Cours 1: Définition/Historique Flashcards

1
Q

Quel est le but de la pharmacogénétique/pharmacogénomique?

A

Ils cherchent à réduire la variation de la réponse aux médicaments en adaptant la thérapie à la génétique individuelle.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Quelles types de relation sont étudiés en pharmacogénétique/pharmacogénomique?

A
  • La relation entre les variations héréditaires et les variations interindividuelles dans la réponse aux médicaments.
  • La relation entre le génotype et le phénotype.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Quelles sont les possibles applications de la pharmacogénomique en clinique?

A
  • aider à maximiser l’efficacité du traitement d’un médicament en ciblant seulement des patients qui vont en toute probabilité répondre.
  • Identifier des individus qui pourraient être à plus haut risque de subir les effets secondaires des médicaments ou la réponse sous-optimale.
  • Chez ces individus, changer les modalités de traitement en utilisant un médicament différent ou une dose différente.
  • avoir des avantages indirects en comprenant les causes de la variabilité de la réponse thérapeutique.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Quels sont les 3 premiers médicaments pour lesquels une variabilité interindividuelle a été remarquée par la pharmacogénétique?

A
  • Le suxaméthonium
  • La primaquine
  • L’isoniazide
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Quelle était la première étude à démontrer un lien entre une variante héréditaire et la sensibilité à un médicament?

A

Une étude suite à l’apparition d’effet indésirable chez une partie de la population prenant le médicament suxaméthonium (succinylcholine) comme relaxant musculaire.

Les individus ayant une forme mutée de l’enzyme cholinestérase (métabolise le suxaméthonium en métabolites inactifs) avaient une relaxation musculaire anormalement prolongée des muscles respiratoires.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Décrit l’histoire de l’isoniazide.

A

Utilisé pour le traitement de la tuberculose et métabolisé par acétylation, l’isoniazide cause chez certains individus de la neurotoxicité périphérique.

Les facteurs génétiques causant une acétylation lente sont responsables de la plus longue rétention de la drogue et d’une sensibilité accrue à la neurotoxicité du médicament.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Quel article résumant les début des découvertes pharmacogénétiques à été publié en 1957?

A

Le papier intitulé “La réaction aux médicaments, les enzymes et la génétique biochimique” écrit par Arnold Motulsky en 1957.

Il y décrit la base de pharmacogénétique.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Comment Arnold Motulsky décrit la base de la pharmacogénétique dans son papier publié en 1957?

A

Il décrit la base de la pharmacogénétique comme suit:
- Les variations génétiques sont, dans la plupart des cas, sans conséquences phénotypiques, sauf si l’individu est exposé à l’effet d’un médicament donné.
- La réaction anormale au médicament donné est causée par l’exagération ou l’affaiblissement de l’effet normal d’une dose donnée.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Décrit le paradigme du CYP2D6, comment il a été découvert et les particularités du CYP2D6.

A

En 1975, le Dr. Smith a souffert de vertige et chute de pression suite à la prise du médicament débrisoquine (tx hypertension). Les métabolites inactifs de ce médicament, normalement trouvé dans l’urine, était absent pour le Dr. Smith.

Le Dr. Smith avait une déficience de cette enzyme. Il a décrit deux phénotypes du métabolisme : les métaboliseurs pauvres et les métaboliseurs rapides.

1) La déficience du CYP2D6 n’est pas un défaut rare à cause de la fréquence élevé de ces polymorphismes.
2) Le CYP2D6 métabolise BEAUCOUP de médicament prescrit.
3) Les conséquences médicales peuvent être différentes selon que le CYP2D6 inactive ou active le médicament.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Quels sont les conséquences possibles d’un métaboliseur pauvre pour CYP2D6 (exemple)?

A
  • Peut causer de la toxicité et une réponse excessive au médicament par l’accumulation des métabolites actifs (impossible de les convertir). Ex: La débrisoquine
  • Peut causer une perte de l’efficacité de la réponse si le CYP2D6 converti la drogue en métabolites actifs. Il y aura alors accumulation de métabolite inactif. Ex: Codéine –> Morphine.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Qu’est-ce que le développement de la génétique moléculaire à permis au niveau de la pharmacogénétique?

A

Le développement de la génétique moléculaire a transformé la pharmacogénétique d’une science phénotypique en une science génétique.

Elle permet maintenant d’identifier:
- les variations génétiques (polymorphismes) (ex: CYP2D6)
- les génotypes
- leur influence sur une fonction produit d’un gène, sur le cinétique d’un médicament, sur la réponse hérapeutique
- l’apparence d’effets secondaires peut être mesuré par des méthodes analytiques.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Combien existe-t-il de polymorphisme pour le CYP2D6?

A

70 polymorphismes qui peuvent être regroupé selon leur effet pénotypique:
- Métaboliseurs ultra-rapides
- Métaboliseurs extensives
- Métaboliseurs intermédiaires
- Métaboliseurs pauvres

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Quels sont les critères pour le dépistage pharmacogénomique?

