Structure tertiaire des protéines Flashcards
Définition de la structure tertiaire.
Repliment du polypetide en 3D et l’assemblage de plusieurs motifs* pour donner naissance à la conformation native ou biologiquement active
*Motif= assemblage de plusieurs structure secondaire
associé à une fonction spécifique
Le repliment dépend de quoi?
Liaison H
Liaison électrostatique
Effet hydrophobe
Liaison covalente S-S (pont disulfure)
De quoi sont composé les tonneau alpha/beta tel dans le triosephosphate isomérase?
8 feuillets beta et 8 helice alpha
Quel motif protéique retrouve-t-on souvent dans les protéines de liaison à l’ADN ou l’ARN?
motif à doigt de zinc
Quels sont les 3 domaines protéiques de la pyruvate kinase?
1) Liaison à l’ATP (f.b)
2) Liaison au substrat (f.b +h.a)
3) Régulateur (f.b +h.a)
Qu’est-ce qui est essentiels au repliment de la protéine, pourquoi et où les retrouve-t-on?
Les domaines hydrophobes car ils sont la principale force de stabilisation de la structure protéique.
On les retrouve à l’intérieur de la protéine
Pourquoi le dépliment de la protéine est-il énergiquement défavorable ?
Car cela expose les domaines hydrophobes au milieu aqueux.
Que peuvent former les cystéines et comment?
Des pont disulfure (lien covalent) entre résidus d’une même ou un autre polypeptide= nécéssaire à la stabilisation ou formation structure 3D
Par l’oxydation des groupes SH (réaction réversible: réduction)
Quel enzyme catalyse la réaction d’oxydation des cystéines et où les retrouve-t-on?
disulfide isomérase dans le RE
Qu’est-ce qui peut causer la dénaturation/dépliement (inactivation biologique) d’une protéine?
La température, le PH, la concentration saline
*Habituellement réversible
Qu’est-ce qui assurent le bon repliement des protéines?
Les chaperonnes moléculaires ATP-dépendante
Qu’est-ce qui assurent la dégradation des protéines mal repliées?
Les protéasomes
Comment les protéasomes savent quels protéines détruire?
Grâce à l’ubiquitine ligase E3 qui se lie sur la chaine latérale des lysines = les protéines sont ubiquitylées
