מבנה ואריזת הגנום (מולקולרית א) Flashcards
איזה זוג כרומוזימים אינם הומולוגים לחלוטין באאוקריוטים?
כרומוזומי המין בזכרים
על מה מבוססת צביעת קריוטיפ מסוג
spectral karyotip?
DNA hybridization
העושה שימוש בפרובים פלורוסנטים לשם סימון כל כרומוזום בצבע שונה
על מה מבוססת צביעת קריוטיפ מסוג
traditional karyotip?
על צביעת גימזה החופשת דפוס שונה של פסים עבור כל כרומוזום המתקבל לפי מבנה הכרומטין שלהם
באילו מוטציות ניתן להבחין באמצעות שיטות ציטוטוקסיות?
שינויים כרומוזומלים גדולים, למשל- טראנסלוקציות, מחיקות, הוספות…
בגנום האנושי, כמה גנים מקודדים לחלבון?
כ-21,000
בגנום האנושי, כמה גנים אינם מקודדים לחלבון
(RNA genes)?
כ-9,000
מה האורך הממוצע של אקסון בגנום האנושי?
145
זוגות בסיסים
כמה אקסונים בממוצע מכיל גן בגנום האנושי?
10.4
מהו האורך הממוצע של גן בגנום האנושי?
27,000
זוגות בסיסים
מהו אורכו הממוצע של חלבון אנושי?
430
חומצות אמינו
מההם פסאודוגנים?
דופליקציות של גנים אשר הכפילו את עצמם ללא אזורי הבקרה ולכן אינם מתבטאים
כמו זוגות בסיסים יש במולקולת דנ”א יחידה של הגנום האנושי?
3.2
מיליארד
מה מולקולת דנ”א צריכה להכיל ע”מ לצליח לעבור שכפול?
3
- מוצא שכפול
- צנטרומר
- שני טלומרים
אילו היסטוני ליבה מרכיבים את הנוקלאוזום?
- 2 H2a
- 2 H2b
- 2 H3
- 2 H4
כמה זוגות בסיסים של דנ”א מתלפפים סביב היסטוני הליבה בנוקלאוזום?
147
זוגות בסיסים
כמה זוגות בסיסים מכילים אזורי ה
DNA linker
המחברים בין הנוקלאוזומים?
50
זוגות בסיסים בממוצע
(מספורים ועד 80)
כמה זוגות בסיסים בממוצע מכיל כל נוקלאוזום?
200
כמה סיבובים יוצרים 147 זוגות הבסיסים המתלפפים על הליבה ההיסטונים בנוקלאוזום?
1.7
סיבובים
היסטונים מורכבים מ______ חומצות אמינו
102-135
מהו מוטיב ההיסטון?
הליקס-לופ-הליקס
שלושה הליקסים עם שני לופים ביניהם
כיצד מתבצע הרכבת הנוקלאוזום?
3
- יצירת דימר H3-H4 - יצירת די-דימר של H3-H4 X2 שמתחיל ללפף על עצמו את הדנ"א - די-דימר של H2a-H2b מצטרף
מהוה מטען החיובי הכללי על ההיסטונים?
חיובי
כיצד מכונה האינטראקציה המתרחשת בין הדימרים של היסטוני הליבה?
אינטראקציית לחיצת יד
עם איזה
groove
בדנ”א, היסטוני הליבה מקיימים אינטראקציה?
minor groove
אלו די-נוקלאוטידים יעדיפו להימצא בחלק שפונה אל חלבוני הליבה ההיסטונית?
(3)
- AA
- TT
- TA
מה תפקיד הקומפלקס
CRC?
chromatin remodeling complex.
קומפלקס המשתמש ב
ATP
למטרת הזזת נוקלאוזומים בזמן שעתוק והכפלה
בממוצע, כל נוקלאוזום מוחלף פעם בשעתיים. מי אחראים על ההחלפה?
2
- חלק מה
CRC - histone chaperons
ההתארגנות של הנוקלאוזומים אחד על השני (זיג-זג) ליצירת סיב 30 ננומטר מתאפשרת בזכות-
(2)
- זנבות ההיסטונים, בעיקר של
H4 - ההיסטון
H1
מהו היחס בין היסטון
H1
לבין ליבת הנוקלאוזום?
1:1
כיצד היסטון
H1
משפיע על התארגנות סיב ה30 ננומטר?
מקיים אינטראקציה עם הנוקלאוזום (עם חלבוני הליבה ועם הדנ”א) ומשנה את כיוון הליפוף של הדנ”א לאחר יציאתו מהנוקלאוזום
איזה היסטון הוא הכי פחות שמור מבחינה אבולוציונית?
H1
מהי היחידה הקטנה הבונה את הכרומטין?
