BLOK 1: Membrantransport, neurologi og biomekanik Flashcards
Kende til cellemembranens opbygning og kunne forklare, at cellemembranen består af et ”lipid dobbeltlag”
En cellemembran består af et dobbeltlaget lipidlag. Lipidlaget udgøres af phospholipider, der ligesom micelledannelse, vender disses hydrofile hoveder ud mod cellens omgivelser og ind mod cellens cytoplasma. Phospholipiderne har både et hydrofilt hoved og en hydrofob hale bestående af to upolære alifatiske carbonkæder. Kæderne vender ind mod hinanden hvilket giver membranen et fedtopløseligt indre. Dette tillader diffusion af fedtopløselige stoffer over cellemembranen.
I cellemembranen findes derudover tværgående proteinkomplekser, der fungerer som porre/transportproteiner så cellen kan afgive og optage næringsstoffer der ikke har en upolær ladning.
Cellemembranens vigtigste funktioner
Kunne gøre rede for cellemembranens vigtigste funktioner
Afgrænsning af cellens arvemateriale, organer og cytoplasma
Beskyttelse mod ydre miljø
Diffusion af specifikke stoffer
Kende de vigtigse membranproteiner og hvad de betyder for cellespecialisering
receptorer
enzymer
vævstypeantigener
forankrings proteiner
transportproteiner.
Ydermere inddeles de efter placering:
Transmembrane (gennem hele membranen)
monolipidlags
lipidforbundne
proteinhæftede proteiner (protein+transmembran protein).
Ved hjælp af ionkanaler og proteiner i cellemembranen foretages selektiv transport af specifikke ioner eller molekyler ind og ud af cellen. Celletypen afhænger af funktion og afgøres således af cellens genetiske materiale samt udtrykte proteiner i cellemembranen.
Eksempler på membranproteiners funktioner kan være transportører (Na/k-pumpen i nerveceller), receptorer (insulinreceptorer) og enzymer.
Afhængigt af membranproteinernes placering i og omkring cellemembranen inddeles de i følgende typer :
receptorer
enzymer
vævstypeantigener
forankrings proteiner
transportproteiner.
Ydermere inddeles de efter placering:
Transmembrane (gennem hele membranen)
monolipidlags
lipidforbundne
proteinhæftede proteiner (protein+transmembran protein).
Typisk ses transmembrane proteiner i alfa-helix-strukture, der danner et rør som udgør ionkanalerne.
Opbygning af membranprotein
Membranprotein
min 19 hydrofobe aminosyre på et a-helix
indre hydrofile aminosyresidekæder der kan interagere med transport stoffer (ca)
Kende til begreberne koncentration, flux og permeabilitet
Kende til begreberne koncentration, flux og permeabilitet
Koncentration: mål for mængde stof c i blanding af stof C (deraf c/C).
Flux: Mål for hvor meget af en given størrelse der strømmer gennem en flade (eks. Ca+ influx).
Permeabilitet angiver et stofs gennemtrængelighed.
Kunne redegøre for cellemembranens (lipid dobbeltlagets) permeabilitet
Kunne redegøre for cellemembranens (lipid dobbeltlagets) permeabilitet
Cellemembranen består som før nævnt af et dobbelt lipidlag hvori de hydrofile hoveder vender udaf, og carbonkæderne (de hydrofobe haler) vender indad.
Således er cellemembranen permeabel overfor mindre hydrofobe stoffer (Oxygen, kuldioxid og kvælstof. Noter også at mindre polære molekyler (uladede) også kan trænge gennem cellemembranen. Det er samtidig ikke muligt for molekyler som vand at trænge gennem membranen, idet at vandet til
Kunne redegøre for hvorfor og hvordan ioner og andre hydrofile molekyler kan transporteres over cellemembranen ved hjælp af membranproteiner
Hydrofile stoffer er polære eller ladede stoffer/ioner. Overordnet set findes tre måder, at polære molekyler kan transporteres over cellemembranen.
Under aktiv transport (forbrug af ATP), kan en transmembran-pumpe transporterer det ladede stof over cellemembranen.
Under faciliteret diffusion kan et polært stof trænge over cellemembranen gennem en transmembran-kanal eller pumpe. Noter at begge typer faciliterede diffusioner foregår under passiv transport, og processen kræver derfor ikke ATP.
