T2 E TP2- ANOMALIAS CROMOSSOMICAS Flashcards
DOENCAS GENETICAS
multifatoriais
(meningocelo)
monogenicas
(hemofilia)
cromossomica
(trissomia 21)
*cromossomopatias
(chat diz “condição médica ou uma síndrome associada a anormalidades cromossômicas”)
- principal causa genética de “Atraso global do desenvolvimento psicomotor” – AGDPM
- 30 a 40% criancas com atraso desenv psicomotor com cromossoptia (trissomia 21 + freq)
- patologia ocorre p alteracao dosagem genica ou alt estrutura dos genes
a) fenotipo + grave p delecoes q para duplicacoes e p autossomapatias
b) fenotipo depende n genes envolvidos e funcao do produto q codificam
c) alt ocorrem geralmente p heterozigotia
CNVs e anomalias cromossómicas - nomenclatura em evolução
- muitas das alterações estruturais dos cromossomas podem ser descritas como anomalias estruturais do genoma (por exemplo inversões e genes de fusão) e CNVs (deleções e duplicações)
- CNVs mts sao variantes freq na populacao contribuindo p variabilidade normal e p suscetibilidade p doencas complexas
- podem ser variaveis de baixa penentrancia e expressao variavel
- CNV normalmente usado p delecoes ou dup isoladas, intracromossomicas, sendo as que reusltam de anomalias intercromossomicas situacoes em q se prefere nomenclatura classica)
Classificação das cromossomopatias
1 O tipo de anomalia;
2. A sua origem;
3. O impacto no fenótipo.
TIPO DE ANOMALIA
numericas
- poliploidias (69, XXX; 92 XXXY)
- aneuploidias (trissomia, turner…)
acontecem de novo, n estudar progenitores
estruturais
- intercromossomicas (translocacoes…)
- intra (delecoes, dup, inversoes, isocromossoma, cromossoma em anel)
- podem ser herdadas, necessario estudar pais
ORIGEM
de novo
- maioria
- pais saudaveis
- origem em anomalias meioticas de um progenitor ou mitoticas do embriao (mosaicos)
- baixo risco recorrencia
- recorrencia explicada p mosaico gonadal e tendencia materna fenomenos de para nao disjuncao meiotica
herdadas
- raras
- um progenitor e portador de anomalia cromossomica estrutural e equilibrada
- progenitor mosaico com baixa % cels com cariotipo normal
- caso de microdelecoes/microduplicacoes com exp variavel e penetrancia incompleta, progenitor pode ter mesma anomalia que o descendente
- risco recorrencia 0-100%
IMPACTO NO FENOTIPO
equilibradas
- sem perda ou ganho de material genetico importante
- fenotipo normal
- pode ocorrer abortos de repeticao, infertilidade, risco anomalias descendencia
Desiquilibradas
- perda ou ganho imp
- anomalias fenotipo + evidentes qnt + extensa a alt
CROMOSSOMOPATIAS ESTRUTURAIS: MECANISMOS
- rotura (pontos de quebra) e recombinação (recombinação homóloga não alélica) facilitada pela existência de sequências repetitivas e com homologias
a) translocacao reciproca
b) translocacao robertsoniana
c) insercao
d) inversao pericentrica e paracentrica
Cromossomopatias estruturais intracromossómicas
a) isocromossoma
b) cromossoma em anel
c) delecoes (terminais e intersticiais)
d) duplicacoes
Há risco para a descendência das anomalias estruturais equilibradas?
(sim)
- formacao de gametas desiquilibrados na origem de descendentes com anomalias e abortamentos de repeticao
- só minoria de zigotos desiquilibrados e viavel
- metade descendentes saudaveis tem mm anomalia equilibrada do progenitor
Risco de anomalias desequilibradas na descendência de pais portadores de anomalias equilibradas
- translocações robertsonianas equilibradas, o risco de anomalias na descendência é significativamente superior quando a portadora é a mãe
- progenitores portadores de translocações robertsonianas envolvendo os cromossomas 14 e 15 há risco de anomalias na descendência por DUP em descendentes com cariótipo normal ou equilibrado (risco < 0,5%)
- (tabela pg 7)
Quando suspeitar de uma patologia cromossómica?
