תיקון נזקי דנ"א (מולקולרית ב)

Question 1

פגיעה באיזה מנגנון תיקון גורמת להופעת תסמונת לינצ’ המאופיינת בסרטנים חוזרים ונשנים?

Answer 1

MMR

Question 2

פגיעה באיזה מנגנון תיקון גורמת למחלה
xerodema pigmentosum
המאופיינת ברגישות יתר לקרינת
UV,
סרטן העור ואבנורמליות נוירולוגית?

Answer 2

NER
(חלבוני
XP)

Question 3

מה הגורם ל
cackayne syndrome
המאופיינת ברגישות לקרינת 
UV
והתפתחו לקויה?

Answer 3

הצימוד בין מערכת
NER
לשעתוק

Question 4

מה הגורם להופעת המחלה
ataxia telanglectasia
המאופיינת בסרטני דם, אי-יציבות גנומית ורגישות לקרינת גמא?

Answer 4

פגיעה בחלבון
ATM
או
ATR המופעלים בתגובה לשבר דו-גדילי

Question 5

BRCA1, BRCA2

לוקחין חלק במנגנון התיקון של-

Answer 5

רקומבינציה הומולוגית

Question 6

ממה נגרם סינדרום
werner
המאופיין בהזדקנות מוקדמת, סרטנים שונים ואי-יציבות גנומית?

Answer 6

מוטציה ב
-eccessory 3’ exonuclease
- DNA helicase
הנדרשים לתיקון נזקים

Question 7

ממה נגרם סינדרום בלום המאופיין בשכיחות גבוהה יותר לסרטנים שונים, עיכוב התפתחותי ואי-יציבות גנומית?

Answer 7

מוטציה ב
DNA helicase
הדרוש לרקומבינציה

Question 8

ממה נגרמת
fanconi anrmia,
המאופיינת בפגמים מולדים, לוקמיה ואי-יציבות גנומית?

Answer 8

מוטציה ב

DNA interstrand cross-link repair

Question 9

מה שכיחות דה-פורינציה ביממה?

Answer 9

18,000

ביום

Question 10

מה שכיחות דה-פירימידינציה ביממה?

Answer 10

600

ביום

Question 11

מה שכיחות דה-אמינציה של ציטוזין ביממה?

Answer 11

100

ביום

Question 12

נזקים לדנ”א המתרחשים כתוצאה מהידרוליזה ספונטנית הם-

4

Answer 12

• דהפורינציה
• דהפירימידינציה
• דה-אמינציה של ציטוזין
• דה-אמינציה של 5-מתילציטוזין

Question 13

דה-אמינציה של ציטוזין תיתן את הבסיס החנקתי

Answer 13

אורציל

Question 14

דה-אמינציה של 5-מתילציטוזין תיתן את הבסיס החנקתי

Answer 14

טימידין

Question 15

דה-אמינציה של אדנוזין תיתן את הנוקלאוטיד-

Answer 15

אינוזין

Question 16

דה-אמינציה של גאוונין תיתן את הבסיס החנקתי

Answer 16

קסנתין

Question 17

דה-אמינציה של הבסיס החנקתי אדנין תיתן את הבסיס החנקתי

Answer 17

היפוקסנתין

Question 18

מה עושות גליקוזידאזות כחלק מ

BER?

Answer 18

סורקות את הדנ”א לזיהוי בסיסים חנקתיים שעברו
base flipping
כתוצאה משינוי שהתרחש בהם

Question 19

מי חותך את הבסיס החנקתי השגוי שהגליקוזידאזות מצאו כחלק ממנגנון
BER?

Answer 19

הגליקוזידאזות בעצמן

Question 20

הוצאת הבסיס הנחקתי השגוי ע”י גליקוזידאז ספציפי במנגנון
BER
גרמה ליצירת אתר בשם-

Answer 20

AP

א-פוריני/ א-פירימידיני

Question 21

מה תפקידו של אתר
AP שנוצר כחלק ממנגנון
BER?

Answer 21

גיוס
AP-endonuclease
שיבצע חיתוך אחד ליד הבסיס החנקתי שהוצא, וגיוס פוספודיאסטראז שיבצע חיתוך שני בצד השני מה שיגרום להוצאת השלד הפוספוסוכרי

Question 22

מה יקרה כחלק ממנגנון
BER
לאחר פעילות
AP-endonuclease?

