שחבור (מולקולרית ג) Flashcards
אלו רצפי קונצנזוס חיוניים לתהליך השחבור?
3
1. GU בתחילת האינטרון 2. AG בסוף האינטרון 2. רצף ה branch point שלאחריו רצף עשיר בפירימידינים
למה משמשת האנרגיה בה עושים שימוש בתהליך השחבור?
2
הגברת דיוק התהליך ועזרה בשינוי המרחבי של חלקיקי הספלייסוזום
מי משתתף בטראנסאסטריפיקציה הראשונה של תהליך השחבור?
2’OH
של האדנוזין שב
branch point
משמש כנוקלאופיל ותוקף את הפוספאט של הנוקלאוטיד הראשון של האינטרון המשמש כאלקטרופיל
לאחר יצירת הלריאט באינטרון האדנוזין של נקודת ההסתעפות יוצרת 3 קשרים פוספודיאסטרים. דרך אלו פחמנים?
2,3,5
של טבעת הריבוז
מי משתתף בטראנסאסטריפיקציה השניה של תהליך השחבור?
3’OH
של הנוקלאוטיד האחרון באקסון 1 שחשוף כעת, משמש כנוקלאופיל ותוקף את הפוספאט הראשון של אקסון 2 המשמש כאלקטרופיל
אלו
snRNAs
משתתפות בבניית הספלייסוזום?
(5)
- U1
- U2
- U4
- U5
- U6
מה תפקיד מולקולות הרנ”א ב
snRNPs
הבונות את הספלייסוזום?
משמשות כ
gRNA
לזיהוי רצפים שונים החיוניים בתהליך השחבור
תאר/י את מנגנון השחבור
8
1. U1 מזהה את ה 5' splice site 2. BBP מזהה את האדנוזין של נקודת ההסתעפות ו U2AF מזהה את הפירימידינים שלאחריו 3. BBP+U2AF מוחלפים ב U2 4. U4+U5+U6 נכנסים , מקרבים בין 1 ל2 5. U6 מחליף את U1 תוך שימוש ב ATP ונוצר האתר הפעיל לטראנסאסטריפיקציה הראשונה. במקביל U1+U4 עוזבים 6. ארגון מחדש של מרכיבי הספלייסוזום וטראנסאסטריפיקציה השניה 7. הלריאט משתחרר יחד עם הפקטורים הנותרים שעוזבים אותו תוך שימוש ב ATP 8. EJC מתיישב על הצומת אקסון-אקסון שנוצר
מהן הדרכים העיקריות המסייעות בשמירת הוצאה לפועל של שחבור תקין ללא טעויות?
(2)
- הצמדת תהליך השחבור לשעתוק
- תהליך ה
exon definition
מה תפקידם של חלבוני
SR?
(2)
- מתיישבים על רצפי ESE המצויים באקסונים ו"מגדירים" אותם - מגייסים את U1+U2
מה תפקידם של חלבוני
hnRNPs?
כנראה מסייעים לספלייסוזום לזהות אינטרונים עליהם הם מתיישבים
מהו
exon definition?
(2)
1. חלבוני SR המתיישבים על האקסונים ומגייסים U1+U2 2. מבנה הכרומטין והמודיפיקציות על ההיסטונים באזורים של אקסונים מסייעים בהדרת האקסון ככזה
אלו חלבונים ימצאו על מרנ”א בוגר, המוכן ליציאה מהגרעין, שעבר את כל שלושת תהליכי העיבוד?
- CBC (cap bonding protein)
- PAB (poly A binding protein)
- EJC (exon junction complex)
מה תפקיד ה
exosome
המצוי בגרעין?
פירוק שאריות הפסולת של ה
RNA
בגרעין
(עשיר באקסונוקלאזות 3 ל5)