Différenciation des populations et migration Flashcards
Quel est l’isolement par distance
Dans les grandes populations, il est difficile d’avoir panmixie. Les chances de reproduction des individus dépendent de leur localisation au sein de la population. Phénomène d’isolement par la distance
Quelles sont les conséquences de l’isolement par la distance
La variation génétique est rarement distribuée de manière uniforme à travers la répartition des espèces
C’est quoi la différenciation génétique
La différenciation génétique est un phénomène naturel très important car c’est un prérequis pour la spéciation
Quelles sont les conséquences de l’isolement des sous-populations
Réduction de l’hétérozygotie
Qu’est-ce que le flux génique
Flux génique = l’échange de gènes entre populations (La migration suivie de la reproduction). Flux génique tend à uniformiser la variation génétique. La dérive génétique, la sélection et même la mutation, amènent la différenciation. L’effet sur les populations dépend de l’intensité de ces différentes forces
Qu’est-ce que l’organisation hiérarchique dans les populations
Les populations peuvent être différenciées à différentes spatiales ou géographiques. Cela peut donner des niveaux progressivement imbriqués
C’est quoi un métapopulation
Groupe de population localises mais connectés par du flux génique. Dans ce type de système, une population peut devenir éteinte puis être recolonisée par les populations adjacentes
C’est quoi un Système dynamique
Où les habitats disponibles peuvent être occupes ou non à un moment donné.
C’est quoi le mesure FST
FST : Mesure de la différenciation entre sous-populations et est toujours positive
C’est quoi le mesure FIS
FIS : Mesure de déviation de HW pour les individus par rapport aux sous-populations d’origine. Cette valeur peut être positive ou négative
C’est quoi le mesure FIT
FIT : Mesure de déviation de HW pour les individus par rapport à la population totale. Cette valeur peut être positive ou négative.
C’est quoi le mesure de Hi
Moyenne au niveau individuel = Ho. Moyenne de l’hétérozygotie observée parmi les individus de chaque sous-populations
C’est quoi le mesure de Hs
Hétérozygotie attendue au niveau des sous-populations = He si chaque sous-populations fait des croisements aléatoires. Moyenne des hétérozygoties attendues dans chaque sous-population
C’est quoi le mesure de Ht
Hétérozygotie attendue au niveau de la population totale = He si la population remplie les conditions de panmixie. Hétérozygotie attendue pour la population totale, basée sur la moyenne des fréquences alléliques
C’est quoi le signification de FST
FST décrit la proportion des différences génétiques entre individus de la population totale que l’on retrouve seulement dans une des sous-populations
Qu’est-ce que cela signifie lorsque FIS et FIT sont tous les deux positifs
Moins d’hétérozygotes qu’attendu (croisements consanguins)
Qu’est-ce que cela signifie lorsque FIS et FIT sont tous deux négatifs
Plus d’hétérozygotes qu’attendu (croisements distants)
Qu’est-ce que cela signifie quand FIT est positif et FIS est 0
Panmixie dans les sous-populations mais les sous-populations sont différenciées
C’est quoi l’effet Wahlund
Effet qui se produit quand on assume que deux (ou plus) sous-populations forment une seule population
C’est quoi les populations cryptiques
Observation de cet effet quand on a affair a des populations cryptiques. Populations sans barrières visibles entre elles, mais qui sont en séparées par des barrières cachées, non évidentes. L’effet Wahlund prédit que l’hétérozygotie augmentera si ces barrières entre sous-populations différenciées sont levées
Quelle est l’évolution du FST
Apparition de différences de fréquences alléliques entre deux sous-populations est difficile à expliquer. Peut-être dû à des phénomènes aléatoires (dérive génétique) ou à la sélection naturelle associée à des phénomènes de migration entre sous-populations
C’est quoi migration
Mouvement d’organisme (ou de leurs gamètes) entre sous-populations. Ne résulte pas forcement en l’échange de gènes entre populations
C’est quoi les populations continentale
Population où les ressources sont suffisantes pour garantir une croissance continue. Taille de la population considérée comme illimitée
C’est quoi les populations insulaire
Population où les ressources sont limitées. La migration est un facteur important de la croissance. A chaque génération, une proportion m de zygotes dans la population insulaire provient d’un échantillon aléatoire de gamètes provenant du continent (1-m est donc la proportion restant de la population initiale à chaque génération)
Quel est le modèle de flux génique des îles
Population de taille suffisante pour négliger la dérive génétique. Dans une sous-population, une proportion m de migrants en provenance partagée entre les sous-populations (incluant la sous-population examinée)
Quels sont les modèles de flux génique
Continent-île, îles, tremplin “Stepping Stone” et tremplin en 2D
Quels sont les approches traditionnelles de structures des populations
- Considère les sous-populations en fonction des sites de prélèvement
- Estimer la structure génétique
- Estimer la distance génétique
- Tester la différenciation entre ces sous-populations désignées
C’est quoi le diagramme en barre
Visualisation de l’assignation de chacun des individus avec les résultats de chaque individu représenté sur une colonne représentant la proportion de leur matériel génétique pouvant être assignée à chacun des k groupes. Chaque groupe génétiquement distinct est représenté en une couleur différente (jusqu’à k groupes). Si chaque sous-population est génétiquement distincte, tous les individus de chaque population auront une colonne d’une seule et même couleur.
Que nous montre l’analyse bayésienne
Un logiciel (STRUCTURE) calcule la probabilité d’observe les données génotypiques analysées pour un nombre k de groupes (avec k = 1, 2, 3, …). La valeur de k donnant la plus haute probabilité d’observer les données est la meilleure façon de décrire les sous-populations
