מנגנון הרפליקציה (מולקולרית ב)

Question 1

על איזה מהגדילים בתהליך השכפול ניתן למצוא מקטעי אוקזאקי?

Answer 1

על הגדיל המתעכב

Question 2

פעילות האקסונוקלאז של דנ”א פולימראז מתרחשת בכיווניות

Answer 2

3’ –> 5’

Question 3

מה תפקידו של דנ”א-פרימאז?

Answer 3

סינתזת פריימרים של רנ”א על גדילי התבנית המשתכפלים

Question 4

מה המרווח בין פריימרים של מקטעי אוקזאקי סמוכים?

Answer 4

100-200

בסיסים

Question 5

מה עושה דנ”א ליגאז?

Answer 5

משתמש ב
ATP
כדי לחבר קשר פוספודיאסטרי בין מקטעי אוקזאקי

Question 6

איך נקרא הפרימאז האאוקריוטי?

Answer 6

DNA polymerase alpha

Question 7

מה עושה הליקאז?

Answer 7

פותח את הדנ”א הדו-גדילי תוך שימוש ב

ATP

Question 8

על איזה גדיל נעות הליקאזות אאוקריוטיות ובאיזו כיווניות?

Answer 8

• הגדיל המוביל

- 3’ –> 5’

Question 9

על איזה גדיל נעות הליקאזות פרוקריוטיות ובאיזו כיווניות?

Answer 9

• הגדיל המעכב

- 5’ –> 3’

Question 10

מה תפקידם של חלבוני

SSB?

Answer 10

ייצוב החד-גדיל והגנה עליו

Question 11

כיצד נקראים חלבוני
SSB
באאוקריוטים וכמה נוקלאוטידים הם קושרים?

Answer 11

• RPA

- 8

Question 12

מה תפקידה של ה

sliding clamp?

Answer 12

העלאת הפרוססיביות של דנ”א פולימראז ע”י ייצובו על גדיל התבנית

Question 13

כיצד נקראת ה
sliding clamp
בפרוקריוטים ובאאוקריוטים?

Answer 13

• beta Clamp

- PCNA

Question 14

כיצד עובד הקומפלקס החלבוני

clamp loader?

Answer 14

משתמש ב
ATP
ע"מ להטעין את ה
clamp
על הדנ"א

Question 15

איזה דנ”א פולימראז אחראי על סנתזת הגדיל במוביל באאוקריוטים?

Answer 15

אפסילון

Question 16

איזה דנ”א פולימראז אחראי על סנתזת הגדיל המתעכב באאוקריוטים?

Answer 16

דלטא

Question 17

מה תפקידה של מערכת ה
mismatch repair (MMR)?

Answer 17

זיהוי בסיסים לא מזווגים והסרתם מהגדיל החדש לאחר השכפול

Question 18

כיצד מתבצע הזיהוי של הגדיל החדש שסונתז ע”י מערכת
MMR
ב
E.coli?

Answer 18

יש בו אדונזין לא ממותל ברצף
GATC
המזהה אותו כגדיל החדש

Question 19

איזה אנזים ממתל את האדנוזין ברצף
GATC
ב
E.coli?

Answer 19

Dam-methylase

Question 20

כיצד מזוהה הגדיל החדש שסונתז ע”י מערכת ה
MMR
באאוקריוטים?

Answer 20

• הגדיל המתעכב החדש מזוהה בזכות ה
  nicks
  טרם פעולת הליגאז
• נוצרים שברים חד גדיליים במנגנון שאינו ידוע בגדיל המוביל החדש

Question 21

מה פגוע בסינדרום

HNPCC?

Answer 21

מערכת

MMR

Question 22

אלו חלבונים מעורבים ב
MMR
ומה תפקידם?
(3)

Answer 22

- MutS:
סורק את הדנ"א למציאת בסיסים לא מזווגים
- MutL:
מחפש שבר חד-גדילי לזיהוי הגדיל החדש ומגייס חלבונים נוספים
- MutH:
בפרוקריוטים. מזהה אדנוזין לא ממותל ברצף
GATC
וחותך על הלא ממותל

Question 23

מה עושה טופואיזומראז 1?

Answer 23

עושה שבר חד גדילי ופותח פיתול על אחד

Question 24

מי החומצה האמינית המצויה באתר הפעיל של טופואיזומראז 1?

Answer 24

טירוזין

Question 25

האם טופואיזומראז עושה שימוש במקור אנרגיה לשם פעילותו?

Answer 25

לא

נקשר זמנים לחד גדיל

Question 26

מה עושה טופואיזומראז 2?

Answer 26

יוצר שבר דו-גדיליבקדמת מזלג השכפול ומתיר פיתול על אחד תוך שימוש ב2 מולקולות
ATP

Question 27

מה מנגנון הפעולה של טופואיזומראז 2?

Answer 27

• יוצר שבר דו גדילי במולקולת דנ”א אחת ונקשר לשני צידיה
• מעביר את מולקולת הדנ”א השנייה דרך ה”שער” שנוצר
• מאחה את השבר ומשתחרר