replicación del DNA y fase S Flashcards

1
Q

Procesos celulares, regulados a nivel genético-molecular, que llevan a una célula desde una mitosis a la siguiente, o la derivan hacia un estado

A

diferenciado de reposo proliferativo y funcionalidad definida

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2
Q

Desde el reposo proliferativo una célula puede

A

regresar al ciclo de división celular o ingresar a un estado de diferenciación irreversible que termina en la muerte celular

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3
Q

Ciclo celular corresponde a

A

la vida completa de una célula, por lo que hay momentos en que la célula va a entrar a ciclos para dividirse como la mitosis

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4
Q

Cada una de las fases de este ciclo proliferativo tiene un tiempo

A

relativo particular

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5
Q

hay células que son capaces de escapar del ciclo proliferativo, pero que pueden volver a reingresar a este ciclo, las cuales son células que escapan a una fase

A

G01, también existen células que escapan a G02

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6
Q

Las células que escapan de G02 ya tienen su DNA duplicado, por lo que ante cualquier estímulo

A

ingresa rápidamente a mitosis, como por ejemplo, los hepatocitos

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7
Q

La diferenciación terminal es el estado que sufren las neuronas, las cuales

A

no pueden volver al ciclo proliferativo (no se encuentran ya en G0)

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8
Q

También están las células G01 que pasan a un estado de senescencia porque

A

ha pasado por muchas divisiones celulares y sus telómeros ya se encuentran más reducidos, por lo que en este estado de senescencia se bloquea permanentemente la proliferación, por lo que de esta forma se evita que la célula pueda convertirse en un cáncer

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9
Q

En el adulto, la mayoría de las células no se encuentran proliferando, pero se encuentran en

A

etapas de reposo proliferativo

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10
Q

En el ciclo celular puede ocurrir la muerte celular en

A

cualquier etapa del ciclo proliferativo

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11
Q

En el ciclo proliferativo encontramos la fase M, y el resto es una

A

interfase

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12
Q

En interfase reconocemos a

A

G1, S y G2

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13
Q

En la fase M se reconoce la

A

mitosis y citocinesis

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14
Q

En la fase G1 y G2 la célula

A

crece en masa y duplica organelos, y para eso requiere de una mayor síntesis de proteínas

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15
Q

Si la célula requiere de una mayor síntesis de proteínas, entonces la célula requerirá de una gran síntesis de todos los RNA

A

mRNA, rRNA, tRNA

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16
Q

El crecimiento en masa de la célula no es necesariamente preciso, ya que por ejemplo, hay células de la médula ósea, y si un paciente se encuentra con anemia, las células que están más diferenciadas que los eritrocitos que son los eritroblastos comienzan a dividirse sin

A

crecer mucho, pero si presentan la división celular

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17
Q

Sistema de detección de errores

A

implica, entre otros, la reparación de daño al DNA y detención del ciclo proliferativo

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18
Q

En interfase los cromosomas se encuentran asociados a

A

territorios cromosómicos discretos

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19
Q

Los humanos somos diploides

A

2n=46

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20
Q

2n

A

2 copias de los cromosomas

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21
Q

La haploidía cuenta con

A

23 cromosomas

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22
Q

En G1 encontramos un cromosoma

A

de origen paterno y uno de origen materno

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23
Q

Al final de S y G2, también hay un cromosoma 1 de origen paterno, y uno materno, pero se encuentran duplicados, por lo que ahora tenemos el doble de

A

cantidad del DNA 2c–>4c

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24
Q

La enzima DNA polimerasa se encarga de generar los

A

enlaces fosfodiéster entre un nucleótido entrante y la cadena de DNA

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25
Q

Para que se genere este enlace, se necesita el extremo 3’ con OH libre, es decir

A

en la catálisis de este enlace fosfodiéster necesita de este extremo

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26
Q

La hebra crece de

A

5’-3’

