טכניקות רקומבינציה (מולקולרית ב)

Question 1

באיזה שלבים של מחזור התא תתרחש רקומבינציה הומולוגית לשם תיקון?
במה זה תלוי?

Answer 1

- לאחר הכפלת הכרומטידות בשלב 
S
ובשלב
G2
- תלוי בהימצאות כרומטידה אחות המשמשת כתבנית לתיקון

Question 2

איך נקרא החלבון שתפס את קצוות השבר הד-גדילי בתיקון בעזרת מנגנון
NHEJ?

Answer 2

Ku

Question 3

תאר/י את שלבי בתיקון במנגנון
NHEJ
(2)

Answer 3

• Ku
  הטרודימרי תופס את קצוות השבר
• חלבונים נוספים מגויסים לשם החזקה, עיבוד וליגציה של השבר

Question 4

באילו תהליכים תאיים מעורבים חלבוני
Ku?
(3)

Answer 4

• NHEJ
• רקומבינציה של נוגדנים
  (V(D)J)
• רקומבינציה ליצירת רצפטורים של תאי
  T
  (TCR)

Question 5

מי האנזים האחראי על
strand exchange
בפרוקריוטים?

Answer 5

RecA

Question 6

מי האנזים האחראי על
strand exchange
באאוקריוטים?

Answer 6

Rad51

Question 7

מהו מנגנון הפעילות של
RecA
ודומיו?
(5)

Answer 7

- קשירת 
ATP
מעלה את האפיניוט שלו לחד גדיל
- קשירת החד גדיל במנגנון קאופרטיבי
- פלישה לדו-גדיל דנ"א  שמשמת כתבנית וחיפוש אחר זיווג בסיסים
- יצירת הטרודופלקס עם חלבון
- הידרוליזת
ATP
ושחרור
RecA
ליצירת הטרודופלקס לבד ותיקון

Question 8

RecA

הוא חלבון ממשפחת ה-

Answer 8

ATPase

Question 9

כיצד
RecA
מחזיק את החד-גדיל בשלב הראשוני של פעילותו?

Answer 9

מחזיק כל 3 נוקלאוטידים כאיל הם מצויים בזיווג גדילים רק שהשךד הפוספו-סוכרי מתוח ולא מסובב

Question 10

למה משמשת הידרוליזת 
ATP
ל
ADP
במנגנון הפעולה של
RecA?

Answer 10

לשחרורו מההטרודופלקס שנוצר

Question 11

לעתים נוצר שבר חד-גדילי במזלג השכפול. באיזה מנגנון הוא מתוקן?

Answer 11

רקומבינציה הומולוגית

Question 12

מה המבנה של

Rad52?

Answer 12

מבנה טבעתי המורכב מ11 תת יחידות

Question 13

מה תפקידו של
Rad52?
(2)

Answer 13

• הטענת
  Rad51
  על החד-גדיל המיועד לתיקון ע”י רקומבינציה הומולוגית
• שחזור הדופלקסים בסוף הרקומבינציה ההומולוגית

Question 14

למה קשור

BRCA1?

Answer 14

קשור לבקרה על העיבוד הראשוני של קצוות השבר הדו-גדילי ברקומבינציה הומולוגית

Question 15

למה קשור

BRCA2?

Answer 15

מיקום
Rad51
במקום הדרוש תיקון ע”י רקומבינציה הומולוגית
ועיכובו כשאינו נדרש

Question 16

מה משמש כתבנית לרקומבינציה ההומולוגית המיוטית?

Answer 16

הכרומוזום ההומולוג

Question 17

מה משמש כתבנית לרקומבינציה הומולוגית לשם תיקון נזקי דנ”א?

Answer 17

הכרומטידה האחות

Question 18

אלו חלבונים אחראים על יצירת השבר הדו-גדילי ברקומביניציה המיוטית?

Answer 18

• Spo11

- Mre11

Question 19

מה עושה

Spo11?

Answer 19

מבצע התקפה נוקלאופילית על פוספט במול’ הדנ”א ליצירת שבר ונשאר קשור אליו

Question 20

מה עושה

Mre11?

Answer 20

מעבד את קצוות השבר שיצר
Spo11
(מוציא אותו גם)

Question 21

מהן שתי האופציות הקיימות לסיום תהליך הרקומבינציה המיוטית?

Answer 21

1. עם
crossover
2. ללא 
crossover
(נוצרים פאצ'ים)

Question 22

כיצד מתבצע
crossover
של מידע גנטי ברקומבינציה המיוטית?

Answer 22

לאחר התיקון נוצר צומת הולידיי כפול.

הליגציה של הסטרנדים שתוקנו מתבצעת לפני ניתוקם לדופלקסים

Question 23

מיהו האנזים האחראי על הביקוע של צומת הולידיי?

Answer 23

רזולבאז
(RuvC
בחיידקים)

Question 24

מהו תהליך ה
branch migration
ולמה הוא משמש?

Answer 24

• נדידת נקודת ההסתעפות של צומת הולידיי

- משמש להגדלת ההטרודופלקס ובהתאם הגדלת האזורים שיעברו שחלוף

Question 25

החלבונים האחראים על ה branch migration עושים שימוש באנרגיה שמקורה מ-

Answer 25

ATP | לשם יעילות התהליך

Question 26

מיהם החלבונים האחראים על ה branch migration בחיידקים?

Answer 26

- RuvA - שני RuvB

Question 27

מה המבנה של | RuvA?

Answer 27

טטרמר, ללא יכולת | ATPase

Question 28

מה המבנה של | RuvB?

Answer 28

הקסמר בעל יכולת | ATPase.

Question 29

על מה אחראי החלבון | RuvA?

Answer 29

על הכוונת תנועת הגדילים אחד על השני ובהתאם הכוונת תנועת ה | branch migration

Question 30

מה תפקידו של | RuvB?

Answer 30

ההליקאז המשתמש ב ATP בשביל תהליך ה branch migration

Question 31

מדוע מתרחשת תופעת ה | gene conversion?

Answer 31

``` תהליך ה branch migration יוצר אזור הטרודופלקס נרחב עם אחוז קטן של mismatch. זה גורם לגיוס מערכת MMR שתתקן את הזיווגים השגויים הללו, לקבלת loss of hetreozigosity באזורים הללו ```

Question 32

מה הבסיס ל | gene conversion?

Answer 32

גיוס מערכת MMR שתתקן באופן אקראי את המיסמאצ'ים המופיעים באזור ההטרודופלקס

Question 33

מהו | gene conversion?

Answer 33

אזורים בהם, מתוך 4 תוצרי המיוזה הצפויים (2 אבהי ו2 אמהי) נוצרים 3 מהורה אחד ורק 1 מההורה השני (סטייה מתוצרי המיוזה הצפויים)