תרגום חלבונים (מולקולרית ג)

Question 1

כמה מולקולות
tRNA
ייחודיות למתיונין יש?

Answer 1

2

• tRNA-met
• tRNAi-met

Question 2

במה נבדלת מולקולת
tRNA-met
מ
tRNAi-met?
(3)

Answer 2

1. נכנסת לאתר
   P
2. עובדת עם פקטורי אניציאציה ולא עם פקטורי אלונגציה
3. בחיידקים- משפעלת אנזים המבצע פורמליזציה על מתיונין לקבלת פורמיל-מתיונין

Question 3

מה תפקידו של
eIF2?
(אאוקריוטים)

Answer 3

מצמיד את
tRNAi-met
לתת היחידה הקטנה של הריבוזום

Question 4

מה תפקידו של

eIF4E?

Answer 4

קושר את ה
5’cap
של מולקולת המרנ”א שיצאה מהגרעין

Question 5

מה תפקידו של

eIF4G?

Answer 5

קשירת 
PAB
מצידו האחד ו
eIF4E
מצידו השני ליצירת גשר ובהתאם מולקולת מרנ"א "מעגלית" להעלאת יעילות התרגום

Question 6

אילו פקטורי אניציאציה אאוקריוטים ישנם?

3

Answer 6

• eIF2
• eIF4E
• eIF4G

Question 7

איזה פקטור אניציאציה הינו חלבון
G
מונומרי?

Answer 7

eIF2

Question 8

לאחר קישור
tRNAi-met
לתת היחידה הקטנה של הריבוזום וכן למרנ”א המעגלי, מתרחש תהליך של סריקה לינארית. מה מטרתו? כיצד הוא מתבצע?

Answer 8

- מטרתו למצוא את ה
AUG
הראשון ממנו מתחיל התרגום
- מתבצע הודות לפעילות הליקאז של פקטורי אניציאציה נוספים המשתמשים ב
ATP

Question 9

מהי תופעת ה

leaky scanning?

Answer 9

דילוג על ה
AUG
הראשון (או יותר) בשל היעדר רצף קוזאק והתחלה מאחד המצוי אחריו

Question 10

מהו רצף קוזאק?

Answer 10

רצף קצר שהימצאותו לאחר
AUG
מסוים מגביר את הסיכוי שהתרגום יתחיל ממנו

Question 11

מהו רצף
shine delgarno
המצוי במרנ”א של חיידקים?

Answer 11

רצף עשיר בפורינים המהווה את אתר הקישור לריבוזום החיידקי, המצוי ב
5’UTR

Question 12

איזה קודון מצוי מיד לאחר רצף שיין דלגרנו בחיידקים?

Answer 12

קודון ההתחלה

AUG

Question 13

מה קורה לאחר מציאת הקודון הראשון ע”י תת היחידה הקטנה של הריבוזום?

Answer 13

- EF2
מבצע הידרוליזה ל
GTP
ומשתחרר
- תת היחידה הגדולה מתחברת

Question 14

מהם ארבעת שלבי האלונגציה?

Answer 14

1. tRNA
   מגיע לעמדה
   A
2. יצירת קשר פפטידי ע”י פפטידיל טראנספראז
3. טראנסלוקציה ספונטנית של תת היחידה הגדולה של הריבוזום
4. טראנסלוקציה של תת היחידה הקטנה של הריבוזום בעזרת פקטור האלונגציה
   EF-G

Question 15

מיהם פקטורי האלונגציה החיידקיים?

3

Answer 15

• EF-tu
• EF-ts
• EF-G

Question 16

מיהם פקטורי האלונגציה האאוקריוטים? מי ההומולוגים הפרוקריוטים שלהם?
(2)

Answer 16

• eEF1 (EF-tu)

- eEF2 (EF-G)

Question 17

מבין פקטורי האלונגציה מי שייכים למשפחת חלבוני ה
G
המונומרים?
(2)
(בפרוקריוטים)

Answer 17

• EF-tu

- EF-G

Question 18

למה משמשים פקטורי האלונגציה?

Answer 18

להגברת יעילות התהליך, שמתקיים באופן איטי בלעדיהם

Question 19

מה תפקידו של

EF-tu?

Answer 19

מביא אמינואציל
tRNA
לאתר 
A 
של הריבוזום

Question 20

מה תפקיד תת היחידה
16S rRNA
של הריבוזום בהקשר לזיווג הבסיסים בין הקודון לאנטיקודון?

Answer 20

כאשר הזיווג תקין היא מתהדקת סביבו ומעודדת הידרוליזת 
GTP
ע"י
EF-tu
כך שהוא משתחרר והאלונגציה יוצאת לפועל

Question 21

מהו מנגנון ההגהה של תהליך התרגום?

