מדנ"א לרנ"א (מולקולרית ג)

Question 1

מהי הדוגמה המרכזי?

Answer 1

DNA –> RNA –> protein

Question 2

מהו המבנה הרווח של מולקולות רנ”א בתא?

Answer 2

מבנה חד גדילי המתקפל על עצמו ליצירת מבנים שניוניים ושלישוניים

Question 3

מהי כיווניות הסנתזה של תהליך השעתוק?

Answer 3

5’ –> 3’

Question 4

מה מקור האנרגיה ליצירת הקשר הפוספודיאסטרי הנוצר בהתווספות נוקלאוטיד בתהליך השעתוק?

Answer 4

שבירת הקושר הפוספואנהדרידי שבין פוספט אלפא לבטא בנוקלאוטיד המתווסף
(כמו בשכפול)

Question 5

מהו הפריימר לו זקוק רנ”א פולימראז לשם תחילת השעתוק?

Answer 5

הוא איננו צריך פריימר כלל

Question 6

איזה יון מצוי באתר הפעיל של רנ”א פולימראז הפרוקריווטי ודרוש לפעילותו?

Answer 6

יון מגנזיום

Question 7

האם יש לרנ”א פולימראז פעילות אקסונוקלאז

3’ –> 5’?

Answer 7

כן

פחות טובה מלדנ”א פולימראז

Question 8

מהי קצב הכנסת טעוויות ע”י רנ”א פולימראז?

Answer 8

1:10,000

Question 9

באילו תהליכים משתתפים

snRNAs?

Answer 9

משתתפים במגוון תהליכים גרעיניים, ביניהם ספלייסינג של

pre-mRNA

Question 10

באילו תהליכים משתתפים

snoRNAs?

Answer 10

משתתפים בעיבוד ובהוספת מודיפיקציות של

rRNAs

Question 11

באילו תהליכים משתתפים

miRNAs?

Answer 11

משתתפים בבקרת ביטוי גנים ע”י חסימה ספציפית של מרנ”א מסוים ושליחתו לדגרדציה

Question 12

באילו תהליכים משתתפים

siRNAs?

Answer 12

משתתפים בבקרת ביטוי גנים ע”י הכוונת מרנ”א ספציפיים לפירוק ויצירת מבנים קטנים בכרומטין ומונעים את ביטוים

Question 13

באילו תהליכים משתתפים

piRNAs?

Answer 13

מתחברים לחלבון בשם
piwi
ומגנים על תאי ה
germ line
מפני טרנספוזונים

Question 14

באילו תהליכים משתתפים

lncRNAs?

Answer 14

משתתפים בבקרת ביטוי גנים, ביניהם אינאקטיבציה של כרומוזום איקס

Question 15

מיהו גדיל ה

antisense?

Answer 15

גדיל התבנית

Question 16

מיהו גדיל ה

sense?

Answer 16

הגדיל שאינו גדיל התבנית ושרצפו זהה לרנ”א ששועתק (מלבד

T)

Question 17

אלו תתי יחדות מכיל אנזים הליבה של הרנ”א פולימראז הפרוקריוטי?

Answer 17

• 2 אלפא
• בטא
• בטא פריים
• אומגה

Question 18

איזו תת יחידה מצטרפת לאנזים הליבה ברנ”א פולימראז הפרוקריוטי ליצירת ההולואנזים?

Answer 18

תת יחידה סיגמא

Question 19

מה תפקידה של תת יחידה סיגמא ברנ”א פולימראז הפרוקריוטי?

Answer 19

הענקת אפיניוט מוגברת של רנ”א פולימראז לפרומוטורים

Question 20

כמה בסיסים מכילה בועית השעתוק הפרוקריוטית?

Answer 20

כ-10 בסיסים

Question 21

ע”י מי מיוצבת בועית השעתוק בפרוקריוטים?

Answer 21

ע”י תת יחידה סיגמא היוצרת אינטראקציה עם הבסיסים הלא מזווגים של בועית השעתוק

Question 22

מה מאפשר לרנ”א פולימראז הפרוקריוטי לפתוח את בועית השעתוק בתחילה?

Answer 22

האינטראקציה של תת יחידה סיגמא עם הליקס הדנ”א בקומפלקס הסגור

Question 23

מהו תהליך ה

scrunching?

Answer 23

תהליך בו רנ”א פולימראז נשאר על גבי הפרומוטור ובמקביל מגדיל את בועית השעתוק, דבר היוצר מתח.

Question 24

בתהליך הסקראנצ’ינג נוצר מתח שגורם ליצירת מקטעי רנ”א קטנים. כיצד הוא נקרא?

Answer 24

aborative cycles / aborative initiations

Question 25

מה קורה עם שחרור (/ קצת לפני) רנ"א פולימראז מהפרומוטור?

Answer 25

תת יחידה סיגמא מתנתקת והשעתוק יוצא לפועל

Question 26

כיצד מתרחשת הטרמינציה של השעתוק?

Answer 26

הפולימראז משעתק את רצף הטרמינטור כחלק מתהליך השעתוק שגורם ליציאת מולקולת הרנ"א שנוצרה מהפולימראז ולניתוק שלו מגדיל ה antisense.

