רצפים וחלבוני בקרת שעתוק (מולקולרית ד) Flashcards
מה האורך של רצפי בקרה?
5-10
בסיסים
כיצד בנוי המוטיב
helix turn helix?
בנוי משני הליקסים- אחד אמיני ואחד קרבוקסילי עם סיבוב ביניהם
כיצד המוטיב
helix turn helix
מזהה את הדנ”א?
עובד כדימר כאשר ההליקסים הקרבוקסילים נכנסים לשני
major grooves
סמוכים
מה המרחק בין שני הליקסים קרבוקסילים בדימר של
helix turn helix?
3.4
ננומטר
(בדיוק סיבוב אחד של הליקס הדנ”א)
כיצד בנוי מוטיב ה
homeodomain?
בנוי מ3 הליקסים הארוזים בצפיפות
כיצד המוטיב
homeodomain
נקשר לדנ”א?
הליקס מספר 3 נקשר לתעלה הגדולה והליקס מספר 1 מזהה בסיסים בתעלה הקטנה
חלבונים המכילים את מוטיב ההומאודומיין לוקחים חלק בעיקר ב-
במתן זהות לרקמה בהתפתחות העוברית
מה המבנה של המוטיב
leucine zipper?
שני מונומרים אלפא הליקאליים היוצרים אינטראקציות הידרופוביות ליצירת מבנה של
coiled coil
קצר דמוי האות
Y
איזו ח”א מכיל אתר הדימריזציה במוטיב רוכסן לאוצין?
לאוצין..
כיצד רוכסן לאוצין נקשר לדנ”א?
דרך חלקים אלפא הליקאליים תחתונים של הדימר האוחזים אותו (כמו אטב)
- צורת
Y
ממה בנוי מוטיב סדין בטא?
משני גדילי בטא
כיצד המוטיב סדין בטא נקשר לדנ”א?
שני גדילי הבטא המרכיבים את המוטיב נקשרים לאותו
major groove
כיצד בנוי המוטיב
zinc finger?
בנוי מאלפא הליקס, סדין בטא ויון אבץ
אילו קשרים יוצר יון האבץ במוטיב החלבוני
zinc finger?
- שני קשרי קורדינציה עם שני היסטידין של האלפא הליקס
- שני קשרי קורדינציה עם שני ציסטאינים של הסדין בטא
כיצד קושר המוטיב
zinc finger
את הדנ”א?
דרך האלפא הליקס המצוי בו ונקשר לתעלה הגדולה