CM2 - Prévention, diagnostic et antibiotiques nº 1 Flashcards
1
Q
Microorganismes : 4 grandes classes traditionnelles
A
Les bactéries
Les virus
Les mycoses (champignons)
Les parasites
2
Q
Nomenclature
- Bactéries, mycoses, parasites (nom latin)
A
Genre (commence par une majuscule)
Espèce (commence par une minuscule)
Italique ou souligné dans les textes
ex: Staphylococcus aureus (en italique)
3
Q
«spp.» signifie
donne exemple pour Staphylococcus spp.
A
«spp.» signifie «species»
oStaphylococcus spp. (species)
- staphylocoques à coagulase négative (bcp moins mechantes)
- Staphylococcus epidermidis
- Staphylococcus saprophyticus
- Staphylococcus cohnii
- Staphylococcus capitis
- Staphylococcus hominis
etc. - Staphylocoque coagulase positive. (bcp + mechante!)
- Staphylococcus aureus
4
Q
Nomenclature
Dans certaines circonstances, il est possible d’interchanger le nom latin et la dénomination commune.
A
Latin - Dénomination commune (pas de majuscule)
Les Staphylococcus - Les staphylocoques
Les Streptococcus - Les streptocoques
Les Streptococcus pneumoniae - Les pneumocoques
Les Neisseria meningitidis - Les méningocoques
«La souche de Staphylococcus aureus isolée des hémocultures de ce patient était sensible à l’oxacilline».
«Soixante-dix pourcent des souches de staphylocoques à coagulase négative isolées dans ce laboratoire sont résistantes à l’oxacilline».
5
Q
Nomenclature
Virus
A
Virus (parfois en latin, parfois non en latin)
o Herpesviridae
«viridae» fait référence à une famille de virus
o Exemple de membres de la famille des Herpesviridae
- Herpès simplex
- Cytomégalovirus
6
Q
Les bactéries: classification
selon quoi?
A
- Selon la forme
- Cocci
- Bâtonnet (bacille)
- Spiralée - Affinité tinctoriale
- Gram positif
- Gram négatif - Atmosphère incubation
- Anaérobie facultative (Peuvent pousser en presence d’oxygene ou sans)
- Anaérobie stricte (Absolument mettre dans environnement sans oxygene)
- Aérobie stricte (Absolument besoin d’oxygene)
7
Q
STRUCTURE D’UNE BACTÉRIE
A
Paroi cellulaire (Paroi cellulaire = paroi bactérienne)
Membrane cytoplasmique
Chromosome (ADN)
Ribosomes (synthèse de protéines à partir de l’ ARN);
Une des différences fondamentales avec nos cellules = paroi cellulaire
8
Q
Structure
Gram positif vs Gram négatif
A
Gram positif
0 Principalement composée d’une couche épaisse de peptidoglycan
0 Acide lipoteichoïque (polysaccharides)
- La paroi cellulaire épaisse des Gram positifs, leurs confère de la résistance et une survie plus facile dans l’environnement.
Gram négatif 0Couche mince de peptidoglycan 0Porines 0Lipopolysaccharides (LPS) 0 Protéines
9
Q
Affinité tinctoriale (Coloration de Gram)
A
Gram + (bleu/violet) ou Gram – (rouge/rose)
10
Q
Coloration de Gram
sert a quoi?
A
Permet de détecter des bactéries dans un échantillon clinique (ex. : expectoration, ponction articulaire, écouvillonnage de conjonctive).
Aide à l’identification d’une bactérie présente dans un bouillon d’enrichissement ou une bouteille d’hémoculture.
Aide à l’identification d’une bactérie capable de croître sur des milieux de laboratoire (ex.: gélose au sang de mouton). (Moins fait de nos jours dans les grands laboratoires)
11
Q
Coloration de Gram
Permet de détecter des bactéries dans
A
un échantillon clinique
un bouillon ou une bouteille d’hémoculture
une colonie sur une gélose.
12
Q
Méthode de coloration de Gram
Étapes pour Gram sur échantillon ou bouillon:
A
- Déposer l’échantillon sur une lame.
- Laisser sécher.
- Fixer à la chaleur.
- Recouvrir la lame de plusieurs gouttes de violet de cristal pendant 30 à 60 secondes. On rince à l’eau courante.
- Recouvrir la lame de plusieurs gouttes de lugol (iode) pendant 30 à 60 secondes. Un complexe violet de cristal-iode se forme dans la bactérie. On rince à l’eau courante.
- Décolorer la lame avec quelques gouttes d’acétone-alcool pendant 1-5 seconde. On rince à l’eau courante.
À cette étape, l’alcool-acétone retire le violet de crystal de la paroi bactérienne des bactéries Gram négatif alors que les bactéries Gram positif peuvent retenir le violet de crystal. - On procède à l’étape de contre-coloration en déposant plusieurs gouttes de safranine pendant 30 à 60 secondes.
- Examen microscopique à immersion i.e. 1000X.