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27
Q

La duración de la fase S es posible porque el cromosoma tiene

A

varios orígenes de replicación, y se encuentran en exceso

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28
Q

Los orígenes de replicación son segmentos de DNA que se saben son ricos en

A

G-C en humanos, mientras que son ricos en A-T en levaduras

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29
Q

No hay una secuencia específica de origen, sino que solo son regiones ricas en

A

G-C, y esta secuencia es reconocida por complejos proteicos que se llaman las proteínas de reconocimiento del sitio de origen

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30
Q

la helicasa, la cual es una enzima que

A

abre los puentes de hidrógeno

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31
Q

Observamos una quinasa dependiente de ciclina que está asociada a una ciclina de fase S, y esta quinasa fosforila a

A

los orígenes de replicación, las proteínas que están en estos orígenes para así dar inicio a la replicación del DNA

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32
Q

Se abre una burbuja de replicación en la que se está abriendo el

A

DNA, y acá participan las enzimas helicasas

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33
Q

cuántos orígenes por cromosoma hay?

A

varios

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34
Q

Los orígenes de replicación se activan de forma

A

asincrónica

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35
Q

El origen 1 y 2 comenzaron la replicación antes que el origen 3, por lo tanto, por casa cromosoma tenemos

A

múltiples orígenes de replicación que aumentan la eficiencia del proceso

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36
Q

Las regiones que se encuentran más condensadas en el DNA son las que

A

más se tardan en activar los orígenes de replicación

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37
Q

Dentro del núcleo hay sectores que presentan factorías de replicación, en las cuales están todas las enzimas que se necesitan para realizar la replicación, como las

A

helicasas, tropoisomerasas, gran cantidad de nucleótidos, etc.

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38
Q

Dentro del núcleo hay regiones discretas que tendrán un conjunto de proteínas que se relacionan con la replicación, y se denominan

A

factoría de replicación

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39
Q

Cada factoría de replicación

A

12-40 burbujas de replicación del mismo cromosoma

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40
Q

La burbuja de replicación crece de forma

A

bidireccionalmente, y genera una horquilla derecha y otra izquierda

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41
Q

Se observa la factoría compuesta por varias burbujas de replicación que pueden ser del

A

mismo cromosoma o de cromosomas distintos que se encuentran en un mismo sector

42
Q

¿el DNA se mueve hacia la factoría o la factoría se mueve hacia el DNA?

A

el DNA se mueve hacia la factoría, no al revés

43
Q

la teoría conservativa

A

en la cual se mantenía la hebra antigua completa y se generaba una hebra nueva completa

44
Q

teoría dispersiva

A

en la cual se creía que había sectores que eran copiados y otros que no

45
Q

DNA polimerasa alfa

A

comienza la síntesis de DNA de novo porque presentan un dominio con actividad primasa

46
Q

DNA polimerasa delta

A

alarga los fragmentos de DNA de la hebra retardada (switch de polimerasa)

47
Q

DNA polimerasa épsilon

A

alarga los fragmentos de DNA de la hebra líder (switch de polimerasa)

48
Q

DNA polimerasa no pueden iniciar la síntesis de DNA de novo, es decir

A

las polimerasas reconocen el extremo 3’ libre, el cual no se encuentra en la burbuja, por lo que sin el OH libre ninguna polimerasa funciona, excepto la alfa DNA polimerasa

49
Q

Con actividad RNA polimerasa la alfa DNA polimerasa puede comenzar la replicación, por lo tanto, la subunidad primasa de la DNA polimerasa es una

A

RNA polimerasa, y lo que hace es incorporar nucleótidos de novo

50
Q

Esta primasa generará un extremo 3’ de novo, e incorporará alrededor de

A

12 nucleótidos de un primer o cebador de RNA

51
Q

La alfa polimerasa luego de incorporar la secuencia de 12 nucleótidos tiene un cambio de actividad, y ahora comienza a

