Bakteriologia - kurs rozszerzony Flashcards

Question 1

Q

mikroorganizmy (definicja)

Answer

A

to jednokomórkowe organizmy widoczne pod mikroskopem

Question 2

Q

formy niejednokomórkowe zaliczane do drobnoustrojów to.. (3)

Answer

A

wirusy
priony
mobilne elementy genetyczne

Question 3

Q

Grupy drobnoustrojów (4) i ich przykłady

Answer

A

prokariotyczne - bakterie, archeony
eukariotyczne - mikroskopijne grzyby (pleśnie, drożdże, drożdżopodobne), śluzorośla (ameboidalne)
protista - glony, pierwotniaki
wirusy

Question 4

Q

wirusy (charakterystyka - 11)

Answer

A

małe organizmy
proste struktury
genom to DNA lub RNA
występują białka strukturalne i wyjątkowo enzymy
brak aktywności metabolicznej
zależne od żywicieli
swoistość i specyficzność
reprodukcja tylko w żywych komórkach
patogeny
fagi drobnoustrojów (pozytywny aspekt) - np. bakteriofagi, algofagi, wirofagi, fungifagi
to ustroje skrajnie pasożytnicze, które powstały na drodze ewolucji degeneratywnej - nastąpiła redukcja genów i zdolności do bycia samodzielną komórką

Question 5

Q

Mikroby (występowanie)

Answer

A

Występują wszędzie - w środowiskach wodnych, lądowych, w powietrzu (ale jest to środowisko przejściowe służące jako miejsce transportu) oraz kolonizują żywicieli.

Question 6

Q

Endolity (charakterystyka - 4)

Answer

A

to skalne pokłady obfitujące w mikroby
to obecność żywych układów drobnoustrojów w skałach i ich szczelinach lub porach, w których znajduje się woda
głównie występują grzyby pleśniowe, drożdże, drożdżopodobne, bakterie i archeony
np. Bacillus infernus - hipertermofil, 20m-2,8km pod ziemią

Question 7

Q

rozmiary mikroorganizmów

Answer

A

0,1 mikrona - 500 mikronów

Wyjątek:

olbrzymy > 0,7 mm
np. Epulopiscium fishelsoni, Thiomargarita namibiensis
nanoby - najmniejsze

Question 8

Q

nanoby (charakterystyka - 12)

Answer

A

najmniejsze z drobnoustrojów: 0,01-0,6 mikronów
określane jako ultramikroby, nanoformy, wapniejące nanocząstki, nanoby
ich transmisja jest szybka i łatwa - odbywa się za pośrednictwem powietrza, asteroid, międzygwiezdnego pyłu, kurzu, chmur.
wykazują wysoką tolerancję na czynniki antymikrobiologiczne, środowiskowe
wykazują wolny metabolizm i wzrost - czas generacji to 3 dni
w hodowlach tkankowych po 30 dniach pojawiają się w formie mlecznego biofilmu
pleomorfizm
budową zbliżone do Gram-ujemnych
zdolne do przechodzenia przez filtry
nieliczne wydzielają węglan apatytu
chorobotwórcze dla ludzi i zwierząt - występuje latentność
możliwy polimorfizm

Question 9

Q

nanoby (występowanie)

Answer

A

Powszechnie występują w glebie, wodzie, stratosferze, ekstremalnych środowiskach, galaktyce. Izoluje się je również z ludzi i zwierząt, ze ścieków i zanieczyszczonych wód.

Question 10

Q

nanoby (wymagania wzrostowe - 2)

Answer

A

wysokie w warunkach in vitro

2. hodowle tkankowe lub komórkowe - surowica 37stC w 5% CO2 atmosferycznego

Question 11

Q

nanoby są oporne na… (3)

Answer

A

wysuszenie i wysoką temperaturę
promieniowanie UV
środki dezynfekcyjne i antyseptyki

Question 12

Q

nanoby są wrażliwe na… (3)

Answer

A

3mR promieniowania jonizującego
gotowanie przez 30 min
chemioterapeutyki - tetracykliny i sulfonamidy

Question 13

Q

nanoby (chorobotwórczość - 5)

Answer

A

kamica nerkowa - nerfotropizm
wielotorbielowatość nerek
choroby wzrostowe układu moczowo-płciowego
choroby naczyniowo-sercowe
powstawanie raka

Question 14

Q

nanoby uczestniczą w procesach takich jak… (3)

Answer

A

procesy chorobotwórcze - miażdżyca tętnic, kamica miazgi zębowej, zapalenia przyzębia
procesy geochemiczne - mineralizacja, skałotwórczość [mineralizacja, kalcyfikacja], glebotwórczość, korozja metali [rdzewienie żelaza, zielenienie miedzi, rozpuszczanie glinu], tworzenie kamienia kotłowego [niedrożność rur]
procesy żywych organizmów - konstruowanie skorupek pierwotniaków, muszli mięczaków, skorupek jaj ptaków

Question 15

Q

nanoby (przykłady - 2)

Answer

A

Nanoarchaeum equitans

2. Nanobacterium sanguineum

Question 16

Q

nanoby (przykład współżycia)

Answer

A

Ignicoccus spp.(archea) i Nanoarcheoum equitans (nanob)

Ignicoccus spp. to termofilny autotrof (źródło energii z przemian H2 lub S), Gram-ujemny ziarniak, charakterystyczna ściana komórkowa, której błona zewnętrzna z dużą przestrzenią peryplazmatyczną
Nanoarchaeum euitans to terfmofilny archeon, posiada zredukowany genom, występuje warstwa S na powierzchni i w peryplazmie pod błoną zewnętrzną, jego tryb życia wymaga żywiciela jako źródło energii i węgla - pasożyt lub interakcja symbiotyczna

Question 17

Q

etapy przeprowadzania badań (5)

Answer

A

obserwacja i pytania
hipoteza
zaplanowanie doświadczenia
powtórzenie eksperymentu
odrzucenie, modyfikacja lub przyjęcie hipotezy

Question 18

Q

3 domeny w świecie żywym to…

Answer

A

bakterie
archea
eukariota

Question 19

Q

Archaea [charakterystyka]

Answer

A

Większość to beztlenowce, nieliczne halofile tlenowe
Brak peptydoglikanu w ścianie komórkowej
Zajmują ekstremalne środowiska np. jelito grube

Question 20

Q

3 główne grupy fizjologiczne Archaea

Answer

A

Metanogeny (przeprowadzają syntezę metanu ze związków mineralnych m.in. CO2 i H2 (uboczny produkt metaboliczny innych bakterii – symbioza))
Halofile (przetrwają w wysokich stopniach zasolenia np. oceany, solanki)
Hipertermofile (wykrywane w gorących środowiskach, np. gejzery, podłoża wulkaniczne, hydrotermalne kominy dna oceanu)

Question 21

Q

przykłady Archaea [3]

Answer

A

Methanosarcina barkeri
Methanococcus janaschii
Methanobacterium thermo

Question 22

Q

Od chwili pojawienia się na Ziemi organizmy komórkowe podlegają nieustannie ewolucji objawiającej się poprzez…

Answer

A

selekcję

- zmienność rekombinacyjną i mutacje

Question 23

Q

współczesna eukariotyczna koncepcja gatunku [3]