13
Q
Limites de la coloration de gram
A
L’absence de bactérie à la coloration de Gram d’un échantillon clinique ne signifie pas que l’échantillon ne contient aucune bactérie. En faible quantité, la coloration de Gram pourrait être négative (absence de bactéries vues à l’examen microscopique) et la culture bactérienne pourrait montrer la présence de bactéries.
Certaines bactéries ne sont pas visibles à la coloration de Gram*1 (ex. : Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia trachomatis, Treponema palidum).
*1 Ces bactéries seront traitées dans le cours sur les «Bactéries fantômes».
Prend vrm bcp de bactéries pour qu’on puisse les voir dans l’échantillon et il y a des bactéries qui ne sont pas capables de prendre la coloration de gram donc c pas pcq en voit pas qu il n’y en a pas
14
Q
APPRENDRE
Bactéries : cocci Gram + en amas
A
Staphylococcus
*Cette coloration de Gram permet d’orienter vers le «Genre» «Staphylococcus».
Elle ne permet pas d’établir l’espèce (ex.: aureus, saprophyticus, etc.).
15
Q
APPRENDRE
Bactéries : cocci Gram + en paires
A
Streptococcus pneumoniae
16
Q
APPRENDRE
Bactéries : cocci Gram + en chainetes
A
Streptococcus
Enterococcus
17
Q
Bactéries : cocci Gram - en paires
A
Neisseria
- meningitidis
- gonorrhoeae spp.
Moraxella catarrhalis (Cause fréquente d’infections des voies respiratoires – pneumonie, bronchite, etc.)
(Il existe plusieurs espèces de Neisseria non pathogènes.
On les retrouve le plus souvent sur les muqueuses.)
18
Q
Bactéries : bâtonnets Gram +
(Bcp de cette catégorie mais peu qui sont importants dans notre vie quotidienne)
- Sporulés
A
Bacillus spp. (aérobie, ANTHRAX!)
Clostridium spp. (anaérobie, DIFFICILE!)
La spore permet une survie prolongée dans l’environnement.
Les spores sont détruites par la stérilisation, l’eau de javel et le peroxyde d’hydrogène).
19
Q
Bactéries : bâtonnets Gram +
(Bcp de cette catégorie mais peu qui sont importants dans notre vie quotidienne)
- Lettres chinoises
A
Corynebacterium spp. (dyphtérie!)
20
Q
Bactéries : bâtonnets Gram +
(Bcp de cette catégorie mais peu qui sont importants dans notre vie quotidienne)
- Longs et minces
A
Listeria monocytogenes (Vrm associé à la nourriture – dangeureux pour femme enceinte + 100% mortalité pour bébé_
Lactobacillus spp.
Erysipelothrix spp.
21
Q
Bactéries : bâtonnets Gram +
(Bcp de cette catégorie mais peu qui sont importants dans notre vie quotidienne)
- Embranchés
A
Nocardia spp.
Actinomyces spp.
22
Q
Bâtonnets Gram + sporulés
clostridioides/clostridium
A
Clostridium difficile - Colite (diarrhée)
Clostridium perfringens - Gangrène gazeuse
Clostridium botulinum - Botulisme (Toxine empeche contraction muscles donc arrête de respirer)
Clostridium tetani - Tétanos (contraction des muscles)
Clostridium spp. - Flore normale du colon
23
Q
Bâtonnets Gram + sporulés
Bacillus
A
Bacillus anthracis Agent de l’anthrax
Bacillus cereus - Intoxication alimentaire
(Très rapidement après l’ingestion de l’aliment
- Diarrhée OU vomissement
- Classique: riz qu’on met au frigo et remange plus tard)
Bacillus spp. - Flore normale de la peau
24
Q
Bactéries : bâtonnets Gram -
A
Entérobactéries (seulement retenir cette colonne)
- Escherichia coli (infection urinaire)
- Klebsiella pneumoniae (infection urinaire)
- Proteus mirabilis (infection urinaire)
- Salmonella spp. (Diarrhée surtout en pays en voie de dev)
- Shigella spp. (Diarrhée surtout en pays en voie de dev)
- Yersinia enterocolitica
- Enterobacter spp.
Autres
- Haemophilus influenzae (Infections respiratoires)
- Pseudomonas aeruginosa (Souvent infections nosocomiales)
- Campylobacter spp. (Cause 1 des diarrhées bactériennes au Qc)
- Vibrio cholerae (Choléra – diarrhée (10-15L/jour))
- Pasteurella multocida (Infections de la peau – se trouve dans bouche du chat)
- Bordetella pertusis (coqueluche)
- Bacteroides fragilis (anaérobie stricte) (Dans tube digestif)
25
Bactéries anaérobies strictes
vs
Bactéries anaérobies facultatives
Les bactéries anaérobies strictes sont tuées par l’oxygène. Il faut les mettre dans un lieu où l’on aura remplacé l’oxygène par de l’azote pour leur croissance.
