מנגנון הרפליקציה (מולקולרית ב) Flashcards

1
Q

על איזה מהגדילים בתהליך השכפול ניתן למצוא מקטעי אוקזאקי?

A

על הגדיל המתעכב

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

פעילות האקסונוקלאז של דנ”א פולימראז מתרחשת בכיווניות

A

3’ –> 5’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

מה תפקידו של דנ”א-פרימאז?

A

סינתזת פריימרים של רנ”א על גדילי התבנית המשתכפלים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מה המרווח בין פריימרים של מקטעי אוקזאקי סמוכים?

A

100-200

בסיסים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

מה עושה דנ”א ליגאז?

A

משתמש ב
ATP
כדי לחבר קשר פוספודיאסטרי בין מקטעי אוקזאקי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

איך נקרא הפרימאז האאוקריוטי?

A

DNA polymerase alpha

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מה עושה הליקאז?

A

פותח את הדנ”א הדו-גדילי תוך שימוש ב

ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

על איזה גדיל נעות הליקאזות אאוקריוטיות ובאיזו כיווניות?

A
  • הגדיל המוביל

- 3’ –> 5’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

על איזה גדיל נעות הליקאזות פרוקריוטיות ובאיזו כיווניות?

A
  • הגדיל המעכב

- 5’ –> 3’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מה תפקידם של חלבוני

SSB?

A

ייצוב החד-גדיל והגנה עליו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

כיצד נקראים חלבוני
SSB
באאוקריוטים וכמה נוקלאוטידים הם קושרים?

A
  • RPA

- 8

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

מה תפקידה של ה

sliding clamp?

A

העלאת הפרוססיביות של דנ”א פולימראז ע”י ייצובו על גדיל התבנית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

כיצד נקראת ה
sliding clamp
בפרוקריוטים ובאאוקריוטים?

A
  • beta Clamp

- PCNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

כיצד עובד הקומפלקס החלבוני

clamp loader?

A
משתמש ב
ATP
ע"מ להטעין את ה
clamp
על הדנ"א
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

איזה דנ”א פולימראז אחראי על סנתזת הגדיל במוביל באאוקריוטים?

A

אפסילון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

איזה דנ”א פולימראז אחראי על סנתזת הגדיל המתעכב באאוקריוטים?

A

דלטא

17
Q
מה תפקידה של מערכת ה
mismatch repair (MMR)?
A

זיהוי בסיסים לא מזווגים והסרתם מהגדיל החדש לאחר השכפול

18
Q

כיצד מתבצע הזיהוי של הגדיל החדש שסונתז ע”י מערכת
MMR
ב
E.coli?

A

יש בו אדונזין לא ממותל ברצף
GATC
המזהה אותו כגדיל החדש

19
Q

איזה אנזים ממתל את האדנוזין ברצף
GATC
ב
E.coli?

A

Dam-methylase

20
Q

כיצד מזוהה הגדיל החדש שסונתז ע”י מערכת ה
MMR
באאוקריוטים?

A
  • הגדיל המתעכב החדש מזוהה בזכות ה
    nicks
    טרם פעולת הליגאז
  • נוצרים שברים חד גדיליים במנגנון שאינו ידוע בגדיל המוביל החדש
21
Q

מה פגוע בסינדרום

HNPCC?

A

מערכת

MMR

22
Q

אלו חלבונים מעורבים ב
MMR
ומה תפקידם?
(3)

A
- MutS:
סורק את הדנ"א למציאת בסיסים לא מזווגים
- MutL:
מחפש שבר חד-גדילי לזיהוי הגדיל החדש ומגייס חלבונים נוספים
- MutH:
בפרוקריוטים. מזהה אדנוזין לא ממותל ברצף
GATC
וחותך על הלא ממותל
23
Q

מה עושה טופואיזומראז 1?

A

עושה שבר חד גדילי ופותח פיתול על אחד

24
Q

מי החומצה האמינית המצויה באתר הפעיל של טופואיזומראז 1?

A

טירוזין

25
Q

האם טופואיזומראז עושה שימוש במקור אנרגיה לשם פעילותו?

A

לא

נקשר זמנים לחד גדיל

26
Q

מה עושה טופואיזומראז 2?

A

יוצר שבר דו-גדיליבקדמת מזלג השכפול ומתיר פיתול על אחד תוך שימוש ב2 מולקולות
ATP

27
Q

מה מנגנון הפעולה של טופואיזומראז 2?

A
  • יוצר שבר דו גדילי במולקולת דנ”א אחת ונקשר לשני צידיה
  • מעביר את מולקולת הדנ”א השנייה דרך ה”שער” שנוצר
  • מאחה את השבר ומשתחרר