Ribo-Seq

Question 1

Welches Gen wird am wahrscheinlichsten über Translation reguliert?

Answer 1

Gen mit instabiler mRNA und instabilem Protein

Question 2

Mittels welchem Experiment können Sie Polysome anreichern?

Answer 2

Dichtegradient > Fraktionierung > Analyse

Question 3

Welche Bedingungen müssen erfüllt sein, damit sie nach einem Ribo-Seq eine Kodon-Aufgelöste Translationsaktivität bestimmen können?

Answer 3

Dir Verdauung muss geklappt haben, sonst falscher readingframe (28 nt)

Question 4

Wie Sähe read coverage für negRNA in einem Ribo-Seq Experiment aus (negativ regulierte Termination)?

Answer 4

Richtung Terminator mehr Reads, dadie Ribosomen Stecken bleiben und ein Stau verursacht wird. keine Termination möglich.

Question 5

Ein uORF wird während Stickstoffmangel in Hefe deutlich weniger translatiet.Welche auswirkung hat dies wahrscheinlich auf das stromabwärts liegende Haupt-ORF?

Answer 5

ORF wird mehr traslatiert, da das Ribosom uORF nicht translatiert und somit nicht dort terminiert.

Question 6

Welche möglichkeiten nutzen eukaryotische Zellen um die Initiation der Translation zu regulieren?

Answer 6

• eIF4G Aktivierung
• miRNA(Repressor)
• Zirkulation (PAPB)