Virus Flashcards
Pourquoi est-ce que les virus étaient décrits comme des agents filtrables auparavant?
Car les bactéries pouvaient être conservées dans un filtre mais pas les virus
Vrai ou faux: on définissait les virus autrefois comme plus petit que la plus petite bactérie et plus grand que la plus grande protéine
Vrai
Le virus est un parasite intracellulaire …
obligatoire
Qu’est-ce que veut dire être un parasite intracellulaire obligatoire?
Cela veut dire que la vie du virus et sa réplication dépend de la machinerie biochimique de la cellule hôte
Vrai ou faux: un virus ne peut produire de protéine, mais il peut produire de l’énergie sans la cellule hôte
Faux, il ne peux pas produire ni énergie, ni protéine
Le virus est fait d’un génome viral d’ADN … ARN
ou
QSJ: surface la plus externe d’un virus qui n’est pas toujours présente?
Enveloppe
Comment est-ce que le virus se reproduit?
En assemblant ces composantes individuelles. Il ne s’agit pas de division cellulaire
Vrai ou faux: les virus sont vivants
faux
Vrai ou faux: les virus doivent encoder tous les processus requis qui ne sont pas fournis par la cellule hôte
Vrai
Comment est-ce que les composantes virales doivent s’assembler?
Par elle même
Vrai ou faux: les virus peuvent infecter toutes les cellules
Faux
Quelles sont les “barrières” à ce que le virus puisse avoir un hôte compatible ?
1) Il doit être capable d’y rentrer
2) La cellule doit posséder la machinerie cellulaire appropriée pour lui permettre de se répliquer
3) Le virus doit être capable de se libérer de la cellule pour transmettre l’infection
La taille des virus se mesure en …
nanomètre
Quel est le plus petit virus et sa taille?
Parvovirus = 18 nm
Quel est le plus gros virus et sa taille?
Poxvirus = 300 nm
Pourquoi est-ce que les virus sont invisibles au microscope optique?
Étant donné que le plus gros grossissement d’un microscope optique est de 400 nm alors que le plus petit virus est de 300 nm
Vrai ou faux: les plus petits virions ont un plus gros génome en général et encodent pour plus de protéines ce qui les rend plus complexe?
Faux, les plus gros virions
Dans quoi ce situe le génome du virus?
Dans une couche protectrice appelée la capside
Qu’est-ce qu’une nucléocapside?
La génome + la capside
Quelles sont les différentes formes de nucléocapside?
- Icosahédrique
- Hélicoïdale
- Complexe (asymétrique)
Vrai ou faux: presque tous les virions ont une nucléocapside?
Faux, tous
Comment appelle-on un virion sans enveloppe?
Un virus nue
Quelle est la composition de l’enveloppe?
Des glycoprotéines, des lipides et des protéines
Quelles sont les différentes classification d’un virus à ADN?
Virus à simple ou double brin
Virus linéaire ou circulaire
Quelles sont les différentes classification pour un virus à ARN?
- Simple brin: polarité positive ou négative
- Double brin : positif ou négatif ou double sens
- Segmenté ou non (influenza = segmenté)
Qu’est-ce que constitue la couche la plus externe d’un virus (capside ou enveloppe)?
- La structure
- La protection
- Le véhicule de transmission du virus
Qu’est-ce qui permet l’interaction entre le virus et la cellule hôte?
Une protéine d’attachement virale ou une autre structure
Qu’est-ce qui se passe lorsqu’on détruit la structure la plus externe d’un virus?
On inactive le virus
Vrai ou faux: les anticorps développés contre les composantes de ces structures de surface peuvent prévenir l’infection?
Vrai
La capside est faite de
protéines
Vrai ou faux: les virus enveloppés sont plus facilement transmissibles, car mieux protégés et résistants ?
Faux, c’est les virus nus
Vrai ou faux: La capside est capable de résister à des conditions environnementales difficiles?
Vrai
Nommer des exemples d’agents ou de conditions auxquels la capside résiste ?