Answer

A

fenetyczna koncepcja (PhCS - pochodząca od wspólnego przodka, bazująca na cechach fenotypowych),
ewolucyjna koncepcja (ECS - powstanie odrębnych taksonów rozdzielonych w czasie i przestrzeni),
polifilogenetyczna (PCS – przeciwstawiająca się taksonomii linneuszowskiej)

Question 24

Q

Prokariotyczna koncepcja gatunku

Answer

A

brak uniwersalnego systemu klasyfikacji prokariotów
współcześnie: filogenetyczna koncepcja w oparciu o analizy informacji i struktur genetycznych oraz wyznaczania podobieństwa genetycznego (parametry: mol% GC, hybrydyzacja DNA-DNA, analiza rRNA)

Question 25

Q

zmienność genetyczna może nastąpić poprzez… [3]

Answer

A

redukcję genomów - chlamydie, wirusy, riketsje
przenoszenie plazmidów - HGT
mutacje

Question 26

Q

Rodzaje transferów genów [2]

Answer

A

HGT – Horyzontalny (lateralny) transfer genów
- Koniugacja – „proces płciowy”, dawca i biorca
- Transdukcja – za pośrednictwem bakteriofagów
- Transformacja – pobieranie wolnego DNA ze środowiska
Wertykalny (pionowy) transfer genów

Question 27

Q

współczesna klasyfikacja organizmów prokariotycznych [cechy]

Answer

A

to taksonomia polifazowa - wielokierunkowa
czerpie informacje z badań:
> fenotypowych - profil aktywności metabolicznej, cechy fizjologiczne, morfologiczne, wirulentność, oporność
> genomowych - informacje genetyczna (np. markery molekularne)
> filogenetycznych

Question 28

Q

genotyp to …

Answer

A

informacja genetyczna + fenotyp modyfikowany przez czynniki środowiska

Question 29

Q

fenotyp to…

Answer

A

rezultat interakcji genotypu z czynnikami środowiskowymi

Question 30

Q

techniki taksonomiczne [5]

Answer

A

zawartość zasad G+C w DNA
- pierwszy marker taksonomiczny
- różnice większe od 10 mol% – organizmy nie należą do tego samego rodzaju
- różnice większe niż 5% – nie należą do tego samego gatunku
metody hybrydyzacja DNA/DNA
- niezbędna do wyznaczania granic gatunku bakteryjnego
- do 20% różnic w ułożeniu nukleotydów w gatunku
sekwencjonowanie kwasów nukleinowych – analiza podjednostek 16S rRNA, genów kodujących polimerazę RNA, gyrazę, syntetazę ATP, białka szoku cieplnego DnaK (homolog Hsp70), syntetazę glutaminy czy genów białka RecA
analiza porównawcza fragmentów DNA
Porównanie sekwencji w metodzie hybrydyzacji DNA-rRNA

Question 31

Q

analiza zawartości G+C w DNA

Answer

A

• dsDNA utworzony z komplementarnych par zasad G+C i A-T, a stosunek molarny G/C i A/T jest stały i zwykle wynosi 1
• względny stosunek zawartości molarności [G+C]/[A+T] jest różny
• pozwalają odróżnić szczepy z podobnym fenotypem
• zawartość G+C w DNA prokariontów mieści się w szerokich granicach 20-80 mol%
o niezależne od technik PCR,
o analiza całego genomu,
o metoda ilościowa,
o detekcja unikalnych gatunków
• marker nie wystarczający do opisania gatunku

Question 32

Q

za złoty standard w określaniu pozycji filogenetycznych / gatunkowej dla prokariontów uznaje się techniki

Answer

A

techniki wyznaczania stopnia podobieństwa/identyczności (homologiczności) całych genomów analizowanych ze sobą szczepów - hybrydyzacja DNA-DNA
• wykorzystuje się naturalne właściwości fizykochemiczne kwasów nukleinowych tj. zdolność do denaturacji i reasocjacji komplementarnych nici w podwójnej helisie DNA
• współczynnik RBR – względny stopień wiązania między nukleotydami
• współczynnik ∆Tm – różnica temperatur denaturacji termicznej w analizach porównawczych między szczepami
• Parametry RBR ∆Tm
- cechuje je wzajemna wysoka korelacja
- wzajemna transformacja niemożliwa
• Zalety parametru ∆Tm
- wartość zawsze taka sama
- zbędna obróbka danych surowych
• Rekomendacje: wartość hybrydyzacji DNA-DNA
- przy poziomie 70% i powyżej współczynnika RBR – duże pokrewieństwo między szczepami
- przy współczynniku ∆Tm ≤ 5oC oznacza bliskie pokrewieństwo genetyczne i można zaliczyć szczepy do tego samego taksonu

Question 33

Q

metody sekwencjonowania DNA [2]

Answer

A

o metoda terminacji łańcucha

o Metoda Maxama i Gilberta (chemiczna degradacja DNA)

Question 34

Q

alternatywne metody sekwencjonowania DNA oparte są na [3]

Answer

A

o Hybrydyzacji
o równoległej ligacji i rozszczepianiu
o Pirosekwencjonowaniu (sekwencjonowanie kwasów nukleinowych w czasie rzeczywistym) - Wyznakowane nukleotydy w momencie dołączania się do nici DNA uwalniany jest pirofosforan, którego ilość jest następnie zliczana

Question 35

Q

Metody typowania DNA

Answer

A

DNA fingerprinting, genetyczny odcisk palca, „Odcisk palca DNA”

pozwalają wykryć wewnątrzgatunkowe różnice
metody pierwszej generacji w oparciu o analizę restrykcyjnych fragmentów DNA całego genomu
metody PCR z analizą z amplifikowanych fragmentów genomowego DNA

Question 36

Q

Analiza rRNA lub genów kodujących rRNA (rDNA)

Answer

A

• geny rRNA wysoce konserwatywne, fundamentalna rola rybosomów
• rRNA cząsteczki występujące, specyficzne o stałej funkcji
• rRNA doskonały marker w badaniach filogenetycznych
• różnice w strukturze pierwszorzędowej odzwierciedlają oddalenie ewolucyjne między organizmami
• badane 3 odmiany rRNA - 23S, 16S i 5S
• najlepiej przebadaną i opisaną molekułą jest 16S, najwięcej informacji
• powszechnie akceptuje się analizę 16S rRNA w badaniach taksonomicznych i filogenetycznych prokariotów w integracji z innymi technikami stosowanymi w polifazowej charakterystyce szczepów
• alternatywne molekuły: 23S rRNA, geny kodujące podjednostki ATPazy, czynniki elongacyjne i polimerazy RNA, białka szoku termicznego, chaperony
o Określenie stopnia pokrewieństwa pomiędzy szczepami powyżej poziomu gatunkowego;
o Umożliwia detekcję niehodowlanych szczepów in situ w próbie środowiskowej
o Analizę dystrybucji i rozmieszczenia szczepów w naturalnych habitatach
o Monitorowanie bioróżnorodności lub struktury mikrobiologicznej w środowiskach (tworząc wyznakowane sondy rRNA, metody pomiaru w czasie rzeczywistym )

Question 37

Q

3 techniki rekonstrukcji drzewa filogenetycznego

Answer

A

o Metody odległościowe (macierze odległości ewolucyjnych, prosty algorytm średnich połączeń UPGMA z analizą skupień sekwencji – algorytmy klastrujące)
o Metody maksymalnej parsymonii (szczepy w obrębie gatunku skojarzone ze zbiorami cech)
o Metody największej wiarygodności (największe prawdopodobieństwo powiązań ewolucyjnych między szczepami)

