Théorie neutre, apparition et disapparition d'allèles Flashcards
Qu’est-ce que l’évolution
Il y a évolution quand la sélection agit sur des variations héritables permettant d’augmenter la valeur adaptive des individus
Que se passe-t-il à travers le mécanisme de l’évolution
La fréquence des variation favorables augmente à travers les générations
Quelle est la théorie neutre
Les taux élevés de polymorphismes observes ne sont pas compatibles avec l’action de la sélection naturelle
Qui a proposé la théorie neutre
Motoo Kimura propose que la variation doive être neutre
Quels sont les composants de la théorie neutre
Les nouveaux variants apparaissent par mutation; la plupart sont sélectivement neutres. Les fréquences alléliques sont dues à l’équilibre entre la mutation et la dérive
Qu’est-ce que la dérive génétique
Fluctuation aléatoire de la fréquence des allèles au fil de générations due à l’effet d’échantillonnage dans une population de taille limitée
De quoi dépend la vitesse de fixation
Vitesse de fixation dépend de la taille de la population
Quelle est la probabilité de fixation égale
Fréquence allélique
Quelle est la probabilité de transition
Probabilité que le nombre d’allèles A passé de i à j dans une population de taille 2N où p est la fréquence de A et q la fréquence des autres allèles
C’est quoi le population effective
Population contribuante effectivement à la génération suivante (taille de la population qui serait responsable de la même dérive génétique que la population réelle)
Qu’est-ce qui peut expliquer le phénomène de population effective
Organisation sociale : seuls les individus dominants se reproduisent (ex : éléphants de mer). Sexe ratio qui n’est pas égale 1 : 1. Sélection naturelle. « Generation overlap » croisement intergénérationnels. Fluctuations marquées dans la taille de la population
Quel est le temps entre la fixation de nouveaux allèles
Temps moyen entre la fixation d’un nouvel allèle est 1/u (mu) (réciproque du taux de mutation). Probabilité d’apparition de mutations augmente avec Ne mais la probabilité de fixation diminue avec Ne
Quel est le temps moyen de fixation de nouveaux allèles
Le temps de fixation ou disparition dépend de Ne. Mutations fixées le sont en moyenne en 4Ne générations
Quel est le taux de fixation
La fixation d’un allèle donné sera plus lente dans une grande population. Mais plus de nouveaux allèles apparaissent dans une grande population. Dérive génétique a un effet plus important à cause de l’effet d’échantillonnage : Les fréquences alléliques changent plus rapidement dans les petites populations
Quelles sont les implications des marqueurs neutres
Le fait que les polymorphismes observés soient neutres nous permet pour étudier divers processus dans les populations dont la dérive génique. La définition de H par Ne et u nous permet de prédire que les plus petites populations présenteront moins de variations. Nous pouvons prédire que les populations accumulent de nouvelles mutations à un taux constant, ce qui nous permet de définir une horloge moléculaire. Les fossiles nous permettent de calibrer cette horloge moléculaire