7. physiologie bactérienne (microbio) Flashcards

1
Q

quelle est la source d’énergie des bactéries

  • phototrophes
  • chimiotrophes
A
  • lumière

- composé chimique

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Q

quelles sont les 2 principales sources de nutriments des bactéries

A
  1. carbone

2. électrons

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3
Q

quelles sont les bactéries qui utilisent le carbone comme source de nutriments + exemples de nutriments

A
  • autotrophes : CO2

- hétérotrophes : composés organiques

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4
Q

quelles sont les bactéries qui utilisent les électrons comme source de nutriment + exemples de nutriment

A
  • lithotrophes : NH3, NO2-, S, H2S, H2, NH3, ions ferreux (inorganique)
  • organotrophes : sucres, alcools, acides, … composés avec carbone
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5
Q

qu’est-ce qu’un milieu de culture défini/synthétique

A

un milieu dont la composition chimique est connue et précise

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6
Q

quel est le but d’avoir un milieu de culture défini

A

étudier le rôle d’un composé sur la croissance

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7
Q

qu’est-ce qu’un milieu de culture complexe + 1 exemple

A

un milieu dont la composition chimique est non rigoureusement déterminée
- contient des extraits de viande, de soya, de levures, hydrolysats de protéines

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8
Q

quel est le but d’avoir un milieu de culture complexe

A

favoriser la croissance de tout organisme pouvant être présent dans un échantillon ou encore en ayant des exigences nutritionnelles spécifiques

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9
Q

quelles sont les 2 formes de milieux de culture possibles

A
  • liquide : bouillon

- solide : gélose

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10
Q

comment est préparée la gélose

A
  • ajout d’agar (extrait d’algue gélifiant, solide jusqu’è 45 degrés C) au bouillon
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11
Q

qu’est-ce que la culture sur gélose permet (2)

A
  • obtention de colonies isolées

- obtention de cultures pures

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12
Q

de quoi dépend le temps de croissance des bactéries sur la gélose (3)

A
  • des espèces
  • des conditions de culture
  • la source d’isolement
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13
Q

quand est-ce que la plupart des espèces en microbio médicale peuvent produire des colonies visibles + 3 exemples

A

après 18-24h d’incubation à 35 degrés C

  • entérobactéries : escherichia coli., Salmonella spp., Klebsiella spp
  • cocci gram + : staphylocoques, streptocoques
  • bactéries non fermentaires : acinetobacter spp, pseudomonas
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14
Q

quelles sont les espèces qui requièrent des incubations plus longues que la normale + le temps nécessaire

A
  • legionella pneumophilia : 2-3 jours minimum (jusqu’à 7 jours)
  • mycobacterium tuberculosis : entre 2 et 6 semaines
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15
Q

qu’est-ce qu’un milieu de culture enrichi

A

un milieu additionné de produits (ex. sang, protéines, vitamines) favorisant la croissance de microbes ayant des besoins nutritifs complexes ou particuliers

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16
Q

qu’est-ce qu’un milieu de culture sélectif

A

un milieu dans lequel il y a un ajout d’inhibiteurs de croissances (anitibios, sels, composés chimiques) pour inhiber la croissance des microbes indésirables et favoriser ceux recherchés

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17
Q

qu’est-ce qu’un milieu de culture différentiel

A

un milieu avec une addition d’éléments (sucres, indicateur de pH) pour distinguer des espèces apparentées

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18
Q

vrai ou faux : un milieu peut être une combinaison d’enrichi, différentiel et sélectif

A

vrai

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19
Q

de quoi est formée la gélose Chapman

A

mannitol, sel et indicateur de pH

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20
Q

qu’est-ce qu’un milieu de transfert

A
  • ne permet pas la croissance

- préserve la viabilité lors du transfert

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21
Q

quelles sont les températures de viabilité des

  • psychrophiles
  • mésophiles
  • thermophiles
A
  • -10 à 25 degrés C
  • 20 à 50 degré C
  • 50 à 100 degrés C
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22
Q

description du modèle aérobie strict

A
  • croissance aérobie seulement

- la croissance a lieu seulement aux endroits oû il y a une forte concentration en O2

