רצפים וחלבוני בקרת שעתוק (מולקולרית ד) Flashcards

1
Q

מה האורך של רצפי בקרה?

A

5-10

בסיסים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

כיצד בנוי המוטיב

helix turn helix?

A

בנוי משני הליקסים- אחד אמיני ואחד קרבוקסילי עם סיבוב ביניהם

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

כיצד המוטיב
helix turn helix
מזהה את הדנ”א?

A

עובד כדימר כאשר ההליקסים הקרבוקסילים נכנסים לשני
major grooves
סמוכים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מה המרחק בין שני הליקסים קרבוקסילים בדימר של

helix turn helix?

A

3.4
ננומטר
(בדיוק סיבוב אחד של הליקס הדנ”א)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

כיצד בנוי מוטיב ה

homeodomain?

A

בנוי מ3 הליקסים הארוזים בצפיפות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

כיצד המוטיב
homeodomain
נקשר לדנ”א?

A

הליקס מספר 3 נקשר לתעלה הגדולה והליקס מספר 1 מזהה בסיסים בתעלה הקטנה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

חלבונים המכילים את מוטיב ההומאודומיין לוקחים חלק בעיקר ב-

A

במתן זהות לרקמה בהתפתחות העוברית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מה המבנה של המוטיב

leucine zipper?

A

שני מונומרים אלפא הליקאליים היוצרים אינטראקציות הידרופוביות ליצירת מבנה של
coiled coil
קצר דמוי האות
Y

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

איזו ח”א מכיל אתר הדימריזציה במוטיב רוכסן לאוצין?

A

לאוצין..

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

כיצד רוכסן לאוצין נקשר לדנ”א?

A

דרך חלקים אלפא הליקאליים תחתונים של הדימר האוחזים אותו (כמו אטב)
- צורת
Y

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

ממה בנוי מוטיב סדין בטא?

A

משני גדילי בטא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

כיצד המוטיב סדין בטא נקשר לדנ”א?

A

שני גדילי הבטא המרכיבים את המוטיב נקשרים לאותו

major groove

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

כיצד בנוי המוטיב

zinc finger?

A

בנוי מאלפא הליקס, סדין בטא ויון אבץ

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

אילו קשרים יוצר יון האבץ במוטיב החלבוני

zinc finger?

A
  • שני קשרי קורדינציה עם שני היסטידין של האלפא הליקס

- שני קשרי קורדינציה עם שני ציסטאינים של הסדין בטא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

כיצד קושר המוטיב
zinc finger
את הדנ”א?

A

דרך האלפא הליקס המצוי בו ונקשר לתעלה הגדולה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

כיצד בנוי המוטיב

helix loop helix?

A

שני הליקסים (ארוך וקצר) המחוברים ביניהם בלופ

17
Q

כיצד קושר המוטיב
helix turn helix
את הדנ”א?

A

ההליקס הארוך של המוטיב יוצר אינטראקציה עם התעלה הגדולה

18
Q

כיצד פועלי פקטורי שעתוק בעלי המוטיב

helix loop helix?

A

עובדים כהומו/הטרו-דימרים במנגנון קואופרטיבי או לא קאופרטיבי

19
Q

פקטורי שעתוק לרוב יעבדו כדימרים. מה המטרה של זה?

2

A
  1. העלאת ספציפיות לרצף הבקרה

2. העלאת אפיניוט לרצף הבקרה

20
Q

איזה תהליך שעושה הנוקלאוזום עוזר להיקשרות פקטורי שעתוק לדנ”א?

A

nucleosome breathing.
תזוזת הדנ”א בקצה הנוקלאוזום בתדירות של 1:20.
(תדירות נמוכה יותר בדנ”א המלופף על אמצע הנוקלאוזום…)