תרגום חלבונים (מולקולרית ג) Flashcards

1
Q

כמה מולקולות
tRNA
ייחודיות למתיונין יש?

A

2

  • tRNA-met
  • tRNAi-met
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q
במה נבדלת מולקולת
tRNA-met
מ
tRNAi-met?
(3)
A
  1. נכנסת לאתר
    P
  2. עובדת עם פקטורי אניציאציה ולא עם פקטורי אלונגציה
  3. בחיידקים- משפעלת אנזים המבצע פורמליזציה על מתיונין לקבלת פורמיל-מתיונין
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

מה תפקידו של
eIF2?
(אאוקריוטים)

A

מצמיד את
tRNAi-met
לתת היחידה הקטנה של הריבוזום

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מה תפקידו של

eIF4E?

A

קושר את ה
5’cap
של מולקולת המרנ”א שיצאה מהגרעין

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

מה תפקידו של

eIF4G?

A
קשירת 
PAB
מצידו האחד ו
eIF4E
מצידו השני ליצירת גשר ובהתאם מולקולת מרנ"א "מעגלית" להעלאת יעילות התרגום
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

אילו פקטורי אניציאציה אאוקריוטים ישנם?

3

A
  • eIF2
  • eIF4E
  • eIF4G
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

איזה פקטור אניציאציה הינו חלבון
G
מונומרי?

A

eIF2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

לאחר קישור
tRNAi-met
לתת היחידה הקטנה של הריבוזום וכן למרנ”א המעגלי, מתרחש תהליך של סריקה לינארית. מה מטרתו? כיצד הוא מתבצע?

A
- מטרתו למצוא את ה
AUG
הראשון ממנו מתחיל התרגום
- מתבצע הודות לפעילות הליקאז של פקטורי אניציאציה נוספים המשתמשים ב
ATP
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מהי תופעת ה

leaky scanning?

A

דילוג על ה
AUG
הראשון (או יותר) בשל היעדר רצף קוזאק והתחלה מאחד המצוי אחריו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מהו רצף קוזאק?

A

רצף קצר שהימצאותו לאחר
AUG
מסוים מגביר את הסיכוי שהתרגום יתחיל ממנו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

מהו רצף
shine delgarno
המצוי במרנ”א של חיידקים?

A

רצף עשיר בפורינים המהווה את אתר הקישור לריבוזום החיידקי, המצוי ב
5’UTR

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

איזה קודון מצוי מיד לאחר רצף שיין דלגרנו בחיידקים?

A

קודון ההתחלה

AUG

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מה קורה לאחר מציאת הקודון הראשון ע”י תת היחידה הקטנה של הריבוזום?

A
- EF2
מבצע הידרוליזה ל
GTP
ומשתחרר
- תת היחידה הגדולה מתחברת
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מהם ארבעת שלבי האלונגציה?

A
  1. tRNA
    מגיע לעמדה
    A
  2. יצירת קשר פפטידי ע”י פפטידיל טראנספראז
  3. טראנסלוקציה ספונטנית של תת היחידה הגדולה של הריבוזום
  4. טראנסלוקציה של תת היחידה הקטנה של הריבוזום בעזרת פקטור האלונגציה
    EF-G
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

מיהם פקטורי האלונגציה החיידקיים?

3

A
  • EF-tu
  • EF-ts
  • EF-G
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

מיהם פקטורי האלונגציה האאוקריוטים? מי ההומולוגים הפרוקריוטים שלהם?
(2)

A
  • eEF1 (EF-tu)

- eEF2 (EF-G)

17
Q
מבין פקטורי האלונגציה מי שייכים למשפחת חלבוני ה
G
המונומרים?
(2)
(בפרוקריוטים)
A
  • EF-tu

- EF-G

18
Q

למה משמשים פקטורי האלונגציה?

A

להגברת יעילות התהליך, שמתקיים באופן איטי בלעדיהם

19
Q

מה תפקידו של

EF-tu?

A
מביא אמינואציל
tRNA
לאתר 
A 
של הריבוזום
20
Q

מה תפקיד תת היחידה
16S rRNA
של הריבוזום בהקשר לזיווג הבסיסים בין הקודון לאנטיקודון?

A
כאשר הזיווג תקין היא מתהדקת סביבו ומעודדת הידרוליזת 
GTP
ע"י
EF-tu
כך שהוא משתחרר והאלונגציה יוצאת לפועל
21
Q

מהו מנגנון ההגהה של תהליך התרגום?