3

Answer 21

1. בדיקת זיווג הבסיסים ע"י
EF-tu
2. בדיקת זיווג הבסיסים ע"י הריבוזום עצמו
(16S rRNA)
3. kinetic proofreading

Question 22

מהי התופעה

kinetic proofreading?

Answer 22

לאחר הידרוליזת
GTP
ע"י
EF-tu
הטרנ"א עם הח"א צריכים להגיע למיקום מדויק. בפרק זמן יכול להתרחש התנתקות שלהם עקב זיווג בסיסים שאינו מושלם.

Question 23

מה קורה כאשר יש מחזורים חוזרים ונשנים של חיבור שגוי של ח”א לאתר
A
בשלב האלונגציה ש התרגום?

Answer 23

פקטור שחרור שבד”כ אחראי על הטרמינציה יסייע לבצע טרמינציה מוקדמת של החלבון המתהווה, שישלח לדגרדציה

Question 24

כיצד מתבצע תהליך הטראנסלוקציה של הריבוזום?

Answer 24

1. תת היחידה הגדולה עושה טראנסלוקציה ספונטנית
2. תת היחידה הקטנה עושה טראנסלוקציה בעזרת
   EF-G

Question 25

מה המינימום של קשרי פוספאט שצריך להשקיע לשם אינקורפורציה של ח"א אח? (בהנחה שהכל הלך חלק ובניסיון הראשון)

Answer 25

4

Question 26

מה מקור האנרגיה ליצירת הקשר הפפטידי?

Answer 26

``` שבירת הקשר האסטרי בין ה tRNA לח"א של המחזור הקודם (שיצירתו דרשה ATP..) ```

Question 27

כיצד נוצר הקשר הפפטידי?

Answer 27

את הפפטידיל טראנספראז מזרז התקפה נוקלאופילית של האמין של הח"א של אתר A על ההידרוקסיל של הח"א של אתר P

Question 28

איזו תת יחידה של הריבוזום הפרוקריוטי מבצעת את פעילות הפפטידיל טראנספראז?

Answer 28

23S rRNA

Question 29

``` כיצד ה tRNA באתר P מסייע לפפטידיל טראנספראז בפעילות הקטליטית שלו? ```

Answer 29

היא תורמת לו OH לאתר הפעיל, החיוני לצורך הקטליזה

Question 30

כיצד מבוצעת טרמינציית התרגום?

Answer 30

``` בהגעה לקודון סיום באתר A נכנס realising factor המסגנל לפפטידיל טראנספראז לעשות הידרוליזהלקשר האסטרי שבין הח"א האחרונה ל tRNA שלה, מה שיגרום לשחרור הפפטיד ```

Question 31

מה קורה לריבוזום לאחר שרור הפפטיד ממננו בטרמינציית התרגום?

Answer 31

הוא מתפרק ומתכונן למחזור תרגום נוסף

Question 32

באילו אורגניזמים ניתן למצוא פוליזומים?

Answer 32

הן באאוקריוטים והן בפרוקריוטים

Question 33

מהו תהליך ה | translation recoding?

Answer 33

תהליך הקיים בחיידקים, ארכיאה ואאוקריוטים המאפשר הכנסה של הח"א סלנוציסטאין תוך כדי התרגום לחלבון

Question 34

איזה קודון מזהה ה tRNA של סלנוציסטאין?

Answer 34

``` UGA שלאחריו stem & loop ייחודי (המגייס פקטור אניציאציה ייחודי הומולגי ל EF-tu) ```

Question 35

כיצד מתבצע הקישור בין סלנוציסטאין ל tRNA הייחודי לה?

Answer 35

aminoacyl-tRNA-synthethase | מחבר אליו את החומצה האמנית סרין שתעבור מיד לאחר מכן מודיפיקציה ליצירת סלנוציסטאין

Question 36

מה תפקיד המערכת | NMD?

Answer 36

``` nonsense mediate mRNA decay. תפקידו לבדוק את תקינות השחבור בסיבוב ה pioneer של הריבוזום ע"ג מרנ"א חדש ```

Question 37

``` מהו המנגנון של שיטת ה NMD? (מה חלבוני UPF בודקים ומה הם עושים במידה ומצאו דבר שאינו תקין) ```

Answer 37

``` חלבוני UPF מזהים- 1. מרחק בין EJC סמוכים (רואים שאינו רב מידי) 2. אם יש EJC לאחר קודון סיום. במידה ומצאו משהו לא תקין הם מגייסים E3 ligase שישמנו את החלבון שנוצר לדגרדציה וכן מתווכים דגרדציה ש המרנ"א הפגום. ```