- Sécheresse
- Acidité (acide digestive)
- Détergents (bile digestive)
Nommer des exemples de capsides symétrique et asymétriques?
Symétrique = icosaédrique ou hélicoïdale
Asymétrique = complexe
Quelles sont les étapes de formations d’une capside icosahédrique?
1) Formation de sous-unités protéiques virales
2) Unissons des sous-unités en protomères
3) 5 protomères s’unissent pour former des capsomères (pentamère)
4) Les capsomères s’assemblent en capside (12 pentamère)
Vrai ou faux: la capside icosahédrique simple est formée de 14 capsomères?
Faux, 12
Vrai ou faux: toutes les faces de l’icosahèdre simple sont identiques
Vrai
Où est-ce que se trouve l’acide nucléique ?
Au centre de la capside qui le protège de l’environnement
Vrai ou faux: afin d’avoir un virion avec une plus grosse capside il suffit d’ajouter des pentamère (pentons) ?
Faux, on ajoute des hexons entre les pentons. Le nombre de pentamètre demeure toujours le même (12)
Comment se forme une capsule hélicoïdale?
Les sous-unités protéiques interagissent entre elles et avec l’acide nucléique pour former une structure qui ressemble à un bâtonnet
Vrai ou faux: l’enveloppe à une structure très différente des membranes cellulaires?
Faux, similaire
QSJ: glycoprotéines virales ancrées sur l’enveloppe et se projettent hors de la surface du virions ?
Spikes
Quelles sont les différents rôles possibles des spikes?
- Certaines agissent comme protéines d’attachement virales, capable de se lier à des cellules cibles
- Certaines sont des antigènes majeurs pouvant féliciter une immunité protectrice
- Autres fonctions possibles
Pourquoi est-ce que les virus non enveloppés ne peuvent pas survivre dans le tractus digestif?
Car contrairement aux virus nus, ils sont facilement neutralités par de la sécheresse, de l’acidité, des détergents et des solvants
La structure de l’enveloppe peut être uniquement maintenu dans …
une solution aqueuse
Comment est-ce que les virus enveloppés sont transmis?
Par des fluides tels que le sang, les gouttelettes respiratoires et les tissus (sperme)
Les virus sont principalement classifiés selon quoi?
- La nature de leur génome
- Leur structure (morphologie)
Quelles sont les différents types de génomes?
ADN ou ARN:
- Simple ou double brin (pour ARN: polarité + ou -)
- Segmenté ou non segmenté
- Linéaire ou circulaire
Quelles sont les différences au niveau de la structure d’un virus?
- Symétrie de la nucléocaspide
- Enveloppé ou non enveloppé
- Nombre de capsomères
- Autres
Quelle est la terminaison lorsqu’on parle d’ordre?
Virales
Quelle est la terminaison lorsqu’on parle de famille?
Viridae
Quelle est la terminaison lorsqu’on parle de sous-famille?
Virinae
Quelle est la terminaison lorsqu’on parle de genre?
Virus
Quelle est la terminaison lorsqu’on parle d’espèce?
Aucun
Vrai ou faux: ce n’est pas tous les virus qui font partie d’un ordre ou d’une sous-famille
Vrai par exemple le virus de l’hépatite C
Voir diapo 25 et 26 pour voir des exemples de virus à ADN et ARN selon leur caractéristiques
25 et 26
Quelles sont les familles de virus à ADN populaires?
- Poxviridae
- Herpesviridae
- Adenoviridae
- Hepadnaviridae
- Papillomaviridae
- Polyomaviridae
- Parvovirdae
Nommer des membres importants dans la famille des poxviridae?
- Virus de la variole
- Virus de la variole simienne (singe)
Nommer des membres importants dans la famille des herpesviridae?
- Herpes simplex virus type 1 et 2
Nommer des membres importants dans la famille des adenoviridae?
Adenovirus
Nommer des membres importants dans la famille des hepadnaviridae ?
Virus hépatite B
Nommer des membres importants dans la famille des papillomaviridae?