Les bactéries anaérobies facultatives peuvent croître en présence ou en l’absence d’oxygène.
26
Exemple de bactéries anaérobies strictes
Clostridium spp.
Bacteroides fragilis
Streptococcus anaerobius
27
Exemple de bactéries anaérobies facultatives
Entérobactéries
Streptocoques β-hémolytiques (groupe A, B, C, G)
Streptococcus viridans
Bacillus anthracis
Enterococcus spp.
Staphylococcus spp.
28
Prévention des infections – pratiques de base
1. Hygiène des mains
Avant de toucher au patient
Avant une intervention aseptique
Après un risque de contact avec un liquide biologique
Après tout contact avec un patient ou son environnement
Avec quoi
La plupart du temps:
Solutions hydroalcooliques ou eau/savon
2. Hygiène respiratoire
Tousser dans son coude
Porter un masque si Sx respiratoires
3. Équipement de protection individuel (EPI) lors de situations particulières
Gants/blouses/protection du visage
(Si risque exposition a liquides biologiques)
4. Utilisation des objets tranchants
29
Précautions de contact
+ exemples
En plus des pratiques de base
On ajoute
Gants
Jaquettes
Exemple:
- SARM
- ERV
- Clostridium difficile
- Gastro-entérites
30
Précautions respiratoires
(gouttelettes)
+ exemples
Gouttelettes >5 microns (1 mètre)
Ajout d’un masque de procédure + protection oculaire
Chambre individuelle
Exemples:
- Covid-19
- Infections invasives à Streptococcus pyogenes
- Influenza/autres virus respiratoires
- Méningite
*La gouttelette va tomber – ne reste pas en suspension dans l’air
31
Précautions aérienne
(aérosols)
+ exemples
Particules < 5 microns
Chambre à pression négative
Chambre individuelle avec salle de bain
Masque N-95
Exemples:
- COVID-19?
- TB
- VZV
- Rougeole
- MRSI (maladie respiratoire sévère infectieuse)
*Reste en suspension dans l’air
Pour VIH – mesures de prévention de base (pas de contact, ou aerienne, etc.)
32
Hémocultures
But :
But : rechercher la présence de bactéries (parfois de levures) dans la circulation sanguine
33
Quand le médecin doit-il prescrire des hémocultures?
1. Patient qui présente de la fièvre avec signes d’atteinte systémique sévères
- Atteinte de l’état général
- Frissons solennels
- Tension artérielle basse
2. Lorsque certains diagnostics graves sont évoqués
- Méningite
- Endocardite
- Infection rénale
- Pneumonie avec dyspnée
3. Tableau de fièvre chez la femme enceinte
4. Tableau de fièvre chez un hôte immuno-supprimé (cancer, VIH +, greffé)
5. Tableau de fièvre ou hypothermie chez la personne âgée
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Hémocultures
Comment procede?
le médecin prescrit 2 hémocultures
L’infirmière prélève 4 bouteilles
L’infirmière se lave les mains.
Elle nettoie la peau du patient avec de l’alcool.
Elle nettoie les bouchons des deux bouteilles d’hémoculture (aérobie et anaérobie).
Elle met le garrot.
Elle met des gants.
Elle désinfecte la peau du patient avec de la chlorhexidine.
Elle ponctionne la veine.
Elle dépose environ 10 ml de sang dans la bouteille aérobie et 10 ml de sang dans la bouteille anaérobie.
Elle retire le garrot puis l’aiguille.
Elle enlève ses gants
Elle se lave les mains.
Prélèvement #2 - 15 à 20 minutes plus tard…doit ponctionner à un deuxième site, pas le même que la première fois
35
Hémocultures : au total
2 bouteilles aérobies
2 bouteilles anaérobies
40 ml de sang
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Question d'examen!
Pourquoi prélever 2 hémocultures i.e. 40 ml de sang?
La probabilité de trouver la bactérie dans le sang dépend du volume de sang cultivé.
- Plus le volume est grand, plus la probabilité est haute
- Risque « coût-bénéfice » devient moins intéressant après 40 mL
- Facteur le plus important pour trouver des bactéries dans le sang si elles sont présentes.
*1e hémoculture – 65% de sensibilité, 2e passe à 95% de sensibilité, 3e passe à 98% donc préfère en faire 2
Pour les enfants, ça dépend de leur poids, on fait pas souvent de bouteille anaérobie non plus
37
Quand prescrire plus que 2 hémocultures (>40 mL de sang)?
Endocardite subaiguë (germe en général peu virulent, patient non instable):
- Obtenir 3 hémocultures en 30 – 60 minutes
- Prélever 2 autres hémocultures si la première série est négative après 24 heures.
(Chaque hémoculture correspond au prélèvement d’une bouteille aérobie et d’une bouteille anaérobie)
38
Pourquoi prélever en « 2 temps »?
