Chapitre 9 : Diagnostic Moléculaire Flashcards
C’est quoi la medecine personnalisée ?
Medecine cherchant a ameliorer la stratification et la prise en charge des patients en UTILISANT DES INFORMATIONS BIOLOGIQUES ET DES BIOMARQUEURS au niveau des voies moléculaires des maladies, de la genetique et de la proteomique ainsi que de la metabolomique
Les 3 types de zygotie ?
Heterozygote
Homozygote
Hemizygote
C’est quoi une maladie monogenique ?
Maladie ou 1 seul gene est impliqué
C’est quoi une maladie mendelienne heterogene ?
Maladie ou le gene affecté peut être différent d’un patient a l’autre
C’est quoi une maladie mendelienne homogene ?
Maladie ou le gène impliqué est le mm chez tous les patients
Les 4 modes de transmission de maladie génétique
Autosomal dominant
Autosomal recessif
Lie a X dominant
Lie a X recessif
C’est quoi la penetrance ? Que signifie qu’elle soit complete ? Incomplète ?
C’est le pourcentage d’invidu avec un genotype a risque qui exprime le phenotype associé (donc malade)
Complete : P=1 tous les gens avec le genotype exprime le phénotype
Incomplete : P<1 individu avec le génotype sans la maladie
Dans une maladie recessive lié a X quel population est plus sensible ?
Les hommes car ils ont plus de gens de contracter la maladie
De qui vient les mitochondries ?
La mere
Les variant des genes mitochondriaux sont ils plus frequent que ceux dans les genes nucleaires ?
Ouii
C’est quoi une heridite non mendelienne ?
Depend de la genetique et de l’environnement ?
Quel est le type de variant qui peut etre associe a des maladies ?
Variants rares (frequence allelique de < 1%)
Quels sont les 3 types de variants associes aux maladies ?
Variants structuraux (nb kr ; strucure kr ; nb copies)
Petites insertions ou deletions
Changement de 1 seul N SNPs
C’est quoi une monosomie ?
Aneuploidie par abscence d’un kr
C’est quoi une trisomie ?
Aneuploidie par gain d’un kr
L’insertion et la translocation impliquent 1 ou 2 kr ?
2 kr
La deletion, la duplication et l’inversion impliquent 1 ou 2 kr ?
1 kr
Si j’enleve ou j’ajoute un multiple de 3 nucleotides est ce que c’est grave ?
Non car ça ne change pas le cadre de lecture
C’est quoi une mutation faux sens ?
Changement d’un AA en un autre AA
C’est quoi une mutation non sens
Insertion d’un codon stop
Les 3 principaux mecanismes de l’épigénétique et leur association
Methylation ADN (repression)
Modification histones (repression et expression)
Variants localisés au histones (instabilité genomique)
C’est quoi un cas index ou patient zero ?
Premier membre d’une famille a être affecté par une maladie genetique et a rechercher des soins médicaux
Que fait on quand on trouve un cas index ?
On dépiste la famille (en cascade) pour les variants des genes
C’est quoi l’expressivité ?
C’est le niveau de mesure d’expression d’un genotype qui se reflete dans le phénotype tsais si l’individu exprime 20 ou 90% du phenotype
C’est quoi une mutation de novo ?
1er individu de la famille a dvlp a la maladie
3 generalites sur la cardiomyopathie hypertrophique ?
Epaississement du myocarde
Maladie du sarcomere
1ere cause de mort subite chez les - de 40 ans
Mode de transmission de la cardiomyopathie hypertrophique ?
Autosomique dominante
Caractéristiques clinique de la CMH ?
Souvent asymptomatique et 1er symptôme = mort subite
3 faits sur le syndrome du QT long ?
Anomalies electriques de L’EC
Risque de syncope
Structure et fonctionnement coeur = normal
Mode de transmission de syndrome QT long ?
Autosomique dominant
2 faits Syndrome de Marfan
Desordre génétique multisystemique affecte l’aorte mais pas seulement
Dysfonctionnement de la fibriline 1, glycoproteine
quelques presentations cliniques ? Du syndrome de marfan
Os deformes
Pb aux yeux
Luette bifide
Aorte deforme
Caractéristique moléculaire du syndrome de Marfan
30% des patients = mutation de novo
Mode de transmission de syndrome de marfan
Autosomique dominant
Quel est l’etalon d’or dans le syndrome de Marfan ?
Sequencage de FBN1 (gene)
La prevalence d’une mort subite cardiaque ? En general pour toutes les maladies
15 a 20% de tous les deces (4% inexpliqués)
Que fait on apres une mort subite cardiaque ?
Autopsié moléculaire
Generalites sur l’hypercholestérolémie familiale ?
Desordre genetique des lipides
Elevation du niveau de LDL
2 Particularités de la HF ? Dont son mode de transmission
Mode de transmission semi dominant car heterozygote ou homozygote
Et
Effet fondateur au Quebec
Présentation clinique phare des gens qui ont l’HF ?
Xanthomee tandineux (pathognomonique)
2 Traitements contre HF
Nvlle Classe de statine
Anticorps monoclonaux contre PCSK9
2 faits sur l’hyperchylomicronemie familiale (CMF)
Desordre genetique de la LPL
Elevation des TG et des Chylomicrons
Mode de transmission de l’hyperchylomicronemie familiale
Autosomique recessif
2 particularités de la CMF
Maladie tres rare
Effet fondateur important au Quebec
Présentation clinique de la CMF
Bcp de TG fans le sang
Boutons
Lipide dans les yeux
Pancréatite et maux de ventre
Traitement de la CMF
Diete faible en gras (contraignant)
2 faits sur la dystrophie de duchenne
Maladie neuromusculaire degenerative
Defaut de la proteine dystrophine
Mode de transmission de DMD
Recessif lie a X (touche bcp + les hommes)
Présentations cliniques de la DMD
bcp de CK
signe de Gowers
Un peu bete et respire mal
3 categories de variants dans la DMD
Large délétion dans le gene DMD
Large duplication
Petite insertion ou deletion ou SNPs
3 faits sur la fibrose kystique (FK) (mucoviscidose)
Maladie la + commune autosomique recessive chez les caucasiens
Desordre multisystemique
Dysfonctionnement du canal chlore CFTR = mucus
Fibrose kystique mode transmission ?
Autosomique recessif
Au niveau moléculaire dans la FK il se passe quoi ?
Plus de 1600 mutations du gene CFTR Et qui sont divisees en 6 classes
Quelles sont les six classes de mutation du gene CFTR
1 : pas de prot
2 : prot va pas a la surface
3 : prot fonctionne pas
4 : prot fonctionne peu
5 : moins de pro
6 : prot est instable
Quel est le variant le plus connu chez le gene CTFR chez les caucasiens ? Il fait quoi ?
Variant deltaF508
Deletetion de 3 N = perte de phenylanaline a la position 508
Pharmacogénétique ? Role ?
Profil genetique qui permet de connaitre la reponse a un medoc et donc medecine personnalise
Depistage pangenomique ? 5 maladies ?
Prédiction de dvl une maladie grace au genotype de pleins de variants d’ADN
Coronarienne
Fibrillation auriculaire
Cancer sein
Diabete 2
Inflammation Intestin
Les deux types de systèmes ?
Fermes et ouverts
Syteme ouvert ??
3 ou 4 zones avec circuit unidirectionnel essentiel pour eviter la contamination