10. diagnostic de laboratoire des infections (microbio) Flashcards
quelles sont les 3 phases du cheminement diagnostique en infectiologie
- phase pré-analytique
- phase analytique
- phase post-analytique
quelles sont les 5 étapes de la phase pré-analytique
- patient consulte avec des symptômes/signes d’une maladie infectieuse
- diagnostic clinique tentatif
- prescription de prélèvements de culture
- prélèvements identifiés au nom du patient puis acheminés au labo avec la demande d’analyse
- réception des prélèvements au labo
quelles sont les 8 étapes de la phase analytique
- examen direct sur le prélèvement
- rapport partiel émis au médecin : interprétation
- mise en culture du prélèvement
- incubation des milieux ensemencés
- lecture des milieux (le lendemain)
- identification bactérienne
- rapport partiel : interprétation
- finalisation de l’identification
quelles sont les 2 étapes de la phase post-analytique
- émission du rapport final
2. interprétation finale du médecin
quelles sont les raisons pour effectuer un examen direct (4)
- quantifier les globules blancs présents dans le prélèvement
- exprimer en valeur relative la quantité de polynucléaires présents dans le prélèvement (dans certains cas)
- observations de micro-organismes pour poser un diagnostic présomptif
- évaluation de la qualité du prélèvement pour décider si le résultat final sera fiable
à quoi sert de quantifier les globules blancs
nous informe sur la réponse inflammatoire et la “purulence” de l’échantillon
quels sont les micro-organismes que nous pouvons observer dans un examen direct en microbiologie (5)
- bactéries
- éléments mycéliens (champignons)
- levure
- structures parasitaires
- inclusions virales
quels sont les 4 examens directs
- sérum physiologique
- hydroxyde de potassium (KOH)
- iode
- fond noir
à quoi sert l’examen direct du sérum physiologique
- permet d’observer la mobilité de certains micro-organismes
- permet d’évaluer rapidement les micro-organismes avec des formes particulières
quel est le mécanisme de l’examen direct de l’hydroxyde de potassium et à quoi sert-il
- KOH 10% digère la kératine
- utile pour diagnostiquer des éléments mycéliens (champignons) à partir de prélèvement (ongles, peau, cheveux)
comment fonctionne l’examen direct de l’iode et à quoi sert-il
- colore les noyaux et organelles cytoplasmiques
- utile pour colorer rapidement les selles d’un patient et diagnostiquer la présence de protozoaires
à quoi sert l’examen direct du fond noir
- mettre en évidence des micro-organismes mal visualisés en microscopie optique standard et qui se colorent difficilement
quels sont les examens directs avec coloration
- coloration de Gram
- coloration de Ziehl-Neelsen
quel est le principe de la coloration de Gram
se base sur le fait que la teneur en lipides de la paroi cellulaire des bactéries est variable
- pauvre en lipides : retiennent plus le colorant cristal violet (Gram positif)
- riche en lipides : le cristal violet ne s’imprègne pas de façon permanente (Gram négatif)
quelle est la technique de la coloration de Gram (10 étapes)
- étaler sur une lame une couche mince du prélèvement à colorer
- fixer à la chaleur
- cristal violet (1 minute)
- laver
- iode (1 minute) pour bien fixer le cristal violet
- décolorer quelques secondes à l’acétone alcool
- laver
- safranine (1 minute)
- laver, assécher
- lire au microscope
quelle est l’interprétation à faire pour une bactérie de couleur bleue et pourquoi (gram)
- paroi pauvre en lipides : Gram positif
- le cristal violet n’a pas été décoloré par l’acétone alcool
- la contre-coloration à la safranine (rose) a été inefficace
quelle est l’interprétation à faire d’une bactérie de couleur rose et pourquoi (gram)
- riche en lipides : Gram négative
- cristal violet est facilement libéré de la paroi par le décolorant : la conter-coloration à la safranine est possible puisque la paroi est libre de colorant
quelles sont les 4 utilités de la coloration de Gram
- reconnaitre rapidement le/les bactéries possiblement pathogènes et d’en informer le clinicien
- évaluer la présence ou l’absence de flore normale quand le prélèvement provient d’un site non stérile
- évaluer la réponse inflammatoire car les globules blancs sont colorés dans le processus
- quantifier de façon relative les polynucléaires vs les cellules mononucléées (distinction d’infection bactérienne vs virale)
quel est le principe de la coloration de Ziehl-Neelsen
La paroi de certains micro-organismes est épaisse et cireuse et ne se colore pas facilement. Une fois les parois colorées par contre elles résistent à la décoloration par un solvant tel l’acidealcool. Ces bactéries sont appelées par conséquent « bacilles
acido-alcoolo résistants » ou B.A.A.R.
quelle est la technique de la coloration de Ziehl-Neelsen (8 étapes)
- préparer une lame à partir du prélèvement comme la coloration de Gram
- “carbol fuchsin”
- laver
- acide-alcool
- laver
- bleu de méthylène
- laver, assécher
8, lire au microscope
quelle est l’interprétation à faire d’une bactérie de couleur rose et pourquoi (ziehl)
- bacille acido-alcoolo résistant (BAAR)
- La paroi épaisse et cireuse a capté le premier colorant de la coloration de Ziehl-Neelsen (« carbol fuchsin ») et a résisté au décolorant
- contre-coloration au bleu de méthylène = inefficace