Replicación de DNA

Question 1

Un nucleótido (dNTP) está formado por:

Answer 1

base nitrogenada
pentosa
grupo fosfato

Question 2

Diferencia entre NTP (nucleósido trifosfato), dNTP (desoxinucleósido trifosfato), ddNTP (didesoxinucleósido trifosfato):

Answer 2

NTP:
- dos OH
- precursores de ácidos nucleicos (ARN y ADN)

dNTP:
- un OH que reacciona con el fosfato del nuevo nucleótido que entra, formando un enlace fosfodiéster
- precursores en la síntesis de ADN

ddNTP:
- no tiene OH.
- usado para secuenciación de Sanger
- nucleótidos modificados
- cuando se incorporan a la cadena de ADN, se detiene la elogación porque no puede formar un enlace fosfodiéster

Question 3

Estructura del ADN

Answer 3

doble hélice
cadenas complementarias

Question 4

Parámetros físico-químicos del ADN

Answer 4

10 pb por vuelta
distancia entre bases 3.4 A
diámetro 2nm (20 A)

Question 5

Formas alternas del DNA

Answer 5

B-DNA (común)
A-DNA
Z-DNA

Question 6

¿Qué hace la RNA polimerasa?

Answer 6

sintetiza un primer de DNA que inicia la replicación

Question 7

Formas en las que se desnaturaliza el DNA

Answer 7

cambios de temperatura
por enzimas (helicasa)
en la replicación en procariontes

Question 8

Diferencias entre la polimerasa I, II y III

Answer 8

polimerasa I:
- repara ADN
- corrige errores
- actividad exonucleasa (5’ –> 3’)
- degrada primers de RNA y los sustituye por DNA

polimerasa II: SOS DNA repair

polimerasa III:
- replicación de la cadena de elongación
- sintetiza hebra continua y rezagada

Question 9

Un fragmento de Okazaki es:

Answer 9

cadenas cortas de ADN recién sintetizadas en la hebra discontinua

estos fragmentos sintetizan la cadena rezagada/discontinua

se unen entre sí mediante la ADN ligasa, completando la nueva cadena

Question 10

Dirección de la síntesis de DNA

Answer 10

5’ –> 3’

Question 11

Característica de las polimerasas

Answer 11

Tienen actividad de corrección

Normalmente de 3’ –> 5’ para ir revisando

Question 12

Moléculas que cortan DNA

Answer 12

EXonucleasa:
- cortan DNA en eXtremos 5’ o 3’

Endonucleasa:
- cortan DNA en el interior
- enzimas de restricción
- cortan de manera específica (hasta 8 pb)

Question 13

Función de las topoisomerasas

Answer 13

liberan tensión de las hebras

Question 14

la ADN polimerasa sintetiza en dirección:

Answer 14

5’ –> 3’

Question 15

Puntos importantes de la replicación de DNA

Answer 15

• semiconservativa
• DNA se sintetiza en dirección 5’ –> 3’
• se necesita un cebador/primer (oligo de 11 o 12 nt)

Question 16

Enzimas que se requieren en la replicación de ADN

Answer 16

DNA polimerasa:
- produce DNA nuevo
- requiere un molde
- agrega nucleótido en el extremo OH’3 de la cadena

Helicasa:
- desnaturaliza (separa las hebras)
- rompe enlaces de hidrógeno entre las bases nitrogenadas
- genera la horquilla de replicación

Primasa:
- sintetiza fragmentos de ARN (primers)
- hace primers pues

Topoisomerasa:
- libera tensión de las hebras

SSB:
- proteínas que se unen a las hebras simples. después de que la helicasa las separó
- evitan que se vuelvan a emparejar o se degraden

Ligasa:
- une fragmentos de Okazaki
- forma enlaces fosfodiéster