A

1) Est-ce qu’il y a une variabilité dans les effets du médicament?
2) Est-ce qu’il y a un index thérapeutique large?
3) Est-ce que la plupart de la variabilité existante peut être expliquée d’une façon fiable par les variables typiques (âge, sexe, fonctions hépatique et rénale, interactions médicamenteuses, etc.)?
4) Est-ce que la susceptibilité aux ES ou aux réponses insuffisantes est transmissibles (familiale)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Quels sont les facteurs influençant les tests pharmacogénétiques?

A

1- La connaissance des variations du génome humain
2- La connaissance de la corrélation entre le génotype et le phénotype
3- L’information provenant de différentes populations
4- Confirmer l’utilité de l’information pharmacogénétique dans le choix de la thérapie et de la posologie dans une étude prospective.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Le génotypage des polymoprhismes de deux gènes est utilisé pour déterminer la capacité métabolique individuelle, lesquels et pourquoi?

A

Les gènes des CYP2D6 et CYP2C19 parce qu’ils codent pour des enzymes qui transforment un grand nombre de médicaments.

On utilise ce génotypage pour les médicaments utilisés en psychiatrie, pour des recommandations de thérapie et pour l’amélioration d’un traitement.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Comment est fait l’examen des données par la FDA pour l’approbation des tests de pharmacogénétiques?

A

1- La variante génétique identifiée doit être étroitement associée avec l’effet toxique ou l’Efficacité réduite.
2- La recommandation spécifique concernant le test devrait être ajoutée à l’étiquette du médicament.
3- Le moment que les patients doivent être testés au cours du traitement doit être indiqué.
4- Il doit y avoir suffisamment de données pour justifier une recommandation spécifique en ce qui concerne l’ajustement du traitement.

17
Q

Quelles agences fournissent des informations concernant les biomarqueurs pharmacogénomiques qui sont inclus dans les fiches d’information des médicaments?

A

FDA, Santé Canada et l’Agence européenne des médicaments (EMA)

18
Q

Quels sont les avantages d’utiliser la pharmacogénétique durant les essais cliniques de développement de nouveaux médicaments?

A

La pharmacogénétique permet de choisir les répondeurs pour les essais cliniques, ce principe permet de:
- s’assurer d’avoir les patients les plus susceptibles de répondre au médicament
- réduire la taille et les dépenses des essais cliniques en étant plus ciblés dans notre population.
- augmenter le nombre de molécules thérapeutiques qui peuvent être efficaces dans une population de patients particulière
- empêcher l’exposition de patients génétiquement vulnérables.

19
Q

La plupart des études pharmacogénétiques sont de quel type?

A

rétrospectives. Peu de variantes de gènes ont été étudiées prospectivement.

20
Q

Quelles sont les limites de l’utilisation de la médecine personnalisée en clinique présentement?

A
  • les études sont majoritairement rétrospective au lieu de prospectives.
  • Nous avons besoin de valeurs prédictives plus fiables.
  • les tests pharmacogénomiques à faire ne sont pas simple, donc difficile à appliquer en clinique
  • les tests coûtent cher et prennent du temps.
  • connaissance encore manquante sur les corrélations entre génotype et phénotype.
  • défi majeur est de déterminer les corrélations qui sont cliniquement utiles.
21
Q

Quelle est la meilleure preuve de l’impact des facteurs génétiques sur la variabilité du métabolisme de médicaments?

A

Les études de jumeaux

22
Q

Quels sont les gènes analysés dans des études pharmacogénétiques?

A

Les gènes qui contrôlent des enzymes qui métabolisent des médicaments et leurs produits (DMEs: Drug metabolizing enzymes).

Les DMEs peuvent aussi être nommés comme les gènes influençant l’absorption, la distribution, le métabolisme et l’excrétion.

Approche:
gène candidat
GWAS (nécessite cartographie HapMap et exploite les déséquilibres de liaison (DL))

23
Q

Quels sont les gènes candidats analysés dans des études pharmacogénétiques? (2 groupes).

A

Premier groupe: les gènes qui codent pour les transporteurs et les DMEs –> ceux qui contrôle les propriétés pharmacocinétiques

Deuxième groupe: les gènes qui codent pour les cibles des médicaments et les éléments des voies associées –> ceux qui contrôlent les propriétés pharmacodynamiques

24
Q

Nommes des exemples (5) d’enzymes métabolisants pouvant avoir des mutations modifiant l’effet de médicaments

A

CYP2C19 *2, *3 : métaboliseurs extensives –> diminue l’effet d’oméprazole

CYP2C9 *2, *3: métaboliseurs extensives –> augmente l’Effet de la warfarine

CYP2D6 *3, *4, *5:

NAT2: acétylation lente –> augmente le risque d’hépatotoxicité avec les meds antituberculose

TPMT *2, *3A, *3C: toxicité hématopoïétique après le traitement avec des thiopurine