- Abortamentos espontâneos do 1.º trimestre;
Sinais de alarme durante a gravidez:
2. Anomalias morfológicas na ecografia fetal, sobretudo se múltiplas;
3. Rastreio das aneuploidias fetais compatível com risco elevado de trissomia 21, 13 ou 18;
4. Alteração do padrão de crescimento intrauterino;
5. Morte fetal – pode ser de causa cromossómica;
Após o nascimento:
6. Fenótipo sugestivo;
7. Por vezes, o diagnóstico só se coloca na adolescência ou na idade adulta;
8. Fenótipo normal com dificuldades reprodutivas;
9. Anomalias do neurodesenvolvimento
1) Abortamentos espontâneos do 1.º trimestre
- principal causa são cromossomopatias
- abortos espontâneos com anonamias cromossomicas – 50%
(50 trissomias, 20 monossomias…) - trissomias 16 anomalias + freq abortos 1 trimestre
- outras causas de aborto: infecoes maternas (parvovirus…)
- antecedente de 1 aborto espontâneo do 1 trimestre de gravidez, nao estudado, por si so nao é um fator de risco de cromossomopatias p gravidezes consequentes
2 Anomalias morfológicas na ecografia fetal, sobretudo se múltiplas
Perante uma anomalia major/sugestiva
- pesquisar a etiologia - realizar um DPN invasivo
- pesquisar causas cromossómicas p array e excluir triploidia
- se (-), pesquisar doença monogénicas por exoma/genoma (NGS)
risco cromossopatia presenca de anomalia fetal isolada ou associada a outras anomalias
- maior quando as anomalias são múltiplas
- anomalias isoladas são frequentemente de etiologia multifatorial
- Algumas anomalias são mais frequentes em determinadas cromossomopatias sugerindo o diagnóstico
- Há causas não cromossómicas para as anomalias congénitas
associacao anomalias cardiacas e cromossopatias
- freq associadas
- Cerca de 20% dos casos de anomalias cardíacas fetais associam-se a cromossomopatias
- + freq trissomias 21 e 18 e microdelecao 22q11 (sindroma DIGeorge)
- há doenças de etiologia monogénica cujas manifestações incluem cardiopatias congénitas
3Rastreio das aneuploidias fetais compatível com risco elevado de trissomia 21, 13 ou 18
4 Alteração do padrão de crescimento intrauterino
(Quando estamos perante uma restrição do crescimento intra-uterino (RCIU) simétrico – de instalação precoce e com dano neurológico mais provável)
Avaliacao
Diâmetro biparietal;
Perímetro cefálico;
Comprimento do fémur;
Perímetro abdominal.
Restrição do crescimento intrauterino (RCIU)
- diagnostico com fetos constitucionalmente pequenos
- CAUSAS NAO GENETICAS: doencas maternas, causas placentares
- CAUSAS GENETICAS: anomalias cromossómicas, doencas monogénicas, sindromas associados a loci com imprinting
- CAUSAS CROMOSSOMICAS (avaliacao com array HCG)
a) 19%
b) 29,4% fetos com malformacoes e 6 a 9 & sem
c) mosaico confinado placenta
5 Morte fetal – pode ser de causa cromossómica
- anomalias cromossómicas em 8 a 13% (> a 20% na presença de anomalias anatómicas ou do crescimento e 4,6% na ausência de anomalias)
- necessário fazer estudos anatómicos, microbiológicos, histológicos e genéticos
- anomalias responsaveis
a) 25 a 60% mortes perinatais
b) 15% anomalias congenitas major (pricipals causa morte infancia)
6 fenotipo sugestivo
carac freq
- manif precoces
- “Atraso global do desenvolvimento psicomotor” (até aos 5 anos) e “défice do desenvolvimento intelectual”;
- alt neurologicas
- Anomalias morfológicas externas múltiplas (dismorfia facial; anomalias do esqueleto…)
- Anomalias morfológicas internas múltiplas (cardíacas, do SNC…)
!! freq anomalias multiplas
7 Por vezes, o diagnóstico só se coloca na adolescência ou na idade adulta
(heterocromossomopatias)
(sem defice intelectual significativo)
- Anomalias do crescimento
- Impuberismo ( anoguidade sexual, menopausa precoce, impotencia…)
8 Fenótipo normal, mas apresentam dificuldades reprodutivas
(portadores anomalias equilibradas)
infertilidade
- 5 a 10% infertilidade ou subinfert fem e 10 a 20% masculina relacionadas com doenca genetica, cromossomic aou mono
- MASCULINA
a) 5 a 15 causa cromossomica
b) 3% total com Sínd. de Klinefelter
c) outras anomalias: deleções e inversões do Y e anomalias equilibradas dos autossomas (fenótipo normal)
d) espermograma: azoospermia (não obstrutiva) ou
oligospermia e espermatozoides com formas e motilidade anómalas
e) Sem outras anomalias do fenótipo
- ANOMALIAS CROMOSSOMICAS EM MULHERES INFERTEIS
a) em 20% mulheres com amenorreia primaria (ausencia menarca) causa ovarica
b) em 4.4% (…) amenorreia secundaria ou insuf ovarica precoce (tmn ha causas mono p esta ultima) - ABORTAMENTOS DE REPETICAO
a) fazer estudo citogentico do casal (causa nao genetica mais freq porem devemis excluir se sao portadoes de anomalia cromossomica equilibrada ( progenitores podem formar gâmetas
desequilibrados e os embriões que formam vão apresentar anomalias cromossómicas estruturais desiquilibradas)
b) qnt mais abordtamentos maior freq de anomalias cromossomicas em casis
c) os tipos mais freq de anomalias
Translocações recíprocas equilibradas;
Translocações robertsonianas equilibradas;
Mosaicismo dos heterocromossomas;
Inversões. - INFERTILIDADE FEMININA ASSOCIADA A IDADE
a) probabilidade de conceberem diminui
b) prob abortamento aumenta
c) % embrioes aneuploides aumenta com idade materna
9 Anomalias do Neurodesenvolvimento
- anomalias cromossómicas são uma causa importante das situações de défice cognitivo, particularmente se associadas a anomalias congénitas
- incluem distubio atencao, hiperatividade…
- podem ocorrer por anomalias estruturais do genoma (CNVS)
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DIAGNOSTICO DE ANOMALICAS CROMOSSMICAS
- qPCR p identificao de trissomias e poliploidias
Mapeamento otico do genoma (OGM)
- ident de cnvs em DPN, diagnostico genetico de anomalias neurodesenv e genetica cancro
- maior limiar de resolucao que arrays HCG
- ident anomalias estruturais equilibradas
- localiza cnvs
- identifica
a) cnvs
b) inversoes e translocacoes
c) aneuploidias
d) triploidias
e) segmentos cm ausencia de homozigotia
f) reps de seq
g) n identifica snv e indels (exigindo metodos de sequencia como genoma ou exoma)
h) exige DNA grande integrirdade e em maior quantidade q metodos de NGS
DIAGNOSTICO DE CROMOSSOPATIAS
- acompanhamento personalizado dp doente e previne ou reduz complicacoes
- ident mecanismo citogenico e avaliar risco de recorrencia
- opcoes reprodutivas
APLICACOES NO ACONSELHAMENTO GENETICO
CASO 1
- Gravidez com progenitor com cromossomopatia conhecida
- risco p descendencia??