Det er også muligt for vand at trænge gennem cellemembranen ved hælp af aquaporiner placeret i membranen.
Porre/ionkanaler
Porre/ionkanaler:
Porer/kanaler tillader kun passage af små hydrofile molekyler. Ofte er kanalerne bygget som et rør, bestående af alfa helixer og evt beta foldeblade. Som regel kan porene reguleres (åbnes og lukkes), ved bestemte stofmængdekoncentrationer eller efter binding til specifikke molekyler.
Aquaporin-kanal: vand
Ion pumper
Pumper: Skubber ioner MOD deres koncentrationsgradient under forbrug af ATP
Større molekyler som aminosyre og sukkergrupper kan kun trænge gennem cellemembranen ved hjælp af faciliteret diffusion. Faciliteret diffusion sker ved, at transport stoffet bindes til et transportprotein (transmembran pumpe), der åbner udad og går tværs gennem lipidlagene. Efter binding ændres transportproteinets tertiære struktur og åbner indad så transport stoffet kan frigives til cellens indre.
Eksempel på en pumpe kan være Na+/k+pumpen.
Na+/k+pumpen er spændingsreguleret, og sørger for konstant opretholdelse af Na+ og k+ koncentratiner på inder såvel som ydersiden af cellemembranen.
Ionkanaler kendes også som uniporterer. Disse kan kun transporterer en specifik typer ioner/molekyler. Ionkanalerne laver passiv transport og benytter ikke ATP under transport. Ionkanalerne kan enten være spændingsregulerede (spænding over membranpotientale) eller ligand-gatede ionakanaler (binding til specifikke ligander).
Sym- vs. antiportere
Symportere
Symporterer transporterer to stoffer samme vej over cellemembranen.
Antiportere
Antiportere transporterer to stoffer hver sin vej over cellemembranen
Opbygning af porre/ionkanaler
Porre/ionkanaler:
PorerIonkanaler opbygges af adskillige polypeptider.
Proteinets sekundære struktur sammenholdes af hydrogenbindinger mellem aminosyrenes NH- og carboxylsyregrupper. Disse
sekundære strukturer inddeles i to underkategorier: alfa-helixer (gul), og
beta-foldeblade (blå). α-helix’er har en vindeltrappe-struktur, der bevirker at radikalerne vender udad. Disse bindes, som før nævnt, sammen af
hydrogenbindinger mellem aminosyrernes NH grupper og en carboxylgrupper 4 led længere oppe i peptidkæden. Det er således a-helixer, der skaber ionkanalernes rørformerede struktur.
Opbygning af ionpumper samt symp- og antiporter
Pumper:
Transmembrane pumper er enzymer, der transporterer ioner ind eller ud af cellen trods koncentrationsgradient.
Symportere og antiportere
CO-transporterne er opbygges af transmembrane protein-strukturer, der danner et intra- og extracellulært hul. Efter at et eller flere molekyler har bundet sig til proteinet foregår en konformationsændring, en ændring i proteinets tertiære struktur, og proteinet åbnes og frigiver transportstofferne.
Beskriv ionkanalers selektivitet
Selektivitet
Ionkanaler transporterer specifikke ioner over cellemembranen og er deraf også selektive idet at de udelukkende transporterer specifikke ioner.
Det ses at nogle ionkanaler er ‘leaky’, og derfor ikke kan lukke, hvilket resulterer i en konstant transport af ioner. Et eksempel på en sådan ionkanal er k+ -kanalen.
Selektiviteten i ionkanaler sker via ion selektivitets “filtre”.
Det transmembrane protein, der udgør ionkanalen, er udstyret med specifikke aminosyre ved åbningen. Før at ioner kan passerer gennem ionkanalen skal disse dehydreres (idet at de uden for cellen befinder sig i vandig opløsning). Ionerne kan kun interagere med aminosyren, såfremt at disses binding er lige så stærk hvis ikke stærkere end bindingerne til vandmolekylerne.
Beskriv ionkanalers GATING
Gating
Gating er en regulering/styring af ionkanalernes aktivitet. Kanalerne kan enten responderer og åbne/lukke på specifikt stimulus (spænding, ligander, varme eller tryk) eller spontant.
Ved stimuli bindes et mindre molekyle til ionkanal-proteinet(ligand-gated-ion kanal), og derefter foregår en konformationsændring i proteinets struktur således at ionkanalen åbnes og tillader passage.
