Chap.3 - Chimie médicinale Flashcards
Quelles sont les sources de la découverte de mx ? (4)
- Produits naturels
- Rationnelle
- Aléatoire
- Basé sur le phénotype
Quelles étaient les premières molécules utilisées comme remèdes ?
Produits naturels. D’abord sous forme d’extrait, puis sous forme pure isolée, puis sous forme modifiée chimiquement
Qu’est-ce qu’un produit naturel ?
N’importe quelle substance produite par un organisme vivant, généralement des métabolites secondaires
Qu’est-ce qu’un métabolite primaire ?
Molécule issue du métabolisme primaire et qui est essentiel à la croissance de l’organisme qui la produit
Qu’est-ce qu’un métabolite secondaire ?
Molécule qui n’est pas essentielle à la croissance, au développement ou à la reproduction de l’organisme qui la produit. Habituellement produits en très petite quantité
Quelles sont les fonctions des métabolites secondaires ? (3)
- Défense
- Communication
- Augmente les chances de survie des organismes qui la produise en repoussant ou en attirant d’autres organismes
Comment est-ce qu’on peut utiliser les produits naturels pour découvrir des mx ? (3)
- Comme ingrédient actif
- Comme tête de série et inspiration pour la synthèse d’analogue
- Comme outil pour la découverte de nouvelles cibles biologiques
Comment est-ce qu’on utilise l’approche rationnelle pour découvrir des mx ? (2)
- Analogues des substrats ou ligands naturels d’une cible biologique (enzyme/récepteur) impliqué dans une maladie
- Utilisation des données structurales pour l’optimisation (cristallographie, RMN, modelage moléculaire)
Qu’est-ce qu’un pharmacophore ?
Ensemble de caractéristiques chimiques nécessaires pour assurer les interactions optimales avec une cible biologique spécifique et pour déclencher (ou bloquer) sa réponse biologique
Quelles sont les 2 approches rationnelles pour découvrir des mx ?
- Basé sur le ligand
- Basé sur la cible
Quels sont les prérequis pour utilisé l’approche basé sur le ligand ?
Avoir plusieurs composés actifs dont on connait le pharmacophore
Quel est l’objectif visé par l’approche basée sur le ligand ?
Conception de nouveaux composés actifs où les éléments du pharmacophore sont présents
Quels sont les outils qu’on utilise pour utiliser l’approche basée sur le ligand ? (2)
- Modélisation moléculaire (technique de docking)
- Cristallographie (rayon-X)
Quels sont les prérequis pour utilisé l’approche basé sur la cible ?
Avoir une cible dont on connait la structure 3D et le site actif
Quels sont les objectifs visés par l’approche basée sur la cible ? (2)
- Conception de nouveaux composés d’actifs
- Amélioration de composés actifs existants
Quels sont les outils qu’on utilise pour utiliser l’approche basée sur la cible ? (3)
- Modélisation moléculaire (pliage/dockage)
- Cristallographie (rayon-X)
- RMN
Comment est-ce qu’on utilise l’approche aléatoire pour découvrir des mx ?
Criblage à haute capacité de collections de composés issus d’ancien programmes et de librairies combinatoires
Quel est le prérequis à l’utilisation de la méthode aléatoire ?
Nécessitent la connaissance moléculaire des cibles
Qu’est-ce que la relation structure-activité (RSA) ?
Relation entre la structure chimique 3D d’une molécule et son activité biologique
Quand est-ce qu’on dit qu’il y a présence de RSA ?
Lorsque certaines modifications structurales à l’intérieur d’un composé tête de série produisent des différences d’activité (amélioration ou détérioration) de l’ordre de 100 fois
(on cherche habituellement des analogues puissant)
Quand est-ce qu’on dit qu’il y a absence de RSA ?
Lorsque tous les analogues sont faibles (µM) ou ont plus ou moins la même activité
Comment est-ce qu’on découvre les groupes essentiels à l’activité biologique? (3)
- Par la RSA
- Par résonnance magnétique nucléaire (RMN)
- Par diffraction des rayons X
Comment est-ce qu’on découvre les groupes essentiels à l’activité biologique à partir de la RSA ?
En comparant les structures et l’activité biologique de plusieurs composés actifs avec le même mécanisme d’action (même site de liaison de la même cible)
Comment est-ce qu’on découvre les groupes essentiels à l’activité biologique à partir de la RMN ?
En analysant les interaction entre un ligand et sa cible