Évaluer la contamination cutanée
Évaluer le caractère continu de la bactériémie
39
hemoculture
Le contamination
Parce que si l’étape de nettoyage de la peau n’a pas été bien réalisée ou si le prélèvement a été difficile à faire, le risque de contamination du sang par des bactéries de la peau est grand.
En conséquence, l’isolement d’une bactérie peu pathogène et reconnue comme colonisant la peau dans une seule hémoculture sera interprété par le MD comme un contaminant.
40
Hémoculture
La bactériémie continue…
Si S. aureus dans une seule hémoculture sur deux (bien prélevées), bactériémie continue peu probable
Si S. aureus dans deux hémocultures sur deux, bactériémie continue plus probable
- Plus de délai entre les deux HC est grand, plus la probabilité de bactériémie continue est grande.
41
Hémocultures
Pourquoi une bouteille aérobie et une anaérobie?
Volume de sang « idéal » par hémoculture = 20 mL
Ratio bouillon/sang par bouteille est d’environ 10 mL
La littérature montre que 10 mL (aé) + 10 mL (ana) = meilleur recouvrement de bactéries
- À cause des anaérobies (augmentation légère)
- Meilleure croissance de certaines bactéries aérobies dans les bouteilles anaérobies (principale raison)
42
Traitement des hémocultures au laboratoire
Dès la réception au laboratoire, les bouteilles d’hémoculture sont déposées dans un appareil qui maintient la température à 37ºC et qui brasse les bouteilles de façon continue.
L’appareil détecte la présence de croissance bactérienne grâce aux métabolites générés par les bactéries dans la bouteille.
La technicienne effectue une coloration de Gram sur le liquide de la bouteille d’hémoculture «positive» et ensemence des milieux de culture (géloses) ce qui permettra d’identifier la bactérie impliquée et de procéder à un antibiogramme
*Pastille au fond de la bouteille qui change de couleur au contact des bactéries – devient jaune si a bactéries donc laser peut voir le changement de couleur tranquillement du vert au jaune et compare si changement correspond a celui auquel on s’attend normalement dans le sang – si a plus que prevu, l’appareil sonne = bouteille positive donc ensuite fait gram directement sur la bouteille
43
Hémocultures
Est-ce important de savoir quelle(s) bouteille(s) est(sont)+?
Pas vraiment
- Un S. epidermidis dans les 2 bouteilles d’une hémoculture n’est pas plus significatif que s’il était retrouvé dans une seule bouteille (contaminant probable - En prenant la prise de sang)
- Même si on trouve un BGN seulement dans la bouteille anaérobie, probabilité demeure élevée que ça sera une bactérie aérobie
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Interprétation des résultats des Gram d’hémoculture
Cocci Gram + amas
Staphylococcus
45
Interprétation des résultats des Gram d’hémoculture
Cocci Gram + en chaînettes
Streptococcus, Enterococcus
| Pneumocoque
46
Interprétation des résultats des Gram d’hémoculture
Cocci Gram + en paires
Pneumocoque
47
Interprétation des résultats des Gram d’hémoculture
Cocci Gram – en paires
Neisseria, Moraxella
48
Interprétation des résultats des Gram d’hémoculture
Bâtonnets Gram -
E. coli, K. pneumoniae, Pseudomonas, Bacteroides fragilis
49
Interprétation des résultats des Gram d’hémoculture
Coccobacille Gram négatif
Haemophilus influenzae
50
Interprétation des résultats des Gram d’hémoculture
Bâtonnets Gram +
Listeria monocytogenes, Clostridium spp.
| Corynebacterium spp., Bacillus spp.
51
Interprétation des résultats d’hémoculture
| bactériémie ou contaminant
Le médecin doit analyser les indices :
La bactérie rapportée est-elle reconnue comme un pathogène ou un colonisant de la peau?
Nombre d’hémoculture positive (pas le nombre de bouteilles)?
- 1/2 ou 2/2 (LE NOMBRE DE PRÉLÈVEMENT ET NON LE NOMBRE DE BOUTEILLES)
Après combien d’heures d’incubation, l’appareil a-t-il détecté la croissance bactérienne?
(NORMALEMENT ENTRE 18 ET 24H – NORMALEMENT AVANT 24H SI IMPORTANT, SOUVENT SI SORT PLUS TARD (+IEURS JOURS, NORMALEMENT C UNE CONTAMINATION CAR EN AVAIT VRM PAS BCP)
Le lien entre le site de l’infection et le germe identifié est-il plausible?
La bactérie rapportée est-elle reconnue comme un pathogène ou un colonisant de la peau?
Pathogènes fréquents dans les hémocultures
52
Interprétation des résultats d’hémoculture
(bactériémie ou contaminant)
Pathogènes fréquents dans les hémocultures :
Staphylococcus aureus (Bactérie dangereuse, ne jamais assumer que c une contamination même si trouve sur la peau – tjrs traiter!!!)
