Replicación Y Reparación ADN

Question 1

Por qué la replicación es semiconservativa?

Answer 1

La hebra madre de divide en dos, y se sintetiza una hebra nueva a partir de cada una. A partir de una cadena madre, se forman dos cadenas; cada una con una hebra madre y la hebra hija. La madre se conserva y la hija es nueva.

Question 2

Por qué la replicacion de ADN es bidireccional?

Answer 2

Es semiconservativa porque una hebra hacia la izquierda y otra hacia la derecha, así se logran generar las dos cadenas hijas.
Cada hebra se replica simultanea y bidireccionalmente.

Question 3

Sitio de origen de la replicacion

Answer 3

Cada genoma tiene secuencias de origen en particular (procariotas solo tienen un punto de origen). Este sitio es donde se reconoce el inicio de la replicacion. Tiene muchas bases de timina y adenina que forman dos puentes de hidrógeno, y son los más fáciles de separar.

Question 4

Polimerizacion del ADN

Answer 4

La hebra parental es tomada por la ADN polimerasa, con los dedos la acomoda en la palma. La palma tiene un sitio catalitico, donde forma el enlace fosfodiester, y otro donde se coloca el último nucleotido pegado a la nueva hebra. Cada vez que se añade un nucleotido, se mueve y al sitio no catalitico.

Question 5

Inicio del proceso de replicacion

Answer 5

Se reconoce el sitio de origen, el cual cuenta con una secuencia conservada. Se recluta la helicasa para desenrollar la doble hélice, y se forma la horquilla de replicacion

Question 6

Horquilla de replicacion

Answer 6

Lugar donde el ADN madre se desenrolla, e inmediatamente se sintetizan las hebras hijas.

Question 7

Proteínas asociadas a la horquilla de replicacion

Answer 7

Helicasa: desenrolla la doble hélice
Topoisomerasa: evita que colapse el ADN desenrollado, lo relaja de la tensión creada por la helicasa. La I lo corta 1 vez, la II lo corta 2
Proteína de unión de ADN de banda simple: permite reconocimiento de la ADNasa, para que no degrade la hebra madre.
ADN polimerasa

Question 8

Cebadores o primers

Answer 8

Fragmentos de ARN que permiten iniciar la replicacion. Los sintetiza la primasa.
Su importancia es que permiten que se inicie la replicacion. Luego deben ser eliminadas, dejando gaps que son rellenados por la polimerasa y ligasa

Question 9

Por qué la replicacion es semidiscontinua?

Answer 9

Porque hay dos hebras que se sintetizan a diferente velocidad
La hebra líder, se sintetiza continuamente de 5’ a 3’, se mueve en la misma dirección que la horquilla de replicacion
Hebra rezagadas se sintetiza de 3’ a 5’, por medio de fragmentos de okasaki. Va en contra de la horquilla de replicacion. Velocidad menor a la hebra líder

Question 10

Hebra guía

Answer 10

Es la que va de 3’ a 5’, y se lee de 5’ a 3’, en ella la primasa coloca un primer, la polimerasa polimeriza la nueva hebra continuamente. Solo se necesita 1 primer. Se mueve en la misma dirección que la horquilla

Question 11

Hebra retardada

Answer 11

Va al revés que la hebra líder, de 5’ a 3’, se le pega un fragmento complementario al primer, y luego otro, se sintetiza en fragmentos de Okazaki, necesita varios primers. Se mueve en dirección opuesta a la horquilla

Question 12

ADN polimerasas en eucariotas

Answer 12

ADNpol I: funciones de limpieza durante la replicacion, recombinacion y reparación. Tiene actividad exonucleasa 5’ a 3’, puede quitar primers
ADNpol II: encargada de la replicacion del ADN. Actividad exonucleasa 3’ a 5’
ADNpol III: principal encargada de replicacion en E. coli. Cuenta con diferentes subunidades, unas para polimerizar, otros para cargar hebras rezagadas en fragmentos de Okazaki. Actividad exonucleasa 3’ a 5’.
ADNpol IV y V: formas inusuales de reparación de ADN

Question 13

Procesividad en ADNpol

Answer 13

Número promedio de nucleotidos añadidos antes de que la ADNpol se disocie

Question 14

Primasa

Answer 14

Sintetiza primers

Question 15

Helicasa

Answer 15

Rompe al frente de la horquilla, suelta las dos hebras

Question 16

Proteína de unión de ADN de banda simple

Answer 16

Evitan que las ADNasas degraden el ADN de banda simple. Mecanismo de defensa contra virus

Question 17

Girasa

Answer 17

Topoisomerasa bacteriana

Question 18

Importancia de la ADN ligasa

Answer 18

Se encarga del último paso, porque polimerasa no puede catalizar enlace fosfodiester entre nucleotidos adyacentes ya polimerizados. Se encarga de unir las dos cadenas separadas, pegando los dos nucleotidos adyacentes de dos fragmentos de Okazaki

Question 19

Topoisomerasa

Answer 19

Evita que el ADN colapse, relajando el ADN por medio de la separación de las hebras
I: hace un corte en la molécula de enrollamiento
II: hace dos cortes en la molécula de ADN, pasa la hebra de arriba hacia abajo, quita el enrollamiento

Question 20

Tasa de fidelidad y sus razones

Answer 20

Es la precisión con la cual se duplica la información genética durante la síntesis de nuevas cadenas de ADN.
Esta tasa se debe a los mecanismos de corrección de errores incorporados en el proceso. La revisión o corrección de errores también es determinante. La especificidad de la ADNpol por los pares complementarios también es determinante

Question 21

Diferencia entre corrección 5’ a 3’ y corrección 3’ a 5’

Answer 21

La 5’ a 3’ actúa al inicio y sirve para quitar primers de ARN
3’ a 5’ es edición de cuando se coloca mal una base.
Las endonucleasas corrigen errores internos, y la exonucleasa corrige externos

Question 22

Etapa del ciclo celular que ocurre la replicacion en células eucariotas

Answer 22

Fase de síntesis (S)
Tarda de 8 a 6 horas

Question 23

Señales que propician la replicacion cromosómica en eucariotas

Answer 23

Hormonas, factores de crecimiento derivado de plaquetas

Question 24

Funciones y propiedades de ADNpol en eucariotas

Answer 24

Alfa: se encarga de los primeros nucleotidos
Progresivas: replicacion en grandes fragmentos, actividad exonucleasa. Son dos:
1. Beta: sintetiza la hebra rezagada
2. Épsilon: síntesis de hebra líder
Reparación: importantes para situaciones extremas
Gamma: de mitocondrias

Question 25

Telómeros: que son

Answer 25

Secuencias repetitivas al final de cromosomas lineales. Los sintetiza la polimerasa.
Es importante porque con los telómeros se asegura que toda la información genética codificante esta siendo conservada. Los factores de crecimiento de los Telómeros se unen al final del telómero para proteger de posibles ataques
En la hebra rezagada queda un fragmento no sintetizado por la ADNpol, por lo que la telomerasa realiza la síntesis de una secuencia no codificante que sirve para terminar de sintetizar la hebra rezagada por completo, y no perder información

Question 26

Telómeros: como se sintetizan

Answer 26

La telomerasa reconoce la estructura repetitiva del telomero, utiliza una plantilla de ARN para añadir un pedazo de ADN a la hebra madre, y a partir de este segmento con la ADNpol alfa en la hebra rezagada. La hebra rezagada siempre queda más corta que la lider, pues se quita el primer.

Question 27

Cómo se dan las reparaciones del ADN

Answer 27

Se detecta el daño, se elimina un fragmento comprometido y se resintetiza