ChIP-Seq

Question 1

Was bedeutet ChIP

Answer 1

Chromatinimmunopräzipitation

Question 2

Auf welchen Bereich wir in einem ChIP-Seq Experiment bevorzugt normalisiert?

Answer 2

Bereich wo keine Peaks sind

Question 3

Welchen Zelltypen brauchen Sie um ChIP-Seq Experiment durchzuführen?

Answer 3

B-Zelle

Question 4

Welches DNA-Bindeproteine bindet Sequenzspezifisch an DNA?

Answer 4

NF-kB (transkriptionsfaktor)

Question 5

Was ist der primäre Zweck der ultraschall Behandlung in einem ChIP-Seq Experiment?

Answer 5

Verkürzung der Chromatinfragmente

Question 6

Wecher dieser Methoden detektiert DNA-Protein Interaktion in vivo?
ChIP und ChIP-Seq
EMSA
Footprint

Answer 6

ChIP und ChIP-Seq

Question 7

Welchen Nachteil hat die Analyse mit einem microarray anstelle einer Sequenzion?

Answer 7

Die Auflösung ist sehr schlecht

Question 8

Was bedeutet 3C (mit Skizze) und welche Frage beantwortet diese Experiment.

Answer 8

Chromatin conformation capture. An welchen Stellen interagieren Chromatine.