavirus
- Astrovirus
- virus de l’hépatite A
- entérovirus
- Rhinovirus
- Calicivirus
Nul ARNaqueur, En Rotant Astronomiquement comme un Rhinocéros Californien, ne peut Épater ses Amis (Hépatite A).
Quels sont les virus ADN nus?
- parvovirus B19
- VPH
- Adénovirus
Adam (ADN) est Nul, car il ne Parvient pas à Adhérer à la collection de Papillons.
Quels sont les virus ARN enveloppés?
- virus influenza
- Coronavirus
- virus respiratoire syncytial
- virus de la rougeole
- virus de la rubéole
- virus des oreillons
- virus de l’hépatite C
- virus de l’immunodéficience humaine (VIH)
(Truc : ceux pour lesquels tu n’as pas de truc)
Quels sont les virus ADN enveloppés?
- herpersviridae
- virus de l’hépatite B
Adam s’enveloppe, car sa mère pèse (mherpès) sur son foie : pauvre bébé (hépatite B)!
Qu’est-ce qui caractérise les rétrovirus?
- virus ARN
- possède TRANSCRIPTASE INVERSE permettant de produire brin d’ADN à partir de l’ARN viral. Cet ADN peut s’intégrer dans la cell qui met virus à l’abri du SI
** Le virus en balle de fusil typique.
Rage
** Le virus filamenteux typique.
Ebola
Les principaux agents responsables des gastro-entérites virales chez les enfants (en ordre).
1) Norovirus
2) Adénovirus 40-41
3) Rotavirus
4) Astrovirus
(NARA)
Les principaux agents responsables des gastro-entérites virales chez les adultes (en ordre).
1) Norovirus
2) Sapovirus
(NS)
Le virus qui font partie du groupe des Caliciviridae.
- Norovirus
- Sapovirus
(NS)
Épidémiologie…
Virus donnant gastro-entérite
1) réservoir
2) transmission
3) facteurs de risques
1)
- humain (selles et vomis des personnes infectées)
2)
- fécale-orale : direct, indirect, vecteur.
- ingestion gouttelettes (vomissement)
3)
- croisières
- hôpitaux
- garderie
- repas communautaires
Manifestations cliniques…
Virus donnant gastro-entérite
- nausées
- vomissements
- diarrhée non sanglante ++ liquide
- crampes abdo
- parfois fièvre
- déshydratation
Complications…
Virus donnant gastro-entérite
++ déshydratation = hospitalisation
Méthodes diagnostiques…
Virus donnant gastro-entérite
- prescrire analyse SLMT si éclosion
- écrire sur requête : “éclosion gastro-entérite d’allure virale”, avec lieu.
- TAAN ou TAAN multiplex pour les hôpitaux riches (Biofire GI panel)
Mesures de prévention et de contrôle…
Virus donnant gastro-entérite
- vaccin pour Rotavirus
- précautions pour ne pas acquérir ou transmettre
- si malade : retour au travail 48h après résolution des symptômes.
Médecins :
- blouse de protection
- masque de procédure
- lunettes de protection
- gants
- lavage des mains au LAVABO
- nettoyage environnement avec eau de Javel
Signes et symptômes évocateurs de déshydratation chez l’enfant.
- yeux enfoncés
- muqueuse buccale sèche
- signe du pli cutané
- absence de larmes
- fontanelle enfoncée
Signes et symptômes évocateurs de déshydratation chez l’adulte.
- soif
- muqueuse buccale sèche
- signe du pli cutané
- tachycardie (+100 bpm) et TA basse
- ++ faiblesse
Quelles sont les circonstances où une investigation est requise pour identifier l’agent infectieux responsable d’une gastro-entérite d’allure virale? (dans centre de santé)
- au moins 2 cas de vomissement + diarrhée sur UNE unité de soins
- cas = patients ou travailleurs
Décris l’investigation appropriée pour identifier l’agent infectieux responsable d’une épidémie de gastro-entérites d’allure virale.
- si éclosion, investigation requise : recherche virus dans les selles de 5 patients/éclosion
- déclaration obligatoire à la santé publique
Décris la prise en charge appropriée pour une gastro-entérite d’allure virale.
- aucune traitement
- ++ hydratation
Quelle gastro-entérite d’allure virale peut être prévenue par la vaccination?