A

incorporar nucleótidos de DNA, incorpora aprox 20 nucleótidos

52
Q

la alfa polimerasa se desprende del DNA debido a que la polimerasa le falta el factor pcna, que es una

A

abrazadera deslizante que permite hace que la enzima tenga procesividad

53
Q

En este caso, la alfa DNA polimerasa no tiene procesividad, por lo que una vez se desprende

A

hay un intercambio de DNA polimerasa denominado el switch de las polimerasas

54
Q

Ahora ingresa la DNA polimerasa delta (retardada) o épsilon (líder), las cuales, si cuentan con la abrazadera y, por ende

A

incorporan varios de cientos de nucleótidos

55
Q

El primer nucleótido que se incorpora es de RNA e irá desde

A

5’-3’, luego en rojo se observa el de la DNA polimerasa alfa, y ahora actúa la polimerasa DNA épsilon/delta

56
Q

Las hebras deben mantener su antiparalelismo, por lo que hacia superior vemos varias secuencias con extremos

A

5’, pero que se van desplazando de 3’ a 5’

57
Q

se forman los fragmentos de Okasaki, por lo que la síntesis se está generando de a

A

fragmentos a medida que se abre la burbuja

58
Q

En la unión de los fragmentos de Okasaki se van eliminando las

A

secuencias de RNA

59
Q

El primer siempre es colocado por la

A

DNA polimerasa alfa

60
Q

Los fragmentos de Okazaki nuevos van a reemplazar los nucleótidos de

A

RNA del fragmento de Okasaki anterior

61
Q

En el modelo de flap o alerón, se viene sintetizando la

A

DNA polimerasa delta, y se encuentra con los nucleótidos de RNA del fragmento de Okasaki previo

62
Q

La DNA polimerasa delta desplaza la hebra, y ella continúa sintetizando el

A

DNA generando de esta forma un alerón o flap

63
Q

Este alerón es reconocido por la flapendonucleasa o FEN1 que corta ese alerón, y luego esto es

A

unido por una ligasa, y por lo tanto, se forma el último enlace fosfodiéster después de ese corte

64
Q

Todos los fragmentos de RNA e incluso algunos de DNA fueron eliminados, pero la DNA polimerasa delta incorpora

A

fragmentos de DNA en esa región

65
Q

El modelo de la RNasa H, la misma DNA polimerasa delta presenta en su estructura una

A

RNasa H, la cual elimina los nucleótidos de RNA

66
Q

La replicación del DNA es un proceso

A
  • bidireccional (2 horquillas)
  • semiconservativo
  • semidiscontinuo (fragmentos de Okasaki)
67
Q

PCNA es la abrazadera deslizante que se une únicamente a la

A

DNA polimerasa delta y épsilon

68
Q

PCNA es una proteína homotrímero, es decir

A

son 3 proteínas iguales que se asocian

69
Q

Proteínas de replicación RPA
Lo que hacen estas proteínas es mantener las bases expuestas, cuando la DNA helicasa va abriendo la burbuja se van incorporando las

A

proteínas RPA para que no se generen estructuras secundarias dentro del DNA que ahora es monohebra

70
Q

las RPA mantienen expuestas las bases para

A

la DNA polimerasa

71
Q

Las RPA se unen solo a las hebras de

A

DNA simples

72
Q

Se encuentran las helicasas de los

A

orígenes de replicación

73
Q

La primera proteína de replicación que comienza a funcionar es la helicasa, la cual utiliza una gran cantidad de

A

ATP con la que se comienza a romper los puentes de hidrógeno de las hebras molde

74
Q

En los telómeros, los cromosomas se asocian a proteínas que mantienen

A

rígidos los telómeros

75
Q

Si existe una enzima que va abriendo los puentes de hidrógeno en una estructura como el DNA que genera la estructura clásica de enrollamiento, lo que pasará es que la helicasa va aumentando la

