טרנספוזיציה ורקומבינציה באתר יעודי (מולקולרית ב) Flashcards
אלו סוגי טרנספוזונים קיימים?
3
- DNA only
- retrovirsl like
- non-retroviral like
איזה אנזים מבטאים טרנספוזונים מסוג
DNA-only?
transposase
איזה אנזימים מבטאים טרנספוזונים מסוג
retroviral like retrotransposones?
(2)
- reverse transcriptase
2. integerase
איזה אנזימים מבטאים טרנספוזונים מסוג
non-retroviral like retrotransposones?
(2)
- reverse transcriptase
2. endonuclease
מה מאפיין את המבנה של טרנספוזונים מסוג
DNA-only?
inverted repeats
קצרים בכל קצה
מה מאפיין את המבנה של רטרוטרנספוזונים מסוג
retroviral like?
direct repeats
ארוכים מכל צד
(LTR- long terminal repeats)
מה מאפיין את המבנה של רטרוטרנספוזונים מסוג
non-retroviral like?
poly A
בקצה 3’ של טרנסקריםט הרנ”א
באיזה אופן מועבר טרנספוזון מסוג
DNA-only?
cut & paste / copy & paste
של מולקולת דנ”א
באיזה אופן מועבר רטרוטרנספוזונים מסוג
non-retroviral like?
מועבר כמולקולת רנ”א שבד”כ מסונתזת מפרומוטור שכן
באיזה אופן מועבר רטרוטרנספוזונים מסוג
retroviral like?
מועבר כמולקולת רנ”א שיצירתו מונעת מפרומוטור המצוי ב
LTR
שלו
דוגמאות לטרנספוזונים מסוג
DNA-only
(6)
- P element (drosophila)
- Ac-Ds (maize)
- IS3 (bacteria)
- Tn3 (E.coli)
- Tn10 (E.coli)
- Tam3 (snapdrogon)
דוגמאות לרטרוטרנספוזונים מסוג
retroviral like
(4)
- copia (drosophila)
- Ty1 (yeast)
- THE1 (human)
- Bs1 (maize)
דוגמאות לרטרוטרנספוזונים מסוג
non-retroviral like
(3)
- F element (drosophila)
- L1 (human)
- Cin4 (maize)
איזו צלקת משאירים
DNA-only transposons
באתר המטרה שאליו הם קפצו?
צלקת של
directed repaeats
כאשר טרנספוזונים מסוג
DNA-only
חותכים את עצמם החוצה הם משאירים שבר דו-גדילה באתר היציאה שלהם. ע”י מי יתוקן?
ע”י מנגנוני תיקון שבר דו-גדילי של התא
NHEJ/RH
מהו המנגנון של טרנספוזונים מסוג
DNA-only?
(4)
- האנזים טרנספוזאז מתבטא ומזהה את ה
inverted repeats
הקצרים - טרנספוזאז מתחבר לרצפי המטרה ויוצר לולאת דנ”א (טרנספוזום)
- טרנספוזאז מבקע את אתר המטרה האקראי בצורת קצוות דביקים ומכניס את לולאת הדנ”א
- פולימראז משלים את המקטעים החסרים, ליגאז מאחה
מהו המנגנון של רטרוטרנספוזונים מסוג
retroviral like?
(3)
- שעתוק הרטרוטרנספוזון למולקולת רנ”א
- רברס טראנסקריפטאז מבצע שעתוק ליצירת מול’ דנ”א דו-גדילית
- אינטג’ראס נקשר אליה , מכניס אותה לגרעין, חותך את גנום התא המארח באזור אקראי ומזרז את החדרת הטרנספוזון
מהו המנגנון של רטרוטרנספוזונים מסוג
non-retroviral like?
(4)
- שעתוק קומפלקס אנזימטי המכיל רברס טראנסקריפטאז ואנדונוקלאז
- האנדונוקלאז יוצר ניק
- רברס טראנסקריפטאז משתמש בקצה 3 של הניק כפריימר ומשעתק מולקולת דנ”א דו-גדילית ע”פ תבנית הרנ”א
- ליגציה
L1
הוא סוג של _______ ממשפחת ה________.י
- LINE
- non-retroviral like retrotransposones
רצפי
Alu
הם סוג של ________ ממשפחת ה________.י
- SINE
- non-retroviral like retrotransposones
מה אין ל
SINEs
שכן יש ל
LINEs?
הם אינם מכילים רברס טראנסקריפטאז ואנדונוקלאז משלהם
מה יש יותר בגנום האנושי-
LINE/SINE?
SINE
איזו משפחת אנזימים משתתפים בתהליך הרקומבינציה באתר ספציפי?
משפחת הרקומבינאזות
מה יקרה לדנ”א שבין שני
directed repeats
שזוהו ע”י רקומבינאז ספציפי?
יעבור
deletion