Secuenciación masiva de nucleótidos Flashcards

Carlos Peralta

1
Q

¿Cuántos aminoácidos tiene una proteína?

A

100 aminoácidos

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

¿Qué es la secuenciación masiva de nucleótidos (NGS)?

A

Técnica que permite la lectura y análisis de millones de fragmentos de ADN o ARN de manera simultánea

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

¿En qué consiste la NGS?

A

Fragmentar el ADN o ARN en pequeños segmentos

Unir adaptadores (secuencias de ADN sintético) a los extremos de estos fragmentos

Amplificar y secuenciar estos fragmentos

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

¿Cuál es el sitio para inicio de la transcripción?

A

Tss

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Transcriptoma es:

A

conjunto de modificaciones epigenéticas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Expresión génica es:

A

Proceso mediante el cual la información almacenada en los genes se utiliza para producir proteínas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Cromatina es:

A

Complejo de ADN y proteínas que forma los cromosomas en el núcleo de la célula

Hace la estructura más densa o más laxa:
- cadena relajada: más fácil de transcribir
- cadena apretada: zonas que no se van a transcribir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

¿En qué ayuda la integración ómica?

A

Entender mecanismos de la regulación génica

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Métodos de secuenciación para un abordaje completo del genoma

A

Sanger DNA sequencing
DNA microarrays
2nd generation sequencing
3rd generation and single molecule sequencing

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Un promotor metilado está _____

A

silenciado

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Técnicas de secuenciación

A

ChIP-Seq
DNAse-Seq/ATAC-Seq
Bis-Seq
sc {}-seq
3C

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

¿Qué es la secuenciación?

A

Proceso que determina el orden de los nucleótidos (A, T, C, G) en una molécula de ADN o ARN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

¿Para qué sirve la secuenciación?

A

identificar genes y sus funciones
comparar genomas
estudiar enfermedades genéticas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

¿Qué significa un pico?

A

es una zona enriquecida de señal dentro del genoma

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

¿Qué representa un pixel?

A

región de genoma

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Combinaciones de datos para el análisis de las secuencias

A

coordenadas + coordenadas:
dice que tanto coinciden los picos entre secuencias

coordenadas + señal:
en un mismo set de regiones