General

Question 1

cuáles son las propiedades que debe tener el material genético?

Answer 1

-tiene que tener información compleja que debe poder variar entre distintas especies, y este material genético debe ser estable
-debe replicarse fielmente
-debe codificar genotipos mediante el pasaje a ARNm y a proteínas.

Question 2

resumen experimentos genéticos con streptococcus

Answer 2

se vio que bacterias muertas pueden igualmente generar que bacterias no virulentas se vuelvan virulentas. al aislar distintas fracciones de estas bacterias muertas se vio que la fracción correspondiente al adn era la que generaba este cambio. se dice que el adn de las bacterias muertas tienen poder transformante.

Question 3

Cuáles son las reglas de Chargaff?

Answer 3

*[A]=[T]
*[C]=[G]
*[A+G]/[T+C]=1
*la proporción entre (A+T) y (G+C) es característica de cada organismo

Question 4

que es el genoma?

Answer 4

Es el conjunto de adn de un organismo, tiene un tamaño de 3000 millones de PBX2 (x2 porque es diploide)

Question 5

Como es la estructura del adn?

Answer 5

-consiste en dos cadenas de nucleotidos enrolladas entre si formando una helice dextrogira con azucares y fosfatos en su exterior y bases nitrogenadas en el interior.
-los nucleotidos de la cadena se unen por uniones fosfodiester entre el fosfato 5´ de uno y el OH 3´ de otro
-Las torsiones de las cadenas generar un surco mayor y uno menor importante para la union de proteinas al ADN

Question 6

en que se basa la complementariedad de las bases?

Answer 6

se basa en los puentes de hidrógeno que se forman entre los grupos ceto de una base y los amino de la otra. Esto permite mantener el diametro de los polinucleotidos de 20 A.

Question 7

que estructuras pueden tomar los cromosomas?

Answer 7

los cromosomas pueden ser circulares, generalmente en procariotas, o lineares que tienen riesgo de degradacion de los extremos

Question 8

que son las estructuras especiales en el adn?

Answer 8

se dan como consecuencia de palindromos, secuencias de nucleotidos que se leen por igual en ambos sentidos sobre la misma hebra, y secuencias que se leen igual en sentido 5´a 3´sobre hebras complementarias.
son secuencias diana para algunas enzimas de restricción.
se pueden formar horquillas cruciformes.

Question 9

cuales son las estructuras inusuales del adn?

Answer 9

-triplex dnas: se pueden formar puentes de hidrogeno adicionales dando lugar a tramos de triple helice por ciertas condiciones en apareamiento Hoogsteen, o puedden darse in vitro si se intercalan oligonucleotidos cortos de pirimidinas en el surco mayor de la doble helice
-cuadruplex dnas: in vitro pueden obtenerse cuartetos de guanina por uniones Hoogsteen si se usan polinucleotidos que solo tienen guanina. En los telomeros puede darse esta estructura para proteger los extremos de degradacion enzimatica

Question 10

como se desnaturaliza el adn? como se forman hibridos?

Answer 10

llevandolo a más de 100°C o con un pH alto, el proceso es reversible y pueden formarse hibridas artificiales si se enfrian con lentitud mezclas de adn desnaturalizado de dos origenes distintos. tabien pueden formarse hibridos de adn y arn.

Question 11

que es el Tm en una curva de desnaturalizacion?

Answer 11

es el punto de fusión o disociacion, la temperatura donde la absorbancia alcanza la mitad del valor maximo. Cuanto mas estable sea la molecula, mayor sera la T a la que puede desnaturalizarse. Esta T es caracteristica de cada ADN y está determinada por la cantidad de GC, ya que entre G y C hay tres P de H lo q hace al enlace mas estable que AT

Question 12

como se vrifica la desnaturalizacion del adn?

Answer 12

mediante la medicion de la absorbancia UV. la solucion de adn absorbe en un maximo de 260 nm y al desnaturalizarse la densidad optica aumenta y absorbe más radicación UV. este efecto se llaa hipercromismo. La doble cadena absorbe 40% menos que las cadenas individuales, y estas menos que los nucleotidos libres.

