7. physiologie bactérienne (microbio) Flashcards
quelle est la source d’énergie des bactéries
- phototrophes
- chimiotrophes
- lumière
- composé chimique
quelles sont les 2 principales sources de nutriments des bactéries
- carbone
2. électrons
quelles sont les bactéries qui utilisent le carbone comme source de nutriments + exemples de nutriments
- autotrophes : CO2
- hétérotrophes : composés organiques
quelles sont les bactéries qui utilisent les électrons comme source de nutriment + exemples de nutriment
- lithotrophes : NH3, NO2-, S, H2S, H2, NH3, ions ferreux (inorganique)
- organotrophes : sucres, alcools, acides, … composés avec carbone
qu’est-ce qu’un milieu de culture défini/synthétique
un milieu dont la composition chimique est connue et précise
quel est le but d’avoir un milieu de culture défini
étudier le rôle d’un composé sur la croissance
qu’est-ce qu’un milieu de culture complexe + 1 exemple
un milieu dont la composition chimique est non rigoureusement déterminée
- contient des extraits de viande, de soya, de levures, hydrolysats de protéines
quel est le but d’avoir un milieu de culture complexe
favoriser la croissance de tout organisme pouvant être présent dans un échantillon ou encore en ayant des exigences nutritionnelles spécifiques
quelles sont les 2 formes de milieux de culture possibles
- liquide : bouillon
- solide : gélose
comment est préparée la gélose
- ajout d’agar (extrait d’algue gélifiant, solide jusqu’è 45 degrés C) au bouillon
qu’est-ce que la culture sur gélose permet (2)
- obtention de colonies isolées
- obtention de cultures pures
de quoi dépend le temps de croissance des bactéries sur la gélose (3)
- des espèces
- des conditions de culture
- la source d’isolement
quand est-ce que la plupart des espèces en microbio médicale peuvent produire des colonies visibles + 3 exemples
après 18-24h d’incubation à 35 degrés C
- entérobactéries : escherichia coli., Salmonella spp., Klebsiella spp
- cocci gram + : staphylocoques, streptocoques
- bactéries non fermentaires : acinetobacter spp, pseudomonas
quelles sont les espèces qui requièrent des incubations plus longues que la normale + le temps nécessaire
- legionella pneumophilia : 2-3 jours minimum (jusqu’à 7 jours)
- mycobacterium tuberculosis : entre 2 et 6 semaines
qu’est-ce qu’un milieu de culture enrichi
un milieu additionné de produits (ex. sang, protéines, vitamines) favorisant la croissance de microbes ayant des besoins nutritifs complexes ou particuliers
qu’est-ce qu’un milieu de culture sélectif
un milieu dans lequel il y a un ajout d’inhibiteurs de croissances (anitibios, sels, composés chimiques) pour inhiber la croissance des microbes indésirables et favoriser ceux recherchés
qu’est-ce qu’un milieu de culture différentiel
un milieu avec une addition d’éléments (sucres, indicateur de pH) pour distinguer des espèces apparentées
vrai ou faux : un milieu peut être une combinaison d’enrichi, différentiel et sélectif
vrai
de quoi est formée la gélose Chapman
mannitol, sel et indicateur de pH
qu’est-ce qu’un milieu de transfert
- ne permet pas la croissance
- préserve la viabilité lors du transfert
quelles sont les températures de viabilité des
- psychrophiles
- mésophiles
- thermophiles
- -10 à 25 degrés C
- 20 à 50 degré C
- 50 à 100 degrés C
description du modèle aérobie strict
- croissance aérobie seulement
- la croissance a lieu seulement aux endroits oû il y a une forte concentration en O2
description du modèle aérobie facultatif
- croissance aérobie ou anaérobie, mais optimale en présence de O2
- croissance a lieu partout dans le tube, mais optimale dans les zones aérobiques
description du modèle anaérobie strict
- croissance anaérobie seulement
description du modèle anaérobie aérotolérant
- croissance anaérobie seulement mais la croissance se poursuit en présence d’O2
- croissance uniforme partout dans le tube (O2 n’a aucun effet)
description de la croissance microaérophile
- croissance aérobie seulement, O2 essentiel en FAIBLE concentration
- croissance a lieu seulement là où une faible quantité d’O2 a diffusé dans le milieu
quelles sont les 2 façons d’avoir des cultures anaérobiques en laboratoire
- chambre anaérobie
- jarre anaérobie
quel est le pH optimal des
- acidophiles
- neutrophiles
- alkalophiles
- < 5,5
- 5 à 8
- > 8,5
qu’est-ce qu’un facteur de croissance
- métabolite essentiel dont le microbe NE SAIT PAS faire la synthèse
- petite molécule (acide aminé, base nucléique, vitamine, hème, ion)
qu’est-ce qui amène les facteurs de croissance
les aliments
quelles sont les 6 phases de la courbe de croissance
- phase de latence
- phase d’accélération
- phase exponentielle
- phase de ralentissement
- phase stationnaire
- phase de décroissance
lors de quelle réaction le glucose est transformé en pyruvate
glycolyse
que se passe-t-il lorsque le pyruvate est dégradé en CO2 dans le cycle de Krebs
- H+ et électrons sont captés par l’O2 pour former H2O
- énergie stockée sous forme d’ATP
vrai ou faux : le cycle de Krebs fonctionne dans la fermentation
faux
est -ce que l’accepteur final des réactions anaérobiques est organique ou inorganique
inorganique
quel est l’accepteur final des électrons en mode de respiration aérobie
oxygène
à quoi se rapporte la notion de croissance microbienne
augmentation du nombre
définition d’un milieu de culture
préparation nutritive destinée à la croissance microbienne
quels sont les 3 facteurs pour obtenir un milieu de culture idéal
- nutriments
- facteurs de croissance
- conditions de croissance optimales (ex. température, pH, etc.)