- Virus du papillome humain
Nommer des membres importants dans la famille des parvoviridae?
Parvovirus B19
Voir diapo 28 pour la liste des virus à ARN
28
Vrai ou faux: les principales étapes de la réplication virale varient beaucoup d’un virus à l’autre
Faux, ce sont les mêmes
Qu’est-ce que fournit la cellule hôte au virus?
- Des substrats
- De l’energie
- La machinerie nécessaire à la synthèse des protéines virales
- Réplication du génome
Qu’est-ce qui arrive si il y a des choses qui ne sont pas fourni par la cellule?
Le génome du virus doit encodé pour ces choses
Les virus à ARN doivent …
encodés pour leurs propres enzymes pour faire la duplication d’ARN
Nommer les 8 étapes de la réplication virale?
1) Reconnaissance de la cellule cible
2) Attachement
3) Entrée dans la cellule à travers la membrane plasmatique
4) Décapsidation
5) Synthèse des constituants viraux
6) Assemblage du virus
7) Bourgeonnement des virus enveloppés
8) Relâchement du virus hors de la cellule hôte
Vrai ou faux: les virus peuvent se lier à des récepteurs sur seulement certaines cellules et parfois seulement sur certains hôtes
Vrai. Exemple: hépatite = hépatocytes. Uniquement humains et non animaux
Les cellules susceptibles ciblées définissent le … tissulaire?
tropisme
Nommer des exemples de tropisme? (6)
Hépatite C = hépatotrope
Virus EBV = lymphotrope
Influenza, virus respiratoire = pnuemotrope
Variole, rougeole, rubéole, varicelle et zona = dermotrope
Hépatite, fièvre jaune, gastro-entérite = viscérotrope
Rage, encéphalite = neurotrope
Nommer des exemples de protéines d’attachement virales et leurs récepteurs?
- Glycoprotéine 120 du VIH : CD4 sur LT
- hémagglutinine glycoprotéine du virus influenza A : Acide sialique sur les cellules épithéliales
Voir diapo 35 pour les autres exemples protéines de surface et leurs récepteurs
35
Comment est-ce que les virus non-enveloppés rentrent dans la cellule?
Principalement par endocytose dédiée par un récepteur
Comment est-ce que les virus enveloppés rentrent dans la cellule?
- Fusion des membranes du virus et de la cellule cible
- Nucléocaspide ou le génome viral est ensuite relâché dans le cytoplasme
Qu’est-ce que doit faire la nucléocaspide suite à l’internalisation?
Arriver au site de réplication et se rompre
Où est-ce que vont les virus selon leur génome?
ADN = vers le noyau (sauf poxvirus)
ARN = vers le cytoplasme (sauf orthmyxovirus et rétrovirus)
Quelles sont les 4 étapes de la synthèse des constituants viraux?
1) Transcription du génome en ARNm pour traduction en protéine non-structurale (produits précoces)
2) Réplication du génome
3) Transcription du génome en ARNm pour traduction en protéines structurales
4) Modification post-traduction de la protéine
Où est-ce que se trouve la machinerie cellulaire nécessaire pour la transcription d’ARNm ?
Dans le noyau
Vrai ou faux: la plupart des virus à ARN utilisent les polymérases de la cellules hôte pour synthétiser l’ARNm dans le noyau
Faux, les virus à ADN
Vrai ou faux: la plupart des virus à ARN se répliquent dans le cytoplasme ?
Vrai
Qu’est-ce doivent faire les virus à ARN afin de faire la transcription et la réplication ?
Ils doivent eux-mêmes encoder des enzymes nécessaires que la cellule hôte n’a pas (leur propre ARN polymerase)
Vrai ou faux: il y a beaucoup d’erreur qui sont faites par les ARN polymérases
Vrai, cela permet des mutations
Où est le site d’assemblage des virus à ADN vs ARN?
ADN: plupart dans le noyau
ARN : plupart dans le cytoplasme
Vrai ou faux: le génome est toujours assemblés avant la capside?
