מדנ"א לרנ"א (מולקולרית ג) Flashcards

1
Q

מהי הדוגמה המרכזי?

A

DNA –> RNA –> protein

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

מהו המבנה הרווח של מולקולות רנ”א בתא?

A

מבנה חד גדילי המתקפל על עצמו ליצירת מבנים שניוניים ושלישוניים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

מהי כיווניות הסנתזה של תהליך השעתוק?

A

5’ –> 3’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מה מקור האנרגיה ליצירת הקשר הפוספודיאסטרי הנוצר בהתווספות נוקלאוטיד בתהליך השעתוק?

A

שבירת הקושר הפוספואנהדרידי שבין פוספט אלפא לבטא בנוקלאוטיד המתווסף
(כמו בשכפול)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

מהו הפריימר לו זקוק רנ”א פולימראז לשם תחילת השעתוק?

A

הוא איננו צריך פריימר כלל

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

איזה יון מצוי באתר הפעיל של רנ”א פולימראז הפרוקריווטי ודרוש לפעילותו?

A

יון מגנזיום

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

האם יש לרנ”א פולימראז פעילות אקסונוקלאז

3’ –> 5’?

A

כן

פחות טובה מלדנ”א פולימראז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מהי קצב הכנסת טעוויות ע”י רנ”א פולימראז?

A

1:10,000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

באילו תהליכים משתתפים

snRNAs?

A

משתתפים במגוון תהליכים גרעיניים, ביניהם ספלייסינג של

pre-mRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

באילו תהליכים משתתפים

snoRNAs?

A

משתתפים בעיבוד ובהוספת מודיפיקציות של

rRNAs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

באילו תהליכים משתתפים

miRNAs?

A

משתתפים בבקרת ביטוי גנים ע”י חסימה ספציפית של מרנ”א מסוים ושליחתו לדגרדציה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

באילו תהליכים משתתפים

siRNAs?

A

משתתפים בבקרת ביטוי גנים ע”י הכוונת מרנ”א ספציפיים לפירוק ויצירת מבנים קטנים בכרומטין ומונעים את ביטוים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

באילו תהליכים משתתפים

piRNAs?

A
מתחברים לחלבון בשם
piwi
ומגנים על תאי ה
germ line
מפני טרנספוזונים
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

באילו תהליכים משתתפים

lncRNAs?

A

משתתפים בבקרת ביטוי גנים, ביניהם אינאקטיבציה של כרומוזום איקס

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

מיהו גדיל ה

antisense?

A

גדיל התבנית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

מיהו גדיל ה

sense?

A

הגדיל שאינו גדיל התבנית ושרצפו זהה לרנ”א ששועתק (מלבד

T)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

אלו תתי יחדות מכיל אנזים הליבה של הרנ”א פולימראז הפרוקריוטי?

A
  • 2 אלפא
  • בטא
  • בטא פריים
  • אומגה
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

איזו תת יחידה מצטרפת לאנזים הליבה ברנ”א פולימראז הפרוקריוטי ליצירת ההולואנזים?

A

תת יחידה סיגמא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

מה תפקידה של תת יחידה סיגמא ברנ”א פולימראז הפרוקריוטי?

A

הענקת אפיניוט מוגברת של רנ”א פולימראז לפרומוטורים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

כמה בסיסים מכילה בועית השעתוק הפרוקריוטית?

A

כ-10 בסיסים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

ע”י מי מיוצבת בועית השעתוק בפרוקריוטים?

A

ע”י תת יחידה סיגמא היוצרת אינטראקציה עם הבסיסים הלא מזווגים של בועית השעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

מה מאפשר לרנ”א פולימראז הפרוקריוטי לפתוח את בועית השעתוק בתחילה?

A

האינטראקציה של תת יחידה סיגמא עם הליקס הדנ”א בקומפלקס הסגור

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

מהו תהליך ה

scrunching?

A

תהליך בו רנ”א פולימראז נשאר על גבי הפרומוטור ובמקביל מגדיל את בועית השעתוק, דבר היוצר מתח.

24
Q

בתהליך הסקראנצ’ינג נוצר מתח שגורם ליצירת מקטעי רנ”א קטנים. כיצד הוא נקרא?

A

aborative cycles / aborative initiations

25
Q

מה קורה עם שחרור (/ קצת לפני) רנ”א פולימראז מהפרומוטור?

A

תת יחידה סיגמא מתנתקת והשעתוק יוצא לפועל

26
Q

כיצד מתרחשת הטרמינציה של השעתוק?

A

הפולימראז משעתק את רצף הטרמינטור כחלק מתהליך השעתוק שגורם ליציאת מולקולת הרנ”א שנוצרה מהפולימראז ולניתוק שלו מגדיל ה
antisense.

27
Q

מהו רצף הטרמינטור הגורם לסיום תהליך השעתוק?