qu’est-ce que les bouillons de culture favorisent
la croissance rapide et abondante des microbes en suspension
qu’est-ce qu’un inoculum
échantillon microbien inoculé dans un milieu de culture
avec quoi se fait le transfert de bactéries d’un milieu de culture liquide vers une gélose
fil à boucle
quelle est la méthode pour obtenir des colonies isolées et quel est le fonctionnement
méthode d’épuisement (ou des stries)
déposer des quantités décroissantes de cellules bactériennes sur les géloses
quelle sorte de milieu de culture faudrait-il utiliser pour les microbes qui croissent lentement et dont la culture est fastidieuse
milieu enrichi
quelle est la température optimale des psychrophiles
15 degrés C
quel est le type de microorganisme le plus abondant
mésophiles
quelle est la caractéristique particulière des bactéries aérobies qui leur permettent de croitre dans des milieux en présence d’O2
ils ont des enzymes de détoxification qui leur permettent de neutraliser les radicaux libres formés par le métabolisme en présence d’O2
quel est le pH optimal qui permet la croissance de la majorité des microbes
6,5 - 7,5
quelle est la méthode la plus courante de qualification d’une population bactérienne
dénombrement sur gélose
en quoi consiste la phase de latence dans la courbe de croissance
- période entre l’ensemencement et la multiplication des bactéries
- correspond au délai nécessaire pour la synthèse des enzymes nécessaires pour que les bactéries puissent métaboliser les nutriments dans leur milieu de culture
en quoi consiste la phase exponentielle dans la courbe de croissance
croissance à vitesse optimale, temps de division cellulaire minimal
en quoi consiste la phase stationnaire dans la courbe de croissance
densité maximale de la culture atteinte, équilibre entre les bactéries formées et celles qui sont mortes
les bactéries qui peuvent sporuler le font pour se protéger de l’augmentation de la toxicité du milieu
localisation des métabolismes respiratoires chez les cellules eucaryotes vs procaryotes
- mitochondries
- le long des membranes cytoplasmiques
qu’est-ce qui fournit de l’énergie stockée sous forme d’ATP dans le métabolisme respiratoire aérobies
le bris des liens chimiques C-C et C-H lorsque le glucose est dégradé en CO2
qu’est-ce qui capte les protons et électrons de la chaine respiratoire du métabolisme respiratoire chez les aérobies
- oxygène inspiré
qu’est-ce qui transporte les H+ et les électrons dans le métabolisme respiratoire chez les aérobies
H+ : NAD et FAD et quinone
électrons : cytochromes b c a
comment se nomme le processus qui décrit la perte graduelle de CO2 par les intermédiaires successifs du catabolisme du pyruvate
décarboxylation
phosphorylation vs phosphorylation oxydative
les deux sont la combinaison d’un groupement phosphate à l’ADP sauf que la phosphorylation oxydative se produit quand la réaction a lieu lors du transfert d’énergie sur une chaine de transporteurs d’électrons
pourquoi les bactéries anaérobies croient plus lentement que les bactéries aérobies
car la respiration anaérobie forme moins d’énergie sous forme d’ATP
quel est l’impact de l’oxygène sur la fermentation
aucun, l’oxygène n’est pas nécessaire à la fermentation : la fermentation peut donc se produire en absence ou en présence d’oxygène
quel est l’accepteur final d’électrons dans la fermentation puisqu’il n’y a pas de cycle de Krebs
composé organique synthétisé dans la cellule
en quoi le pyruvate est-il transformé en fermentation et de quoi cela dépend-il
- produits de fermentation relargués dans le milieu (éthanol, acide lactique, etc.)
- nature du microorganisme
- subtrat
- enzyme
1 avantage et 1 désavantage de la fermentation
avantage : l’analyse du produit final permet d’identifier le micro-organisme
désavantage : N’a pas accès au cycle de Krebs donc les seuls 2 ATP produits viennent de la glycolyse
types de fermentation voir p. 12-13 notes
…
quels sont les facteurs importants pour la conception des cuves des bioréacteurs industriels
- aération
- pH
- température
bioréacteurs industriels : production par lots vs production à écoulement continu
- on recueille le produit après la fermentation
- on retire en continu le milieu épuisé de même que le produit recherché
exemple de métabolite primaire et secondaire
primaire : éthanol
secondaire : pénicilline
voir diapo 38-39 pour produits de la microbiologie industrielle
…
pourquoi voulons-nous une culture pure
car on peut caractériser les bactéries
quel est le type de milieu de culture de la gélose Chapman
sélectif pour les staphylococques
différentiel entre espèces/souches de staphylocoques
exemple de milieu de culture différentiel
gélose de sang qui distingue les streptocoques qui sécrètent ou pas l’hémolyse
de quoi est composée la gélose de chapman, qu’est-ce qu’elle inhibe, comment fait-elle la différenciation
- mannitol, sel, indicateur pH
- inhibe les bactéries qui ne tolèrent pas le sel
- différencie celles fermentant ou non le mannitol
quel est le type de milieu de culture de la gélose sang
différentiel entre les streptocoques produisant ou non des hémolysines
quel est le type de milieu de culture de la gélose MacConkey
- sélectif pour favoriser la croissance des Gram- et inhiber les Gram+
- différentiel selon la capacité fermentaire du lactose
quel est le type de milieu de culture de la gélose éosine-bleu de méthylène
différentiel avec la fermentation du lactose et favorise les entérobactéries Gram-