Question 38

Q

białka o wysoce konserwatywnych sekwencjach przydatne w ustalaniu filogenetycznych związków bakterii [7]

Answer

A

o białko szoku termicznego Hsp70 (białka opiekuńcze w warunkach stresowych)
o syntaza lanylo-RNA
o dehydrogenaza bursztynianowa – enzym oddechowy – cykl Krebsa
o hydroliza pirofosforanu – rozkład ATP
o czynniki elongacyjne
o białka rybosomalne L2, L5, 11 15
o gyrazy – białko bakteryjne, replikacja, transkrypcja, rekombinacja

Question 39

Q

Domena: Bacteria

aparat jądrowy
plazmidy
ściana komórkowa
lipidy w błonie
białka histonowe
rybosomy
operony
introny
inicjatorowy tRNA
Wrażliwość rybosomów na toksynę błoniczą
Polimeraza RNA zależna od DNA
Wrażliwość na rafampicynę
Wrażliwość na chloramfenikol, streptomycynę i kanamycynę
Czynniki transkrypcyjne
Replikacja
Metanogeneza
Nitryfikacja
Fotosynteza z udziałem chlorofilu
patogeny
Życie w warunkach ekstremalnych

Answer

A

aparat jądrowy - nukleoid
plazmidy - powszechne
ściana komórkowa - mureina
lipidy w błonie - Wiązania estrowe
białka histonowe - Tylko histonopodobne
rybosomy - 70S
operony - obecne
introny - t. w rRNA i pre-mRNA
inicjatorowy tRNA - formylometionina
Wrażliwość rybosomów na toksynę błoniczą - niewrażliwe
Polimeraza RNA zależna od DNA - 1 (4 podjednostki)
Wrażliwość na rafampicynę - wrażliwe
Wrażliwość na chloramfenikol, streptomycynę i kanamycynę - wrażliwe
Czynniki transkrypcyjne - niepotrzebne
Replikacja - 1 punkt startowy
Metanogeneza - Nie występuje
Nitryfikacja - występuje
Fotosynteza z udziałem chlorofilu - występuje
patogeny - występują
Życie w warunkach ekstremalnych - Mało powszechne

Question 40

Q

Domerna Archeae:

aparat jądrowy
plazmidy
ściana komórkowa
lipidy w błonie
białka histonowe
rybosomy
operony
inicjatorowy tRNA
Wrażliwość rybosomów na toksynę błoniczą
Polimeraza RNA zależna od DNA
Wrażliwość na rafampicynę
Wrażliwość na chloramfenikol, streptomycynę i kanamycynę
Czynniki transkrypcyjne
Replikacja
Metanogeneza
Nitryfikacja
Fotosynteza z udziałem chlorofilu
patogeny
Życie w warunkach ekstremalnych

Answer

A

aparat jądrowy - nukleoid
plazmidy - powszechne
ściana komórkowa - pseudomureina lub brak (brak kwasu muraminowego)
lipidy w błonie - Wiązania eterowe (brak kwasów tłuszczowych, obecność izoprenoidy i hydroksyizoprenoidy)
białka histonowe - obecne
rybosomy - 70S
operony - występują
inicjatorowy tRNA - metionina
Wrażliwość rybosomów na toksynę błoniczą - wrażliwe
Polimeraza RNA zależna od DNA - Kilka (8-12 podjednostek)
Wrażliwość na rafampicynę - niewrażliwe
Wrażliwość na chloramfenikol, streptomycynę i kanamycynę - niewrażliwe
Czynniki transkrypcyjne - wymagane
Replikacja - Wiele punktów startowych
Metanogeneza - występuje
Nitryfikacja - występuje (1 organizm)
Fotosynteza z udziałem chlorofilu - nie występuje
patogeny - nie wykryto
Życie w warunkach ekstremalnych - Powszechne (Halobacterium salinarum, Pyrolobus fumari)

Question 41

Q

Domena Eukarya

aparat jądrowy
plazmidy
ściana komórkowa
lipidy w błonie (wiązania)
białka histonowe
rybosomy
operony
introny
inicjatorowy tRNA
Wrażliwość rybosomów na toksynę błoniczą
Polimeraza RNA zależna od DNA
Wrażliwość na rafampicynę
Wrażliwość na chloramfenikol, streptomycynę i kanamycynę
Czynniki transkrypcyjne
Replikacja
Metanogeneza
Nitryfikacja
Fotosynteza z udziałem chlorofilu
patogeny
Życie w warunkach ekstremalnych

Answer

A

aparat jądrowy - obłonione jądro
plazmidy - rzadkie
ściana komórkowa - Celuloza, chityna
lipidy w błonie - Wiązania estrowe
białka histonowe - obecne
rybosomy - 80S i 70S
operony - brak
introny - obecne
inicjatorowy tRNA - metionina
Wrażliwość rybosomów na toksynę błoniczą - wrażliwe
Polimeraza RNA zależna od DNA - 3 (wielko jednostkowe)
Wrażliwość na rafampicynę - niewrażliwe
Wrażliwość na chloramfenikol, streptomycynę i kanamycynę - niewrażliwe
Czynniki transkrypcyjne - wymagane
Replikacja - Wiele punktów startowych
Metanogeneza - Nie występuje
Nitryfikacja - Nie występuje
Fotosynteza z udziałem chlorofilu - Występuje (chloroplasty)
patogeny - Stosunkowo nieliczne
Życie w warunkach ekstremalnych - rzadkie

Question 42

Q

4 dowody na 3 domeny życia

Answer

A

typ i rodzaj ściany komórkowej – mureina, pseudomureina, celuloza, chityna (wyjątek grupa Planctomyces-Pirellla i Mycoplasma-Chlamydia, brak mureiny, kwasu muraminowego)
rodzaj i układ lipidów – fosfolipidy i fytany/bifytany (wyjątek nieliczne ekstremofilne bakterie)
rodzaje i ilość podjednostek polimerazy RNA
mechanizmy syntezy białek – bakterie kodon start AUG, tRNA – zmodyfikowana metionina, rybosomy niewrażliwe na toksynę błoniczą, hamowanie biosyntezy białek przez antybiotyki

Question 43

Q

Metody fenotypowe

Answer

A

obserwacje cech morfologicznych, fizjologicznych i wzrostowych izolatów
testy fenotypowe - oznaczanie w metodach bezpośrednich lub pośrednich: aktywność enzymatyczną, profil wykorzystywania substratów, warunki wzrostowe i inne
metody muszą być wystandaryzowane, jednolite i powtarzalne (szczepy referencyjne i wzorcowe jako punkt odniesienia; liczba analiz biochemiczno-enzymatycznych, liczba powtórzeń analiz, n liczba szczepów/izolatów blisko spokrewnionych; inokulacja, warunki inkubacji optymalne)

Question 44

Q

testy pomocnicze w identyfikacji szczepów za pomocą metod fenotypowych

Answer

A

o taksonomia numeryczna – systemy identyfikacji mikroorganizmów
- np. API, Biolog, Vitek, Feniks
- Wyniki są interpretowane komputerowo
- Dedykowane głównie dla diagnostyki klinicznej
o taksonomia dychotomiczna
- barwienie grama
- morfologia kolonii
- wzrost na rekomendowanych podłożach
o chemotaksonomia – użyteczne w identyfikacji i klasyfikacji prokariotów - specyficzne molekuły
• Komponenty ściany komórkowej (typ peptydoglikanu, kwasy tejchojowe)
• Lipidy (kwasy tłuszczowe, lipidy polarne, LPS, chinony)
• Poliaminy (związki polikationowe

