Vorlesung 2 Flashcards
Nachweis Proteinsynthees N-> C Terminus
Pulse Chase Experiment
normale Translation in vitro
Fragmentierung mit Trypsin
danach anhängen von Radioaktiven AS
je später Fragmentierung, desto mehr Radioaktiv
Durchmesser DNA
20 Angström
Länge große Furche
22 Angström
Länge kleine Furhce
12 Angström
DNA Doppelhelix bildet sich aus durch
elektrostatische Abstoßung der Zucker-Phosphat-Gruppen im Rückgrat
Basenpaarung (HäBrücken)
Base Stacking
Typ B Doppelheilix
rechtsgängig
3,4 nm Windung
2,0 nm Durchmesser
10 bP / Windung
enthält große und kleine Furche
Zucker in C2’-Endo Konformation
Propeller Twist
DNA leicht verdreht
warum große und kleine Furche
N-gylkosidische Bindung nicht planar, sondern 120° Knick
Basen knicken von der Mitte aus betrachtet in verschiedene Richungen ab
C2’-Endo
C2’ Atom des Riboserings befindet sich oberhalb der Ringebene
Flatung der Zuckerringe beeinflusst Orierntung der Phosphodiesterbrücke und der glycosidischen Bindung
A-Helix der DNA
11bp/Turn
rechtsgängig
deutlich seltener, eher artifiziell
kleine Furche enger und tierfer
Zucker in C3’ endo Konformation
Basenpaare um 19° zur Helix geneigt
in der MItte Loch/ Basen weiter entfernt
syn-Konformation
Zucker und Base auf gleicher Seite der Zucker
bei Z DNA
Winkel phi
bezieht sich auf Konformation des Ribose-Rings
ob Zucker auf gleicher Seite oder anderer wie Base ist
entgegen: anti, zusammen: syn
anti-Konformation
andere Seite
bei A, B Helix
Z DNA
linksgängig
nur eine tiefe Furche in der Helix
Zickzackverlauf der P-Gruppen
tritt durch Sequenzen alternierender Purine und Pyrimidine auf
Pyrimidine in anti-Form, Purine in syn Form
kommt durchaus in vivo vor
12 bp/ turn
wo kommt Z DNA vor
in massiv transkrivierten / replizierten Regionen
Z-DNA bindenen Protine in antiviraler Abwehr
Z Struktur kann zu Genominstabilität führen (ds Brüche)
Krebs und Autoimmunerkrankung