Pneumocoque
Entérocoque
Streptococcus pyogenes (groupe A)
E. coli
Pseudomonas aeruginosa
Candida
53
Le médecin doit analyser les indices :
Le lien entre le site de l’infection et le germe identifié est-il plausible?
Exemple de lien plausible : présence de Neisseria meningitidis dans l’hémoculture d’un patient hospitalisé pour une méningite.
Exemple de lien peu plausible : présence de Streptococcus viridans dans l’hémoculture d’un enfant hospitalisé pour une méningite. Les Streptococcus viridans ne cause pas de méningite.
54
Hémocultures et infection de cathéter
Les infections de cathéter (veineux ou artériel) peuvent être attribuables à des bactéries de la flore normale de la peau.
La présence de 2/2 hémocultures positives à un germe de la flore normale de la peau (staphylocoque à coagulase négative, Corynebacterium sp.,Bacillus sp.) devrait évoquer une infection de cathéter vasculaire.
55
Bactériémie : communautaire ou nosocomiale
Une bactériémie communautaire est attribuable à une infection acquise dans la communauté.
- Ex. : Patient sans antécédents médicaux, admis il y a 48 heures pour une pneumonie au lobe inférieur droit. Les hémocultures prélevées à l’arrivée à l’hôpital montrent la présence de Streptococcus pneumoniae.
Une bactériémie est qualifiée de nosocomiale si :
- Elle survient plus de 48 heures après l’arrivée à l’hôpital
ET
- Elle est attribuable à une condition infectieuse qui n’était pas présente à l’arrivée à l’hôpital.
- Ex.: Accidenté de la route intubé aux soins intensifs depuis 5 jours qui développe une pneumonie du lobe inférieur droit. Les hémocultures et les sécrétions trachéales prélevées il y a 48 heures montrent du Staphylococcus aureus
56
Hémoculture : combien ça
| coûte
Environ 15.20$ par série (1 bouteille aérobie +1 bouteille anaérobie)
57
Hémoculture
Des fois doit refaire des hémocultures pour prouver que c’est négatif après traitement
pour quels pathogenes?
Des fois doit refaire des hémocultures pour prouver que c’est négatif après traitement - Staph. aureus et candida
Donc a des patients qu on va reprelever mais c pas un enjeu de diagnostic mais on a besoin de prouver qu’on est plus bactériémique – STAPHYLOCOCCUS AUREUS et CANDIDA (levures dans le sang)
58
Diagnostic de diarrhée à Clostridioides difficile
Selles non formées
Basée sur la recherche de toxines (ou du gene de la toxine)
Trois techniques possibles FACILEMENT disponibles
- Test rapide EIA (++)
- Recherche de toxine sur culture cellulaire (moins facile)
- Recherche de toxine par TAAN (++)
Une technique PEU utilisée au Québec
- La culture toxigénique de C. difficile
59
Diagnostic de diarrhée à Clostridioides difficile
Technique EIA
Juste savoir qu on trouve la toxine soit sur une petite plaquette comme celle-la ou TAAN
Ag GDH : positif Toxine : positif
Ag GDH : positif Toxine : négatif -> Recherche toxine par culture cellulaire
Ag GDH : négatif Toxine : négatif
18.70$
60
Diagnostic de diarrhée à Clostridioides difficile
Recherche de toxines de Cd avec TAAN
TAAN plus sensible que culture cellulaire et que test rapide EIA
Trop sensible? (Gens peuvent être colonisés mais pourrait leur donner un diagno de c. difficile pour rien)
Risque de traiter des porteurs sains de souches toxinogènes
De plus en plus de laboratoires utilisent cette méthode
61
Recherche de toxine de Cd par culture cellulaire
Ne l utilise plus
Plus sensible que le test rapide EIA
Résultat final après 24 heures
Coût : 35.00$
Tapis cellulaire normal
vs
Tapis cellulaire avec surnageant de selles contenant la toxine B
62
Tapis cellulaire avec surnageant de selles contenant la toxine B
Gélose CCFA
Besoin de plusieurs jours
Besoin d’identifier la bactérie
Besoin de faire une culture cellulaire pour prouver que la souche produit de la toxine.
DONC, long, coûteux et peu utiliser hors de la recherche
63
La recherche de pseudomembranes pour c dif
Examen assez rapide
- Le gastro-entérologue va voir avec un colonoscope
Examen très spécifique
-Le diagnostic différentiel est très limité
Examen peu sensible
- La plupart des patients n’auront PAS de pseudomembranes
- Associé à formes plus sévères
```
*Donc le fait de ne pas en voir ne nous aide pas (mais le fait d’en voir nous aide)
Peut sensible (car peu de patient se rendent à ce stade avancé), mais très spécifique
```
64
D’autres agents infectieux peuvent causer la diarrhée
```
Bactéries entéropathogènes
- Salmonella
- Shigella
- Yersinia enterocolitica
- E. coli
- Campylobacter
Voyage?
Poulet mal cuit?
Contact avec animaux sang froid? Consommation viande crue?
Hamburger saignant?