Question 45

Q

2 metody klasyfikacji organizmów

Answer

A

• klucze dychotomiczne
o Powszechne w diagnostyce identyfikacyjnej
o w oparciu na obecności lub braku danej analizowanej cechy (fenotypowe, morfologiczne)
o Na zasadzie wykluczania
• kladogramy (klastryczna, analiza skupień)
o to mapy wskazujące na stopień pokrewieństwa pomiędzy organizmami w zestawieniu cech zbiorczych
o Analiza genetyczna (pokrewieństwo genetycznego za pomocą analizy rRNA)
o analiza chemotaksonomiczna (białka, lipidy, LPS, aa, cukrowce)
o analiza komputerowa (podobieństwo, pokrewieństwo i identyczność wyrażane w procentach)

Question 46

Q

Alternatywne metody typowania fenotypu [4]

Answer

A

• serotypowanie (zmienność antygenowa) – wykrywanie: rzęski, fimbrie, otoczki, białka ściany komórkowej, osłony
• profilowanie elektroforetyczne białek
- całkowite białka komórkowe, OMP bakterii Gram-ujemnych, analiza ML enzym elektroforeza
• analiza LPS metodami elektroforetycznymi (zmienność w części O-swoistego łańcucha bocznego)
• techniki spektrometryczne

Question 47

Q

Klasyfikacja organizmów prokariotycznych - 3 etapy

Answer

A

• obecnie badania taksonomiczne prowadzone są na trzech następujących po sobie poziomach
o metody posiewowe szczepów
 metody fenotypowe – testy biochemiczne, fizjologiczne, analiza kwasów tłuszczowych, analiza DNA (badania polimorfizmu, PCR)
o ustalenie pozycji filogenetycznej – metody sekwencjonowania genu 16S rRNA
o ustalenie przynależności gatunkowej – metody hybrydyzacji DNA-DNA

Question 48

Q

system fenetyczny

Answer

A

zakłada grupowanie organizmów na podstawie podobieństwa zespołu cech ujawniających się fenotypowo

Question 49

Q

system filogenetyczny

Answer

A

uwzględnia najnowsze odkrycia dotyczące pokrewieństw ewolucyjnych (podstawą jest struktura DNA, ale obecnie również konserwatywne sekwencje zawierające insercje i delecje, geny kodujące białka)

Question 50

Q

Identyfikacja taksonomiczna mikroorganizmów

Answer

A

określenie przynależności badanego organizmu go odpowiedniej jednostki taksonomicznej, najczęściej gatunku

Question 51

Q

Gatunek to

Answer

A

populacja mikroorganizmów wykazujących wysoki stopień podobieństwa w ściśle określonym zakresie cech, a różniących się od innych gatunków tego samego rodzaju
to monofiletyczna grupa bakterii genomowo i fenotypowo spójna, którą można diagnozować na podstawie charakterystycznych cech fenotypowych

Question 52

Q

taksogatunek

Answer

A

grupa organizmów (szczepy, izolaty) z wysokim podobieństwem fenotypowym i tworzący odrębny klaster z charakterystycznym zestawem cech fenotypowych

Question 53

Q

genetyczny gatunek, genogatunek, genovar, grupa DNA

Answer

A

grupa organizmów z wysokim poziomem podobieństwa hybrydyzacji DNA-DNA

różne genogatunki nie mogą być odróżniane od innych genogatunków na podstawie znanych cech fenotypowych
Genogatunki pozostają bez nazwy taksonomicznej do momentu wykazania różnic w cechach fenotypowych

Question 54

Q

nomengatunek

Answer

A

grupa organizmów z nazewnictwem dwuczłonowym

Question 55

Q

Koncepcje gatunku dla organizmów prokariotycznych - 4

Answer

A

• fenetyczna/politetyczna koncepcja PhSC, sprowadza się do empirycznej analizy danych stabilnych cech fenotypowych (umowne operacyjne jednostki taksonomiczne, operational)
• ewolucyjna koncepcja gatunku, ESC – brak skamielin, brak informacji morfologicznych, genetycznych i fenotypowych ancestralnego przodka prokariotów
• filogenetyczna koncepcja gatunku PSC w 2 wariantach:
o monofiletyczna,
o diagnostyczna
• Monofiletyczna koncepcja gatunku
o zgrupowanie szczepów homologicznie spójnych ze sobą
o analiza sekwencji rRNA (16S rRNA w prokariotach) lub genów housekeeping (badanie autapomorfii/homologii między organizmami)
o sekwencje homologiczne i unikalne w taksonie, z wykluczeniem sekwencji wstawionych w genom z powodu HTG

Question 56

Q

Diagnostyczna koncepcja gatunku

Answer

A

gatunek jako najmniejszy diagnostyczny klaster obejmujący również wzorzec cech powyżej poziomu taksonu, wspólnych w obrębie rodzaju, rodziny, rzędzie etc
funkcjonalne jednostki diagnostyczne, diagnostic units (różne kryteria)
klastry – genetyczne, fenotypowe, fizjologiczne, patogeniczności, serologiczne, fagospecyficzne

Question 57

Q

Filo-fenetyczna koncepcja gatunku

Answer

A

• jednostki taksonomiczne to najlepiej opisane jednostki operacyjne z uniwersalnym ale wyróżniającym się zespołem cech diagnostycznych, niespotykanych w innych jednostkach
• przy opisie szczepów stosuje się 3 poziomy analiz
o wyznaczanie granicy taksonu w analizach genetycznych (metody hybrydyzacji całkowitego genomu, oznaczanie wielkości genomu i stosunku mol%GC)
o badania fenotypowe (ważne w klasyfikacji i wykazaniu wewnątrzgatunkowych różnic) obejmujące klasyczne i fenetyczne metody diagnostyczne (profile biochemiczno-enzymatyczne, fizjologiczne, serologiczne i in., markery chemotaksonomiczne oraz techniki typowania molekularnego)
o detekcja monofiletyczności szczepów w taksonie (16S rRNA)

Question 58

Q

Filogenetyczny gatunek z definicji to

Answer

A

monofiletyczny i genetycznie spójny klaster (grupa) organizmów z wysokim stopniem pokrewieństwa / podobieństwa przy zastosowaniu licznych niezależnych technik diagnostycznych (genetycznych i niegenetycznych)

Question 59

Q

różnice między fermentacją a oddychaniem

Answer

A

o podczas fermentacji brakuje zewnętrznego akceptora elektronów i protonów (końcowy produkt glikolizy – pirogronian – jest dalej redukowany – do produktów fermentacji)
o podczas oddychania akceptorem elektronów i protonów jest O2 lub inny związek nieorganiczny który się redukuje

Question 60

Q

Typy syntezy ATP w przyrodzie - 3

Answer

A

• fosforylacja substratowa podczas fermentacji
o ATP wytwarzany jest w procesie katabolizmu związków organicznych,
o glikoliza, cykl CCC
• fosforylacja oksydatywna podczas oddychania
o ATP generowane podczas przenoszenia elektronów i protonów przez odpowiednie systemy białek enzymatycznych w membranach ATPazy lub wytwarzające gradient protonowy
• fosforylacja fotosyntetyczna (u fototrofów)
o synteza ATP wskutek konwersji energii świetlnej w specjalnych układach transformacyjnych