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23
Q

description du modèle aérobie facultatif

A
  • croissance aérobie ou anaérobie, mais optimale en présence de O2
  • croissance a lieu partout dans le tube, mais optimale dans les zones aérobiques
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24
Q

description du modèle anaérobie strict

A
  • croissance anaérobie seulement
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25
Q

description du modèle anaérobie aérotolérant

A
  • croissance anaérobie seulement mais la croissance se poursuit en présence d’O2
  • croissance uniforme partout dans le tube (O2 n’a aucun effet)
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26
Q

description de la croissance microaérophile

A
  • croissance aérobie seulement, O2 essentiel en FAIBLE concentration
  • croissance a lieu seulement là où une faible quantité d’O2 a diffusé dans le milieu
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27
Q

quelles sont les 2 façons d’avoir des cultures anaérobiques en laboratoire

A
  • chambre anaérobie

- jarre anaérobie

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28
Q

quel est le pH optimal des

  • acidophiles
  • neutrophiles
  • alkalophiles
A
  • < 5,5
  • 5 à 8
  • > 8,5
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29
Q

qu’est-ce qu’un facteur de croissance

A
  • métabolite essentiel dont le microbe NE SAIT PAS faire la synthèse
  • petite molécule (acide aminé, base nucléique, vitamine, hème, ion)
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30
Q

qu’est-ce qui amène les facteurs de croissance

A

les aliments

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31
Q

quelles sont les 6 phases de la courbe de croissance

A
  1. phase de latence
  2. phase d’accélération
  3. phase exponentielle
  4. phase de ralentissement
  5. phase stationnaire
  6. phase de décroissance
32
Q

lors de quelle réaction le glucose est transformé en pyruvate

A

glycolyse

33
Q

que se passe-t-il lorsque le pyruvate est dégradé en CO2 dans le cycle de Krebs

A
  • H+ et électrons sont captés par l’O2 pour former H2O

- énergie stockée sous forme d’ATP

34
Q

vrai ou faux : le cycle de Krebs fonctionne dans la fermentation

A

faux

35
Q

est -ce que l’accepteur final des réactions anaérobiques est organique ou inorganique

A

inorganique

36
Q

quel est l’accepteur final des électrons en mode de respiration aérobie

A

oxygène

37
Q

à quoi se rapporte la notion de croissance microbienne

A

augmentation du nombre

38
Q

définition d’un milieu de culture

A

préparation nutritive destinée à la croissance microbienne

39
Q

quels sont les 3 facteurs pour obtenir un milieu de culture idéal

A
  • nutriments
  • facteurs de croissance
  • conditions de croissance optimales (ex. température, pH, etc.)
40
Q

qu’est-ce que les bouillons de culture favorisent

A

la croissance rapide et abondante des microbes en suspension

41
Q

qu’est-ce qu’un inoculum

A

échantillon microbien inoculé dans un milieu de culture

42
Q

avec quoi se fait le transfert de bactéries d’un milieu de culture liquide vers une gélose

A

fil à boucle

43
Q

quelle est la méthode pour obtenir des colonies isolées et quel est le fonctionnement

A

méthode d’épuisement (ou des stries)

déposer des quantités décroissantes de cellules bactériennes sur les géloses

44
Q

quelle sorte de milieu de culture faudrait-il utiliser pour les microbes qui croissent lentement et dont la culture est fastidieuse

A

milieu enrichi

45
Q

quelle est la température optimale des psychrophiles

A

15 degrés C

46
Q

quel est le type de microorganisme le plus abondant

A

mésophiles

47
Q

quelle est la caractéristique particulière des bactéries aérobies qui leur permettent de croitre dans des milieux en présence d’O2

A

ils ont des enzymes de détoxification qui leur permettent de neutraliser les radicaux libres formés par le métabolisme en présence d’O2

48
Q

quel est le pH optimal qui permet la croissance de la majorité des microbes

A

6,5 - 7,5

49
Q

quelle est la méthode la plus courante de qualification d’une population bactérienne

A

dénombrement sur gélose

50
Q

en quoi consiste la phase de latence dans la courbe de croissance

A
  • période entre l’ensemencement et la multiplication des bactéries
  • correspond au délai nécessaire pour la synthèse des enzymes nécessaires pour que les bactéries puissent métaboliser les nutriments dans leur milieu de culture
51
Q

en quoi consiste la phase exponentielle dans la courbe de croissance

A

croissance à vitesse optimale, temps de division cellulaire minimal

52
Q

en quoi consiste la phase stationnaire dans la courbe de croissance

A

densité maximale de la culture atteinte, équilibre entre les bactéries formées et celles qui sont mortes
les bactéries qui peuvent sporuler le font pour se protéger de l’augmentation de la toxicité du milieu

