Chap.3 - Chimie médicinale Flashcards
Quelles sont les sources de la découverte de mx ? (4)
- Produits naturels
- Rationnelle
- Aléatoire
- Basé sur le phénotype
Quelles étaient les premières molécules utilisées comme remèdes ?
Produits naturels. D’abord sous forme d’extrait, puis sous forme pure isolée, puis sous forme modifiée chimiquement
Qu’est-ce qu’un produit naturel ?
N’importe quelle substance produite par un organisme vivant, généralement des métabolites secondaires
Qu’est-ce qu’un métabolite primaire ?
Molécule issue du métabolisme primaire et qui est essentiel à la croissance de l’organisme qui la produit
Qu’est-ce qu’un métabolite secondaire ?
Molécule qui n’est pas essentielle à la croissance, au développement ou à la reproduction de l’organisme qui la produit. Habituellement produits en très petite quantité
Quelles sont les fonctions des métabolites secondaires ? (3)
- Défense
- Communication
- Augmente les chances de survie des organismes qui la produise en repoussant ou en attirant d’autres organismes
Comment est-ce qu’on peut utiliser les produits naturels pour découvrir des mx ? (3)
- Comme ingrédient actif
- Comme tête de série et inspiration pour la synthèse d’analogue
- Comme outil pour la découverte de nouvelles cibles biologiques
Comment est-ce qu’on utilise l’approche rationnelle pour découvrir des mx ? (2)
- Analogues des substrats ou ligands naturels d’une cible biologique (enzyme/récepteur) impliqué dans une maladie
- Utilisation des données structurales pour l’optimisation (cristallographie, RMN, modelage moléculaire)
Qu’est-ce qu’un pharmacophore ?
Ensemble de caractéristiques chimiques nécessaires pour assurer les interactions optimales avec une cible biologique spécifique et pour déclencher (ou bloquer) sa réponse biologique
Quelles sont les 2 approches rationnelles pour découvrir des mx ?
- Basé sur le ligand
- Basé sur la cible
Quels sont les prérequis pour utilisé l’approche basé sur le ligand ?
Avoir plusieurs composés actifs dont on connait le pharmacophore
Quel est l’objectif visé par l’approche basée sur le ligand ?
Conception de nouveaux composés actifs où les éléments du pharmacophore sont présents
Quels sont les outils qu’on utilise pour utiliser l’approche basée sur le ligand ? (2)
- Modélisation moléculaire (technique de docking)
- Cristallographie (rayon-X)
Quels sont les prérequis pour utilisé l’approche basé sur la cible ?
Avoir une cible dont on connait la structure 3D et le site actif
Quels sont les objectifs visés par l’approche basée sur la cible ? (2)
- Conception de nouveaux composés d’actifs
- Amélioration de composés actifs existants
Quels sont les outils qu’on utilise pour utiliser l’approche basée sur la cible ? (3)
- Modélisation moléculaire (pliage/dockage)
- Cristallographie (rayon-X)
- RMN
Comment est-ce qu’on utilise l’approche aléatoire pour découvrir des mx ?
Criblage à haute capacité de collections de composés issus d’ancien programmes et de librairies combinatoires
Quel est le prérequis à l’utilisation de la méthode aléatoire ?
Nécessitent la connaissance moléculaire des cibles
Qu’est-ce que la relation structure-activité (RSA) ?
Relation entre la structure chimique 3D d’une molécule et son activité biologique
Quand est-ce qu’on dit qu’il y a présence de RSA ?
Lorsque certaines modifications structurales à l’intérieur d’un composé tête de série produisent des différences d’activité (amélioration ou détérioration) de l’ordre de 100 fois
(on cherche habituellement des analogues puissant)
Quand est-ce qu’on dit qu’il y a absence de RSA ?
Lorsque tous les analogues sont faibles (µM) ou ont plus ou moins la même activité
Comment est-ce qu’on découvre les groupes essentiels à l’activité biologique? (3)
- Par la RSA
- Par résonnance magnétique nucléaire (RMN)
- Par diffraction des rayons X
Comment est-ce qu’on découvre les groupes essentiels à l’activité biologique à partir de la RSA ?
En comparant les structures et l’activité biologique de plusieurs composés actifs avec le même mécanisme d’action (même site de liaison de la même cible)
Comment est-ce qu’on découvre les groupes essentiels à l’activité biologique à partir de la RMN ?
En analysant les interaction entre un ligand et sa cible
Comment est-ce qu’on découvre les groupes essentiels à l’activité biologique à partir de la diffraction des rayons X ?
En analysant une co-structure cristalline d’un ligand avec sa cible
Qu’est-ce que l’optimisation structurelle ?
Modifications basées sur la structure cristalline du récepteur ligand qui visent à optimiser l’affinité d’un mx pour son récepteur
Qu’est-ce qu’un bioisostérie ?
Approche à la modification structurale d’une tête de série qui a démontré plusieurs fois son utilité dans l’amélioration des propriété biopharmaceutiques d’une molécule sans nuire à son efficacité
Pourquoi effectuer la modification bioisostérique d’une tête de série ? (8)
- Pour obtenir un meilleur profil d’activité
- Pour obtenir un meilleur profil de sélectivité
- Pour obtenir un meilleur profil d’effets secondaires
- Pour obtenir un meilleur profil toxicologique
- Pour obtenir un meilleur profil pharmacocinétique
- Pour obtenir un meilleur profil de stabilité
- Pour obtenir une synthèse plus simple
- Pour se démarquer du brevet d’une autre organisation
Qu’est-ce que la dénomination commune internationale (aussi appelé nom générique) ?
Nom unique et non commerciale d’une substance active pharmacologique défini par l’Organisation mondiale de la santé, conçu pour être utilisable sans ambiguïté dans un grand nombre de langue
Quels sont les 2 principes fondamentaux de la dénomination commune internationale (DCI) ?
- Nom unique (son et orthographie)
- Longueur raisonnable
Quels sont les principes secondaires de la dénomination commune internationale ? (40
- Emploi de segments clés pour désigner l’activité thérapeutique, les fonctions chimiques et certains éléments de structure
- Simplification orthographique
- Acides désignés par un seul mot (ex. Atorvastatine)
- Sels désignés par un terme qui ne modifie pas le nom d’origine (ex. Atorvastatine calcique)
Qu’est-ce qu’un segment clé dans la dénomination commune internationale des mx ?
Segment dans le nom du mx qui désigne l’activité thérapeutique, les fonctions chimiques et des éléments de structure