Question 61

Q

Alternatywne procesy kataboliczne

Answer

A

• oddychanie beztlenowe
o akceptorem elektronów jest inny związek niż O2 np. NO3-, Fe3+, SO42-, HCO3-
o mały zysk energetyczny
o źródłem związków węgla są związki organiczne
o w środowiskach ekstremalnych (brak O2)
• chemolitotrofia
o donorami elektronów są związki nieorganiczne (siarczki, amoniak itp.)
o źródłem związków węgla jest CO2 (autotrofizm)
o tlenowce

Question 62

Q

Autotrofy – fotosyntetyczne

• fototrofy

Answer

A

o kwant świetlny jako źródło energii w procesie fotosyntezy
o źródłem związków węgla mogą myć CO2 (fotoautorofy) lub związki organiczne (fotoheterotrofy)
o donory e : zredukowane związki mineralne H2O, H2S, S0, S2O3-
o procesy fotosyntezy mogą przebiegać w warunkach tlenowych (sinice) lub beztlenowych (bakterie purpurowe i zielone)

Question 63

Q

Uniport

Answer

A

jeden z rodzajów dyfuzji wspomaganej substancji przez błony biologiczne, zachodzącego wewnątrz organizmów żywych, podczas którego przez jedno białko przenośnikowe (uniporter), transportowana jest cząsteczka tylko jednego typu zgodnie z gradientem swojego stężenia

Question 64

Q

symport

Answer

A

jeden z rodzajów transportu aktywnego zachodzących wewnątrz organizmów żywych, podczas którego przez jedno białko transportowane są dwie cząsteczki jednocześnie (w tym samym kierunku)

Answer 65

A

ruch

białka - flagelina

Answer 66

A

koniugacja, transfer genetyczny

białka - pilina

Answer 67

A

adhezja do powierzchni, ochrona przed fagocytozą

białko - pilina

Answer 68

A

adhezja do powierzchni, ochrona przed fagocytozą, biofilm, ochrona przed wysychaniem, rezerwa zw. organicznych
polisacharydy, rzadziej polipeptydy

Answer 69

A

ziarnistości zapasowe, rzadziej struktury o specyficznej funkcji
węglowodany, lipidy, białka, jony nieorganiczne

Answer 70

A

materiał genetyczny, system operonów

dwuniciowa cząsteczka DNA, rzadko z białkami histonopodobnymi, koliście zamknięta superhelisa

Answer 71

A

nie niezbędny autonomiczny pozachromosomalny materiał geentyczny, warunkuje oporność na antybiotyki (plazmidyR) i jony metali ciężkich, syntezę enzymów katabolicznych i czynników wirulencji
dwuniciowa, kolista lub liniowa cz. DNA

Answer 72

A

ciała przetrwalne

składniki budulcowe, jak w komórkach wegetatywnych, kwas dipikolinowy

Answer 73

A

mykolany i związki lipidowe charakterystyczne dla promieniowców,
cecha diagnostyczna: kwasooporność

Answer 74

A

Planctomyces spp., Pirellula spp., Mycoplasma spp., Anaplasma spp.

Answer 75

A

jako czynnik zjadliwości przyczyna sepsy (posocznicy) bakteryjnej
• potężny stymulator odpowiedzi immunologicznej i wstrząsu septycznego (endotoksycznego)
• jako superantygen – wstrząs septyczny, pobudzanie komórek B i makrofagów, czynnik pirogenny, zjawisko DIC, hipotensja i hipoksja wielonarządowa

Answer 76

A

• powszechne u Archeaebacteria
• Eubacteriae różnych grup filogenetycznych:
o u gram-dodatnich układają się na ścianie komórkowej (mureinie i innych polimerach)
o u gram-ujemnych łączą się za pośrednictwem LPS błony zewnętrznej
• funkcje
o stabilizacja
o ochrona
o matryca jonowymienna
o czynnik zjadliwości

Answer 77

A

funkcja ochronna, ale struktury nie niezbędne
• otoczki polisacharydowe w serotypowaniu niektórych mikroorganizmów grzybów i bakterii
• otoczki poli-D-kw. glutaminowe u B. anthracis powstają dopiero w żywicielu
• otoczki jako czynniki wirulencji
• wykrywanie otoczek:
o metody barwienia (pozytywno-negatywne)
o serologiczne
• śluzy/otoczki:
o dekstranowe i lewanowe (paciorkowce próchniczotwócze Leuconostoc spp.)
o alginianowe(P. aeruginosa)
• Rhizobium trifolii – pozytywna rola w ryzosferze

Answer 78

A

funkcja ochronna i odżywcza
o Struktury zapewniające zawartość i ciągłość kolonijną mikroorganizmów – w pochewkach żyją, rozmnażają i przemieszczają się
o Stanowią poważny problem w oczyszczalniach ścieków, ale też stosowane jako osad czynny
o Pochewka – korzystne warunki środowiska, brak pochewki – niekorzystne warunki środowiska
- Sphaerotilus natans – bakteria pochewkowa, wody słodkowodne i ścieki
- Leptotrix ssp. - bakteria utleniająca niektóre metale Fe i Mn, tlenki metali inkrustują pochewki, powszechne w środowisku wodnym i terenach podmokłych

Answer 79

A

Chlamydiae - ciałka EB i RB złożony cykl życiowy
Planctomyces
Spiroplasma
Mycoplasma
najmniejsze wolnożyjące bakterie (0,1-0,25μm), samoreplikujące się jednostki
wysoka plastyczność komórkowa
w membranie obecne sterole i białka adhezyjne
wzrost powolny również w warunkach in vitro (sterole, hopanoidy)
Endosymbionty wiążące N, termofilne eubakterie, bakterie spiralne

Answer 80

A

o strukturalnie podobne do steroli, obecne w błonach wielu bakterii ale nie w archeabakteriach
o triterpenoidy, klasa lipidów o niezwykłych amfifilnych właściwościach
o w błonach pełnią funkcje
 wzmacniające
 przepuszczalności
 chemotaktyczne

Answer 81

A

wywodzą się od bakterii gram-dodatnich
brak ściany komórkowej daje negatywny efekt wybarwienia w metodą Grama
Mykoplazmy są przykładem tzw. ewolucji degeneracyjnej z redukcją wielkości genomu
redukcja rozmiaru genomu bakteryjnego wiąże się z utratą pewnych genów strukturalnych związanych ze ścianą komórkową, szlakami metabolicznymi, enzymami
zjawisko to wiąże się ze zmniejszeniem rozmiarów bakterii częściowej lub całkowitej zależności od żywiciela (odżywianie, replikacja, powielanie)

Mycoplasma pneumoniae
• przewlekłe atypowe zapalenie oskrzeli i / lub płuc
• nosicielstwo powszechne
• adhezja tkankowo-specyficzna
• żyje w przestrzeniach międzykomórkowych wydłużając swój kształt komórki
• możliwość wnikania do komórek nabłonka

Answer 82

A

• wydłużanie komórek, tworzenie filamentów, wypustek, tubuli, pączków, wyrostków u bakterii środowiskowych – pozwalają zwiększyć powierzchnię komórki w stosunku do jej objętości – to pewniejsza adsorpcja związków ze środowiska lub szybsza ekspansja terenowa

