טרנספוזיציה ורקומבינציה באתר יעודי (מולקולרית ב) Flashcards

1
Q

אלו סוגי טרנספוזונים קיימים?

3

A
  • DNA only
  • retrovirsl like
  • non-retroviral like
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

איזה אנזים מבטאים טרנספוזונים מסוג

DNA-only?

A

transposase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

איזה אנזימים מבטאים טרנספוזונים מסוג
retroviral like retrotransposones?
(2)

A
  1. reverse transcriptase

2. integerase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

איזה אנזימים מבטאים טרנספוזונים מסוג
non-retroviral like retrotransposones?
(2)

A
  1. reverse transcriptase

2. endonuclease

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

מה מאפיין את המבנה של טרנספוזונים מסוג

DNA-only?

A

inverted repeats

קצרים בכל קצה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מה מאפיין את המבנה של רטרוטרנספוזונים מסוג

retroviral like?

A

direct repeats
ארוכים מכל צד
(LTR- long terminal repeats)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מה מאפיין את המבנה של רטרוטרנספוזונים מסוג

non-retroviral like?

A

poly A

בקצה 3’ של טרנסקריםט הרנ”א

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

באיזה אופן מועבר טרנספוזון מסוג

DNA-only?

A

cut & paste / copy & paste

של מולקולת דנ”א

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

באיזה אופן מועבר רטרוטרנספוזונים מסוג

non-retroviral like?

A

מועבר כמולקולת רנ”א שבד”כ מסונתזת מפרומוטור שכן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

באיזה אופן מועבר רטרוטרנספוזונים מסוג

retroviral like?

A

מועבר כמולקולת רנ”א שיצירתו מונעת מפרומוטור המצוי ב
LTR
שלו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

דוגמאות לטרנספוזונים מסוג
DNA-only
(6)

A
  • P element (drosophila)
  • Ac-Ds (maize)
  • IS3 (bacteria)
  • Tn3 (E.coli)
  • Tn10 (E.coli)
  • Tam3 (snapdrogon)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

דוגמאות לרטרוטרנספוזונים מסוג
retroviral like
(4)

A
  • copia (drosophila)
  • Ty1 (yeast)
  • THE1 (human)
  • Bs1 (maize)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

דוגמאות לרטרוטרנספוזונים מסוג
non-retroviral like
(3)

A
  • F element (drosophila)
  • L1 (human)
  • Cin4 (maize)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

איזו צלקת משאירים
DNA-only transposons
באתר המטרה שאליו הם קפצו?

A

צלקת של

directed repaeats

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

כאשר טרנספוזונים מסוג
DNA-only
חותכים את עצמם החוצה הם משאירים שבר דו-גדילה באתר היציאה שלהם. ע”י מי יתוקן?

A

ע”י מנגנוני תיקון שבר דו-גדילי של התא

NHEJ/RH

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

מהו המנגנון של טרנספוזונים מסוג
DNA-only?
(4)

A
  • האנזים טרנספוזאז מתבטא ומזהה את ה
    inverted repeats
    הקצרים
  • טרנספוזאז מתחבר לרצפי המטרה ויוצר לולאת דנ”א (טרנספוזום)
  • טרנספוזאז מבקע את אתר המטרה האקראי בצורת קצוות דביקים ומכניס את לולאת הדנ”א
  • פולימראז משלים את המקטעים החסרים, ליגאז מאחה
17
Q

מהו המנגנון של רטרוטרנספוזונים מסוג
retroviral like?
(3)

A
  • שעתוק הרטרוטרנספוזון למולקולת רנ”א
  • רברס טראנסקריפטאז מבצע שעתוק ליצירת מול’ דנ”א דו-גדילית
  • אינטג’ראס נקשר אליה , מכניס אותה לגרעין, חותך את גנום התא המארח באזור אקראי ומזרז את החדרת הטרנספוזון
18
Q

מהו המנגנון של רטרוטרנספוזונים מסוג
non-retroviral like?
(4)

A
  • שעתוק קומפלקס אנזימטי המכיל רברס טראנסקריפטאז ואנדונוקלאז
  • האנדונוקלאז יוצר ניק
  • רברס טראנסקריפטאז משתמש בקצה 3 של הניק כפריימר ומשעתק מולקולת דנ”א דו-גדילית ע”פ תבנית הרנ”א
  • ליגציה
19
Q

L1

הוא סוג של _______ ממשפחת ה________.י

A
  • LINE

- non-retroviral like retrotransposones

20
Q

רצפי
Alu
הם סוג של ________ ממשפחת ה________.י

A
  • SINE

- non-retroviral like retrotransposones

21
Q

מה אין ל
SINEs
שכן יש ל
LINEs?

A

הם אינם מכילים רברס טראנסקריפטאז ואנדונוקלאז משלהם

22
Q

מה יש יותר בגנום האנושי-

LINE/SINE?

23
Q

איזו משפחת אנזימים משתתפים בתהליך הרקומבינציה באתר ספציפי?

A

משפחת הרקומבינאזות

24
Q

מה יקרה לדנ”א שבין שני
directed repeats
שזוהו ע”י רקומבינאז ספציפי?

A

יעבור

deletion

25
``` מה יקרה כאשר יש מולקולת דנ"א מעגלית עם directed repeats הזהים ל directed repeats המצויים על גנום התא המארח, וזוהו ע,"י רקומבינאז? ```
הדנ"א של המולקולה המעגלית תיכנס פנימיה בין ה directed repeats שבגנום המארח
26
מה יקרה למולקולת דנ"א המצויה בין inverted repeats שזוהו ע"י רקומבינאז ספציפי?
היא תעבור אינברסיה
27
מהו תהליך ה phase variation בו עושה שימוש חיידק הסלמונלה?
תהליך העושה שימוש במנגנון הרקומבינציה באתר ספציפי (אינברסיה) הגורם לשינוי בביטוי הגן של החלבון פלג'לין (H2 --> H1) המאפשר לחיידק להתחמק ממערכת החיסון שלנו
28
איזו שיטה מחקרית מבוססת על המנגנון של רקומבינציה באתר ספציפי?
Cre-LoxP
29
איך עובדת שיטת | Cre-LoxP?
- CRE (רקומבינאז) יוכנס תחת פרומוטור אינדוסבילי בסוג תא מסוים - לאותו סוג תא מכניסים רצפי loxP משני צידי הגן אותו רוצים לערוך גנטית באוריינטציה הדרושה למחקר
30
איזו עמידות לאנטיביוטיקה מכיל הטרנספוזון | Tn3 (DNA-only)?
אמפיצילין
31
איזו עמידות לאנטיביוטיקה מכיל הטרנספוזון | Tn10 (DNA-only)?
טטרהציקלין
32
האם הטרנספוזון Tn10 תמיד יקנה עמידות לאנטיביוטיקה לתא המאחסן אליו הוא נכנס?
לא. | יכול להעביר רק את עצמו / רק עמידות לאנטיביוטיקה / גם וגם