Faux, c’est également possible que la capside virales soit assemblée et ensuite rempli du génome
L’enveloppe est acquise lors du … du virus?
bourgeonnement
Vrai ou faux: la majorité des virus à ADN bourgeonnent de la membrane sans tuer la cellule?
Faux, ARN
Vrai ou faux: tous les virus acquièrent leur enveloppe grâce à la membrane plasmatique?
Faux, certains par l’enveloppe du réticule endoblastique et de l’appareil de Golgi
Qu’est-ce qui se passe parfois durant l’assemblage?
Des erreurs qui résultent en la formation de virions vides ou contenant un génome défectueux
Quelles sont les trois façons dont les virus sont relâchés de la cellule?
- Lyse cellulaire
- Exocytose
- Bourgeonnement à travers la membrane plasmatique
Les virus … sont souvent relâchés après lyse cellulaire et les virus … le sont souvent sans tuer la cellule
nus
enveloppés
Comment sont relâchés les virus qui bourgeonnent dans le cytoplasme?
Par exocytose ou lyse cellulaire
Quels sont les mécanismes de transmission virale?
- Aérosols
- Ingestion de nourriture et eau contaminées
- Fomites
- Contact direct avec les sécrétions
- Contact sexuel
- Sang contaminé ou transplantation d’organe
- Zoonoses
- De la mère à l’enfant: transmission verticale
Quels sont les mécanismes de transmission virale?
- Aérosols
- Ingestion de nourriture et eau contaminées
- Fomites
- Contact direct avec les sécrétions
- Contact sexuel
- Sang contaminé ou transplantation d’organe
- Zoonoses
- De la mère à l’enfant: transmission verticale
De quoi dépend le mode de transmission ?
Le mode de transmission dépend de quelle est la source du virus et de la capacité du virus à endurer les conditions de l’environnement et du corps jusqu’à sa cellule cible
Vrai ou faux: la composition et la grosseur de la capside est le principal déterminant structural du mode de transmission virale?
Faux, c’est la présence ou non d’enveloppe
Les virus non enveloppés sont souvent transmis par voie …
fécale-orale (car résistant à l’acidité gastrique, etc.)
Nommer une source fréquente de virus nus ?
Les fomites (objects contaminés)
Pourquoi est-ce que les virus enveloppés sont souvent transmis par gouttelettes respiratoires, salive et sperme, sang, organe transplanté ?
Car les virus enveloppés sont plus fragiles. Ils ont donc besoin d’une enveloppe intacte pour rester infectieux et doivent rester mouillé
Voir diapo 48 pour résumer des propriétés virales
…
Les animaux peuvent être des … ou des …
vecteurs
réservoirs
Quelle est la différence entre un vecteur et un réservoir?
Vecteur = transmet l’infection à d’autre animaux ou à des humains
Réservoirs = maintiennent et amplifient le virus dans l’environnement
Comment sont appelés les maladies virales qui peuvent atteindre les animaux et les humains?
Zoonoses
Qu’est-ce qu’un arbovirose?
Lorsque les arthropodes sont les vecteurs de l’infection virale
Quelles sont les facteurs qui peuvent contribuer à la transmission?
- Sexe non protégé
- Condition de vie
- Travail/loisir
- Styles de vie
- Fréquentation de garderie
- Voyage
Quelles sont les trois grandes catégories de transmissions ?
- Respiratoire
- Fécale-orale (contact ou zoonose)
- Transmission par le sang (sexe, transmission verticale mère/enfant)
Quelles sont les 4 grandes façons de détecter/diagnostiquer des infections virales?
1) Culture virale sur des cellules dérivées de tissus humains en couche monocellulaire
2) Détection d’anticorps spécifiques chez l’hôte infecté
3) Détecteur du matériel génétique viral
4) Observation en microscopie électronique
Quelles sont les méthodes de culture virale?
Observer l’apparition d’effets cytopathiques caractéristiques
Vrai ou faux: les cultures virales sont encore très utilisés?
Non, ce n’est plus utilisé en laboratoire médicaux.
