Wouter Suring Genomics deel 2 Flashcards
Welke 3 ‘onderdelen’ van het genoom worden gebruikt voor humaan forensisch onderzoek?
Short tandem repeats –> STR
mtDNA (mitochondrieel)
Single Nucleotide Polymorphism –> SNP
Wat zijn short tandem repeats?
Repeats van 3,4,5 basen.
Hoe worden STR’s gedetecteerd en waarvoor en waarom wordt het gebruikt?
- Gedetecteerd met PCR gevolgd door elektroforese.
- Veel variatie dus handig voor identificatie van personen.
Waarom moet je meerdere loci van STR’s bekijken om te vergelijken?
STR allel zit in 5-20% van de bevolking het is dus niet onderscheidend genoeg om maar naar 1 te kijken.
Hoe ziet mtDNA eruit? (3)
Circulair, 16000bp, control region.
Wat is een eigenschap van de control region?
In de control region zit de meeste variatie.
- Wordt dus gebruikt voor identificatie van mensen.
Wat betekent SNP en wat is het?
Single Nucleotide Polymorphism.
= Een afwijking van 1 basepaar tussen individuen.
Zit een SNP altijd op één chromosoom?
Omdat een mens van elk chromosoom 2 kopieën heeft, kan het zijn dat op het andere chromosoom een andere nucleotide is ingebouwd:
homozygoot SNP = dezelfde nucleotiden, heterozygoot SNP = verschillende nucleotiden
Noem verschillende SNPs om eigenschappen aan te tonen.
- Identiteitsbepaling
- Verwantschap
- Afkomst
- Fenotype
Waarom worden SNPs gebruikt om verwantschap aan te tonen?
SNPs hebben lage mutatiesnelheid.
- Haplotype: SNPs die samen overerven. (Bijv. je moeder heeft dezelfde SNPs als jou).
Op welke manieren worden genomics gebruikt voor niet-humaan forensisch onderzoek?
Voedsel
- Bio terrorisme, allergenen identificeren, oorsprong voedsel bepalen
Dieren
- Doping controle, dierenbeten, illegaal vissen
Planten
- Drugs identificatie, identificatie van zeldzame en exotische planten
Micro-organismen
- Bio terrorisme (virus)