25
Nomme 1 exemple de mutation d'un transporteur qui modifie l'effet de médicament.
ABCB1, C3435T: TT génotype on moins de chance d'avoir de l'epilepsie résistante au drogue. CC génotype on une meilleure immune recovery avec les traitement antiviraux.
26
Nommes 3 exemples de cibles de médicament ayant des mutations, causant une modification des effets du médicament.
ADRB1 (récepteur adrénergique b1): Arg389Gly --> Arg/Arg on une meilleure réponse au antagoniste des récepteurs b-adrénergiques. ADRB2 (récepteur adrénergique-b2): Arg16Gly --> Allèle Gly associé à une diminution de la réponse à certain b-bloquant. TYMS (thymidylate synthase): TSER *2/*3: *3 diminue la réponse au 5-Flurouracil comparé au *2. *3/*3 requiert une plus grande dose.
27
Nomme 1 exemple de gènes connus comme étant liés à une maladie.
Apolipoprotéine E (APOE) lié à la maladie d'Alzheimer. Avec le médicament Tacrine, certains polymorphisme permettent un meilleure clinical improvment.
28
Quelle est la définition d'un gène?
Une séquence nucléique d'une longueur donnée qui contrôle un trait donné.
29
Décrit la relation génotype-phénotype à l'échelle génomique.
Le génome (l'ADN) est répliqué, puis transcrit en ARN. L'ARN devient un ARNm puis est traduit en protéine par des ribosomes. La protéine fait son action dans le système. Cette action représente le phénotype, soit l'effet fonctionel de la protéine qui est déterminé par le génotype.
30
Que signifie un allèle mineur?
Un allèle mineur représente l'allèle moins fréquemment rencontré dans la population.
31
Quels sont les différents types de polymorphismes?
-SNP: single nucléotide polymorphisms - changement d'un nucléotide - Short indels (insertion/deletion): 3 nucléotides et moins. - les polymorphismes de répétition (2R, 3R, 4R): --> microsatellite repeat number (STR): répétition de 2-4 pb --> minisatellites: répétition de 10 pb ou plus. --> Repeated genes: répétition de ARNm, histones --> large inversions,deletions (rare)
32
Quelle est la définition du polymorphisme génétique?
C'est la variation d'ADN existant sous forme de deux allèles ou sous forme de multiples allèles dans la population.
33
Quelles sont les définitions d'un haplotype, génotype, d'un allèle et d'un diplotype?
Haplotype: un haplotype représente un groupe d'allèle qui sont généralement hérité ensemble. Génotype: représente la constitution génétique d'un organisme. Allèle: un allèle représente un variant d'une séquence de nucléotide, ou d'un gène Diplotype: le diplotype est la combinaison des deux haplotypes des paires de chromosomes homologues. Un diplotype spécifique est la variante de toutes les combinaisons possibles des haplotypes qui existent dans la population.
34
Quels sont les approches pour choisir les variations dans les gènes candidats qui ont un effet sur la fonctionnalité?
- L'approche se basant sur la séquence du gène candidat: les SNPs potentiellement fonctionnels - parce qu'ils sont localisés dans la région de signification fonctionnelle potentielle. - L'approche se basant sur la cartographie, soit le modèle de déséquilibre de liaison (LD).
35
Quels sont les différents effets que peuvent avoir les SNPs fonctionnels?
1. Plus d'expression (+ de protéines) 2. Moins d'expression (- de protéines) 3. Aucune expression (déficience de la protéine) 4. Une expression modifiée contrôlé par de nouveau facteurs.
36
Quelles sont les données phénotypiques fréquemment utilisées dans les études pharmacogénétiques?
Les données pharmacologiques: la dose, le niveau du médicament et de ses métabolites dans le plasma et dans les cellules cibles Les paramètres cliniques: la variété de paramètres spécifiques pour une maladie donnée qui peuvent estimer la réponse au médicament en termes d'efficacité, ainsi que la variété de paramètres spécifiques pour un médicament donné qui peuvent estimer la réponse en termes de toxicité.
37
Qu'est-ce qu'elle demande quand elle dit: Combien des allèles a un SNP?
Elle veut dire combien de position nucléotide possède des variant.
38
Qu'est-ce qu'elle demande quand elle dit: Combien des génotypes d'un SNP on retrouve dans la population?
Elle demande combien il y a de génotype possible pour 1 SNP, elle demande le nombre d'haplotype possible (*).
39
Quels sont les types d'associations trouvés avec des études d'associations?
- Association directe : le polymorphisme engendre un effet direct sur la réponse au médicament - Association indirecte : le SNPs observé n’a pas d’effet directe sur la maladie ou sur la réponse au médicament, mais il a une association directe avec un autre SNP qui lui a un effet sur la maladie. En d’autres mots, le SNP observé n’a pas d’effet, mais il est toujours présent avec un autre SNP (Haplotype – déséquilibre de liaison) qui lui a un effet.