Recombinación Y Mecanismos De Reparación

Question 1

mecanismo de lectura de prueba, quué mecanismo de reparacion es?

Answer 1

es un mecanismo realizado en la duplicacion por la exonucleasa 3´-5´ del replisoma, que elimina los nucleotidos mal incorporados. Mejora la fidelidad de la replicacion por un factor de 100

Question 2

mecanismo de reparacion de apareamientos incorrectos por errores de duplicacion, que mecanismo de reparacion es?

Answer 2

en e coli MutS, MutL y MutH. Se detecta el apareamiento incorrecto en el adn, se une al sitio y cambia de conformacion para reclutar a L, que activa a H que funciona como enzima produciendo una incision en la cadena donde está el mal apareamiento. La DNApolIII rellena esa parte y una ligasa la sella.

Question 3

fotorreactivacion, que mecanismo de reparacion es?

Answer 3

una fotoliasa captura luz y romper enlaces covalentes que unen a pirimidinas continuas formadas por la luz uv, las bases dañadas se reparan

Question 4

mecanismo de reparacion por escision de bases, que mecanismo de reparacion es?

Answer 4

una glucosidada reconoce y eliina una base dañada por hidrolisis del enlace glucosidico. las glucosidasas son especificas de la lesion. luego reparan el daño nucleasa polimerasa y ligasa

Question 5

mecanismo de reparacion por escision de nucleotido, que mecanismo de reparacion es?

Answer 5

se usa en ausencia del proceso de reactivacion. en e coi funcunan UvrA y UvrB que recorren el ADN buscando dimeros de timina, UvrB desnaturaliza al ADN alrededor de la distorsion, UvrC forma un complejo y corta a los lados de la lesion. Una DNA helicasa UvrD separa el fragmento y la polimerasa II y la ligasa reparan y sellan la brecha
en eucariotas es similar pero con mas proteinas, que se denominan XP

Question 6

reparacion post replicativa, que mecanismo de reparacion es?

Answer 6

en E. coli cuando la ADN polimerasa III encuentra cierto tipo de lesiones como dimeros de timina detiene la sintesis, se salta un fragmento y reanuda la replicacion. como hay una copia intacta de la region en la otra doble helice que se replica, una RecA repara el hueco

Question 7

sistema SOS, que mecanismo de reparacion es?

Answer 7

es un sistema de emergencia que se disapra cuando la polimerasa III se saltea una region por contener una gran cantidad de dimeros de timina por la luz uv. se activa la RecA que interacciona con LexA para reparar las lesiones producidas por la luz. rellenan los huecos al azar y se usa como ultimo recurso ya que es un proceso mutagenico.

Question 8

Qué es la recombinación? Q beneficio tiene?

Answer 8

Es el intercambio de información genética entre dos moléculas de ADN doble cadena, aumenta la diversidad génica

Question 9

Cuáles son las funciones de la recombinación homóloga en procariontes?

Answer 9

-reparar roturas bicatenarias de adn
-reiniciar horquillas de replicación colapsadas
-recombinacion entre adn cromosomico bacteriano y adn exogeno (conjugacion, transduccion, transformacion)

Question 10

Qué maquinaria proteica interviene durante la recombinación por rotura de la cadena en procariontes?

Answer 10

-rec BCD forma la monocadena
-rec A se encarga de la invasión de cadenas
-RuvAB se encarga de la migración en rama
-ruvC genera la resolución

Question 11

Funciones de la recombinación homóloga en los eucariontes

Answer 11

-reparacion de roturas bicatenarias de adn
-reiniciar horquillas de replicación colapsadas
-asegura la correcta segregacion de los cromosomas y la variabilidad genetica en la meiosis

Question 12

Cuáles son las etapas de la recombinación homóloga?

Answer 12

VER DIAPO
1. Se alinean los cromosomas homologos y se produce un corte en la misma posición de ambas moléculas
2. El extremo libre de cada molécula migra hacia la otra molecula, invade el extremo escindido y genera una unión de holliday desplazando la cadena complementaria original
3. Las dos cadenas de nucleotidos intercambian posiciones y se generan dos moléculas duplex
4. Según el tipo de corte se resuelve con o sin entrecruzamiento

Question 13

VER VIDEO Y ESQUEMATIZAR LA RECOMBINACION

Answer 13

!!!!!!

Question 14

Qué es un adn heteroduplex?