Rotavirus
** Les gastro-entérites d’origine virale arrivent le + svt quand?
Pendant l’hiver
Les virus de la famille des Picornaviridae étant pathos pour l’humain.
- Entérovirus : poliovirus, échovirus, coxsackie A et B
- Rhinovirus
- virus hépatite
A
Les principales caractéristiques des picornavirus humains
- petits (pico)
- RNA (picoRNAvirus)
- nus
Épidémiologie…
entérovirus
1) réservoir
2) transmission
3) facteurs de risque
1) humain
2) fécale-orale (direct et indirect)
3)
- jeunes enfants/bébés
Pathogenèse…
entérovirus
1) va à l’oropharynx : amygdales : sang et organes cibles
2) intestin : plaques de Peyer : sang et organes cibles
3) va aux selles (transmission)
Moyens de prévention des infections à…
entérovirus
Poliovirus : vaccin
Principales manifestations cliniques (et distinguer maladies sévères des non sévères)…
entérovirus
ÉCHOVIRUS :
- conjonctivite (NS)
- fièvre + éruption généralisée (NS)
- herpangine (NS)
COXSACKIE A :
- pied-main-bouche (NS)
- méningite (S)
COXSACKIE B :
- pleurodynie (NS)
- myocardite et péricardite (S)
- “rhume d’été” (NS)
POLIOVIRUS :
- atteinte corne ant. moelle : paralysie asymétrique (S)
- atteinte villos intestinales + plaques de Peyer (résiste acidité estomac)
- méningite (S) et encéphalite (S)
Dans quelles situations des analyses sont justifiées pour confirmer une infection à entérovirus?
Slmt pour manifestations cliniques sévères : TAAN sur LCR
Pk les TAAN sont la méthode diagnostique de premier choix pour le diagnostic de la méningite à entérovirus?
Car permet de distinguer de quel type d’entérovirus il est question, selon les anticorps et antigène utilisés
En quoi les poliovirus se distinguent des autres entérovirus au regard de l’épidémiologie?
- ne se transmet pas par microgouttelettes, donc pas d’infections des voies respiratoires
- mutation résistante au vaccin
- risque = si pas vaccin
En quoi les poliovirus se distinguent des autres entérovirus au regard des manifestations cliniques?
- paralysie asymétrique
- méningite
En quoi les poliovirus se distinguent des autres entérovirus au regard de la prévention?
- vaccin
Épidémiologie…
Rhinovirus
1) réservoir
2) transmission
3) facteurs de risques
1) humain
2) gouttelettes et fomites
3) tt le monde, mais surtout à l’école ou en milieux de groupes
Pathogenèse…
Rhinovirus
- croissance 33*C
- IMP : détruit par acidité estomac (un des rares virus nus qui l’est)
Manifestations cliniques…
Rhinovirus
Rhume commun
Pk n’est-il pas nécessaire de faire des prélèvements pour le diagnostic d’infection à rhinovirus?
Caractéristiques cliniques = tlmt descriptifs que pas besoin.
Principales caractéristiques des adénovirus
- 100 sérotypes
- virus nus
- groupe hétérogène de virus
Épidémiologie…
Adénovirus
1) réservoir
2) transmission
3) facteurs de risques
1) humain
2)
- gouttelettes
- fécale-orale
3)
- enfants
- militaires
Pathogenèse…
Adénovirus
1) réplication dans cells épith pharynx, conjonctive, tractus dig
2) passage dans lymphe jusqu’aux ganglis
3) possibilité de virémie avec atteinte d’organes à dist (surtout immunosupprimés)
4) possibilité d’excréter virus dans selles pendant 1 an
Manifestations cliniques…
Adénovirus
- adénoïdes
- cystite hémorragique
- pharyngite
- conjonctivite
- gastro-entérite
(plsrs autres infections : hépatite, méningo-encéphalite, myocardite, gastroentérite, pneumonie)
Méthodes diagnostiques…
Adénovirus
- slmt pour infections sévères ou épidémies
- culture ou TAAN
Traitement…
Adénovirus
Cidofovir IV SLMT pour immunosupprimés qui vont mourir sinon
Prévention des infections à…
Adénovirus
aucun vaccin au Canada (en a pour militaires aux USA)
