תיקון נזקי דנ"א (מולקולרית ב) Flashcards

1
Q

פגיעה באיזה מנגנון תיקון גורמת להופעת תסמונת לינצ’ המאופיינת בסרטנים חוזרים ונשנים?

A

MMR

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q
פגיעה באיזה מנגנון תיקון גורמת למחלה
xerodema pigmentosum
המאופיינת ברגישות יתר לקרינת
UV,
סרטן העור ואבנורמליות נוירולוגית?
A

NER
(חלבוני
XP)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q
מה הגורם ל
cackayne syndrome
המאופיינת ברגישות לקרינת 
UV
והתפתחו לקויה?
A

הצימוד בין מערכת
NER
לשעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מה הגורם להופעת המחלה
ataxia telanglectasia
המאופיינת בסרטני דם, אי-יציבות גנומית ורגישות לקרינת גמא?

A

פגיעה בחלבון
ATM
או
ATR המופעלים בתגובה לשבר דו-גדילי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

BRCA1, BRCA2

לוקחין חלק במנגנון התיקון של-

A

רקומבינציה הומולוגית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

ממה נגרם סינדרום
werner
המאופיין בהזדקנות מוקדמת, סרטנים שונים ואי-יציבות גנומית?

A

מוטציה ב
-eccessory 3’ exonuclease
- DNA helicase
הנדרשים לתיקון נזקים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

ממה נגרם סינדרום בלום המאופיין בשכיחות גבוהה יותר לסרטנים שונים, עיכוב התפתחותי ואי-יציבות גנומית?

A

מוטציה ב
DNA helicase
הדרוש לרקומבינציה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

ממה נגרמת
fanconi anrmia,
המאופיינת בפגמים מולדים, לוקמיה ואי-יציבות גנומית?

A

מוטציה ב

DNA interstrand cross-link repair

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מה שכיחות דה-פורינציה ביממה?

A

18,000

ביום

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מה שכיחות דה-פירימידינציה ביממה?

A

600

ביום

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

מה שכיחות דה-אמינציה של ציטוזין ביממה?

A

100

ביום

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

נזקים לדנ”א המתרחשים כתוצאה מהידרוליזה ספונטנית הם-

4

A
  • דהפורינציה
  • דהפירימידינציה
  • דה-אמינציה של ציטוזין
  • דה-אמינציה של 5-מתילציטוזין
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

דה-אמינציה של ציטוזין תיתן את הבסיס החנקתי

A

אורציל

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

דה-אמינציה של 5-מתילציטוזין תיתן את הבסיס החנקתי

A

טימידין

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

דה-אמינציה של אדנוזין תיתן את הנוקלאוטיד-

A

אינוזין

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

דה-אמינציה של גאוונין תיתן את הבסיס החנקתי

A

קסנתין

17
Q

דה-אמינציה של הבסיס החנקתי אדנין תיתן את הבסיס החנקתי

A

היפוקסנתין

18
Q

מה עושות גליקוזידאזות כחלק מ

BER?

A

סורקות את הדנ”א לזיהוי בסיסים חנקתיים שעברו
base flipping
כתוצאה משינוי שהתרחש בהם

19
Q

מי חותך את הבסיס החנקתי השגוי שהגליקוזידאזות מצאו כחלק ממנגנון
BER?

A

הגליקוזידאזות בעצמן

20
Q

הוצאת הבסיס הנחקתי השגוי ע”י גליקוזידאז ספציפי במנגנון
BER
גרמה ליצירת אתר בשם-

A

AP

א-פוריני/ א-פירימידיני

21
Q

מה תפקידו של אתר
AP שנוצר כחלק ממנגנון
BER?

A

גיוס
AP-endonuclease
שיבצע חיתוך אחד ליד הבסיס החנקתי שהוצא, וגיוס פוספודיאסטראז שיבצע חיתוך שני בצד השני מה שיגרום להוצאת השלד הפוספוסוכרי

22
Q

מה יקרה כחלק ממנגנון
BER
לאחר פעילות
AP-endonuclease?