```
Virus
- Norovirus (diarrhée épidémique) (Hyper contagieux (prend seulement qq virus))
- Rotavirus (enfants surtout)
Parasites
- Au Québec, giardiase surtout (Soit dans garderies ou contact avec eau pas propre)
65
Urines
| Deux types d’examen de laboratoire peuvent être réalisés
Analyse d’urine (laboratoire de biochimie)
- Sera vu en 2e année
Culture d’urine (laboratoire de microbiologie)
66
Prélèvement pour cultured’urine
ne pas confondre avec quoi?
Ne pas confondre avec le prélèvement requis pour les TAAN N. gonorrhoeae et Chlamydia trachomatis
Pour gono/chlamydia = début de jet
- Pcq donnent des urethrite et non pas des cystites (au niveau de la vessie)
Pour culture d’urine = mi-jet
- Pcq l’uretre distale n’est pas sterile alors que l’urine devrait être stérile dans vessie
67
La culture d’urine - principes
L’urètre distale n’est pas stérile
L’urine est normalement stérile
Comment faire la différence entre
Colonie qui proviennent de l’urètre et celles qui proviennent de la vessie?
- Mi-jet
- Culture quantitative (>108 UFC/L)
68
Technique de prélèvement d’urine par mi-jet
Débuter la miction dans la toilette
Au milieu de la miction, uriner dans le pot stérile
Terminer la miction dans la toilette
69
Culture d’urine
sur quel type de gelose?
Gélose au sang et gélose MacConkey incubées à 37˚C jusqu’au lendemain matin
(mettre 0.001 mL d'urine)
70
Culture d’urine
le jour d'après?
Gélose au sang
Gélose MacConkey
Y a-t-il plus de 100 colonies sur la gélose au sang : OUI Y a-t-il plus de 100 colonies sur la gélose MacConkey : OUI
Préparation pour l’antibiogramme.
Pas tres important dans context du cours mais la gelose MacConckey est selective et differentielle (pas de gram + et fermentation la lactose – rose = lactose +)
Puis le jours d apres peut faire l antibiogramme
Voit si bactérie est sensible ou résistante aux différents ATBs
71
Temps-réponse des cultures d urine
48-72 heures
Pour avoir une culture d’urine donc doit vrm attendre (peut pas demander un résultat après 4-6h)
72
Comment expliquer inflammation avec culture d’urine négative?
Culture faite après le début des antibiotiques
L’inflammation vient d’ailleurs que l’urine (urètre?, la prostate?)
L’inflammation est causée par un microorganisme non cultivable
73
Principaux agents responsables des infections urinaires
```
E. coli (+++)
Proteus mirabilis
Klebsiella pneumoniae
Enterocococcus spp.
Staphylococcus saprophyticus
```
Pseudomonas aeruginosa
Truc mnémotechnique: KEEPS
74
Infection urinaire haute/basse
Symptômes d’infection urinaire basse:
Brûlures mictionnels
Hématurie macroscopique
Urgence mictionnelle
(Inflammation dans la vessie)
75
Infection urinaire haute/basse
Symptômes d’infection urinaire haute:
Idem à 1) + (Brûlures mictionnels, Hématurie macroscopique, Urgence mictionnelle) +
Douleur loge lombaire
Fièvre
Leucocytose
(Douleur au niveau des loges rénales
pyelonephrite)
76
Coût : analyse/culture urine
Analyse d’urine
1.70$
Culture d’urine
7.40$
77
Les mécanismes d’action et ATB
Trimethoprisulf améthoxazolem-
TMP/SMX
Inhibition de la synthèse des folates
78
Les mécanismes d’action et ATB
Fluoroquinolones
```
Ciprofloxacine
Lévofloxacine
Moxifloxacine
Norfloxacine
Ofloxaxine
```
Réplication ou réparation de l'ADN
79
Les mécanismes d’action et ATB
Métronidazole
Métronidazole
Réplication ou réparation de l'ADN
80
Les mécanismes d’action et ATB
Antituberculeux
* Isoniazide
* Rifampin
* Ethambutol
* Pyrazinamide
* Streptomycine
Réplication ou réparation de l'ADN
81
Les mécanismes d’action et ATB
Lincosamides
Clindamycine
Synthèse des protéines
82
Les mécanismes d’action et ATB
Oxazolidinones
Linezolide
Linezolide
83
Les mécanismes d’action et ATB
Tétracyclines
Tétracycline
Minocycline
Doxycycline
Synthèse des protéines
84
Les mécanismes d’action et ATB
Aminoglycosides
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Streptomycine
Synthèse des protéines
85
Les mécanismes d’action et ATB
Macrolides
Érythromycine
Clarithromycine
Azithromycine
Synthèse des protéines
86
Les mécanismes d’action et ATB
Glycopeptides et
autres
Vancomycine
Daptomycine
Paroi cellulaire
87
Les mécanismes d’action et ATB
Beta lactamines
paroi cellulaire
Ont un noyau beta lactam qui va aller se lier de facon covalente sur les penicillin binding proteins
Empeche la bacterie de faire sa paroi de peptidoglycan donc bacterie se vide de son contenu et meurt
Beta lactamines: penicillines, monobactam, carbapenemes et cephalosporines
88
Les mécanismes d’action et ATB
Beta lactamines
Quelles sont les grandes categories?