הנוקלאוזום
הסבר/י את המושג
position effect
התפשטות אזור הטרוכרמטי לאזור אאוכרומטי
הסבר/י את המושג
position effect varigation
הורשת ה
position effect
לכל אחד מתאי הבת בשושלת התאית
אילו סוג רצפים מונעים את התפשטות ההטרוכרומטין כחלק מה
position effect?
barier sequence
מה קורה כאשר הגן
white
בדרוזופילה עובר אינוורסיה נדירה הגורמת לו להימצא ליד אזור הטרוכרומטי?
הוא עובר השתקה ומתקבלות עיניים אדומות עם כתמים לבנים
אילו מודיפיקציות שיירי ליזין יכולים לקבל?
אצטילציה, מונו/בי/טרי-מתילציה, הוספת ביוטין, יוביקוויטינציה והוספת מולקולת סומיל
איזו מודיפיקציה שיירי סרין יכולים לקבל?
פוספורילציה
מיהם הוריאנטים של היסטון
H4?
אין לו
באיזה שלב של מחזור התא מסונתזים היסטוני הליבה?
S
באיזה שלב של מחזור התא מסונתזים ההיסטונים הוריאנטים?
לכל אורך האינטרפאזה
אילו משפחות אנזימים אחראיות על התפשטות הקוד ההיסטוני על נוקלאוזומים סמוכים?
(2)
- readers
- writers
למה גורם הקומפלקס
HP1
לאחר גיוסו?
התפשטות ההטרוכרומטין לנוקלאוזומים סמוכים
איזו מודיפיקציה
HP1
מזהה?
(שילוב של 2)
- trimethyl K9H3
- trimethyl K20H4
למה גורמת שילוב המודיפיקציות
trimethyl K4H3 + acetyl K9H3?
ביטוי גנים
למה גורמת המודיפיקציה
trimethyl K27H3?
גיוס קומפלקס
polycomb
והשתקת גנים
מהו רצף
HS4?
barrier sequence
המפריד בין הגן לבטא-גלובין לבין איזור הטרוכרמטי
כיצד רצפים חוסמים מגייסים חלבונים חוסמים?
שלושה מנגנונים
- מחסום פיזי- נקשרים לרצף ולקומפלקס חלבוני גדול ומונעים מעבר
- היקשרות לנוקלאוזומים והגנה עליהם מפני מודיפיקציות חדשות
- מגייסים חלבונים העושים מודיפיקציות המתנגדות למודיפיקציות של הטרוכרומטין
מהו
CENP-A?
וריאנט של ההיסטון
H3
המצוי בצנטרומרים ועוזר ביצירת הקינטכור במיטוזה
מהם
alpha satellite?
רצף קצר החוזר על עצמו מספר רב של פעמים שלעיתים מצוי בצנטרומרים אנושיים ולעיתים לא
(לא מחייב)
מהם ניאו-צנטרומרים?
צנטרומרים חדשים שנוצרו לאורך האבולוציה כתוצאה משבירת כרומוזומים ואינם יושבים על רצפי
Alpha-sattelites
כיצד מתרחשת הורשת מיקום הצנטרומר או הטרוכרומטין אל הכרומטידה האחות בזמן השכפול, בבני אדם?
(אפיגנטיקה).
חלק מחלבוני הליבה ההיסטונים מועברים לכרומטידה האחות, שיגייסו קומפלקסים שיגרמו להתפשטות המודיפיקציות על ההיסטונים החדשים שהצטרפו.
כרומוזום
lampbrush
וכרומוזום פוליטין ניתנים לראיה במיקרוסקופ אור. מה מקורם?
- lampbrush-
ביצית של דו חיים (גם בכרומוזמים אנושיים באינטרפאזה) - פוליטין-
תאי רוק של לארוות הדרוזופילה.
אל גנים ניתן למצוא על הלולאות הבולטות החוצה מה
lampbrush chromosome?
גנים פעילים המקודדים למולקולות
RNA.
מי יוצר את הפיגום החלבוני של הכרומוזומים במיטוזה?
2
- קונדנסין
- טופואיזומראז 2
הבנדים של כרומוזום פוליטין מכילים גנים ________, והאינטרבנדים מכילים גנים ________.י
- מתבטאים (95% מהחומר הגנטי)
- לא מתבטאים (5% מהחומר הגנטי)
כיצד קרוי הצנטרומר של כרומוזום הפוליטין?
chromocenter
היכן בגרעין מצוי הטרוכרומטין?
בסמוך ללמינה הגרעינית
היכן בגרעין מצוי אאוכרומטין שעובר ביטוי?
במרכז, עם דרך פנויה ל
NPC
הגרעינן, גופיפי קחאל וגרנולות אינטרכרומטיניות הם דוגמאות ל-
אזורים ממודרים בגרעין המכילים ריכוזים גבוהים של רנ”א וחלבון ספציפיים, המשמשים לצרכים שונים
מה רוחב מולקולת דנ”א בכרומוזום המיטוטי?
700
ננומטר
מדוע יש צורך ברמת דחיסה גבוהה כ”כ של הכרומוזום בזמן המיטוזה?
2
- קל יותר לבצע הפרדה כך
2. הגנה על הדנ”א בהיעדר הגרעין