transcripcion del ADN Flashcards
como difiere la transcripcion de la replicacion?
-en la transcripcion se obtiene una sola cadena y la cadena de ARN no permanece apareada al adn molde
-la replicacion debe ser más fiable
-la transcripcion solo se da en fragmentos determinados, no se transcribe todo el adn
-la polimerasa es distinta
-La RNA polimerisa no requiere de cebador
tipos de ARN
el ARN puede ser codificante (ARNm) o no codificante, que es la mayor parte. Los no codificantes son ARNn, ARNt, SNrna, snoRNA, scRNA, miRNA
como es la ARN polimerasa? cual es la mas presente en eucariotas?
en eucarriotas hay 3 polimerasas distintas, pero la que hace la mayor parte de la transcripcion es la II. tienen forma de pinza de cangrejo, con una zona central que se denomina receso de centro activo que puede fijar 2Mg
que es la unicdad de transcripcion y como es?
es el trozo de adn que codificada una molecula de ARN y las secuencias que se necesitan para transcribirlo, Cad aunidad incluye un promotor, una unidad codificante de ARN y un terminador. el primer nucleotido transcripto se numera como +1
cuales son las etapas de la transcripcion?
- iniciacion: es la más importante, principalmente el reconocimiento de la RNApol y el promotor. el complejo cerrado entre ambos ses abre por cambios estructurales y el ADN alrededor se desenrolla y se producce una burbuja de ADN monocatenaria. primero llegan dos ribonucleotidos al sitio activo y se unen entre si, luego la enzima se mueve por la cadena molde incorporando ribonucleotidos a la cadena de ARN formandose a la vez que abre la hebra. la incorporacion de los primeros 10 ribonucleotidos es ineficaz, liberando transcriptos cortos hasta que la sintesis funcione (iniciacion abortiva)
- alargamiento: la ARN polimerasa cataliza la sintesis de ARN, desenrolla el ADN por delante y lo renaturaliza por detras
- terminacion: para detenerse y liberar el ARN algunas celulas tienen secuencias que desencadenan este paso
Como se da la transcripcion en las bacterias? que pasos destacan?
-en bacterias la ARN polimerasa está formada por una holoenzima constituida por las subunidades alfa, beta, beta’ y sigma.
-el factor sigma reconoce secuencias consenso a -10 y -35 pb, son conservadas entre especies.
-en E. coli el factor sigma predominante es sigma70
-algunos promotores sigma70 carecen de regiones -35, pero poseeen un elemento -10 extendido con una secuenca corta adicional corriente arriba, que compensa la falta de region -35
-EN BACTERIAS TRANSCRIPCION Y TRADUCCION SE DAN DE MANERA SIMULTANEA
qué es la fuerza de un promotor? (bacterias)
se relaciona con la union incial acertada del promotor a la polmerasa, la eficacia de isomerizacion y la facilidad de la polimerasa para vencer la iniciacion abortiva. los promotores que tienen secuencias parecidas a las secuencias consenso suelen ser más fuertes
que es el elemento UP? (bacterias)
es un elemento de ADN adicional al que se ne la ARN pol y que aumenta la afinidad de unionr entre la polimerasa y el ADN en secuencias que deben transcribirse seguido. UP es reconocido por una porcion de la subunidad alfa denominado alfaCTD
canales de entrada y salida en el complejo abierto de la enzima (bacterias)
-el adn ingresa por un cana de entrada entre las pinzas
-se separa el adn en el centro activo, y la cadena no molde sale por un canal NT y queda en la superficie de la enzima
-la cadena molde continua por el centro activo y sale por el canal T
-los ribonucleotidos ingresan por un canal superior al sitio activo
-la cadena de RNA sale por un canal de salida durante el alargamiento
cambios estructurales de la polimerasa cuando se transiciona de complejo cerrado a abierto (bacterias)
-region sigma 1.1 bloquea el ingreso cuando no está unido el adn, cuando se une al adn se desplaa al exterior de la enzima
cuales son las funciones de revision de la polimerasa durante la transcripción (bacterias)?
-Edicion pirofosfaltica, intercambia un ribonucleotido incorrecto por el correcto
-Edición hidrolítica, retrocede en la secuencia y escinde una porcion para eliminar la secuencia con error
qué tipos de señales de terminacion en la secuencia de RNA hay en las bacterias?
terminadores dependientes de Rho y no dependientes de Rho
Cómo son los terminadores independientes de Rho (bacterias)
Las secuencias de terminacion en el transcrito de ARN forman una estructura de tallo y horquila que luego es seguida por una secuencia de 6-8 uracilos, lo que marca que termina la sintesis de ARN. no requiere la participacion de otros factores.
como son los terminadores dependientes de Rho en bacterias?
La proteína Rho tiene forma anular, se une a la cadena de ARN que sale de la polimerasa y reconoce sitios Rut de 40 nucleotidos que no se pliegan como estructura secundaria y tienen abundantes C. El proceso de terminacion lo da luego de que el terminador haya sido transcripto a ARN.
Como se diferencia la transcripcion en eucariotas de la transc en procariotas?
-Eucariotas poseen 3 polimerazas y no 1
-Requieren de factores de transcripcion generales, a los que tambien se les suman factores adicional para la transcripcion in vivo