Pénicillines
Pénicillines avec inhibiteur de beta lactamases
Monobactams
Carbapénèmes
Céphalosporines (1e a 5e generation)
Pénicillines naturelles
Pénicillines résistantes à la pénicillinase
Aminopénicillines
Carboxipénicillines
Uréidopénicillines
89
Les mécanismes d’action et ATB
Beta lactamines
Pénicillines avec inhibiteur de beta lactamases
Amoxicilline / acide clavulanique
Ticarcilline / acide clavulanique
Pipéracilline / tazobactam
PAROI CELLULAIRE
90
Les mécanismes d’action et ATB
Beta lactamines
monobatams
Aztréonam
Paroi cellulaire
91
Les mécanismes d’action et ATB
Beta lactamines
Carbapénèmes
Imipénème
Méropénème
Ertapénème
92
Les mécanismes d’action et ATB
Beta lactamines
Cephalosporines
1e generation:
Céfazoline
Céphalexin
Céphadroxil
```
2e generation:
Céfuroxime
Céfaclor
Cefprozil
Céfoxitine
Céfotétan
```
```
3e generation:
Ceftriaxone
Cefotaxime
Céfixime
Ceftazidime
```
paroi cellulaire
4e generation:
Céfépime
5e generation:
Ceftobiprole
Ceftaroline
93
Les mécanismes d’action et ATB
Beta lactamines
Pénicillines naturelles
* Péni benzathine
* Péni G
* Péni V
paroi cellulaire
94
Les mécanismes d’action et ATB
Beta lactamines
Pénicillines résistantes à la pénicillinase
* Cloxacilline
* Méthicilline
Paroi cellulaire
95
Les mécanismes d’action et ATB
Beta lactamines
Aminopénicillines
* Ampicilline
* Amoxicilline
paroi cellulaire
96
Les mécanismes d’action et ATB
Beta lactamines
Carboxipénicillines
Ticarcilline
paroi cellulaire
97
Les mécanismes d’action et ATB
Beta lactamines
Uréidopénicillines
Pipéracilline
paroi cellulaire
98
Gram + utilise bcp quel type d atb
Utilise bcp les beta-lactamines pcq attaquent paroi cellulaire donc ne touche pas a nos cellules et pas bcp d effets secondaires
99
Synthèse des peptidoglycans
Dimeres de sucre qui vont etre assemblés ensemble pour faire des grandes chaines
100
Pénicilline
Classe :
Catégorie :
Voies d’administration :
```
Classe : β-lactamines
Catégorie : Pénicilline
Voies d’administration :
- Orale (V)
- Intraveineuse (G)
- Intramusculaire (benzathine)
```
S’attaque a paroi cellulaire
101
Pénicilline
spectre
Streptocoques β hémolytiques
Tous : A, B, C et G
Streptococcus pneumoniae
La majorité
Streptococcus groupe viridans
La majorité
Streptococcus anaérobies
La majorité
Treponema pallidum
Tous
Bactéries anaérobies de la flore ORL
Plusieurs
Strepto du groupe A - Pas de resistance decrit jusqu’à maintenant, n existe pas
102
Ampicilline
| spectre
Streptocoques β hémolytiques, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus groupe viridans, Streptococcus anaérobies, Bactéries anaérobies de la flore ORL
Enterococcus faecalis
Listeria monocytogenes
Certaines entérobactéries (E. coli, Salmonella spp., Shigella spp. Proteus mirabilis)
Haemophilus influenzae non producteur de B-lactamase
103
Bactéries productrices de ß- lactamases
Staphylococcus aureus (non SARM)
Environ 35% des Haemophilus influenzae
La plupart des Moraxella catarrhalis
Tous les Klebsiella pneumoniae
Environ 30% des E. coli
104
Résistance par production de ß-lactamases
Va manger l’ATB avant que l’ATB va pouvoir aller manger bactérie donc bactérie va etre resistance a l’ATB
Beta lactamase mange les beta lactamines
105
Résistance par production de ß-lactamases
Deux solutions…
Des antibiotiques qui résistent aux ß-lactamases
- Cloxacilline/oxacilline/méthicilline (Noyau beta-lactam auquel on rajouté des petits piquants - le rend indigeste pour la beta lactamase)
- Céfazoline
Les inhibiteurs de ß-lactamases
- Acide clavulanique
- Tazobactam (Inhibiteur de beta lactamase qui va aller manger la beta lactamase qui ne pourra alors pas aller manger l’ATB avant que l’ATB puisse faire sa job)
106
La cloxacilline
Staphylococcus aureus et autres Staphylococcus spp. sensibles à la méthicilline
Streptococcus sensible à la pénicilline
Cocci Gram positif anaérobies
107
La céfazoline
Streptococcus ß hémolytiques (tous)
Streptococcus viridans (majorité)
Staphylococcus aureus (excluant SARM)
Quelques entérobactéries (ex. : E. coli, Proteus, Klebsiella)
108
Pipéracilline/tazobactam
Mauvais tableau (pas amoxicilline) mais meme spectre donc ne change rien, juste mode d’administration differente
```
Comme l’amoxicilline
Ajouts
Commentaires
Staphylococcus aureus (Non SARM)
Produit pénicillinase
E. coli, K. pneumoniae, P. mirabilis
Produisent ß-lactamases
Plusieurs autres entérobactéries
```
```
Haemophilus influenzae
Produisent ß-lactamases
Moraxella catarrhalis
Produisent ß-lactamases
Pseudomonas aeruginosa
```
Anaérobies (B. fragilis, Clostridium sp. autres que Cd.)