Answer 83

A

•	czynny ruch
•	determinanty wirulencji
•	działa jak śruba okrętowa
•	przypomina smaganiem biczem
•	Ruch rzęski napędzany jest chemotaktycznie
-	układ sensoryczno-przekaźnikowy

Answer 84

A

ruch w kierunku bodźca

Answer 85

A

ruch w kierunku przeciwnym do działania bodźca, tzw ucieczka, repelenty – „odstraszacze”

Answer 86

A

forma swaring - nieliczne bakterie zdolne do konsolidacji i różnicowania się w zespolony wspólny układ ruchu
forma bezrzęsna
- typ drgający - ruch bierny Browna, przy współudziale energii kinetycznej cząsteczke
- ruch ślizgowy - substancje śluzowate i struktury powierzchniowe drobnoustrojów - adhezyny, fimbrie
- ruch przez rozsuwanie - komórek po podzialek, wskutek wzrostu bakterii

Answer 87

A

glikogen – liczne bakterie z rodzajów Bacillus, Salmonella, Escherichia, Arthobacter, sinice
skrobia – Acetobacter pasteurians, Neisseria spp
poliglukoza, granuloza - Fusobacterium spp., Clostridium spp
kwas poli-β-hydroksymasłowy – wiele bakterii tlenowych i beztlenowych, bakterie fototroficzne (polimer acetylo-CoA z glukozy lub skrobi)
cyjanoficyna – poli-aa, źródło N sinic
siarka (okta-siarka) - pierścieniowe cząsteczki ośmioatomowe, politioniany i łańcuchy trójatomowe lub dłuższe (np. bakterie siarkowe)
polifosforany (Spirillum volutans, Corynebacterium spp.) tzw wolutyna (ciało metachromatyczne) - źródło fosforanów

Answer 88

A

ziarnistości wewnątrzkomórkowe jako materiał zapasowy typu pochodnych kwasów tłuszczowych (biopolimery polialkonaty)
rodzaj związków tłuszczowych zależy od składu chemicznego pożywki hodowlanej, najczęstszy związek to PHB

Answer 89

A

– złożone struktury w procesach wiązania CO2 z udziałem 2-ch enzymów RuBisCo i CA
• CA przekształca HCO3- do CO2, Rubisco wiąże CO2 przy pomocy RuBP, rybulozo-1,5-difoxforan i przeprowadza przemiany CO2 do 3 cząsteczek 3-foxfogliceryniany (3-PGA)
• prawdopodobnie O2 bierze udział w syntezie fosfoglikolanu (w cytozolu)
Synechococcus ssp. Morska sinica z typowym karboksysomem
Halothiobacillus spp – liczne karboksysomy
S. Typhimurium z bardzo licznymi enterosomami, mniej regularne i mniejsze niż typowe karboksysomy

Answer 90

A

to głównie mikroorganizmy wodne żyjące w środowisku o niskiej koncentracji O2
• gram-ujemne mikroaerofile, lub ścisłe beztlenowce
• otoczone podwójną warstwą fosfolipidów
• krystaliczne magnetyty
• magnetyty warunkują ruch chemotaktyczny wzdłuż linii pola magnetycznego
- używają magnetosomów w celu zlokalizowania i utrzymania optymalnych warunków dla swojego wzrostu i przeżycia w oparciu o pionowy gradient stężenia chemicznego i potencjału redoks, poprzez biomineralizację Fe i S

Answer 91

A

biosynteza ściany komórkowej
podziały komórkowe
replikacja chromosomu
mezosom – wpuklenia błony cytoplazmatycznej w postaci pęcherzyków, rurek, lamelli
Artefakt powstający podczas przygotowywania preparatu (?)

Answer 92

A

• fikobilisomy pełnią funkcję fotosystemu II jak u roślin zielonych i krasnorostów
• tylakoidy z fikobilisomami po zewnętrznej stronie aparatu u sinic
• funkcja fikobilisomów:
o fotoreceptory,
o fotoprotekcja (redukcja energii podczas przenoszenia z fikobilisomów do fotosystemu)

Answer 93

A

• u bakterii zielonych barwniki fotosyntetyczne zebrane w kompleksie na błonie cytoplazmatycznej

Answer 94

A

• u beztlenowych bakterii fotosyntetycznych szczególnie bakterii purpurowych pigmenty fotosyntetyczne bezpośrednio związane z błoną chromotaforową

Answer 95

A

endospory - (przetrwalniki, spory wewnętrzne) liczne bakterie z rodzajów Bacillus, Clostridium, Desulfotomaculum, Sporolactobacillus, Sporosarcina, związek charakterystyczny tylko dla endospor to kwas dipikolinowy DPA
cysty – cała komórka wegetatywna przekształca się w ciało przetrwalne, Azotobacter, odporne na wysuszenie, ciepło (nie tak jak endospory), środki dezynfekcyjne
egzospory – Methylosinus spp, powstają w wyniku tzw. procesu pączkowania z komórki macierzystej, gruba odporna ściana
akinety - sinice
konidia – promieniowce Streptomyces spp., Nocardia spp., Thermoactinomyces spp, Micromonospora spp.
mikrospory - u bakterii śluzowych, powstają w specjalnych strukturach tzw. ciałkach owocowych (sporangiach lub cystach), jako przekształcone komórki wegetatywny w odpowiedzi na niekorzystne warunki środowiska, głód

Answer 96

A

jak większość Plancomyces spp. wokół nukleidu uformowały coś w rodzaju osłonki jądrowej z błony cytoplazmatycznej tworząc tzw. wewnętrzną błonę – może być modelem w wyjaśnieniem pochodzenia jądra komórkowego u eukariota
pałeczki Gram-ujemne,
pozbawione ściany komórkowej,
pączkujące bakterie wodne
wytwarzające łodyżki jak caulobacterie

Answer 97

A

chromosom główny Ch1 – geny metabolizmu podstawowego rozmieszczone w całym replikonie
chromosom(y) dodatkowy(e) - nieliczne geny metabolizmu podstawowego, rozmieszczone w segmentach DNA, obecność systemów replikacyjnych i genów o charakterze adaptacyjnym

Answer 98

A

fakultatywny fotoautotrof, w zależności od warunków przeprowadza procesy fotosyntetyczne, oddychanie beztlenowe, w tym fermentację

Answer 99

A

o koliście kowalentnie zamkniętej formy CCC (super-zwinięta, super skręcona)
o koliście otwartej formy OC (gdy przecięta jest jedna nić w podwójnej helisie DNA)
o liniowy replikon o zamkniętych końcach typu struktury spinki do włosów (Borrelia spp, Streptomyces)

Answer 100

A

- autoreplikony, nie niezbędne, różna wielkość i liczba, różna rola
o	rodzaje plazmidów: 
	oporności, 
	wirulencji, 
	kataboliczne, 
	koniugacyjne, 
	kryptyczne

Answer 101

A

obligatoryjne symbionty i pasożyty obligatoryjny endosymbiont cykad „Candidatus Hodgkinia cicadicola” 0,14Mpz, wolnożyjąca bakteria Candidatus Pelagibacter ubique 1,3 Mpz

Answer 102

A

geny stanowiące konserwatywny rdzeń genomu (8 %)
geny nadające charakterystyczne cechy gatunkom (ok 64%)
geny dodatkowe (28 %, swoisty rezerwuar genów)

Answer 103

A

regiony międzygenowe pomiędzy operonami
duże regiony międzygenowe (>1000pz) kodujące tzw. funkcjonalny RNA (tRNA i sRNA / ncRNA)
pseudogeny

