Prokaryot transkription Flashcards
Vad innebär konstitutiv genexpression?
Att en gen uttrycks konstant
Dessa gener kallas ofta housekeeping genes
Vad innebär reglerbar genexpression?
Gener är inducernara och kan sättas på / stängas av när dess produkt behövs
Hur många nivåer av prokaryot genreglering finns, och vilka är nivåerna?
3 stycken
- Transkriptionsreglering
- Translationsreglering
- Post-translationell reglering
Vad är ett operon?
En sträcka på DNA:t som innehåller en eller flera besläktade gener samt de operator- och promotorsekvenser som reglerar deras transkription
Vad heter sekvensen på ett operon, dit reglersekvenser binder?
Operator
Vad heter sekvensen på operonet, dit polymeraser binder in?
Promotor
När sker framföralllt reglering av transkription?
Vid dess initiering
Har en gen börjat transkriberas, blir det med mycket stor sannolikhet ett färdigt protein
Vad är operator site?
Det är platsen dit proteiner kan binda in, till operonet, och reglera transkription
Vilka tre faktorer påverkar initiering av transkriptionen hos prokaryoter?
- Specificitetsfaktor - olika sigmafaktorer. Dessa reglerar RNA-polymerasets specificitet för specifika promotorer
- Repressorer (negativ reglering) - proteiner som binder till en specifik sekvens i promotorn (operatorn). Genom att fysiskt ligga i vägen, förhindrars RNA-polymeraset från att börja transkribera igen
- Aktivatorer (positiv reglering) - binder intill eller nära promotorn och underlättar för RNA-polymeraset att binda in till promotorn och påbörja transkriptionen
Vilken är den vanligaste sigmafaktorn hos prokaryoter?
Sigma70
Vad är sigma-subenhetens uppgift?
Hjälper RNA-polymeraset att hitta till promotorn
Vad är skillnaden mellan kärnenzym och holoenzym?
Kärnenzym binder inte specifikt till promotorn. Innehåller endast de subenheter av RNA-polymeraset som behövs för enzymets katalytiska aktivitet
Holoenzym binder specifikt till promotorn. Är komplett, innehållande alla subenheter + sigmafaktorn :) Hittar promotorn MYCKET snabbare
Vad gör en repressor?
Stänger av gener
Vad gör en co-repressor?
Hjälper repressorer att binda in till operonet och utöva sin negativa reglering
Vad gör en aktivator?
Den aktiverar transkription
Vad gör en co-aktivator? Ge exempel på en sådan?
Den binder in till aktivatorn, för att den ska kunna binda till operonet
Ex. cAMP binder till CRP (för att CRP ska kunna binda till activator site på operonet)
Kan ett ämne vara både en aktivator och en repressor?
Ja
Det beror på bindningsstället på måloperonet
Vad innebär katabolisk repression i transkriptionsreglering?
När tillgängligheten på energikällor styr uttrycket av gener
Ex. Om det finns mycket glukos, kommer Lac-operonet inte att slås på eftersom laktos inte behöver brytas ner just då
Vad är ALLTID förstahandsvallet som energikälla i celler?
Glukos
I vilket scenario slås Lac-operonet på?
Låg glukos, höga cAMP-nivåer och förekomst av laktos i omgivningen