Question 13

como se relaciona Tm con las hibridaciones?

Answer 13

para una solucion acuosa de adn que contiene sales para que se de la hibridacion, el Tm efectivo se puuede calcular como Eff Tm= 81,5 + 16,6 (log[Na]) + 0,41 (%G+C)°C-0,72 (%formamida)

Question 14

cual es el efecto del cloruro de sodio en la desnaturalizacion?

Answer 14

a mayor cc de sales, mayor es la T en la cual el ADN se desnaturaliza, por la fuerza ionica, ya que el Na aisla las cargas negativas generando que la helice sea mas estable.

Question 15

que parametros afectan la desnaturalizacion del adn?

Answer 15

-la composicion de bases ya que Tm aumenta con el %GC,
-la longitud de la secuencia cuando es una secuencia de menos de 150 pb ya que Tm aumenta con la longitud en secuencias pequeñas,
-incremento de Tm con el aumento de cc de sales
-disminuye Tm con el aumento de %mismatch
-disminuye Tm con el aumento de la cc de formamida y de urea

Question 16

que condiciones favorecen la desnaturalizacion?

Answer 16

alta temperatura, baja fuerza ionica y alto pH.

Question 17

densidad del adn

Answer 17

si se introduce adn en un gradiente de densidad, el adn va a migrar hasta que el soluto de menor mp coincida con la densidad del adn, tiene densidad de flotacion. Es posible luego aislar moleculas de adn de diferentes densidades. Se relaciona con el contenido de GC, siendo que a mayor contenido de GC mayor es la densidad.

Question 18

formas de la estructura secundaria

Answer 18

-ADN B: forma fisiologica, helice dextrogira, bases apiladas cerca del eje central, 10 pb por vuelta.
-ADN A: helices dextrogiras RNA-ADN y RNA-RNA, 11 pb por vuelta, los pares de bases se apilan desplazados del eje central. Surco mayor mas angosto y profundo, menor mas ancho y menos profundo
-ADN Z: repeticiones alternantes de purinas y pirimidinas a altas cc de CG, héice levógira, puede desempeñar un papel en el control de la expresión génica

Question 19

cómo es el modelo de renaturalización?

Answer 19

en la renaturalizacion hay un modelo de cremallera en la cual hay primero una etapa donde se forma un pequeño duplex en una región complementaria y luego en una etapa rápida se reasocian las cadenas.
La velocidad de renaturalización está directamente asociada con la complejidad del adn.

Question 20

qué es el valor C?

Answer 20

es la cantidad total de adn de un genoma haploide y es característico de cada especie. las especies más evolucionadas tienen un genoma más grande, pero no define esto solo la complejidad del genoma

Question 21

como se calcula la complejidad del adn?

Answer 21

es la suma del nuero de nucleotidos de cada tipo de secuencia (SU, SBNC, SR, SAR) sin tener en cuenta las veces que se repite
SU secuencias unicas
SBNC secuencias de bajo numero de copias
SR secuencias repetidas
SAR secuencias altamente repetidas

Question 22

que son las curvas CoT?

Answer 22

es una función de % de adn total como cadena simple, en funcion a la concentracion inicial de adn en mol/L x tiempo de renaturalización. De esto puede obtenerse el punto medio de la reacción de renaturalización, el CoT medio, que es un valor que permite estimar la longitud del genoma.

Question 23

cinetica de la reasociacion en procariotas

Answer 23

curva de reasociacion simple, dado que el genoma procarionte carece de secuencias repetitivas y todas tienen la misma probabilidad de encontrar su complementaria (recordar curva)

Question 24

cinetica de reasociacion en eucariotas

Answer 24

la curva tiene 3 puntos de inflexión porque la reasociación se hace en 3 tiempos: en un primer tiempo se asocia rápido un 20-25% de adn altamente repetitivo, luego un 25-30% de adn medianamente repetitivo y por ultimo en un proceso más lento se reasocia un 45-55% de adn de copia unica. El valor CoT medio en este caso permite calcular la proporción de cada elemento en el genoma.