Answer 22

דנ”א פולימראז ימלא את החור וליגאז יאחה את הניק

Question 23

מיהו הפולימראז המשתתף במערכת ה
BER
באאוקריוטים?

Answer 23

דנ”א פולימראז בטא

Question 24

מהם שלבי מנגנון מערכת
BER?
(4)

Answer 24

- גליקוזידאזות מזהות נזק וחותכות את הבסיס החנקתי החוצה ליצירת
AP site
- גיוס 
AP endonuclease
ופוספודיאסטראז
שיחתכו ויגרמו להוצאת השלד הפוספוסוכרי
- דנ"א פולימראז משלים
- ליגאז סוגר את הניק

Question 25

כיצד מתוקנים א-פורינציה וא-פירימידינציה?

Answer 25

ע"י BER ללא שלב הסריקה והזיהוי ע"י גליקוזידאזות

Question 26

אילו נזקים יתוקנו ע"י מערכת | NER?

Answer 26

נזקים גדולים הגורמים לעיוות מבנה ההליקס | למשל פירימידין דימרים

Question 27

איזה קרצינוגן מצוי בטבק ובמוצרי דיזל? ע"י איזה מנגנון ההיקשרות שלו לדנ"א תתוקן?

Answer 27

- בנזופירן | - NER

Question 28

מהם שלבי מנגנון ה NER? (4)

Answer 28

- קומפלקס אנזימטי סורק ומתיישב על נזק - אז הוא מבצע שני ניקים במרחק מהנזק ומסיר את האוליגונוקלאוטיד שביניהם המכיל אותו - דנ"א פולימראז משלים - ליגאז סוגר את הניק

Question 29

מה אורך האוליגונוקלאוטיד שמוסר ע"י מערכת NER בפרוקריוטים?

Answer 29

12

Question 30

מה אורך האוליגונוקלאוטיד שמוסר ע"י מערכת NER באאוקריוטים?

Answer 30

30

Question 31

אלו חלבונים משתתפים ב NER בחיידקים? (לא מוזכר בספר)

Answer 31

``` - UvrA,B: סורקים ומתיישבים - UvrC: מבצע את הניקים - UvrD: ההליקאז שמוציא את האוליגונוקלאוטיד - דנ"א פולימראז וליגאז ```

Question 32

מה מאפשר הצימוד בין מערכת ה NER לפעילותו של רנ"א פולימראז בשעתוק?

Answer 32

בקרת איכות ברמה גבוהה של הדנ"א כך שכאשר רנ"א פולימראז מגיע לאתר הנזק הוא נעצר (באאוקריוטים) או מוסר ומתחבר מחדש (בפרוקריוטים)

Question 33

מה עושה האנזים | O6-methyl-guanisine transferase (MGMT)?

Answer 33

לוקח את קבוצת המתיל מגאוונין שעבר מתילציה על חמצן 6 ומחבר אותו לציסטאין שלו באופן בלתי הפיך (האנזים המתאבד, תיקון ישיר)

Question 34

מי מתקן את הנזק | O6 methyl-guanine?

Answer 34

MGMT

Question 35

כיצד מתוקנת דה-אמינציה של ציטוזין ממותל ברצפי | CpG?

Answer 35

ע"י דה-מתילאז ספציפי המזהה רצפי TG (לא יעיל במיוחד)

Question 36

מה תפקידן של | translesion polymerases?

Answer 36

מעקף של נזקי דנ"א כבדים בזמן שכפול

Question 37

כיצד פועלות | translesion polymerases?

Answer 37

הן מכניסות נוקללאוטידים (בין 2 ל3) באופן רנדומלי באזור הנזק ומאפשרת המשך שכפול של הדנ"א בזמן השכפול

Question 38

מדוע translesion polymerases פחות מדויקות? (2)

Answer 38

1. חסרות פעילות אקסונוקלאז לביצוע הגהה | 2. לא מצליחות להבחין בין בסיסי הדנ"א באותה יעילות כמו פולימראזות רגילות

Question 39

כיצד מגויסות פולימראזות המעקף בעת הצורך?

Answer 39

מודיפיקציה על המצמד המחליק גורם לניתוק הפולימראז הרגיל ולגיוסן