La structure des acides aminées

Question 1

Quel fonction compose les acides aminées?

Answer 1

amine (NH2), acide (COOH), H et R

Question 2

Comment retrouve-t-on les acides aminées à PH physiologique? Dès lors, comment apelle-t-on ce type de molécule?

Answer 2

amine (NH3+) et acide (COO-)

Ce sont des molécules amphotérique (base+acide) ce qui permet de moduler leur fonction.

Question 3

Les acides aminées sont chirale. Qu’est-ce qu’une moécule chirale? Et, sous quel forme retrouve-t-on les acides aminées?

Answer 3

C’est une molécule dont le Calpha possède 4 chaines différentes et que l’image miroir n’est pas superposable.
On retrouve les acides aminées sont la forme L uniquement.

Question 4

Comment distinguer la forme L vs D?

Answer 4

On utilise CORN
1)COO
2)R
3)NH3+
Si dans le sens aiguille d'une montre=ok

Question 5

Nommez les acides aminés non polaire.

Answer 5

Gycine, Alanine, Valine, Leucine, Isoleucine, Phenylalanine, Méthionine,Tryptophane, Proline

Question 6

Nommez les acides aminés polaire non chargé.

Answer 6

Aspargine, Glutamine, Tyrosine, Threonine, Cysteine, Serine

Question 7

Nommez les acides aminés polaire basique (+).

Answer 7

Lysine, Histidine, Arginine

Question 8

Nommez les acides aminés polaire acide (-).

Answer 8

Acide aspartique, acide glutamique

Question 9

Quels sont les particularités de la glycine?

Answer 9

non hydrophobe, non chargé, non chiral et pas de chaine latéral

Question 10

Quels sont les particularités de la proline?

Answer 10

La chaine latéral forme un cycle avec l’amine.

Pas de pont H possible, cis/trans= même énergie, N-Calpha fixe

Question 11

Quel est la particularité de la cystéine?

Answer 11

Groupement SH qui peut formé des pont disulfure.

Question 12

Quels sont les caractéristiques des acides aminées non polaires?

Answer 12

Hydrophobe ou interaction faible avec l’eau, fréquement retrouvé à l’intérieur de la molécule de protéine, ne partcipe pas directement aux réactions chimiques.

Question 13

Quels sont les caractéristiques des acides aminées polaires non-chargés?

Answer 13

Interactions des groupements fonctionnelles avec l’eau, en contact avec l’eau dans la protéine, peut aussi se retrouver à l’intérieur pour faire des pont H

Question 14

Quels sont les caractéristiques des acides aminées polaires chargés?

Answer 14

Chaine latérale chargée à PH physiologique

Contact avec l’eau ou à l’interieur pour pont H

Question 15

Dans une solution où l’on retrouve des acides aminées, le PH est calculé en fonction de quoi?

Answer 15

Proportion de la forme acide de l’acide aminée et de la forme basique

Question 16

Qu’est-ce que le point isoélectrique?

Answer 16

PH auquel une moécule est électriquement neutre.

Question 17

Qu’est-ce que le zwitterion?

Answer 17

Espèce moléculaire qui a des charges qui s’annulent.

Question 18

Comment calcule-t-on le PI si il y a

a) 2 fonctions ionisables;
b) 2 acides;
c) 2 bases?

Answer 18

a) PI=(PKa1+PKa2)/2
b) PI=(PKa1+PKa2)/2
c) PI=(PKa2+PKa3)/2

Question 19

Comment les chaines latérales influenent-elles le PI et le comportement le liens avec le PH?

Answer 19

Certains acides aminées possèdent un groupement ionisable, donc perdent un proton à un PH donnée.

Question 20

Quel est la valeur du PKa des groupes ou acides aminées suivant:

a) COOH terminal
b) NH3+ du Caplpha
c) Cystéine
d) Tyrosine
e) Acide aspartique
f) Acide glutamique
g) Lysine
h) Arginine
i) Histidine

Answer 20

a) 2
b) 9
c) 8,4
d) 10,5
e) 3,9
f) 4,1
g) 10,5
h) 12
i) 6,0

Question 21

Comment les acides aminés peuvent-ils former des chaines?

Answer 21

Condensation de 2A.A (perte H2O)==> formation d’un lien covanlent (lien peptidique) entre le carboxyle1 et l’amine2

Question 22

Qu’est-ce que la structure primaire?

Answer 22

L’arrangement linéaire de A.A

Question 23

Qu’est-ce que la structure secondaire?

Answer 23

Formation locales de structure 3D à plusieurs A.A (hélice alpha et feuillet plissé beta)

Question 24

Qu’est-ce que la structure tertiaire?

Answer 24

Assemblage de structure secondaires en motifs protéiques formant la configuration native de la protéine

Question 25

Qu’est-ce que la structure quaternaire?

Answer 25

Assemblage de plusieurs polypetides entre eux pour former une protéine fonctionelle (sous-unités)

Question 26

Lequel n’est pas un acide aminé?

Alanine
Histidine
Adénine
Tryptophane

Answer 26

Adénine

Question 27

Lequel n’est pas un acide aminé?

Cytosine
Leucine
Glutamine
Cystéine

Answer 27

Cytosine

Question 28

Vrai ou Faux, à pH physiologique (pH~7), la chaîne latérale de l’acide glutamique est chargée?

Answer 28

Vrai

Question 29

Quels acides aminés parmi les suivants sont dans la catégorie polaire chargé?

Lysine
Arginine
Sérine
Leucine

Answer 29

Lysine

Arginine

Question 30

Quels acides aminés parmi les suivants sont dans la catégorie hydrophobe?

Tryptophane
Leucine
Méthionine
Cystéine

Answer 30

Tryptophane
Leucine
Méthionine

Question 31

Quelle est la charge nette de ce tripeptide à pH physiologique (pH~7) (Trp-Val-Arg)

1-
Il n’est pas chargé.
2+
1+

Answer 31

1+