Comment est-ce qu’on appelle la science qui permet la détection d’anticorps spécifique chez l’hôte?
La sérologie
Quel est la méthode de choix de détection viral?
La détection du matériel génétique viral : PCR
Vrai ou faux: la microscopie électronique n’est plus vraiment utilisée aujourd’hui en hôpitaux?
Vrai, seulement en recherche
Quelles sont les méthodes afin de contrôler les infections virales?
- Hygiène (lavage de mains, équipements de protection individuelle, distanciation, etc.)
- Vaccination (prévention)
- Traitement antiviral (seulement certaines infections)
Quelles sont les cibles thérapeutiques du traitement virales?
Les étapes du cycles de réplication
Comment les traitements thérapeutiques peuvent inhiber l’attachement du virus à la cellule?
1) Anticorps neutralisants :naturel ou immunisation passive avec des injections. Anticorps se fixent au spike pour empêcher leur liaison.
2) Antagoniste de récepteurs spécifiques : analogues des récepteurs cellulaires ou de la PAV qui bloquent l’interaction entre le virus et la cellule. (Exemple: inhibiteur récepteur CCR5. qui empêchent VIH de se lier aux macrophages et aux CD4) en gros ce lie au récepteur.
Comment les traitements thérapeutiques peuvent inhiber l’entrée dans la cellule et la decapsidation?
Pour les virus qui entrent par des vésicules endocytiques, des antiviraux vont neutraliser le pH de ces compartiments pour empêcher la fusion ou le bris de la membrane. Donc soit la vésicule ne se fusionne même pas avec la membrane soit la vésicule ne peut pas se briser et donc laisser sortir le virus pour qu’il se décapside.
Exemple:
Amantadine et rimantadine (influenza A)
Enfuvirtide qui bloque entrée et décapsidation VIH en inhibant fusion GP41
Pourquoi est-ce que l’inhibition de la synthèse de l’ARNm est pas une bonne cible?
Il est difficile d’inhiber l’ARNm du virus sans inhiber celle de la cellule hôte
La plupart des antiviraux sont des …
analogues des nucléosides (nucléosides modifiés)
Qu’est-ce que permet les antiviraux analogues des nucléosides (exemple) ?
Les analogues nucléosidiques se lient facilement à l’ADN/ARN polymérase virale (moins précise que les enzymes de l’hôte) et inhibent la réplication virale en arrêtant l’élongation de la chaîne d’ADN ou d’ARN.
L’ADN polymerase virale du HSV et la transcriptase inverse sont des exemples.
Les analogues nucléosidiques inhibent la réplication virale le plus souvent par…
l’arrêt de l’élongation de la chaîne d’ADN et d’ARN
Pourquoi est-ce que les ADN/ARN polymérases virales sont des cibles idéales?
Étant donné qu’elles sont essentielles à la réplication virales et qu’elles sont différentes des enzymes de l’hôte
Quelle est le mode d’action des analogues non nucléosidiques de la polymérase?
Ils se lient de façon non compétitive à l’enzyme à des sites autres que celui du substrat pour inhiber la polymérase.
Expliquer le mécanisme de l’analogue nucléosidique de la polymérase du VIH
1) Un analogue de la cytosine fait compétition avec le substrat naturel.
2) Les kinases de la cellules de l’hôte vont tri-phosophoryler l’analogue de la cytosine
3) L’analogue de la cytosine triphosphorylé va être incorporé dans la chaîne d’ADN virale qui résulte en la terminaison de l’élongation de la chaîne.
La transcriptase inverse est donc bloquée, car elle ne peut pas continué son travail.
Comment les traitements antiviraux empêchent l’assemblage du virus et le relâchement?
Leur but est d’inhiber les enzymes responsables de ces étapes.
- Inhibiteur de la protase du VIH, enzyme essentielle à l’assemblage du virus et à la production de virions infectieux
- Inhibiteur de la neuraminidase de l’influenza A et B ce qui empêche la libération du virus de la cellule.