53
Q

localisation des métabolismes respiratoires chez les cellules eucaryotes vs procaryotes

A
  • mitochondries

- le long des membranes cytoplasmiques

54
Q

qu’est-ce qui fournit de l’énergie stockée sous forme d’ATP dans le métabolisme respiratoire aérobies

A

le bris des liens chimiques C-C et C-H lorsque le glucose est dégradé en CO2

55
Q

qu’est-ce qui capte les protons et électrons de la chaine respiratoire du métabolisme respiratoire chez les aérobies

A
  • oxygène inspiré
56
Q

qu’est-ce qui transporte les H+ et les électrons dans le métabolisme respiratoire chez les aérobies

A

H+ : NAD et FAD et quinone

électrons : cytochromes b c a

57
Q

comment se nomme le processus qui décrit la perte graduelle de CO2 par les intermédiaires successifs du catabolisme du pyruvate

A

décarboxylation

58
Q

phosphorylation vs phosphorylation oxydative

A

les deux sont la combinaison d’un groupement phosphate à l’ADP sauf que la phosphorylation oxydative se produit quand la réaction a lieu lors du transfert d’énergie sur une chaine de transporteurs d’électrons

59
Q

pourquoi les bactéries anaérobies croient plus lentement que les bactéries aérobies

A

car la respiration anaérobie forme moins d’énergie sous forme d’ATP

60
Q

quel est l’impact de l’oxygène sur la fermentation

A

aucun, l’oxygène n’est pas nécessaire à la fermentation : la fermentation peut donc se produire en absence ou en présence d’oxygène

61
Q

quel est l’accepteur final d’électrons dans la fermentation puisqu’il n’y a pas de cycle de Krebs

A

composé organique synthétisé dans la cellule

62
Q

en quoi le pyruvate est-il transformé en fermentation et de quoi cela dépend-il

A
  • produits de fermentation relargués dans le milieu (éthanol, acide lactique, etc.)
  • nature du microorganisme
  • subtrat
  • enzyme
63
Q

1 avantage et 1 désavantage de la fermentation

A

avantage : l’analyse du produit final permet d’identifier le micro-organisme
désavantage : N’a pas accès au cycle de Krebs donc les seuls 2 ATP produits viennent de la glycolyse

64
Q

types de fermentation voir p. 12-13 notes

A

65
Q

quels sont les facteurs importants pour la conception des cuves des bioréacteurs industriels

A
  • aération
  • pH
  • température
66
Q

bioréacteurs industriels : production par lots vs production à écoulement continu

A
  • on recueille le produit après la fermentation

- on retire en continu le milieu épuisé de même que le produit recherché

67
Q

exemple de métabolite primaire et secondaire

A

primaire : éthanol

secondaire : pénicilline

68
Q

voir diapo 38-39 pour produits de la microbiologie industrielle

A

69
Q

pourquoi voulons-nous une culture pure

A

car on peut caractériser les bactéries

70
Q

quel est le type de milieu de culture de la gélose Chapman

A

sélectif pour les staphylococques

différentiel entre espèces/souches de staphylocoques

71
Q

exemple de milieu de culture différentiel

A

gélose de sang qui distingue les streptocoques qui sécrètent ou pas l’hémolyse

72
Q

de quoi est composée la gélose de chapman, qu’est-ce qu’elle inhibe, comment fait-elle la différenciation

A
  • mannitol, sel, indicateur pH
  • inhibe les bactéries qui ne tolèrent pas le sel
  • différencie celles fermentant ou non le mannitol
73
Q

quel est le type de milieu de culture de la gélose sang

A

différentiel entre les streptocoques produisant ou non des hémolysines

74
Q

quel est le type de milieu de culture de la gélose MacConkey

A
  • sélectif pour favoriser la croissance des Gram- et inhiber les Gram+
  • différentiel selon la capacité fermentaire du lactose
75
Q

quel est le type de milieu de culture de la gélose éosine-bleu de méthylène

A

différentiel avec la fermentation du lactose et favorise les entérobactéries Gram-