Answer 14

es a hebra de adn bicatenaria que contiene uno o más pares de bases desapareados. esto se debe al movimiento de la unión de holliday, donde la cadena doble original se está desapareando mientras cada una se aparea con la hebra invasora

Question 15

como puede ser la resolución de la recombinacion? (ver video)

Answer 15

la resolución incluye el corte en dos lugares posibles, cuando ponemos a las hebras en un plano vemos los diferentes cortes.
-por entrecruzamiento: recorte en las dos cadenas que no fueron cortadas en la recombinación, generando tambien una recombinación en esas hebras. las dos moleculas bicatenarias son un espejo de la otra
-sin entrecruzamiento: el corte se da en las que fueron cortadas en la recombinacion. la hebra unida a la recombinada mantiene su secuencia original

Question 16

como es la recombinacion homologa cuando hay dos uniones de holliday?

Answer 16

usar esquema del ppt

Question 17

que proteinas catalizan los pasos de la recombinacion en procariotas

Answer 17

RecA: apareamiento de cadenas homologas e invasion de cadenas
RecBCD: Procesamiento de roturas del adn para generar monocadenas e invadir, congregación de proteinas de intercambio de cadenas
Ruv AB: reconocimiento de unionres de holliday y migración de ramas
RuvC: resolución de uniones de holliday

Question 18

que proteinas catalizan los pasos de la recombinacion en eucariotas

Answer 18

-Rad: apareamiento de adn homologos e invasion de cadenas, procesamiento de roturas del adn para generar monocadenas, congregacion de protenas de intercambio de cadenas
-HO: introducción de roturas bicatenarias
-Dmc1 y Spo11 actúan en la meiosis

Question 19

que es la conversion genica?

Answer 19

es el mecanismo por el q se pierde un alelo de un gen y se reemplaza por otro alternativo. Se propuso la hibridacion de cadenas dependiente de sintesis

Question 20

como es el mecanismo de la hibridacion de cadenas dependiente de sintesis?

Answer 20

dos doble cadenas homologas, en una OH escinde en ambas cadenas, se elminan nucleotidos del extremo 5´(el extremo 5´del corte, no de la cadena, se pierde la secuencia del gen) y por Rad51 la porción 3´de la cadena cortada invade a la homologa, se comienza a sintetizar en este extremo la cadena complementaria a la invadida y mientras la homologa del alelo cortado se extirpa. la cadena que invadio, con el adn sintetizado nuevo vuelve a su posicion original y sirve para sintetizar su complementaria. quedan las dos cadenas con una copia exacta de la informacion de la hebra homologa

Question 21

como se relaciona la conversion genica con los mecanismos de reparacion del adn?

Answer 21

una forma de reparar un apareamiento incorrecto que forma un heteroduplex es por recombinacion, y puede generar una conversión génica segun que base se tome como referencia para la nueva sintesis en la reparacion

Question 22

que es la recombinacion especifica de sitio? como se da?

Answer 22

son los intercambios que se dan en secuencias cortas, de 12 a 24 pb, en secuencias particulares.
se requiere de una recombinasa, que puede ser serina recombinasa o tirosina recombinasa segun el aa en el sitio activo.
el bacteriofago lambda tiene una tirosna recombinassa que genera lisogenia en e coli

Question 23

que son los transposones?

Answer 23

son segmentos de adn capaces de trasladarse de una localizacion a otra de los cromosomas, con o sin duplicacion del elemento transponible
esto incrementa o disminuye el adn en el genoma, geneera mutaciones, cambia la forma de expresion de un gen
el movimiento es al azar, mediado por una transposasa

Question 24

como actua la transposasa?

Answer 24

es codificada por los transposones, se une a ambos extremos del transposon (tienen extremos con secuencias repetidas invertidas) y a la secuencia blanco del adn, algunos en secuencias especificas y otras en cualquier lugar
VER DIBUJO DE TRANSPOSONES

Question 25

cuales son los tipos de transposones?

Answer 25

ver dibujo
-transposones de adn
-retrotransposones semejantes a virus/retrovirus
-retrotransposones de poli-A

Question 26

como es un retrotransposon?

Answer 26

la secuencia donadora de adn se transcribe y se obtiene un arn, a este arn se le hace una transcripcion reversa y se obtiene un adn que se recombina con el adn diana
difiere del transposon donde la secuencia de la molecula donadora se corta por la transposasa y por recombinacion ingresa al adn diana

Question 27

como se inserta el transposon?

Answer 27

se corta un fragmento del adn diana, el transposon se une a uno de los fragmentos y va a copiar una secuencia corta de ese extremo al que se unio, que se va a copiar en el otro extremo. entonces, si el transposon fuera a saltar de nuevo desde ese lugar, deja la huella de una duplicacion de un fragmento de pocos nucleotidos

Question 28

que es el elemento Alu?

Answer 28

es un SINE (elemento nuclear corto intercalado), hay 500 mil copias en el genoma, representa ARN transcripto de forma reversa de 7S y no codifica proteinas.