3

A
1. בדיקת זיווג הבסיסים ע"י
EF-tu
2. בדיקת זיווג הבסיסים ע"י הריבוזום עצמו
(16S rRNA)
3. kinetic proofreading
22
Q

מהי התופעה

kinetic proofreading?

A
לאחר הידרוליזת
GTP
ע"י
EF-tu
הטרנ"א עם הח"א צריכים להגיע למיקום מדויק. בפרק זמן יכול להתרחש התנתקות שלהם עקב זיווג בסיסים שאינו מושלם.
23
Q

מה קורה כאשר יש מחזורים חוזרים ונשנים של חיבור שגוי של ח”א לאתר
A
בשלב האלונגציה ש התרגום?

A

פקטור שחרור שבד”כ אחראי על הטרמינציה יסייע לבצע טרמינציה מוקדמת של החלבון המתהווה, שישלח לדגרדציה

24
Q

כיצד מתבצע תהליך הטראנסלוקציה של הריבוזום?

A
  1. תת היחידה הגדולה עושה טראנסלוקציה ספונטנית
  2. תת היחידה הקטנה עושה טראנסלוקציה בעזרת
    EF-G
25
Q

מה המינימום של קשרי פוספאט שצריך להשקיע לשם אינקורפורציה של ח”א אח?
(בהנחה שהכל הלך חלק ובניסיון הראשון)

A

4

26
Q

מה מקור האנרגיה ליצירת הקשר הפפטידי?

A
שבירת הקשר האסטרי בין ה
tRNA
לח"א של המחזור הקודם
(שיצירתו דרשה 
ATP..)
27
Q

כיצד נוצר הקשר הפפטידי?

A

את הפפטידיל טראנספראז מזרז התקפה נוקלאופילית של האמין של הח”א של אתר
A
על ההידרוקסיל של הח”א של אתר
P

28
Q

איזו תת יחידה של הריבוזום הפרוקריוטי מבצעת את פעילות הפפטידיל טראנספראז?

A

23S rRNA

29
Q
כיצד ה
tRNA
באתר 
P
מסייע לפפטידיל טראנספראז בפעילות הקטליטית שלו?
A

היא תורמת לו
OH
לאתר הפעיל, החיוני לצורך הקטליזה

30
Q

כיצד מבוצעת טרמינציית התרגום?

A
בהגעה לקודון סיום באתר
A
נכנס
realising factor
המסגנל לפפטידיל טראנספראז לעשות הידרוליזהלקשר האסטרי שבין הח"א האחרונה ל
tRNA
שלה,  מה שיגרום לשחרור הפפטיד
31
Q

מה קורה לריבוזום לאחר שרור הפפטיד ממננו בטרמינציית התרגום?

A

הוא מתפרק ומתכונן למחזור תרגום נוסף

32
Q

באילו אורגניזמים ניתן למצוא פוליזומים?

A

הן באאוקריוטים והן בפרוקריוטים

33
Q

מהו תהליך ה

translation recoding?

A

תהליך הקיים בחיידקים, ארכיאה ואאוקריוטים המאפשר הכנסה של הח”א סלנוציסטאין תוך כדי התרגום לחלבון

34
Q

איזה קודון מזהה ה
tRNA
של סלנוציסטאין?

A
UGA
שלאחריו
stem & loop
ייחודי
(המגייס פקטור אניציאציה ייחודי הומולגי ל
EF-tu)
35
Q

כיצד מתבצע הקישור בין סלנוציסטאין ל
tRNA
הייחודי לה?

A

aminoacyl-tRNA-synthethase

מחבר אליו את החומצה האמנית סרין שתעבור מיד לאחר מכן מודיפיקציה ליצירת סלנוציסטאין

36
Q

מה תפקיד המערכת

NMD?

A
nonsense mediate mRNA decay.
תפקידו לבדוק את תקינות השחבור בסיבוב ה
pioneer
של הריבוזום ע"ג
מרנ"א חדש
37
Q
מהו המנגנון של שיטת ה
NMD?
(מה חלבוני
UPF
בודקים ומה הם עושים במידה ומצאו דבר שאינו תקין)
A
חלבוני
UPF
מזהים-
1. מרחק בין
EJC
סמוכים (רואים שאינו רב מידי)
2. אם יש
EJC
לאחר קודון סיום.
במידה ומצאו משהו לא תקין הם מגייסים
E3 ligase
שישמנו את החלבון שנוצר לדגרדציה וכן מתווכים דגרדציה ש המרנ"א הפגום.