A

דנ”א פולימראז ימלא את החור וליגאז יאחה את הניק

23
Q

מיהו הפולימראז המשתתף במערכת ה
BER
באאוקריוטים?

A

דנ”א פולימראז בטא

24
Q

מהם שלבי מנגנון מערכת
BER?
(4)

A
- גליקוזידאזות מזהות נזק וחותכות את הבסיס החנקתי החוצה ליצירת
AP site
- גיוס 
AP endonuclease
ופוספודיאסטראז
שיחתכו ויגרמו להוצאת השלד הפוספוסוכרי
- דנ"א פולימראז משלים
- ליגאז סוגר את הניק
25
Q

כיצד מתוקנים א-פורינציה וא-פירימידינציה?

A

ע”י
BER
ללא שלב הסריקה והזיהוי ע”י גליקוזידאזות

26
Q

אילו נזקים יתוקנו ע”י מערכת

NER?

A

נזקים גדולים הגורמים לעיוות מבנה ההליקס

למשל פירימידין דימרים

27
Q

איזה קרצינוגן מצוי בטבק ובמוצרי דיזל? ע”י איזה מנגנון ההיקשרות שלו לדנ”א תתוקן?

A
  • בנזופירן

- NER

28
Q

מהם שלבי מנגנון ה
NER?
(4)

A
  • קומפלקס אנזימטי סורק ומתיישב על נזק
  • אז הוא מבצע שני ניקים במרחק מהנזק ומסיר את האוליגונוקלאוטיד שביניהם המכיל אותו
  • דנ”א פולימראז משלים
  • ליגאז סוגר את הניק
29
Q

מה אורך האוליגונוקלאוטיד שמוסר ע”י מערכת
NER
בפרוקריוטים?

A

12

30
Q

מה אורך האוליגונוקלאוטיד שמוסר ע”י מערכת
NER
באאוקריוטים?

A

30

31
Q

אלו חלבונים משתתפים ב
NER
בחיידקים?
(לא מוזכר בספר)

A
- UvrA,B:
סורקים ומתיישבים
- UvrC:
מבצע את הניקים
- UvrD:
ההליקאז שמוציא את האוליגונוקלאוטיד
- דנ"א פולימראז וליגאז
32
Q

מה מאפשר הצימוד בין מערכת ה
NER
לפעילותו של רנ”א פולימראז בשעתוק?

A

בקרת איכות ברמה גבוהה של הדנ”א כך שכאשר רנ”א פולימראז מגיע לאתר הנזק הוא נעצר (באאוקריוטים) או מוסר ומתחבר מחדש (בפרוקריוטים)

33
Q

מה עושה האנזים

O6-methyl-guanisine transferase (MGMT)?

A

לוקח את קבוצת המתיל מגאוונין שעבר מתילציה על חמצן 6 ומחבר אותו לציסטאין שלו באופן בלתי הפיך
(האנזים המתאבד, תיקון ישיר)

34
Q

מי מתקן את הנזק

O6 methyl-guanine?

A

MGMT

35
Q

כיצד מתוקנת דה-אמינציה של ציטוזין ממותל ברצפי

CpG?

A

ע”י דה-מתילאז ספציפי המזהה רצפי
TG
(לא יעיל במיוחד)

36
Q

מה תפקידן של

translesion polymerases?

A

מעקף של נזקי דנ”א כבדים בזמן שכפול

37
Q

כיצד פועלות

translesion polymerases?

A

הן מכניסות נוקללאוטידים (בין 2 ל3) באופן רנדומלי באזור הנזק ומאפשרת המשך שכפול של הדנ”א בזמן השכפול

38
Q

מדוע
translesion polymerases
פחות מדויקות?
(2)

A
  1. חסרות פעילות אקסונוקלאז לביצוע הגהה

2. לא מצליחות להבחין בין בסיסי הדנ”א באותה יעילות כמו פולימראזות רגילות

39
Q

כיצד מגויסות פולימראזות המעקף בעת הצורך?

A

מודיפיקציה על המצמד המחליק גורם לניתוק הפולימראז הרגיל ולגיוסן