Alle ionkanaler bliver gatede, og kan kun fungere via passiv transport.
Beskriv spændings- og ligandregulrede ionkanaler
Spændingsregulerede ionkanaler
Andre ionkanaler er spændingsregulerede og responderer på ændring i membranpotentialet. Spændingsregulerede ionkanaler er typisk set på nerveceller, da disse spiller en stor rolle i videreførslen af aktionspotentiale over cellemembranen.
Ligand-regulering
Ligand-regulerede ionkanaler er gatede, og åbner/lukker kun ved stimuli fra specifikke ligander bundet til ionkanalen.
Efter ligandbinding kan ionkanalen også inaktivieres, ved en konformationsændring så stor at proteinet ikke kan vende tilbage til oprindelig form.
Have kendskab til salte, samt simple syrer og baser
Salt
Salte er ionforbindelser mellem metalliske og ikke metalliske ioner. Fælles for alle salte er dog, at de:
Opløst i vand kan danne frie ioner
Er krystalliseret i fast form
Ikke har en samlet elektrisk ladning (TJEK)
NaCl(s) + H2O ⇄ Na+(aq) + Cl-(aq)
Når en ionforbindelse (et salt), reagerer med vand afskilles ionforbindelsen, og ionerne bliver fritflydende i vand, hvilket giver vandet den elektriske ledeevne.
Syre
Syre er et stof, et molekyle, der er i overskud af protoner, og derfor afgiver hydroner.
Trods varierende syrestyrke er væsken ætsende.
HCl(aq) + H2O(l) → H3O+(aq) + Cl- (aq)
Når en syre reagerer med vand afgives der protoner til H2O som reagerer med denne og danner oxoniumion (H3O+). Samtidig findes der nu klor, som en fri negativ ladet ion da denne lige har afgivet en proton.
Base
Omvendt er baser et molekyle der er i underskud af H+ og modtager hydroner, og er derfor
NH3 (aq) + H2O(l) → NH4+(aq) + OH- (aq)
Når baser reagere med vand, optages der protoner fra H2O - især hvis basen er stærk. Derfor afgives der protoner og vandet bliver basisk med OH- grupper.
Kend forskellige enheder for tryk
Kraft (F = Force)
F = m*a (a=acceleration)
Tyngdekraft (Fg)
Objekt med masse på m= 0,100 kg.
Tyngdekraft: Fg = m*g (g=tyngdeacceleration).
g=9,82 m=0,100 kg
F = 0,100 kg * 9,82 (N/kg) = F=0,982 Newton
Tryk (Ft)
Ft = Fg/A (A=Areal)
Tryk er tyngdekraft pr. areal. Alment når der snakkes om tryk angives det i enten newton (N), pascal (newton/m2), eller bar (100kPa).
Beskriv Iso- hypo- hypertonisk miljø i cellen
Isotonisk miljø: Koncentrationen af stoffer uden for cellen er lig med koncentrationen inde i cellen, hvilket resulterer i ingen nettodiffusion af vand og opretholdelse af normal celleform og størrelse.
Hypotonisk miljø: Koncentrationen af stoffer uden for cellen er lavere end koncentrationen inde i cellen, hvilket fører til en nettostrøm af vand ind i cellen. Dette kan resultere i cellehævelse og mulig sprængning af cellen.
Hypertonisk miljø: Koncentrationen af stoffer uden for cellen er højere end koncentrationen inde i cellen, hvilket resulterer i en nettostrøm af vand ud af cellen. Dette fører til tab af nødvendig væske for mikroorganismerne og kan påvirke deres overlevelse.
Beregn osmotisk tryk
Kunne beregne osmotisk tryk
p = Osmotisk tryk i = antal partikler ved opløst stof
C = Molære koncentration R = gaskonstanten (0,080205 ((kgatm)/(molK))
T = absolut temperatur målt i K (C+273).
pOsmotisk tryk=iCRT
Forskel på intra og ekstracellulæe koncentraitnoer
Have kendskab til intra- og ekstracellulære koncentrationer
Der skelnes mellem intra- og ekstracellulære koncentrationer grundet at der i cellemembranen findes adskillige forskellige pumper, ionkanaler, og proteiner, der tillader specifikke molekyler og ioner at passerer ind i cellen. Denne selektivitet bevirker også at der kan være en anderledes koncentration af eksempelvis kalium indeni, som udenfor cellen.