week 3, HC.7 - Proteomics, metabolomics, miRNA's en RNAi screens

Question 1

wat is proteomics

Answer 1

analyse voor de hoeveel eiwit

Question 2

wat zijn de stappen van eiwit identificatie met massa spectrometrei

Answer 2

eiwitmengesel (knippen) met trypsine digestie –> anaylse met massa spectrometrie –> data vergelijking en identificatie van het eiwit

Question 3

wat is het nut van de trypsine digestie

Answer 3

je wilt heel precies de massa weten en dit gaat makkelijker met kleinere stukjes

Question 4

hoe kan een match gemaakt worden tussen het eiwit en de spectrometrie

Answer 4

vanuit het database menselijk genoom worden alle mogelijke tryptische fragmenten en hun spectrometrie beeld bepaalt

dit word vergeleken

Question 5

hoe kun je de eiwit interactie van een eiwit bekijken

Answer 5

met antilichamen eiwit wegvangen en vervolgens met de spectrometrie bekijken welke trypische fragmeten allemaal aan dit eiwit gebonden zijn

Question 6

wat is metabolomics

Answer 6

analyseren welke metabolieten voorkomen in het bloed

Question 7

hoe werkt de regulatie van translatie

Answer 7

MicroRNa word gecodeerd in het DNA, dit kan ingebouwd worden in een RISC complex wat bij binding aan mRNA de translatie beïnvloed

Question 8

wat doen de eiwitten drosha en dicer

Answer 8

knippen de MicroRNA op maat

Question 9

wat kan er met siRNAs gedaan worden

Answer 9

zorgen voor mRNA afbraak