progenitor normal mas com translocacao reciproca equilibrada
- risco especifico
mulher 47XXX
- sem risco p descendencia
um deles com inversao paracentrica
- supostamente sem risco mas foram descritas excecoes
CASO 2
- feto com cromossomopatia desequilibrada
se numerica
- de novo, n estudar pais
se estrutural
- herdada, estudar pais
CASOS 3 e 4
3 - – Achados imprevistos em cariótipo/array realizado no âmbito de rastreio pré-natal (feto sem anomalias morfológicas ou de crescimento). A anomalia tem ou não impacto funcional?)
- presencao cromososma supranumerario
- ESTUDAR PAIS
a) 30% herdados de progenitores saudaveis
b) 70% de novo, sendo q 13% destes ha anomalias
4 - Mosaicismo diagnosticado em DPN com feto sem anomalias na ecografia
- % de células aneuploides pode variara de tecido para tecido
- O estudo de células sanguíneas pode dar falsos negativos
- Prognóstico difícil de avaliar no mosaicismo fetal
- geralmente o prognóstico é bom para o MCP
CASO
- feto 20 semanas
- maformacao cardiaca
- ausencia de antecedentes familiares
PROGNOSTICO
- das anomalias em si, associado a sindroma
O QUE DEVEMOS EXLUIR?
- alt cromossomica desiquilibrada
sabendo que pode ter mais ou menos de 4MB
- array de HGC
- qpcr fluorescente
RESULTADOS
- qpcr excluiu T13,18 E 21
- array indica translocao reciproca com delecao e duplicacao extensas
ESTUDAR PROGENITORES
- sao saudaveis, logo sera alt equilibrada, nao usar array
-
Diagnóstico pré-natal: maiores dificuldades de interpretação dos resultados dos arrays de
HGC/SNP
- indicado na presença de anomalias anatómicas fetais, para excluir cromossomopatia
- diagnóstico de uma anomalia cromossómica pode ter como consequência a interrupção
da gravidez. - cuidado na interpretacao quando realizado na ausencia de anomalias fetais ou na presenca de anomalia frequentemente etiologia multifatorial e q pode ser de bom prognostico
- nas VUS (variante signif incerto) comparar com pais pois algumas variantes sao nao patogenicas ou de baixa penetrancia
Anomalias do desenvolvimento fetal
COMO PROCEDER
- Excluir triploidia e aneuploidias mais frequentes com qPCR fluorescente
- Array (de HGC ou de SNP) para excluir CNVs
- Realização de sequenciação global do exoma (WES) ou do genoma (WGS) (NGS)
LIMITES DA WES
1) n substitui array ( n ident aneuploidias, deleções e duplicações cromossómicas)
2) Não identifica todas as poliploidias
3) Atualmente não identifica expansão de tripletos (mutações dinâmicas) nem inserção de retrotransposões
4) Possibilidade de existirem regiões de baixa cobertura e regiões de impacto funcional não sequenciadas
5) Identificação de VUS e de achados secundários e incidentais (com impacto no feto e nos progenitores e familiares)
6) Resultado mais demorado
7) A realização de trios (estudo dos progenitores e do feto) facilita o diagnóstico mas encarece o exame
Sequenciação global do genoma (WGS)
- + complexo e oneroso
- no futuro com possibilidade de identificação de variantes não só da sequência do DNA, incluindo a inserção de retrotransposões, mas também das anomalias cromossómicas equilibradas ou não
Fenótipo compatível com cromossomopatia em diagnóstico pós-natal
1) verificar diagnostico
2) avaliar prognostico
3) avaliar risco de recorrencia
- em muitos fenotipos e necessario excluir causa nao genetica