Produisent ß-lactamases
*Perte du Listeria monocytogenes
Tres large spectre
108
Pipéracilline/tazobactam
Mauvais tableau (pas amoxicilline) mais meme spectre donc ne change rien, juste mode d’administration differente
```
Comme l’amoxicilline
Ajouts
Commentaires
Staphylococcus aureus (Non SARM)
Produit pénicillinase
E. coli, K. pneumoniae, P. mirabilis
Produisent ß-lactamases
Plusieurs autres entérobactéries
```
```
Haemophilus influenzae
Produisent ß-lactamases
Moraxella catarrhalis
Produisent ß-lactamases
Pseudomonas aeruginosa
```
Anaérobies (B. fragilis, Clostridium sp. autres que Cd.)
Produisent ß-lactamases
*Perte du Listeria monocytogenes
Tres large spectre
109
ß-lactamines – effets
| secondaires
Effets secondaires
Allergie (fièvre et/ou éruption) (vraies allergies sont tres rares mais graves)
Néphrite interstitielle
Gastro-intestinal (diarrhée, nausée, colite à Cd)
Surinfection à Candida (vaginose a candida car alteration de la flore vaginale)
110
Et le SARM?
modification de la cible
Donc les noyaux beta lactam ne seront pas capables d aller se lier
Donc mecanisme de resistance completement different, la bacterie est alors capable de faire sa paroi et ne va pas mourir
POUR COURS RETENIR:
Si a un SARM – la beta-lactamine n’est pas une bonne idée
111
POUR COURS RETENIR:
Si a un SARM – la beta-lactamine n’est pas une bonne idée
Puisque le mécanisme de résistance n’est pas une ß-lactamase...
Puisque le mécanisme de résistance n’est pas une ß-lactamase
- La résistance aux ß-lactamase (cloxacilline/céfazoline) n’aide pas
- Les inhibiteurs de ß-lactamase (clavulanate/tazobactam) n’aident pas
112
O
Y
113
Vancomycine
Classe :
Voies d’administration :
Classe : Glycopeptide
Voies d’administration :
Intraveineuse (pour les infections autres que Cd)
Orale (pour le traitement de la diarrhée à Cd)
Peut pas passer de un a l autre
Aucune goutte de vanco qui va aller dans le sang du paient si le donne per os donc pour cela que per os est bon pour le c diff car la bacterie est dans le tube digestif l ATB va y rester
114
Vancomycine
spectre
Staphylococcus aureus - Incluant le SARM
Staphylocoques à coagulase négative - Incluant les souches résistantes à la méthicilline
Streptocoques
Entérocoques -Sauf ERV (Enterocoque resistant a la vancomycine_
Bâtonnets Gram positif (incluant le Cd)
*Pas d’activité contre les Gram négatif
ANTIGRAMME GRAM + PURE
115
quelle bactéries n’est pas couverte par la vancomycine
Soit ERV ou chercher des bactéries gram -
116
Effets secondaires de la vancomycine IV
Réaction liée à la perfusion - Parle aussi de « red man syndrome »
Néphrotoxicité
Leucopénie
1. Faut l’ajuster à l’insuffisance rénale
2. Doit doser – donne 3e dose puis après dose et avant la 4e pour voir combien le patient en a accumulé pour arriver à la bonne dose pour chaque patient (diffère d;une personne à l’autre) - IMPORTANT (aurait dû être écrit dans la diapo)
117
La latence virale
Une fois qu’on a attrapé le virus, on est pris avec…
*Si on perd le contrôle sur le virus, c’est là où on a le problème
Les manifestations de la réactivation peuvent être différents de celles de la primo-infection.
Virus - Primo-infection - Réactivation
HSV-1 - Stomato-gingivite - Feux sauvage
VZV - Varicelle - Zona
EBV - Mononucléose - Syndromes lymphoprolifératifs
CMV - Mononucléose - Rétinite, colite, pneumonie, etc.