A

tensión del DNA, y cuando la tensión es lo suficientemente grande, se genera un sobreenrrollamiento del DNA

76
Q

el aumento de tensión y sobreenrollamiento funcionan enzimas como la

A

topoisomerasa

77
Q

La topoisomerasa I

A

elimina la tensión del DNA

78
Q

La topoisomerasa II

A

evita los sobrenrrollamientos

79
Q

La toposiomerasa I corta una de las hebras

A

la pasa por sobre la otra y vuelve a unir al DNA, por lo que va delante de la helicasa para disminuir la tensión

80
Q

La toposiomerasa II corta las 2 hebras de DNA, la pasa por

A

el sector que está sobrenrrollado y vuelve a asociar las 2 hebras de DNA

81
Q

la hebra molde de la retardada, y lo que hace es hacer un loop con el fin de que

A

ambas polimerasas queden hacia la misma dirección

82
Q

En el final de la hebra retardada se incorpora un primer

A

Este primer es removido y lo que genera es un fragmento más corto, esto es lo que se denomina como acortamiento de los telómeros

83
Q
  • en cada replicación se pierden
A

100 pares de bases

84
Q
  • en aprox 125 replicaciones se pierde todo el
A

telómero

85
Q

los telómeros necesitan ser sellados y estar asociados a una serie de proteínas que impiden que el telómero se asocie al telómero de otro cromosoma, lo cual se denomina

A

traslocaciones robesonianas

86
Q

complejo shelterina

A

reconoce repeticiones que se encuentran en los telómeros

87
Q

Se genera un apareamiento entre las hebras y de estar forma las proteínas

A

sellan este telómero

88
Q

Para que se selle se genera un loop entre la hebra

A

más corta y la hebra más larga

89
Q

Los telómeros no se pueden asociar a proteínas relacionadas con la reparación Ku 70/80, que es un sistema de reparación de extremos no homólogos

A

Este sistema detecta alteración en el DNA como si hubiera un corte en la hebra de DNA

90
Q

La proteína de reparación detecta que hubo un doble corte en la hebra de DNA

A

por lo que hay que repararlo

91
Q

Las proteínas de reparación, si encuentran otros cromosomas que tengan el mismo problema, los va a juntar y generará una

A

recombinación robesoniana

92
Q

si se encuentra el complejo shelterina y se encuentra todo el sellamiento del telómero, entonces no es posible que las proteínas de reparación puedan acceder al telómero

A

por lo que no se generan recombinaciones

93
Q

El daño en el telómero es lo que va generando la

A

senescencia de la célula

94
Q

Las células van replicándose hasta llegar a cierto punto en el que ya tienen tan cortos los telómeros que frenan la proliferación y pasan a ser células en

A

senescencia

95
Q

Se genera una hebra más corta en la discontinua, pero al otro lado donde se encuentra la hebra líder que llega hasta el final, entonces ese telómero no se cortó, pero debe haber un corte en el extremo

A

5’ para que pueda asociarse el complejo shelterina y así pueda sellarse el telómero

96
Q

Para esto se encuentra la exonucleasa apolo que va a eliminar los nucleótidos de DNA de la región

A

5’, lo mismo pasa con la otra hebra líder

97
Q

Hay tipos celulares que cuentan con la participación de la telomerasa:

A
  • células de la línea germinal
  • células embrionarias
  • células madre poco diferenciadas
  • células cancerígenas
98
Q

la telomerasa es una ribonucleoproteína que tiene una región de proteína y otra de

A

RNA, y tiene la capacidad de generar la transcripción reversa

99
Q

El RNA hibrida con la secuencia que corresponde a los 6 nucleótidos de

A

la región telomérica

100
Q

Lo que hace la telomerasa es alargar la hebra molde en

A

3’, y de molde se utiliza la misma secuencia de RNA que posee la telomerasa

101
Q

se alarga la hebra molde y luego se incorpora otro partidor que genera un

A

nuevo fragmento final