A

רצף היוצר מבנה של
hair pin
כאשר הוא משועתק, שלאחריו יש ריבוי בסיסי
A, T

28
Q

מהם רצפי הקונצנזוס של הפרומוטור הפרוקריוטי ומה מיקומם?

A
1. pribnow box (TATAAT):
במיקום
-10
2. -35 box (TTGACA):
במיקום
-35
29
Q

מהו המרחק הממוצע בין שני רצפי הקונצנזוס של הפרומוטור הפרוקריוטי?

A

17

בסיסים בממוצע

30
Q

אילו יונים מכיל רנ”א פולימראז האאוקריוטי?

A
  • יון מגנזיום

- יון אבן

31
Q

למה מקודד רנ”א פולימראז
I?
(3)

A
  • 5.8S
  • 18S
  • 28S
    (rRNA)
32
Q

למה מקודד רנ”א פולימראז
II?
(6)

A
  • pre mRNA
  • snoRNA
  • miRNA
  • siRNA
  • lncRNA
  • most snRNA
33
Q

למה מקודד רנ”א פולימראז
III?
(4)

A
  • tRNA
  • 5S rRNA
  • some snRNA
  • other small RNAs
34
Q

כמה תת יחידות מכיל רנ|א פולימראז

II?

A

12

35
Q

מיהם פקטורי השעתוק הכלליים של רנ”א פולימראז

II?

A

TFIID,B,F,E,H

36
Q

אלו תתי יחידות מכיל בתוכו פקטור השעתוק הכללי

TFIID?

A
  • TBD
  • TAF
    (10-11
    כאלו)
37
Q

מה תפקיד תת היחידה

TBP?

A

זיהוי ה
TATA box
בפרומוטור האאוקריוטי

38
Q

היכן מצוי ה

TATA box בפרומוטור האאוקריוטי?

A

(-25) - (-30)

39
Q

מה המבנה של

TBP?

A

תת יחיגה מונומרית בעלת סימטריה דו-צדדית

40
Q

כיצד נקשר
TBP
לרצף הקונצנזוס אותו הוא מזהה?

A

הוא נקשר דרך ה
minor groove
וגורם לעיוות במנה הדו-גדילי

41
Q

איזה רצף מזהה

TFIIB?

A

BRE

42
Q

מה תפקידו של

TFIIB?

A

מזהה את הרצף
BRE
וחיוני למיקום הפולימראז בנקודה הנכונה לתחילת שעתוק

43
Q

מה תפקידו של

TFIIF?

A

חיזוק הקשרים בין פולימראז ל
TBP, TFIIB
וגיוס שאר הפקטורים שאחריו

44
Q

איזה פקטור שעתוק אאוקריוטי הוא הומולוגי לתת היחידה סיגמא הפרוקריוטית ע”פ אלברטס?

A

TFIIF

45
Q

מה תפקידו של

TFIIE?

A

חיוני לגיוס

TFIIH

46
Q

מה תפקידו של
TFIIH?
(2)

A
  1. הליקאז הפורם את בועית השעתוק תוך שימוש ב
    ATP
  2. קינאז המזרחן את הסרינים המצויים בעמדה 5 של ה
    CTD
    של הפולימראז

–> גורם לשחרור הפולימראז מהפרומוטור

47
Q

מה המבנה של ה
CTD
של רנ”א פולימראז האאוקריוטי?

A

בנוי מ52 חזרות של 7 חומצות אמינו, כאשר יש סרין בעמדה 5

48
Q

מי מזהה את הרצף
BRE?
(אאוקריוטים)

A

TFIIB

49
Q

מי מזהה את ה
TATA box?
(אאוקריוטים)

A

TBP

TFIID

50
Q

מי מזהה את הרצף
INR?
(אאוקריוטים)

A

TFIID

51
Q

מי מזהה את הרצף
DPE?
(אאוקריוטים)

A

TFIID

52
Q

אילו רצפים מצויים על הפרומוטור האאוקריוטי ומה מיקומם?

4

A
  1. BRE: -35
  2. TATA box: -30
  3. INR: +1
  4. DPE: +30
53
Q

מה תפקיד המדיאטור?

A

קומפלקס חלבוני גדול המאפשר לאקטיבטורים שונים לתקשר עם פולימראז 2 ועם פקטורי שעתוק כלליים

54
Q

התכה של כמה בסיסים בזמן השעתוק גורמת ליצירת פיתול על בגדיל הדנ”א?

A

10

55
Q

איזה סוג של פיתולי על נוצר מקדימה לרנ”א פולימראז ואיזה נוצר מאחוריו?

A
  • מקדימה נוצרים פיתולי על חיוביים

- מאחורה נוצרים פיתולי על שליליים

56
Q

מה עושה האנזים הפרוקריוטי

GYRASE?

A

מכניס פיתולי על שליליים למולקולת הדנ”א המשועתקת תוך שימוש ב

ATP