בקרות ביטוי גנים ע"י רנ"א שאינו מקודד (מולקולרית ד) Flashcards
מהם שלושת הסוגים של מולקולות
RNAi?
- miRNA
- siRNA
- piRNA
מה יקרה למולקולות המטרה של
RNAi?
(3 אפשרויות)
- יעברו ביקוע
- translational represion
ובסופו של דבר הרס ב
P-bodies - יצירת הטרוכרומטין בגן הדנ”א ממנה מולקולת המטרה משועתקת
כיצד חלבוני ארגונאט/פיווי בוחרים את אחד מגדילי הרנ”א הדו-גדילי שישמש כמכווין?
בחירה אקראית
מהו
miR-gene?
הגן המקודד ל
miRNA
מי משעתק את מולקולות ה
miRNA?
RNA polymerase 2
poly A + 5’cap
מהו המנגנון בו
miRNA
נוצר ועובד?
(4)
- בגרעין- שעתוק, קאפינג ופולי אדנילציה. לאחר מכן קיפול למבנה שניוני שעובר ביקוע (דרושה ופאשה) ליצירת
stem & loop
שיוצא מהגרעין - בציטוזול- דייסר חותך את הראש לקבלת רנ”א דו-גדילי
- ארגונאט נצמד לאחד מהגדילים ודואג לדגרדציה של השני ליצירת קומפלקס
RISC - הקומפלקס מגיע לאתר המטרה בעזרת ההכוונה של ה
gRNA
(אז יש כמה אפשרויות לפי זיווגי הבסיסים שנוצרים)
מה גורל מולקולת המטרה המזוהה ע”י קומפלקס
RISC?
(2)
1. זיווגי בסיסים שאינם מושלמים גורמים ל transitional pause מהיר ולשליחת המרנ"א ל P-body שם יעבור דגרדציה בסופו של דבר 2. אם זיווגי הבסיסים מושלמים יתבצע ביקוע של המרנ"א ע"י RISC מה שיביא לדגרדציה מהירה שלה ע"י אקסונוקלאזות
מה מקורה של מולקולת
siRNA?
מקור חוץ גנומי.
כלומר אינה מקודדת מגן המצוי בגנום אלא מגיעה מבחוץ (למשל, ווירוס, טרנספוזון, ניסוי)
מה בד”כ יהיה גורל המרנ”א המזוהה ע”י
siRNA?
דגרדציה מהירה מאחר ובד”כ יתבצע זיווג בסיסים מושלם ביניהם
כיצד
siRNA
מאפשר לתאי צמח להתגונן מפני הדבקה וויראלית של חלק מתאיו?
ה
siRNA
עובר דרך הפלזמודסמטה כך שתאים שטרם הודבקו גם כן מוגנים מפני ההדבקה
מהו מנגנון השתקת כרומטין תוך שימוש במולקולות
RNAi?
siRNA מעובד עובר אינטראקציה עם קומפלקס RITS החושף NLS, נכנס לגרעין ושם מגייס אנזימים העושים מודיפיקציות על היסטונים הגורמים ליצירת הטרוכרומטין בדנ"א הסמוך לשעתוק של אותה מולקולת רנ"א אליה הכווין ה siRNA לקבלת השתקה של הגן
איזו משפחת חלבונים מצויים בקומפלקסים
RISC
ו
RITS?
חלבונים ממשפחת הארגונאט
כיצד נוצר
piRNA?
נוצרת מולקולת רנ”א ארוכה מאזור הקרוי
piRNA array
שעוברת לאחר מכן ביקוע לקבלת חד-גדיל של
piRNA
מהם ההבדלים בין piRNA לבין miRNA, siRNA? (4)
- אין מעורבות של דייסר בעיבודו
- אין יצירה של רנ”א דו-גדילי
- piRNA
מעט ארוכות יותר - עוברים אינטראקציה עם חלבוני פיווי ולא ארגונאט
למה משמשת מערכת ה
piRNA?
הגנה מפני טראנספוזונים בתאי מין