Question 27

מהו רצף הטרמינטור הגורם לסיום תהליך השעתוק?

Answer 27

רצף היוצר מבנה של hair pin כאשר הוא משועתק, שלאחריו יש ריבוי בסיסי A, T

Question 28

מהם רצפי הקונצנזוס של הפרומוטור הפרוקריוטי ומה מיקומם?

Answer 28

``` 1. pribnow box (TATAAT): במיקום -10 2. -35 box (TTGACA): במיקום -35 ```

Question 29

מהו המרחק הממוצע בין שני רצפי הקונצנזוס של הפרומוטור הפרוקריוטי?

Answer 29

17 | בסיסים בממוצע

Question 30

אילו יונים מכיל רנ"א פולימראז האאוקריוטי?

Answer 30

- יון מגנזיום | - יון אבן

Question 31

למה מקודד רנ"א פולימראז I? (3)

Answer 31

- 5.8S - 18S - 28S (rRNA)

Question 32

למה מקודד רנ"א פולימראז II? (6)

Answer 32

- pre mRNA - snoRNA - miRNA - siRNA - lncRNA - most snRNA

Question 33

למה מקודד רנ"א פולימראז III? (4)

Answer 33

- tRNA - 5S rRNA - some snRNA - other small RNAs

Question 34

כמה תת יחידות מכיל רנ|א פולימראז | II?

Answer 34

12

Question 35

מיהם פקטורי השעתוק הכלליים של רנ"א פולימראז | II?

Answer 35

TFIID,B,F,E,H

Question 36

אלו תתי יחידות מכיל בתוכו פקטור השעתוק הכללי | TFIID?

Answer 36

- TBD - TAF (10-11 כאלו)

Question 37

מה תפקיד תת היחידה | TBP?

Answer 37

זיהוי ה TATA box בפרומוטור האאוקריוטי

Question 38

היכן מצוי ה | TATA box בפרומוטור האאוקריוטי?

Answer 38

(-25) - (-30)

Question 39

מה המבנה של | TBP?

Answer 39

תת יחיגה מונומרית בעלת סימטריה דו-צדדית

Question 40

כיצד נקשר TBP לרצף הקונצנזוס אותו הוא מזהה?

Answer 40

הוא נקשר דרך ה minor groove וגורם לעיוות במנה הדו-גדילי

Question 41

איזה רצף מזהה | TFIIB?

Answer 41

BRE

Question 42

מה תפקידו של | TFIIB?

Answer 42

מזהה את הרצף BRE וחיוני למיקום הפולימראז בנקודה הנכונה לתחילת שעתוק

Question 43

מה תפקידו של | TFIIF?

Answer 43

חיזוק הקשרים בין פולימראז ל TBP, TFIIB וגיוס שאר הפקטורים שאחריו

Question 44

איזה פקטור שעתוק אאוקריוטי הוא הומולוגי לתת היחידה סיגמא הפרוקריוטית ע"פ אלברטס?

Answer 44

TFIIF

Question 45

מה תפקידו של | TFIIE?

Answer 45

חיוני לגיוס | TFIIH

Question 46

מה תפקידו של TFIIH? (2)

Answer 46

1. הליקאז הפורם את בועית השעתוק תוך שימוש ב ATP 2. קינאז המזרחן את הסרינים המצויים בעמדה 5 של ה CTD של הפולימראז --> גורם לשחרור הפולימראז מהפרומוטור

Question 47

מה המבנה של ה CTD של רנ"א פולימראז האאוקריוטי?

Answer 47

בנוי מ52 חזרות של 7 חומצות אמינו, כאשר יש סרין בעמדה 5

Question 48

מי מזהה את הרצף BRE? (אאוקריוטים)

Answer 48

TFIIB

Question 49

מי מזהה את ה TATA box? (אאוקריוטים)

Answer 49

TBP | TFIID

Question 50

מי מזהה את הרצף INR? (אאוקריוטים)

Answer 50

TFIID

Question 51

מי מזהה את הרצף DPE? (אאוקריוטים)

Answer 51

TFIID

Question 52

אילו רצפים מצויים על הפרומוטור האאוקריוטי ומה מיקומם? | 4

Answer 52

1. BRE: -35 2. TATA box: -30 3. INR: +1 4. DPE: +30

Question 53

מה תפקיד המדיאטור?

Answer 53

קומפלקס חלבוני גדול המאפשר לאקטיבטורים שונים לתקשר עם פולימראז 2 ועם פקטורי שעתוק כלליים

Question 54

התכה של כמה בסיסים בזמן השעתוק גורמת ליצירת פיתול על בגדיל הדנ"א?

Answer 54

10

Question 55

איזה סוג של פיתולי על נוצר מקדימה לרנ"א פולימראז ואיזה נוצר מאחוריו?

Answer 55

- מקדימה נוצרים פיתולי על חיוביים | - מאחורה נוצרים פיתולי על שליליים

Question 56

מה עושה האנזים הפרוקריוטי | GYRASE?

Answer 56

מכניס פיתולי על שליליים למולקולת הדנ"א המשועתקת תוך שימוש ב | ATP