Answer 104

A

horyzontalnego transferu genów
rekombinacji prowadzącej rearanżacji genetycznej i
redukcji prowadząca do zmniejszenia rozmiarów genów

Answer 105

A

o chromosomy,
o plazmidy R/ nr,
o transpozony i inne elementy ruchowe,
o kasety genowe i integrony,

Answer 106

A

o	mutacje (transfer wertykalny), 
o	koniugacja (transfer horyzontalny), 
o	transdukcja, 
o	transformacja, 
o	naturalna elektoporacja, 
o	transfer z udziałem GTA, 
o	transpozycja

Alternatywny procesem pojawienia się nowych informacji genetycznych to duplikacja segmentów DNA i ich dywergentna ewolucja

Answer 107

A

symetryczny podział komórkowy ważnym i kluczowym białkiem w maszynerii kontrolującym podział jest białko FtsZ. Monomery tego białka polimeryzują tworząc pierścień pośrodku komórki macierzystej i inicjują miejsce rozejścia się komórek potomnych

Answer 108

A

formy wegetatywne
formy przetrwalne
formy o kluczowej funkcji dla całego układu kolonii

Answer 109

A

podział binarny
dyspersja formy nitkowatej z utworzeniem hormogonii (jednostek infekcyjnych dla roślin i wytworzenia układu symbiotycznego), gonidii (pseudohormogonii)
baeocyty wytwarzane przez sinice- komórka macierzysta zwiększa znacznie swoje rozmiary, asymetryczny podział wewnętrzny
niektóre bakterie rozmnażają się przez asymetryczny podział poprzez pączkowanie na jednym biegunie komórki macierz. Często tworzą się układy rozet komórek po podziale. Niektóre Plancomytes, sinice, Firmicutes, prostheca Proteobacterie
złożony proces podziału komórek bakteryjnych u bakterii wytwarzających prostheca – Cykl rozwojowy Caulobacter ssp: G1 – różnicowanie się komórek (wolno-pływająca i forma pre-osiadła), S – replikacja DNA, utrata rzęsek, fimbrii i aparatu chemotaktycznego, formowanie łodyżki, metylacja –DNA, formowanie pierścienia podziałowego Z, G2/M - asymetryczny podział komórkowy
Nietypowy podział asymetryczny u G. obscuriglobus poprzez pączkowanie komórek macierzystych – cechy nietypowe: Formowanie i wzrost pączka z cytoplazmą, Pod koniec podziału zachodzi segregacja chromosomów, Dryf genomu bez udziału białek regulacyjnych FtsZ, Dojrzewanie pączka z kompartmentacją wewnątrzkomórkową
atypowy podział komórki u bakterii olbrzymów: 2 pierścienie podziałowe Z na biegunach komórki macierzystej, wzrost i dojrzewanie dwóch potomnych komórek wewnątrz komórki macierzystej, śmierć komórki macierzystej i uwalnianie komórek potomnych

Answer 110

A

• gram-ujemna zakrzywiona pałeczka,
• atakuje i pożera inne Gram-ujemne bakterie w ciągu 4h (skuteczny drapieżnik)
o wnika do przestrzeni peryplazmatycznej ofiary
o formuje się bdelloplast z helikalną komórką
o komórka ta rośnie i powiększa się, w niej dochodzi do wielokrotnych wewnętrznych podziałów z wytworzeniem potomnych komórek

Answer 111

A

przyczepia się do powierzchni ofiary i wysysa jej wnętrze, Bakteria-drapieżca atakuje tylko bakterie z rodzaju Chromatium

Answer 112

A

wnika do cytoplazmy swojej ofiary i pożera ją od środka , atakuje tylko bakterie z rodzaju Chromatium

Answer 113

A

mechanizmy regulacji genetycznej w bakteriach: regulacja transkrypcji (czynniki transkrypcji, stymulatory w aktywacji czynników zjadliwości, np. odpowiednie stężenie Fe w żywicielu aktywuje regulator toksyny błoniczej u C. diptheariae)
regulacja posttranskrypcyjna (poprzez rybonukleazy)
regulacja translacyjna (czynniki translacji)
regulacja post-translacyjna (biosynteza i modyfikacja bakteriocyn typu lantybiotyki u Lactobacillus spp.)
quorum sensing QS (szlak sygnałów) uczestniczą odpowiednio efektory i regulatory

Answer 114

A

•	składniki odżywcze
•	pH
•	temperatura
•	potencjał redox
•	wilgotność 70-80%
•	aktywność wody
•	stopień zasolenia
•	ciśnienie atmosferyczne
Czynniki fizyczne i chemiczne wpływają na wzrost, namnażanie , przeżywalność oraz aktywność metaboliczną drobnoustrojów

Answer 115

A

bez dostępu tlenu i światła
bardzo wysoka temperatura od 100oC;
wysokie ciśnienie nawet przekraczające 400x od normalnego ciśnienia atmosferycznego
skrajne wartości pH (0-10)
wysoki stopie zasolenia (20% NaCl i więcej, w warunkach laboratoryjnych)
hydrotermalne wulkany na dnie Oceanu Spokojnego pełne życia, życie poza zasięgiem człowieka
trujące gazy (metan, siarczki, cyjanki, wodorki i inne)
obecność ciężkich metali (Hg, As, Cd, Pb)

Answer 116

A

rodzaj i sposób akumulacji energii
utrzymanie homeostazy środowiska wewnątrzkomórkowego
regulacja metabolizmu i kinetyka reakcji biochemicznych
stabilność strukturalna i czynnościowa komponentów komórkowych
płynność i stabilność membran
produkcja ochronnych substancji (egzopolimery, biosurfaktanty, barwniki, kompatybilne soluty, krioprotektanty, ekstremolity; pochodne aa, monocukry, aminy)
produkcja białek ochronnych: Hsp, Csp, Cap, Rec (reperacja kwasów nukleinowych i regulacja procesów replikacji, transkrypcji i translacji)

Answer 117

A

niska temperatura (niższa od optimum temp wzrostu) wywołuje zjawisko szoku termicznego (cold shock) - Gram-ujemne bakterie bardziej wrażliwe niż gram-dodatnie
spadek temperatury w czasie wzrostu wywołuje spadek aktywności metabolicznej i namnażanie komórek

Answer 118

A

zmiany morfo-fizjologiczne (zmiana kształtu komórek, zniekształcenia struktur komórkowych, inhibicja biosyntezy DNA, RNA, białek, modyfikacja biosyntezy lipidów)
zmiany strukturalne (skład lipidów w błonach cytoplazmatycznych i LPS, wzrost nienasyconych kwasów tłuszczowych, pogrubienie ściany komórkowej)
ekspresja genów tzw cold shock response, białka szoku zimnego i aklimatyzacji do zimna, inhibicja białek szoku cieplnego
aktywacja i ekspresja innych genów niż CSR lub nadekspresja genów strukturalnych

Answer 119

A

regiony polarne i osady morskie, bardzo niskie temperatury, szybko giną w temperaturze pokojowej

Answer 120

A

powszechne na całym świecie: gleba, wody, żywność przechowywana w lodówce (4oC) - problem sanitarny

