Wardit Tigchelaar Genexpressie Eukaryoten Flashcards
Wat is Rna processing ? (3)
Een extra stap die alleen uitgevoerd wordt bij eukaryoten.
Vindt plaats in de celkern. Tussen transcriptie en translatie.
Wat is differentiele genexpressie?
De expressie van verschillende genen door cellen met hetzelfde genoom. Hierdoor ontstaan verschillen tussen celtypes.
Wat zijn transcriptiefactoren?
Transcriptiefactoren binden aan DNA en RNA polymerase bindt vervolgens aan de transcriptiefactoren. = transcriptie initiatie complex. (promotor hoort ook bij het complex).
Wanneer eindigt transcriptie en wat gebeurd er dan met polymerase?
Transcriptie eindigt 10-35 nucleotiden na de poly-a-staart. Daar laat Polymerase los.
Wat zijn de 5 stappen van genexpressie in eukaryoten?
- chromatine modificatie = DNA ‘uitpakken’.
- Transcriptie = DNA naar RNA.
- RNA processing = intronen verwijderen. RNA naar mRNA.
- Transport naar cytoplasma.
- Translatie.
Wat gebeurt er door Acetylatie?
Door acetylatie van histonen staarten komt het chromatine losser te zitten en kan er transcriptie plaatsvinden.
Wat gebeurt er door methylatie?
Minder transcriptie. Het chromatine gaat meer in elkaar zitten.
- Kan zorgen voor lange tijd inactivatie van genen in cellulaire differentiatie.
Wat is genomische inprenting?
Reguleert methylatie expressie van moederlijke of vaderlijke allelen van specifieke genen aan het begin van de ontwikkeling.
wat is epi genetische erfelijkheid?
Chromatine modificaties veranderen niet de DNA sequentie, maar ze kunnen doorgegeven worden aan toekomstige generaties van cellen
Wat doen Chromatine modificatie enzymen?
Zorgen voor controle over genexpressie door een regio te maken van DNA die meer of minder kan binden voor transcriptie.
Wat zijn control elements?
stukjes niet coderend DNA die dienen als bindingspunt voor transcriptiefactoren. Bevinden zich vóór promoter, dus upstream.
Waar zitten proximal control elements?
Bevinden zicht dichtbij de promoter.
Waar zitten Distal control elements?
ook wel enhancers = bevinden zich ver weg van het gen en soms zelfs in een intron.
Wat is een Activator?
een eiwit dat bindt aan een enhancer en stimuleert de transcriptie.
Hoe werkt een activator?
- Activator eiwit bind aan enhancer regio.
- DNA-buigend eiwit brengt de activator dichtbij de promoter.
- Mediator eiwit en transcriptiefactoren zijn aanwezig.
Wat is Combinatorial control of gene activation?
Een specifieke combinatie van controle elementen die transcriptie activeren alleen wanneer de geschikte activator eiwitten aanwezig zijn.
Wat is een huishoudgen?
Genen die altijd aanwezig zijn, komen altijd (een beetje) tot expressie.
Wat gebeurd er tijdens RNA processing?
- Uiteindes van het transcript veranderen, 5’ kant en 3’ kant.
- RNA Splicing; pre-mRNA wordt mRNA
Wat is een spliceosome?
Organel waar splicing plaatsvindt.
Cel herkent door een specifieke sequentie waar de intronen zich bevinden.
Wat is alternatieve splicing en wat kun je hiermee?
Sommige exonen worden ook eruit gespliced. Hiermee kun je achterhalen met welk celtype je te maken hebt.
Wat gebeurd er als de uiteindes van het transcript veranderen, 5’ kant en 3’ kant?
5’cap wordt toegevoegd aan 5’ kant. Poly-a-staart wordt toegevoegd aan de 3’ kant.
Functies”
Wat is de functie van de poly-a-staart?
- Maakt de export van mRNA naar het cytoplasma mogelijk
Wat doet de 5’cap?
- Beschermt mRNA tegen enzymen die het af willen breken.
- Helpt om ribosomen te binden aan de 5’ kant.
Waarom is eukaryoot mRNA langer aanwezig dan prokaryoot mRNA?
Door de UTR aan de 3’ kant.