Answer 121

A

aktywność specyficznych enzymów w niskich temperaturach – mniejsza liczba oddziaływań wewnątrz-cząsteczkowych, inaktywacja lub nawet destrukcja w wyższych zakresach temperatur
specjalna II rzędowa struktura białek z dużą ilością alfa-helisy, więcej polarnych aa (odwrotnie w przypadku mezofilów i termofilów)
długi czas generacji
niska i powolna aktywność biochemiczna
złożony cykl życiowy (sporulacja-germinacja), formy przetrwalne lub faza VBNC (przejściowa, fizjologiczna lub całkowita)

Answer 122

A

• bakterie w stanie VBNC są w stanie minimalnej metabolicznej aktywności, ale nie zdolne do podziałów (uśpione)
o nienaruszona struktura komórki
o redukcja wielkości i kształtu komórki
o zmiany i rearanżacja struktur i osłon komórki, membran, DNA, białek, rybosomów
o zmiany w patogenności (zablokowana lub aktywowana)

Answer 123

A

optymalna temperatura środowiska
obecność czynników odżywczych i czynników wzrostu
obecność specyficznych związków jako czynniki sygnalne: aa, czynniki promujące resuscytację (Rpf) (2CS system, remodeling lub uwalnianie fragmentów ściany komórkowej) czy autoinduktory

Answer 124

A

o	temperatura
o	stężenie soli
o	potencjał redoks
o	dostępność składników pokarmowych
o	światło

Answer 125

A

termofile (optymalna temperatura >45oC)
hipertermofile (optymalna temperatura ≤80oC)
ekstremalne hipertermofile (optymalna temperatura >80oC)

Answer 126

A

o związki mineralne
o pH odczynu
o ilość i rodzaj składników odżywczych (pierwiastków biogennych, czynników wzrostowych, zewnętrzne akceptory lub donory elektronów

Answer 127

A

chemoorganotrofia
chemolitotrofia (utlenianie H2, przemiany zw S, Fe i Nnorg)
autotrofia (metanogenesis)
biodostępność składników odżwczych i czynniki abiotyczne wpływają na rozmieszczenie i dystrybucję bioróżnorodności mikrobiologicznej
różne strategie metabolizmu pozwalają tworzyć konsorcja, kooperacje między drobnoustrojami

Answer 128

A

charakterystyczna struktura III rzędowa białek – strukturalne, enzymatyczne i transportery (permeazy)
białka szoku termicznego HSP
chaperoniny – białka chroniące chromosom bakteryjny przed denaturacją i rozkręceniem
nasycone długo-łańcuchowe kwasy tłuszczowe w fosfolipidach błony cytoplazmatycznej
polimeraza Taq oraz polimeraza Pfu
Wiązania eterowe w lipidach
poli-izoprenoidy zamiast kwasów tłuszczowych w lipidach u Archea
tetra-eterowe lipoglikany
Białka histonopodobne w stabilizacji chromosomu bakteryjnego
Małe rozmiary DNA
Rewertaza DNA gyrazy (odmiana topoizomerazy) chroni helisę DNA przed rozwinięciem i denaturacją
Duże stężenia związków drobno-cząsteczkowych w cytoplazmie: cykliczne difosfoglicerole, di-fosfoinozytol, mannozo-glicerydy (czynniki termo-stabilizujące enzymy i DNA przed denaturacją)
Glikoproteiny, warstwa S w osłonach komórkowych i EPS biofilmu

Answer 129

A

systemy transportu do i z komórki (uniport, symport i antysport)

Answer 130

A

efflux H+ i kanały K+ lub Na+ (antysport)
alkalizacja pH otoczenia
osłony komórkowe i matriks biofilmu
produkcja białek szoku cheperonin
ekspresja czynników transkrypcji
QS i zmiany liczebności populacji drobnoustrojów

Answer 131

A

wzrost procesów deiminacji aa i fermentacji cukrów
wzrost produkcji syntetaz ATPaz z systemem kanałów H+
zmiany strukturalne i fizjologiczne błon komórkowych i osłon komórkowych (wzrost kardiolipin i skwalenu, kwasów tejchojowych i tejchuronowych, polimerów warstwy S)
wzrost ekspresji i aktywność antyportów monowartościowych kationów i protonów: Na+/H+ lub Na+(K+)/H+
blokowanie aktywności kanałów H+ typu effluks

Answer 132

A

przejście w fazę VBNC, formy spoczynkowe (sporulacja)
zmiany morfologii komórek i w osłonach komórkowych
aktywacja swoistych kanałów i pomp
wzmożona aktywność zewnątrzkomórkowych enzymów (proteaz, amylaz i innych sacharolitycznych enzymów)
akumulacja kompatybilnych solutów
zmiana lipidów w błonach komórkowych (wzrost kwaśnych lipidów: DPG, PG, z kwaśnymi aa, kardiolipin)
wzrost udziału cyklopropanu w fosfolipidach (E. coli), lub nienasyconych krótko-łańcuchowych kwasów tłuszczowych (Lactobacillusspp.)

Answer 133

A

budowa osłon komórkowych, glikokaliks wiąże Na+
kanały i pompy - uniport K+, symport i antyport Na+/H+
relokalizacja Na+ w wakuolach gazowych
rozmieszczenie K+/Na+ w procesach osmotycznych i hydratacji cytoplazmy
barwniki niefotosyntetyczne w biogenezie ATP, siły protonowej - bakteriodopsyna
halorodopsyna jako kanały chlorkowe i sensoryczne białka w procesach fototaktycznych
cytoplazma kwasowa, obecność białek kwasowych i polarnych
stabilizacja aktywności rybosomów jonami K+

Answer 134

A

związki będące produktami pierwotnego lub wtórnego metabolizmu różnych organizmów, posiadające aktywność biologiczną - metabolity bioaktywne

głównymi producentami grzyb i promieniowce

Answer 135

A

końcowe produkty podstawowej przemiany materii - metabolizm pierwotny

Answer 136

A

związki organiczne na ogół po zakończeniu wzrostu - metabolizm wtórny

Answer 137

A

pigmenty
biocydy i bakteriocyny
antybiotyki i związki antybiotykopodobne
toksyny
feromony (Al)
inhibitory enzymów i biosurfaktanty
PHA i inne związki zapasowe

Answer 138

A

indukcja substratowa
indukcja powodowana przez regulatory metaboliczne
represja i hamowanie kataboliczne
regulacja związkami azotu
regulacja fosforanowa i energetyczna
hamowanie w sprzężeniu zwrotnym
regulacja z udziałem pierwiastków śladowych
regulacja tlenowa
regulacha innymi czynnikami, np. temp, pH

Answer 139

A

ochroną producentów przed stresem środowiskowym
antagonistycznymi relacjami między organizmami
zwiększeniem szansy przetrwania producentów w środowisku przez współzawodnictwo o przestrzeń, regulacje szybkości i kierunków procesów metabolicznych, rywalizację o składniki pokarmowe, modyfikacje morfologiczne i fizjologiczne

Answer 140

A

fotosynteza i ochrona przed fotooksydacją u bakterii
procesy niefotosyntetyczne i ochrona przed fotouszkodzeniami - S. ruber
pozyskiwanie żelaza - siderofory
związek defensywny - funkcja ochronna przed szkodliwymi czynnikami środowiskowymi, stresem osmotycznym, odpowiedzią immunologiczną
związki ofensywne - działanie przeciw bakteriom, grzybom itp

Brainscape's Knowledge GenomeTM

Bakteriologia - kurs rozszerzony Flashcards

Brainscape's Knowledge Genome^TM